FuNGI

R0IB24

Protein Details

Accession

R0IB24

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-52	YIDSIAGKQRPPKRQRKTKEAIKQELEQE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
31-42	KQRPPKRQRKTK
542-593	GRGSGGRGGPPGRGGQNQRGRGQQGGGRGGAPRGGGPPAARGRGNIARTGRG

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011545 DEAD/DEAH_box_helicase_dom IPR014001 Helicase_ATP-bd IPR001650 Helicase_C IPR027417 P-loop_NTPase IPR025696 rRNA_proc-arch_dom IPR016438 SKI2-like IPR012961 Ski2/MTR4_C IPR040801 Ski2_N
Gene Ontology	GO:0005524 F:ATP binding GO:0016787 F:hydrolase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003724 F:RNA helicase activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF00270 DEAD PF08148 DSHCT PF00271 Helicase_C PF13234 rRNA_proc-arch PF17911 Ski2_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS51192 HELICASE_ATP_BIND_1 PS51194 HELICASE_CTER
CDD	cd18795 SF2_C_Ski2

Amino Acid Sequences

METLSGKLEELRLSSSQLEQDAGYIDSIAGKQRPPKRQRKTKEAIKQELEQEFLTPSRSFNTQWLNRLQQRWEAPTNYHSLFQIAPTQTRTIIRFTREGLEGRVTGYKEVTVPANSATAKNSTSLLRKPANRAEFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAAIEDQAIQQHENADGNKARGLDRVINFSAEGGLLEVPPGFTRGLDLQKKQSTDNSIAQEVEETLGEAPAPVGETGVDQEDVDNTGADGIDVPEDGQTPGEEEIDALLPVEFPALAPHGPLAMGTGRKAGREWAHMVDINRDITNFRELVPEMAREYPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALAAKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRQTFDDVGILTGDVQIKPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTPKRPIPLEHYLWAGKNIHKIVTADKKFIDNGWKEANDILSGKDKVKAPAASDAQAGRGSGGRGGPPGRGGQNQRGRGQQGGGRGGAPRGGGPPAARGRGNIARTGRGGGRTTAAQDRNIWVHLIQYLRTKDLLPACIFVFSKKRCEENADALSNIDYCTAAEKSAIHMTIEKSLARLSREDRELPQIKRLRELLSRGIAVHHGGMLPIVKEVVEILFAKTLVKVLFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGREFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGTVIICAPGADEAPPAARLRQMMLGEPTKLRSQFRLTYNMMLNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHQGKVKLSEAELEKIKREPCEICDVDLEACHQSCEDYKRLTNEMHLSLLINPIGRRVPSKNRLIVYKKDNIRTAGMLMQDGTSKGHEPTVKVLEVAQHQDRKPDDLLPYLGPFAQLYRKLPNNPKDLILKTAFVPLNDIECFTKTTIDVPESVQNLNRKKGKANSGQDTLKLAQDQFLPLCGSWDYEDWDEYDYSRIKSLKFRELEEARKREGQNAVSKMCLNCPNFLKHFAMEHDQWLIKENIHALRQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLKDLGFVDEGSRVELKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLAEYEPEEIVALLSAFVFQEKTDVEPTLTASLERGVAKIVQISEKVNDIQTKHQVILSADDSNDFVSKPRFGMVEVVYEWARGMSFNRITDLTDVMEGTIVRVITRLDETCREVKNAARIIGDPTLFQKMGSCQELIKRDICNCASLYL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.23
3	0.24
4	0.23
5	0.23
6	0.18
7	0.18
8	0.17
9	0.16
10	0.13
11	0.11
12	0.1
13	0.1
14	0.11
15	0.16
16	0.16
17	0.19
18	0.28
19	0.37
20	0.48
21	0.57
22	0.67
23	0.73
24	0.82
25	0.88
26	0.9
27	0.92
28	0.92
29	0.92
30	0.91
31	0.9
32	0.85
33	0.8
34	0.77
35	0.69
36	0.61
37	0.51
38	0.41
39	0.34
40	0.29
41	0.27
42	0.2
43	0.18
44	0.18
45	0.21
46	0.21
47	0.25
48	0.35
49	0.37
50	0.43
51	0.5
52	0.57
53	0.61
54	0.65
55	0.62
56	0.59
57	0.59
58	0.6
59	0.59
60	0.53
61	0.49
62	0.48
63	0.51
64	0.45
65	0.4
66	0.33
67	0.29
68	0.26
69	0.24
70	0.28
71	0.24
72	0.26
73	0.27
74	0.29
75	0.3
76	0.34
77	0.34
78	0.33
79	0.35
80	0.37
81	0.37
82	0.38
83	0.39
84	0.39
85	0.39
86	0.35
87	0.34
88	0.3
89	0.29
90	0.31
91	0.27
92	0.24
93	0.23
94	0.21
95	0.17
96	0.19
97	0.2
98	0.16
99	0.17
100	0.16
101	0.2
102	0.2
103	0.2
104	0.2
105	0.2
106	0.19
107	0.19
108	0.2
109	0.21
110	0.26
111	0.29
112	0.35
113	0.4
114	0.45
115	0.51
116	0.59
117	0.6
118	0.59
119	0.59
120	0.58
121	0.54
122	0.5
123	0.46
124	0.37
125	0.32
126	0.27
127	0.24
128	0.18
129	0.14
130	0.14
131	0.1
132	0.1
133	0.1
134	0.09
135	0.09
136	0.08
137	0.09
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.05
142	0.04
143	0.04
144	0.03
145	0.03
146	0.03
147	0.03
148	0.03
149	0.06
150	0.07
151	0.08
152	0.09
153	0.1
154	0.12
155	0.15
156	0.16
157	0.2
158	0.21
159	0.22
160	0.24
161	0.24
162	0.23
163	0.23
164	0.26
165	0.28
166	0.28
167	0.33
168	0.32
169	0.31
170	0.3
171	0.27
172	0.24
173	0.16
174	0.13
175	0.08
176	0.07
177	0.06
178	0.07
179	0.06
180	0.06
181	0.07
182	0.08
183	0.07
184	0.07
185	0.1
186	0.14
187	0.24
188	0.3
189	0.33
190	0.4
191	0.45
192	0.47
193	0.47
194	0.47
195	0.44
196	0.44
197	0.47
198	0.42
199	0.39
200	0.37
201	0.35
202	0.31
203	0.25
204	0.19
205	0.13
206	0.09
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.06
212	0.05
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.06
218	0.07
219	0.08
220	0.09
221	0.07
222	0.08
223	0.08
224	0.1
225	0.1
226	0.09
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.05
233	0.05
234	0.05
235	0.06
236	0.06
237	0.07
238	0.07
239	0.07
240	0.07
241	0.08
242	0.09
243	0.09
244	0.08
245	0.07
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.06
251	0.06
252	0.06
253	0.06
254	0.05
255	0.04
256	0.05
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.07
264	0.08
265	0.09
266	0.1
267	0.11
268	0.16
269	0.17
270	0.18
271	0.18
272	0.22
273	0.22
274	0.26
275	0.29
276	0.26
277	0.29
278	0.32
279	0.32
280	0.3
281	0.3
282	0.27
283	0.24
284	0.21
285	0.18
286	0.17
287	0.2
288	0.16
289	0.14
290	0.16
291	0.16
292	0.19
293	0.2
294	0.19
295	0.18
296	0.21
297	0.21
298	0.18
299	0.19
300	0.17
301	0.16
302	0.15
303	0.15
304	0.14
305	0.16
306	0.18
307	0.16
308	0.16
309	0.15
310	0.16
311	0.18
312	0.18
313	0.17
314	0.15
315	0.15
316	0.14
317	0.15
318	0.14
319	0.1
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.05
327	0.06
328	0.06
329	0.07
330	0.07
331	0.06
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.07
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.05
342	0.07
343	0.07
344	0.08
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.1
349	0.11
350	0.18
351	0.19
352	0.21
353	0.23
354	0.26
355	0.26
356	0.3
357	0.38
358	0.38
359	0.47
360	0.47
361	0.52
362	0.53
363	0.55
364	0.61
365	0.52
366	0.46
367	0.43
368	0.44
369	0.37
370	0.33
371	0.32
372	0.2
373	0.19
374	0.17
375	0.1
376	0.07
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.09
381	0.09
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.07
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.09
393	0.09
394	0.09
395	0.09
396	0.08
397	0.07
398	0.08
399	0.11
400	0.1
401	0.09
402	0.1
403	0.11
404	0.11
405	0.11
406	0.11
407	0.09
408	0.09
409	0.1
410	0.08
411	0.07
412	0.07
413	0.09
414	0.07
415	0.06
416	0.08
417	0.08
418	0.08
419	0.09
420	0.09
421	0.07
422	0.09
423	0.09
424	0.07
425	0.07
426	0.08
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.03
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.04
444	0.03
445	0.03
446	0.04
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.06
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.09
457	0.1
458	0.1
459	0.16
460	0.22
461	0.26
462	0.29
463	0.34
464	0.38
465	0.4
466	0.45
467	0.41
468	0.41
469	0.46
470	0.52
471	0.51
472	0.51
473	0.49
474	0.45
475	0.46
476	0.4
477	0.34
478	0.31
479	0.35
480	0.33
481	0.33
482	0.34
483	0.32
484	0.31
485	0.31
486	0.27
487	0.21
488	0.23
489	0.22
490	0.2
491	0.2
492	0.2
493	0.24
494	0.32
495	0.32
496	0.29
497	0.29
498	0.29
499	0.28
500	0.29
501	0.3
502	0.21
503	0.23
504	0.26
505	0.25
506	0.24
507	0.25
508	0.23
509	0.16
510	0.15
511	0.13
512	0.13
513	0.14
514	0.15
515	0.18
516	0.19
517	0.19
518	0.24
519	0.24
520	0.21
521	0.26
522	0.27
523	0.24
524	0.24
525	0.23
526	0.19
527	0.18
528	0.17
529	0.1
530	0.09
531	0.09
532	0.08
533	0.09
534	0.08
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.11
539	0.12
540	0.13
541	0.17
542	0.2
543	0.27
544	0.34
545	0.39
546	0.4
547	0.41
548	0.4
549	0.37
550	0.35
551	0.28
552	0.24
553	0.22
554	0.2
555	0.17
556	0.16
557	0.16
558	0.15
559	0.13
560	0.09
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.14
566	0.15
567	0.17
568	0.17
569	0.16
570	0.2
571	0.25
572	0.26
573	0.24
574	0.23
575	0.23
576	0.23
577	0.25
578	0.21
579	0.18
580	0.18
581	0.15
582	0.15
583	0.13
584	0.15
585	0.19
586	0.19
587	0.18
588	0.18
589	0.19
590	0.19
591	0.19
592	0.17
593	0.11
594	0.1
595	0.11
596	0.11
597	0.11
598	0.15
599	0.15
600	0.16
601	0.17
602	0.16
603	0.17
604	0.19
605	0.21
606	0.16
607	0.17
608	0.16
609	0.17
610	0.17
611	0.16
612	0.2
613	0.18
614	0.25
615	0.25
616	0.28
617	0.27
618	0.32
619	0.34
620	0.34
621	0.38
622	0.32
623	0.3
624	0.28
625	0.27
626	0.21
627	0.17
628	0.1
629	0.05
630	0.04
631	0.06
632	0.06
633	0.06
634	0.06
635	0.06
636	0.08
637	0.1
638	0.11
639	0.09
640	0.1
641	0.11
642	0.14
643	0.15
644	0.12
645	0.11
646	0.12
647	0.14
648	0.13
649	0.15
650	0.14
651	0.18
652	0.21
653	0.22
654	0.22
655	0.29
656	0.35
657	0.33
658	0.39
659	0.4
660	0.37
661	0.39
662	0.39
663	0.34
664	0.31
665	0.33
666	0.29
667	0.25
668	0.25
669	0.22
670	0.21
671	0.18
672	0.15
673	0.12
674	0.08
675	0.06
676	0.05
677	0.05
678	0.05
679	0.05
680	0.04
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.04
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.07
692	0.06
693	0.08
694	0.06
695	0.07
696	0.06
697	0.06
698	0.08
699	0.08
700	0.09
701	0.08
702	0.08
703	0.07
704	0.08
705	0.07
706	0.06
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.06
711	0.06
712	0.07
713	0.07
714	0.07
715	0.08
716	0.09
717	0.12
718	0.18
719	0.19
720	0.23
721	0.24
722	0.25
723	0.3
724	0.34
725	0.36
726	0.39
727	0.4
728	0.37
729	0.41
730	0.4
731	0.35
732	0.3
733	0.25
734	0.18
735	0.15
736	0.15
737	0.09
738	0.09
739	0.09
740	0.08
741	0.09
742	0.11
743	0.11
744	0.11
745	0.12
746	0.12
747	0.12
748	0.12
749	0.11
750	0.09
751	0.1
752	0.08
753	0.07
754	0.07
755	0.06
756	0.05
757	0.04
758	0.04
759	0.03
760	0.04
761	0.04
762	0.04
763	0.04
764	0.05
765	0.06
766	0.07
767	0.07
768	0.08
769	0.08
770	0.1
771	0.13
772	0.13
773	0.14
774	0.17
775	0.18
776	0.19
777	0.19
778	0.2
779	0.19
780	0.21
781	0.2
782	0.2
783	0.24
784	0.29
785	0.32
786	0.37
787	0.35
788	0.38
789	0.38
790	0.36
791	0.32
792	0.25
793	0.22
794	0.15
795	0.13
796	0.09
797	0.07
798	0.06
799	0.05
800	0.06
801	0.06
802	0.07
803	0.09
804	0.11
805	0.13
806	0.14
807	0.14
808	0.14
809	0.16
810	0.18
811	0.17
812	0.2
813	0.19
814	0.2
815	0.21
816	0.2
817	0.19
818	0.17
819	0.16
820	0.13
821	0.14
822	0.13
823	0.13
824	0.15
825	0.15
826	0.16
827	0.18
828	0.18
829	0.15
830	0.19
831	0.2
832	0.22
833	0.26
834	0.24
835	0.23
836	0.26
837	0.27
838	0.23
839	0.25
840	0.23
841	0.22
842	0.3
843	0.29
844	0.27
845	0.26
846	0.25
847	0.22
848	0.21
849	0.19
850	0.12
851	0.11
852	0.1
853	0.09
854	0.08
855	0.12
856	0.16
857	0.18
858	0.19
859	0.22
860	0.25
861	0.28
862	0.28
863	0.29
864	0.29
865	0.27
866	0.24
867	0.22
868	0.19
869	0.17
870	0.18
871	0.15
872	0.12
873	0.1
874	0.11
875	0.13
876	0.13
877	0.16
878	0.2
879	0.29
880	0.36
881	0.43
882	0.47
883	0.48
884	0.55
885	0.57
886	0.59
887	0.55
888	0.56
889	0.55
890	0.55
891	0.56
892	0.5
893	0.47
894	0.4
895	0.35
896	0.29
897	0.24
898	0.19
899	0.16
900	0.14
901	0.12
902	0.12
903	0.11
904	0.09
905	0.1
906	0.1
907	0.14
908	0.15
909	0.15
910	0.2
911	0.24
912	0.23
913	0.22
914	0.22
915	0.22
916	0.23
917	0.27
918	0.27
919	0.29
920	0.29
921	0.35
922	0.35
923	0.35
924	0.34
925	0.33
926	0.29
927	0.26
928	0.28
929	0.24
930	0.24
931	0.2
932	0.19
933	0.15
934	0.13
935	0.12
936	0.15
937	0.17
938	0.18
939	0.24
940	0.29
941	0.37
942	0.46
943	0.52
944	0.53
945	0.51
946	0.52
947	0.52
948	0.48
949	0.46
950	0.39
951	0.32
952	0.27
953	0.33
954	0.3
955	0.24
956	0.25
957	0.2
958	0.21
959	0.2
960	0.21
961	0.14
962	0.15
963	0.17
964	0.14
965	0.15
966	0.12
967	0.15
968	0.16
969	0.16
970	0.16
971	0.17
972	0.21
973	0.22
974	0.23
975	0.24
976	0.28
977	0.32
978	0.39
979	0.42
980	0.39
981	0.44
982	0.51
983	0.56
984	0.59
985	0.63
986	0.62
987	0.63
988	0.63
989	0.58
990	0.55
991	0.46
992	0.38
993	0.31
994	0.24
995	0.2
996	0.19
997	0.2
998	0.16
999	0.17
1000	0.16
1001	0.14
1002	0.15
1003	0.13
1004	0.13
1005	0.12
1006	0.13
1007	0.15
1008	0.14
1009	0.15
1010	0.14
1011	0.16
1012	0.15
1013	0.14
1014	0.17
1015	0.16
1016	0.16
1017	0.2
1018	0.22
1019	0.22
1020	0.29
1021	0.35
1022	0.4
1023	0.4
1024	0.42
1025	0.47
1026	0.51
1027	0.59
1028	0.61
1029	0.6
1030	0.55
1031	0.6
1032	0.58
1033	0.54
1034	0.54
1035	0.5
1036	0.49
1037	0.5
1038	0.47
1039	0.42
1040	0.44
1041	0.39
1042	0.39
1043	0.4
1044	0.33
1045	0.33
1046	0.35
1047	0.4
1048	0.39
1049	0.43
1050	0.4
1051	0.33
1052	0.35
1053	0.33
1054	0.35
1055	0.3
1056	0.29
1057	0.29
1058	0.28
1059	0.26
1060	0.27
1061	0.24
1062	0.19
1063	0.19
1064	0.22
1065	0.23
1066	0.23
1067	0.24
1068	0.21
1069	0.23
1070	0.23
1071	0.24
1072	0.22
1073	0.2
1074	0.22
1075	0.21
1076	0.23
1077	0.2
1078	0.2
1079	0.18
1080	0.16
1081	0.16
1082	0.19
1083	0.23
1084	0.21
1085	0.23
1086	0.24
1087	0.26
1088	0.25
1089	0.26
1090	0.25
1091	0.2
1092	0.23
1093	0.21
1094	0.21
1095	0.19
1096	0.18
1097	0.16
1098	0.14
1099	0.14
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.13
1103	0.14
1104	0.16
1105	0.18
1106	0.19
1107	0.2
1108	0.22
1109	0.22
1110	0.23
1111	0.25
1112	0.25
1113	0.24
1114	0.22
1115	0.22
1116	0.17
1117	0.17
1118	0.16
1119	0.13
1120	0.11
1121	0.09
1122	0.07
1123	0.07
1124	0.07
1125	0.06
1126	0.05
1127	0.04
1128	0.04
1129	0.05
1130	0.04
1131	0.04
1132	0.05
1133	0.06
1134	0.06
1135	0.06
1136	0.06
1137	0.06
1138	0.06
1139	0.06
1140	0.06
1141	0.04
1142	0.04
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.06
1147	0.05
1148	0.08
1149	0.08
1150	0.12
1151	0.14
1152	0.15
1153	0.15
1154	0.16
1155	0.18
1156	0.18
1157	0.18
1158	0.15
1159	0.13
1160	0.13
1161	0.16
1162	0.15
1163	0.13
1164	0.13
1165	0.13
1166	0.14
1167	0.17
1168	0.17
1169	0.17
1170	0.19
1171	0.21
1172	0.21
1173	0.23
1174	0.24
1175	0.24
1176	0.27
1177	0.26
1178	0.32
1179	0.38
1180	0.39
1181	0.37
1182	0.36
1183	0.36
1184	0.32
1185	0.35
1186	0.31
1187	0.25
1188	0.22
1189	0.22
1190	0.21
1191	0.19
1192	0.19
1193	0.14
1194	0.14
1195	0.15
1196	0.17
1197	0.17
1198	0.19
1199	0.18
1200	0.19
1201	0.25
1202	0.23
1203	0.24
1204	0.23
1205	0.26
1206	0.23
1207	0.23
1208	0.22
1209	0.16
1210	0.14
1211	0.1
1212	0.11
1213	0.17
1214	0.22
1215	0.23
1216	0.26
1217	0.26
1218	0.28
1219	0.28
1220	0.28
1221	0.21
1222	0.17
1223	0.16
1224	0.13
1225	0.14
1226	0.12
1227	0.11
1228	0.12
1229	0.1
1230	0.09
1231	0.1
1232	0.1
1233	0.11
1234	0.16
1235	0.17
1236	0.19
1237	0.24
1238	0.29
1239	0.35
1240	0.38
1241	0.38
1242	0.36
1243	0.39
1244	0.43
1245	0.44
1246	0.42
1247	0.37
1248	0.36
1249	0.38
1250	0.4
1251	0.36
1252	0.28
1253	0.26
1254	0.29
1255	0.27
1256	0.26
1257	0.24
1258	0.24
1259	0.3
1260	0.31
1261	0.29
1262	0.26
1263	0.34
1264	0.39
1265	0.4
1266	0.39
1267	0.37
1268	0.37
1269	0.44
1270	0.43
1271	0.39

R0IB24

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer