Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IMP9

Protein Details
Accession R0IMP9    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-145EAGYRKTKPTRKPGLTQEMRSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 17.5, cyto_mito 10.833, nucl 4.5, cyto_nucl 4.333, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR002492  Transposase_Tc1-like  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006313  P:DNA transposition  
Pfam View protein in Pfam  
PF13384  HTH_23  
PF01498  HTH_Tnp_Tc3_2  
Amino Acid Sequences MSPNTDPYTRTLIVALKSPSVGKSTSQISELTDVHPRTVNRIYSRAIEAGFEPNVLPLKILPEHVQDAPRSGRPSKQTDKVKEQIIQQVRRDRYGREKSCADVAGALSLQGVNISRTTVWRVLREAGYRKTKPTRKPGLTQEMRSARLKWALDHKD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.28
3 0.22
4 0.23
5 0.23
6 0.22
7 0.2
8 0.2
9 0.15
10 0.18
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.2
16 0.23
17 0.22
18 0.2
19 0.23
20 0.22
21 0.23
22 0.26
23 0.24
24 0.26
25 0.31
26 0.35
27 0.31
28 0.34
29 0.35
30 0.33
31 0.35
32 0.31
33 0.26
34 0.21
35 0.18
36 0.18
37 0.16
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.07
45 0.1
46 0.1
47 0.12
48 0.12
49 0.13
50 0.16
51 0.17
52 0.19
53 0.16
54 0.18
55 0.19
56 0.2
57 0.21
58 0.2
59 0.23
60 0.26
61 0.33
62 0.36
63 0.43
64 0.48
65 0.51
66 0.57
67 0.57
68 0.55
69 0.5
70 0.47
71 0.47
72 0.46
73 0.45
74 0.43
75 0.47
76 0.45
77 0.46
78 0.45
79 0.4
80 0.43
81 0.49
82 0.48
83 0.45
84 0.45
85 0.42
86 0.44
87 0.41
88 0.31
89 0.21
90 0.18
91 0.14
92 0.12
93 0.1
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.06
102 0.07
103 0.08
104 0.13
105 0.17
106 0.2
107 0.21
108 0.24
109 0.27
110 0.31
111 0.36
112 0.38
113 0.42
114 0.48
115 0.48
116 0.53
117 0.6
118 0.64
119 0.67
120 0.71
121 0.73
122 0.71
123 0.77
124 0.79
125 0.8
126 0.8
127 0.75
128 0.74
129 0.7
130 0.67
131 0.62
132 0.54
133 0.47
134 0.46
135 0.43
136 0.39