FuNGI

R0JJW6

Protein Details

Accession

R0JJW6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
748-769	EADHAGKKRKRDTPKHNSGAGD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
753-766	GKKRKRDTPKHNSG

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 9.5, cyto 6.5, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR046351 UTP4 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0030686 C:90S preribosome GO:0000462 P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)

Amino Acid Sequences

MDIHRSRFVPYPPSAINALAFSHPEAEHGQQDPGSLRLAIGRANGNIEIWNPAKGSWLQEKVFYGGKDRSVEGLAWTQEPDERDAQGKLVPGRLRLFSIGYSSTVTEWDLTTGLPARHSNGNHSEVWCFAAQPRLKNAAKGASKDEGDARQKLVAGCADGTIVLLSTDNDDLTFERFVSRATNKKARALSISYKDHHTVLAGFADSMIRVFDTRNGNVIRNISLGSGPHGGPKEILVWKVKCLPNGDFVSGDSTGDIRIYNGKNYSQTQRISGHEADVLDLAVTRDGSSIFSAGMDRRTCFYTSKKGQAQGQSGKWRKVSHQRHHEHDVKAMTTYEGSKLSVVVTGGIDTQPIVVPIRQFGKELSRGLPALPPTPPMTSASGARLLVSWWSTEVRIWRVKPQDDGTEKPKVVARLALQGEENIISVSISRDGGLLAVATASTVKLFQLLHPQAGAGPGLRVRKLDMPSIAGAKALKMAATGKWLAAILATDEIQLVRIVRTDDPADLPRALEKVQPLRRLDRDTITSTPLSGPSGIYERSIAHGDFSSDGNAFAVVDLAGYVDTWVIKGHEDTTAPEIDIGDSTPMAEDDGSGDEEETSEQITYLGQHWERNPSGHLLPRLDSTPVLLSFQPNPDASSKPNPNGNPAVHATRQNPHPQSHELPATEYRLLLVSAEHQLYLFDVLSGRLSEWSRRNPPSSYPREYKQLDLPAKGCIWDVTEAQQRIWVYSEKWLFMFDLTRDLVVPVSEADHAGKKRKRDTPKHNSGAGDAIPRKEAPVAKMRRFQSDESDKTGRQKWIDVNAVRRSPDADDDEDDDADADEPNPNTHSLTALGRNQSQDGRGDAEDAVNGSNTSNGTTTTTSKRSEPWWHTFKYRPILGIVPISAHDGFHAPEVVLVERPSWDLDLPPRFVGTHEQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.4
2	0.35
3	0.32
4	0.25
5	0.24
6	0.19
7	0.19
8	0.16
9	0.18
10	0.17
11	0.18
12	0.2
13	0.21
14	0.24
15	0.24
16	0.26
17	0.22
18	0.24
19	0.24
20	0.22
21	0.21
22	0.16
23	0.15
24	0.15
25	0.16
26	0.16
27	0.18
28	0.2
29	0.19
30	0.21
31	0.22
32	0.19
33	0.19
34	0.18
35	0.2
36	0.18
37	0.2
38	0.17
39	0.17
40	0.2
41	0.21
42	0.26
43	0.29
44	0.35
45	0.34
46	0.37
47	0.39
48	0.38
49	0.41
50	0.36
51	0.33
52	0.3
53	0.34
54	0.33
55	0.32
56	0.31
57	0.28
58	0.28
59	0.25
60	0.26
61	0.23
62	0.22
63	0.21
64	0.19
65	0.2
66	0.22
67	0.23
68	0.2
69	0.2
70	0.21
71	0.22
72	0.22
73	0.21
74	0.25
75	0.23
76	0.27
77	0.28
78	0.3
79	0.33
80	0.33
81	0.33
82	0.3
83	0.3
84	0.24
85	0.25
86	0.22
87	0.19
88	0.19
89	0.18
90	0.16
91	0.15
92	0.15
93	0.12
94	0.11
95	0.11
96	0.1
97	0.09
98	0.11
99	0.14
100	0.14
101	0.17
102	0.18
103	0.2
104	0.26
105	0.27
106	0.32
107	0.34
108	0.37
109	0.37
110	0.37
111	0.35
112	0.29
113	0.32
114	0.25
115	0.19
116	0.17
117	0.23
118	0.24
119	0.28
120	0.33
121	0.39
122	0.4
123	0.41
124	0.43
125	0.44
126	0.45
127	0.44
128	0.43
129	0.39
130	0.39
131	0.38
132	0.38
133	0.37
134	0.38
135	0.37
136	0.33
137	0.3
138	0.32
139	0.3
140	0.29
141	0.22
142	0.18
143	0.16
144	0.15
145	0.13
146	0.11
147	0.1
148	0.08
149	0.06
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.07
154	0.07
155	0.07
156	0.07
157	0.08
158	0.09
159	0.11
160	0.11
161	0.09
162	0.1
163	0.1
164	0.11
165	0.17
166	0.22
167	0.29
168	0.36
169	0.45
170	0.46
171	0.54
172	0.56
173	0.52
174	0.51
175	0.49
176	0.49
177	0.49
178	0.52
179	0.47
180	0.48
181	0.47
182	0.42
183	0.36
184	0.29
185	0.21
186	0.16
187	0.16
188	0.12
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.08
193	0.08
194	0.06
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.12
199	0.17
200	0.18
201	0.24
202	0.26
203	0.28
204	0.3
205	0.31
206	0.26
207	0.22
208	0.22
209	0.16
210	0.15
211	0.13
212	0.13
213	0.14
214	0.13
215	0.17
216	0.17
217	0.17
218	0.16
219	0.16
220	0.19
221	0.18
222	0.21
223	0.24
224	0.24
225	0.27
226	0.35
227	0.36
228	0.34
229	0.36
230	0.35
231	0.36
232	0.38
233	0.36
234	0.28
235	0.26
236	0.27
237	0.23
238	0.21
239	0.13
240	0.1
241	0.09
242	0.09
243	0.09
244	0.06
245	0.12
246	0.14
247	0.17
248	0.19
249	0.21
250	0.24
251	0.28
252	0.33
253	0.32
254	0.32
255	0.33
256	0.35
257	0.35
258	0.37
259	0.34
260	0.3
261	0.26
262	0.24
263	0.21
264	0.17
265	0.14
266	0.08
267	0.08
268	0.07
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.05
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.06
278	0.06
279	0.08
280	0.09
281	0.13
282	0.14
283	0.14
284	0.16
285	0.18
286	0.19
287	0.21
288	0.25
289	0.3
290	0.34
291	0.42
292	0.45
293	0.47
294	0.5
295	0.54
296	0.57
297	0.53
298	0.54
299	0.56
300	0.56
301	0.55
302	0.54
303	0.49
304	0.48
305	0.52
306	0.57
307	0.57
308	0.63
309	0.65
310	0.68
311	0.74
312	0.75
313	0.65
314	0.59
315	0.51
316	0.41
317	0.36
318	0.3
319	0.22
320	0.16
321	0.15
322	0.12
323	0.11
324	0.1
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.09
329	0.08
330	0.07
331	0.06
332	0.06
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.05
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.06
341	0.06
342	0.07
343	0.09
344	0.13
345	0.13
346	0.13
347	0.14
348	0.18
349	0.21
350	0.23
351	0.22
352	0.21
353	0.21
354	0.21
355	0.22
356	0.18
357	0.16
358	0.14
359	0.15
360	0.14
361	0.15
362	0.15
363	0.15
364	0.16
365	0.15
366	0.16
367	0.16
368	0.16
369	0.16
370	0.15
371	0.13
372	0.1
373	0.1
374	0.09
375	0.08
376	0.07
377	0.07
378	0.07
379	0.09
380	0.11
381	0.15
382	0.2
383	0.21
384	0.26
385	0.32
386	0.33
387	0.35
388	0.35
389	0.38
390	0.37
391	0.4
392	0.37
393	0.38
394	0.36
395	0.34
396	0.33
397	0.27
398	0.23
399	0.23
400	0.19
401	0.2
402	0.21
403	0.2
404	0.18
405	0.17
406	0.17
407	0.14
408	0.13
409	0.05
410	0.05
411	0.04
412	0.04
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.04
422	0.03
423	0.03
424	0.02
425	0.02
426	0.02
427	0.02
428	0.03
429	0.03
430	0.03
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.15
435	0.16
436	0.16
437	0.16
438	0.16
439	0.15
440	0.15
441	0.15
442	0.05
443	0.05
444	0.08
445	0.09
446	0.09
447	0.09
448	0.11
449	0.16
450	0.17
451	0.19
452	0.17
453	0.18
454	0.18
455	0.19
456	0.18
457	0.13
458	0.11
459	0.09
460	0.09
461	0.07
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.06
466	0.09
467	0.09
468	0.08
469	0.08
470	0.08
471	0.07
472	0.06
473	0.06
474	0.04
475	0.04
476	0.05
477	0.04
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.05
482	0.05
483	0.05
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.09
488	0.1
489	0.1
490	0.12
491	0.13
492	0.14
493	0.13
494	0.13
495	0.12
496	0.12
497	0.12
498	0.12
499	0.14
500	0.21
501	0.26
502	0.32
503	0.33
504	0.37
505	0.41
506	0.44
507	0.43
508	0.37
509	0.36
510	0.34
511	0.33
512	0.3
513	0.26
514	0.22
515	0.2
516	0.18
517	0.15
518	0.11
519	0.09
520	0.08
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.09
526	0.11
527	0.13
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.1
533	0.1
534	0.1
535	0.08
536	0.09
537	0.07
538	0.07
539	0.06
540	0.05
541	0.05
542	0.03
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.03
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.03
551	0.03
552	0.04
553	0.04
554	0.05
555	0.06
556	0.06
557	0.08
558	0.09
559	0.1
560	0.12
561	0.12
562	0.12
563	0.12
564	0.11
565	0.09
566	0.09
567	0.08
568	0.06
569	0.05
570	0.05
571	0.05
572	0.05
573	0.05
574	0.04
575	0.04
576	0.04
577	0.06
578	0.06
579	0.06
580	0.07
581	0.06
582	0.07
583	0.07
584	0.06
585	0.05
586	0.05
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.06
591	0.07
592	0.12
593	0.12
594	0.15
595	0.17
596	0.23
597	0.24
598	0.24
599	0.24
600	0.23
601	0.24
602	0.26
603	0.29
604	0.24
605	0.24
606	0.25
607	0.24
608	0.22
609	0.19
610	0.16
611	0.15
612	0.14
613	0.14
614	0.13
615	0.14
616	0.15
617	0.17
618	0.19
619	0.16
620	0.18
621	0.18
622	0.2
623	0.22
624	0.29
625	0.32
626	0.32
627	0.38
628	0.37
629	0.4
630	0.44
631	0.4
632	0.36
633	0.34
634	0.35
635	0.31
636	0.35
637	0.33
638	0.32
639	0.37
640	0.41
641	0.42
642	0.4
643	0.42
644	0.43
645	0.44
646	0.44
647	0.43
648	0.34
649	0.34
650	0.34
651	0.33
652	0.28
653	0.24
654	0.19
655	0.15
656	0.15
657	0.11
658	0.09
659	0.08
660	0.11
661	0.11
662	0.11
663	0.1
664	0.1
665	0.1
666	0.11
667	0.09
668	0.06
669	0.06
670	0.07
671	0.08
672	0.08
673	0.08
674	0.1
675	0.12
676	0.18
677	0.23
678	0.32
679	0.39
680	0.44
681	0.47
682	0.46
683	0.53
684	0.57
685	0.59
686	0.59
687	0.57
688	0.55
689	0.6
690	0.6
691	0.55
692	0.52
693	0.53
694	0.49
695	0.47
696	0.45
697	0.39
698	0.37
699	0.34
700	0.28
701	0.19
702	0.16
703	0.15
704	0.15
705	0.17
706	0.25
707	0.25
708	0.24
709	0.27
710	0.25
711	0.24
712	0.25
713	0.22
714	0.16
715	0.23
716	0.26
717	0.23
718	0.23
719	0.23
720	0.21
721	0.2
722	0.22
723	0.15
724	0.17
725	0.16
726	0.16
727	0.16
728	0.15
729	0.15
730	0.11
731	0.11
732	0.07
733	0.08
734	0.08
735	0.08
736	0.1
737	0.16
738	0.19
739	0.28
740	0.32
741	0.38
742	0.46
743	0.55
744	0.64
745	0.69
746	0.77
747	0.79
748	0.86
749	0.86
750	0.81
751	0.73
752	0.64
753	0.57
754	0.48
755	0.45
756	0.36
757	0.31
758	0.28
759	0.27
760	0.26
761	0.27
762	0.28
763	0.24
764	0.32
765	0.39
766	0.44
767	0.52
768	0.53
769	0.58
770	0.59
771	0.56
772	0.57
773	0.58
774	0.54
775	0.54
776	0.57
777	0.5
778	0.53
779	0.57
780	0.52
781	0.44
782	0.46
783	0.45
784	0.48
785	0.55
786	0.53
787	0.55
788	0.57
789	0.59
790	0.54
791	0.49
792	0.43
793	0.36
794	0.37
795	0.34
796	0.29
797	0.28
798	0.3
799	0.31
800	0.29
801	0.26
802	0.2
803	0.16
804	0.14
805	0.11
806	0.09
807	0.11
808	0.11
809	0.13
810	0.14
811	0.14
812	0.15
813	0.15
814	0.16
815	0.15
816	0.18
817	0.23
818	0.27
819	0.31
820	0.32
821	0.34
822	0.35
823	0.35
824	0.33
825	0.3
826	0.26
827	0.26
828	0.23
829	0.24
830	0.21
831	0.19
832	0.18
833	0.16
834	0.14
835	0.11
836	0.11
837	0.09
838	0.1
839	0.1
840	0.11
841	0.1
842	0.11
843	0.14
844	0.16
845	0.21
846	0.26
847	0.31
848	0.32
849	0.34
850	0.37
851	0.41
852	0.48
853	0.52
854	0.54
855	0.57
856	0.59
857	0.63
858	0.67
859	0.69
860	0.67
861	0.62
862	0.54
863	0.5
864	0.49
865	0.45
866	0.41
867	0.33
868	0.25
869	0.23
870	0.25
871	0.22
872	0.18
873	0.16
874	0.14
875	0.14
876	0.15
877	0.15
878	0.11
879	0.12
880	0.15
881	0.15
882	0.16
883	0.15
884	0.15
885	0.15
886	0.16
887	0.16
888	0.16
889	0.15
890	0.17
891	0.25
892	0.31
893	0.33
894	0.33
895	0.32
896	0.31

R0JJW6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer