Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0J5F7

Protein Details
Accession R0J5F7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
150-177VDGEAEAERRRKKKKKKRDGGDDASTVRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
134-147DAKMARAKKKAGEA
154-167AEAERRRKKKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MTEPRMRLRQKGQQFPTQDLEAFLLAFGDNDYPLPETVRVLDEIITDYIIETCHEAASVAHHARRAKIKLDDFKFMLRRDTGKLGRVSEMLETDKELKRKRKAFDTDEGAVLADRDRDRERERERERDGADAGDAKMARAKKKAGEAESVDGEAEAERRRKKKKKKRDGGDDASTVRSG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.69
2 0.67
3 0.63
4 0.56
5 0.46
6 0.37
7 0.33
8 0.25
9 0.21
10 0.15
11 0.1
12 0.08
13 0.07
14 0.07
15 0.06
16 0.05
17 0.06
18 0.07
19 0.08
20 0.08
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.12
28 0.12
29 0.11
30 0.12
31 0.12
32 0.1
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.08
45 0.13
46 0.14
47 0.15
48 0.18
49 0.2
50 0.23
51 0.3
52 0.29
53 0.29
54 0.34
55 0.4
56 0.45
57 0.47
58 0.48
59 0.42
60 0.45
61 0.44
62 0.38
63 0.34
64 0.27
65 0.26
66 0.25
67 0.3
68 0.27
69 0.28
70 0.29
71 0.28
72 0.27
73 0.25
74 0.23
75 0.17
76 0.16
77 0.12
78 0.1
79 0.1
80 0.13
81 0.15
82 0.2
83 0.25
84 0.32
85 0.39
86 0.46
87 0.48
88 0.54
89 0.59
90 0.59
91 0.61
92 0.59
93 0.52
94 0.46
95 0.42
96 0.33
97 0.25
98 0.2
99 0.13
100 0.1
101 0.08
102 0.11
103 0.13
104 0.18
105 0.21
106 0.3
107 0.36
108 0.43
109 0.49
110 0.55
111 0.57
112 0.6
113 0.57
114 0.51
115 0.46
116 0.36
117 0.31
118 0.24
119 0.2
120 0.16
121 0.15
122 0.12
123 0.15
124 0.18
125 0.21
126 0.22
127 0.25
128 0.27
129 0.35
130 0.42
131 0.41
132 0.44
133 0.44
134 0.44
135 0.43
136 0.39
137 0.3
138 0.23
139 0.2
140 0.14
141 0.13
142 0.14
143 0.2
144 0.27
145 0.35
146 0.47
147 0.57
148 0.68
149 0.77
150 0.83
151 0.88
152 0.92
153 0.95
154 0.95
155 0.95
156 0.93
157 0.89
158 0.83
159 0.74