Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DFP4

Protein Details
Accession B0DFP4    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
225-244EPKTQQTSTKAKRKERPSSDHydrophilic
335-358TCEYPKESRRGQHKRSPKGKAGHRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-294RRSAPAPVKQKVASVPPPRQSTAPPPKPHIPKKD
342-358SRRGQHKRSPKGKAGHR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_299937  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00463  ZN2_CY6_FUNGAL_1  
PS50048  ZN2_CY6_FUNGAL_2  
CDD cd00067  GAL4  
Amino Acid Sequences MSNLYGSSYQDSFQPTFSPATRDENRRSFLDLNQPLTAMGRRQPNHIQTPAPNLYLPQPTFSPTYDPATQNFQVASHQEFDRSEDIHVPHDEGDRFRSQQPAGGIAYYVSDTFCETPLAHGDDWDFSSPPVSDPSTCGSFQYYNSAEGSVEWQTYEIPCEDQLAYDAFGQPHYSAVNLLPYRSQHPPISPTQHSSYSELSANVLFLSELSRAESKISKTPITPSEPKTQQTSTKAKRKERPSSDSDLDMDFKPHFPSSSRRRSAPAPVKQKVASVPPPRQSTAPPPKPHIPKKDGGQKRLSLACLFCRERKIACGRPSEDEPDQTCAQCLRRDLTCEYPKESRRGQHKRSPKGKAGHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.21
3 0.25
4 0.26
5 0.28
6 0.25
7 0.33
8 0.4
9 0.46
10 0.52
11 0.55
12 0.57
13 0.55
14 0.58
15 0.51
16 0.49
17 0.52
18 0.49
19 0.46
20 0.42
21 0.4
22 0.35
23 0.34
24 0.32
25 0.24
26 0.23
27 0.28
28 0.29
29 0.35
30 0.44
31 0.49
32 0.54
33 0.55
34 0.54
35 0.48
36 0.56
37 0.53
38 0.46
39 0.39
40 0.32
41 0.33
42 0.36
43 0.33
44 0.27
45 0.24
46 0.25
47 0.28
48 0.27
49 0.28
50 0.23
51 0.28
52 0.31
53 0.32
54 0.31
55 0.36
56 0.35
57 0.32
58 0.29
59 0.24
60 0.21
61 0.22
62 0.22
63 0.18
64 0.18
65 0.19
66 0.19
67 0.22
68 0.22
69 0.21
70 0.19
71 0.21
72 0.22
73 0.23
74 0.24
75 0.21
76 0.2
77 0.23
78 0.24
79 0.2
80 0.24
81 0.23
82 0.25
83 0.26
84 0.29
85 0.25
86 0.27
87 0.27
88 0.25
89 0.22
90 0.2
91 0.18
92 0.13
93 0.14
94 0.1
95 0.09
96 0.06
97 0.05
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.08
103 0.09
104 0.13
105 0.16
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.12
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.17
128 0.21
129 0.19
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.15
134 0.14
135 0.15
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.08
151 0.09
152 0.08
153 0.1
154 0.08
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.06
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.16
169 0.18
170 0.21
171 0.17
172 0.18
173 0.22
174 0.25
175 0.31
176 0.29
177 0.3
178 0.3
179 0.32
180 0.32
181 0.31
182 0.28
183 0.23
184 0.23
185 0.19
186 0.17
187 0.13
188 0.12
189 0.08
190 0.07
191 0.05
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.07
197 0.08
198 0.08
199 0.1
200 0.13
201 0.14
202 0.19
203 0.22
204 0.21
205 0.22
206 0.26
207 0.29
208 0.33
209 0.37
210 0.36
211 0.42
212 0.45
213 0.46
214 0.46
215 0.44
216 0.43
217 0.45
218 0.51
219 0.51
220 0.56
221 0.63
222 0.68
223 0.73
224 0.77
225 0.8
226 0.78
227 0.76
228 0.73
229 0.73
230 0.66
231 0.6
232 0.51
233 0.42
234 0.36
235 0.29
236 0.25
237 0.17
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.24
244 0.32
245 0.42
246 0.45
247 0.45
248 0.48
249 0.51
250 0.59
251 0.6
252 0.6
253 0.59
254 0.58
255 0.61
256 0.58
257 0.57
258 0.49
259 0.46
260 0.46
261 0.44
262 0.49
263 0.51
264 0.55
265 0.54
266 0.52
267 0.49
268 0.51
269 0.54
270 0.55
271 0.53
272 0.56
273 0.63
274 0.72
275 0.77
276 0.76
277 0.71
278 0.69
279 0.73
280 0.77
281 0.76
282 0.73
283 0.71
284 0.65
285 0.64
286 0.61
287 0.54
288 0.47
289 0.41
290 0.4
291 0.41
292 0.42
293 0.4
294 0.41
295 0.42
296 0.4
297 0.46
298 0.49
299 0.49
300 0.52
301 0.57
302 0.56
303 0.59
304 0.61
305 0.6
306 0.54
307 0.52
308 0.47
309 0.44
310 0.43
311 0.37
312 0.35
313 0.32
314 0.33
315 0.31
316 0.32
317 0.3
318 0.31
319 0.36
320 0.39
321 0.45
322 0.49
323 0.49
324 0.51
325 0.56
326 0.58
327 0.6
328 0.62
329 0.6
330 0.63
331 0.7
332 0.73
333 0.74
334 0.79
335 0.83
336 0.87
337 0.87
338 0.85