FuNGI

B0D368

Protein Details

Accession

B0D368

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
933-956	ILASCNNKRMRRDRIERVKVHSGV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8, cyto 8, mito 6, plas 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_315790 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MTQSLVCNRQRPPDLPTHDKFSDICFDLLYPPTFQETDNNSGSWRLTSLEPSHQVISPYAYQLRLLLWSGGRNDVMKDFVEMCRTAGLTSNITLVQLYRDVQVQAFRSKLFSRELMHRYENTLRRVKFPWPVTFQLASLLYNGVLHTNEILDLLPSVQEVYEAHLSDTGDLLKQFHDALLQKAERQSPKACFQEILQKFKPRKARGFNASLISAAHVTITPTRMLLEGPLPTQSNNAIRKYKGCDDNFIRVDFRDEDRSSYKRNQDVDDMSVLRERVGDVLKQGIMIAGRHFQFLAYSTSSLREHAVWFMSSFESGGEMITPQKVVRDLGDFSALAQQPSKYAARIAQKFSATDPSVHIHGHEWERVDDIEYIEERTIRNDDGDIETRKTVHCFTDGVGTISESLGQEIFETLRNNEGRLEEKAPLPSAYQIRFMGSKGVVVVDKQLDKNSSGIRMRLRPSMIKFPSLAQSEPLEISEAFRYPKLCYLNRPLVMFLEDLGVRLQTFLDLQNAAIAEAQTIDDSLEQFRSIMETHRGGLGKSFDFPDILKHFEDDGFDLHSQDGRPGIDNQFIKQLRNVARIEVLREIKHSARIKIPDSYLLVGVADEGPAYRKDGYQNVYELPEGHIYACVQKAGDKEPTWLSGSCSISRSPVAHPGDVQRVRCIGKPPEDKLCLFSHLVNVVVLPSVGKRSLASCLGGGDLDGDIYSVIMLEPLLPTQMVVPASYDSLPPRALPPGQSIEEAVCDFIVEYIHSDVLGLLSNRLLVIADQSKEGVFDQDCEHLAVLCSQAVDYPKQGNPVDLSGGALPHPLIRCKPDWQSAEINAPRQTDYYKSTRALGVMFRDHRLEVDGPLPEMEQRDRSAEPLLSDPISLAYKDRVQRHIGTAIEPSEHEFVTTLFQRYVAELSYICAIHTLSNSRTIRLREEEVVAGTILASCNNKRMRRDRIERVKVHSGVIVKEIRQDLVAPGYHDSEKLTPDARLAGQLLTLERAWQAWVFSLKLGNEFGANSFGLIALGSIFDCLDRLEGKKGQSLDTVIEEEDTERLDFDAF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.6
2	0.63
3	0.63
4	0.62
5	0.56
6	0.56
7	0.5
8	0.44
9	0.43
10	0.36
11	0.32
12	0.24
13	0.24
14	0.25
15	0.29
16	0.27
17	0.2
18	0.19
19	0.23
20	0.23
21	0.22
22	0.27
23	0.29
24	0.33
25	0.34
26	0.33
27	0.3
28	0.31
29	0.32
30	0.25
31	0.19
32	0.15
33	0.15
34	0.21
35	0.24
36	0.31
37	0.34
38	0.36
39	0.37
40	0.37
41	0.37
42	0.32
43	0.32
44	0.26
45	0.27
46	0.26
47	0.24
48	0.23
49	0.22
50	0.22
51	0.2
52	0.19
53	0.17
54	0.17
55	0.2
56	0.22
57	0.24
58	0.24
59	0.23
60	0.23
61	0.22
62	0.22
63	0.19
64	0.19
65	0.19
66	0.19
67	0.23
68	0.21
69	0.2
70	0.2
71	0.2
72	0.18
73	0.2
74	0.21
75	0.19
76	0.19
77	0.2
78	0.18
79	0.18
80	0.18
81	0.13
82	0.12
83	0.13
84	0.13
85	0.12
86	0.15
87	0.15
88	0.17
89	0.21
90	0.23
91	0.25
92	0.26
93	0.25
94	0.27
95	0.28
96	0.3
97	0.3
98	0.3
99	0.3
100	0.38
101	0.41
102	0.43
103	0.46
104	0.44
105	0.46
106	0.51
107	0.53
108	0.51
109	0.56
110	0.51
111	0.52
112	0.53
113	0.53
114	0.53
115	0.53
116	0.54
117	0.52
118	0.55
119	0.56
120	0.53
121	0.47
122	0.43
123	0.37
124	0.29
125	0.23
126	0.19
127	0.14
128	0.13
129	0.13
130	0.1
131	0.09
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.05
145	0.06
146	0.06
147	0.1
148	0.14
149	0.14
150	0.14
151	0.16
152	0.17
153	0.16
154	0.17
155	0.14
156	0.11
157	0.11
158	0.12
159	0.1
160	0.11
161	0.11
162	0.1
163	0.14
164	0.14
165	0.17
166	0.24
167	0.25
168	0.27
169	0.31
170	0.38
171	0.36
172	0.39
173	0.42
174	0.4
175	0.47
176	0.49
177	0.46
178	0.4
179	0.38
180	0.44
181	0.44
182	0.47
183	0.45
184	0.49
185	0.51
186	0.56
187	0.65
188	0.62
189	0.66
190	0.67
191	0.7
192	0.7
193	0.73
194	0.71
195	0.64
196	0.56
197	0.47
198	0.38
199	0.29
200	0.21
201	0.15
202	0.11
203	0.07
204	0.09
205	0.1
206	0.12
207	0.11
208	0.1
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.12
214	0.12
215	0.12
216	0.15
217	0.15
218	0.15
219	0.16
220	0.18
221	0.23
222	0.27
223	0.32
224	0.34
225	0.35
226	0.39
227	0.45
228	0.49
229	0.51
230	0.47
231	0.5
232	0.51
233	0.59
234	0.57
235	0.52
236	0.45
237	0.36
238	0.38
239	0.32
240	0.3
241	0.28
242	0.27
243	0.3
244	0.34
245	0.37
246	0.38
247	0.43
248	0.47
249	0.45
250	0.48
251	0.46
252	0.47
253	0.47
254	0.43
255	0.4
256	0.34
257	0.28
258	0.27
259	0.24
260	0.18
261	0.16
262	0.13
263	0.12
264	0.13
265	0.12
266	0.11
267	0.14
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.11
272	0.1
273	0.1
274	0.11
275	0.13
276	0.13
277	0.13
278	0.13
279	0.12
280	0.12
281	0.13
282	0.15
283	0.12
284	0.13
285	0.13
286	0.16
287	0.17
288	0.17
289	0.17
290	0.14
291	0.13
292	0.14
293	0.15
294	0.13
295	0.12
296	0.13
297	0.12
298	0.11
299	0.1
300	0.08
301	0.07
302	0.07
303	0.06
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.08
311	0.09
312	0.1
313	0.11
314	0.13
315	0.13
316	0.14
317	0.16
318	0.14
319	0.13
320	0.2
321	0.19
322	0.16
323	0.16
324	0.15
325	0.14
326	0.18
327	0.18
328	0.11
329	0.12
330	0.17
331	0.25
332	0.3
333	0.33
334	0.34
335	0.34
336	0.34
337	0.34
338	0.36
339	0.28
340	0.24
341	0.23
342	0.2
343	0.21
344	0.2
345	0.19
346	0.14
347	0.17
348	0.19
349	0.18
350	0.18
351	0.16
352	0.18
353	0.17
354	0.18
355	0.14
356	0.12
357	0.12
358	0.11
359	0.12
360	0.11
361	0.12
362	0.1
363	0.11
364	0.13
365	0.11
366	0.11
367	0.1
368	0.12
369	0.15
370	0.19
371	0.2
372	0.2
373	0.2
374	0.2
375	0.21
376	0.21
377	0.18
378	0.15
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.18
383	0.18
384	0.18
385	0.16
386	0.15
387	0.14
388	0.13
389	0.13
390	0.07
391	0.07
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.08
398	0.09
399	0.09
400	0.14
401	0.15
402	0.15
403	0.16
404	0.17
405	0.17
406	0.19
407	0.21
408	0.17
409	0.19
410	0.2
411	0.19
412	0.18
413	0.16
414	0.17
415	0.19
416	0.18
417	0.2
418	0.19
419	0.19
420	0.19
421	0.19
422	0.18
423	0.14
424	0.13
425	0.1
426	0.11
427	0.1
428	0.09
429	0.11
430	0.1
431	0.12
432	0.12
433	0.14
434	0.14
435	0.14
436	0.17
437	0.16
438	0.19
439	0.19
440	0.21
441	0.24
442	0.27
443	0.29
444	0.3
445	0.31
446	0.3
447	0.33
448	0.39
449	0.37
450	0.34
451	0.32
452	0.29
453	0.33
454	0.3
455	0.27
456	0.18
457	0.18
458	0.17
459	0.17
460	0.15
461	0.11
462	0.09
463	0.1
464	0.09
465	0.09
466	0.09
467	0.1
468	0.11
469	0.11
470	0.15
471	0.2
472	0.2
473	0.24
474	0.3
475	0.37
476	0.37
477	0.37
478	0.33
479	0.28
480	0.28
481	0.23
482	0.16
483	0.1
484	0.08
485	0.08
486	0.08
487	0.07
488	0.06
489	0.06
490	0.05
491	0.04
492	0.05
493	0.05
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.06
501	0.06
502	0.04
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.04
509	0.04
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.06
516	0.06
517	0.08
518	0.1
519	0.11
520	0.11
521	0.14
522	0.14
523	0.13
524	0.14
525	0.15
526	0.12
527	0.12
528	0.13
529	0.1
530	0.11
531	0.11
532	0.14
533	0.14
534	0.16
535	0.15
536	0.14
537	0.15
538	0.15
539	0.15
540	0.11
541	0.1
542	0.1
543	0.1
544	0.1
545	0.09
546	0.1
547	0.1
548	0.09
549	0.1
550	0.08
551	0.09
552	0.11
553	0.12
554	0.17
555	0.17
556	0.17
557	0.24
558	0.24
559	0.24
560	0.22
561	0.28
562	0.26
563	0.31
564	0.31
565	0.23
566	0.26
567	0.26
568	0.27
569	0.25
570	0.24
571	0.19
572	0.2
573	0.22
574	0.19
575	0.26
576	0.28
577	0.25
578	0.27
579	0.31
580	0.32
581	0.32
582	0.32
583	0.27
584	0.25
585	0.24
586	0.19
587	0.15
588	0.13
589	0.09
590	0.09
591	0.06
592	0.05
593	0.03
594	0.03
595	0.05
596	0.05
597	0.07
598	0.07
599	0.08
600	0.11
601	0.16
602	0.18
603	0.19
604	0.2
605	0.2
606	0.2
607	0.19
608	0.17
609	0.15
610	0.13
611	0.11
612	0.1
613	0.1
614	0.09
615	0.11
616	0.1
617	0.09
618	0.08
619	0.1
620	0.11
621	0.14
622	0.19
623	0.17
624	0.2
625	0.2
626	0.22
627	0.22
628	0.21
629	0.2
630	0.21
631	0.23
632	0.22
633	0.22
634	0.21
635	0.2
636	0.21
637	0.21
638	0.16
639	0.22
640	0.23
641	0.22
642	0.23
643	0.25
644	0.33
645	0.34
646	0.34
647	0.27
648	0.28
649	0.29
650	0.3
651	0.33
652	0.28
653	0.35
654	0.4
655	0.42
656	0.47
657	0.48
658	0.46
659	0.44
660	0.4
661	0.34
662	0.28
663	0.25
664	0.2
665	0.17
666	0.17
667	0.14
668	0.12
669	0.09
670	0.08
671	0.07
672	0.05
673	0.05
674	0.06
675	0.06
676	0.07
677	0.07
678	0.08
679	0.11
680	0.12
681	0.13
682	0.11
683	0.12
684	0.11
685	0.11
686	0.1
687	0.07
688	0.05
689	0.05
690	0.04
691	0.04
692	0.03
693	0.03
694	0.03
695	0.03
696	0.02
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.03
701	0.04
702	0.04
703	0.04
704	0.04
705	0.05
706	0.07
707	0.07
708	0.07
709	0.08
710	0.08
711	0.1
712	0.1
713	0.11
714	0.1
715	0.12
716	0.12
717	0.12
718	0.13
719	0.15
720	0.16
721	0.16
722	0.19
723	0.22
724	0.23
725	0.23
726	0.22
727	0.19
728	0.19
729	0.18
730	0.13
731	0.08
732	0.07
733	0.06
734	0.06
735	0.06
736	0.04
737	0.06
738	0.07
739	0.07
740	0.07
741	0.07
742	0.06
743	0.06
744	0.08
745	0.07
746	0.06
747	0.07
748	0.07
749	0.07
750	0.07
751	0.06
752	0.04
753	0.09
754	0.12
755	0.13
756	0.13
757	0.14
758	0.13
759	0.14
760	0.14
761	0.13
762	0.1
763	0.11
764	0.12
765	0.14
766	0.15
767	0.15
768	0.15
769	0.12
770	0.12
771	0.11
772	0.1
773	0.08
774	0.08
775	0.07
776	0.09
777	0.11
778	0.12
779	0.13
780	0.17
781	0.18
782	0.24
783	0.24
784	0.24
785	0.24
786	0.24
787	0.23
788	0.18
789	0.18
790	0.13
791	0.13
792	0.11
793	0.1
794	0.08
795	0.1
796	0.12
797	0.13
798	0.15
799	0.19
800	0.22
801	0.27
802	0.33
803	0.38
804	0.39
805	0.41
806	0.44
807	0.43
808	0.49
809	0.47
810	0.45
811	0.4
812	0.39
813	0.35
814	0.31
815	0.3
816	0.24
817	0.27
818	0.28
819	0.3
820	0.3
821	0.32
822	0.32
823	0.31
824	0.29
825	0.27
826	0.26
827	0.29
828	0.3
829	0.29
830	0.3
831	0.29
832	0.27
833	0.27
834	0.24
835	0.18
836	0.19
837	0.18
838	0.17
839	0.17
840	0.17
841	0.15
842	0.17
843	0.17
844	0.17
845	0.17
846	0.2
847	0.2
848	0.22
849	0.24
850	0.22
851	0.21
852	0.21
853	0.22
854	0.19
855	0.18
856	0.17
857	0.16
858	0.15
859	0.14
860	0.13
861	0.14
862	0.2
863	0.26
864	0.31
865	0.33
866	0.37
867	0.4
868	0.43
869	0.45
870	0.4
871	0.35
872	0.33
873	0.3
874	0.26
875	0.23
876	0.22
877	0.18
878	0.17
879	0.16
880	0.13
881	0.12
882	0.16
883	0.19
884	0.18
885	0.16
886	0.17
887	0.17
888	0.18
889	0.19
890	0.14
891	0.13
892	0.11
893	0.12
894	0.14
895	0.14
896	0.12
897	0.12
898	0.11
899	0.12
900	0.14
901	0.18
902	0.16
903	0.26
904	0.27
905	0.28
906	0.33
907	0.34
908	0.37
909	0.38
910	0.41
911	0.35
912	0.37
913	0.36
914	0.32
915	0.31
916	0.24
917	0.19
918	0.14
919	0.12
920	0.09
921	0.1
922	0.12
923	0.12
924	0.2
925	0.28
926	0.34
927	0.42
928	0.51
929	0.59
930	0.66
931	0.75
932	0.79
933	0.82
934	0.87
935	0.84
936	0.83
937	0.82
938	0.72
939	0.64
940	0.56
941	0.48
942	0.39
943	0.39
944	0.35
945	0.26
946	0.3
947	0.3
948	0.27
949	0.25
950	0.24
951	0.2
952	0.22
953	0.23
954	0.19
955	0.19
956	0.22
957	0.22
958	0.22
959	0.23
960	0.2
961	0.2
962	0.22
963	0.22
964	0.19
965	0.2
966	0.23
967	0.21
968	0.21
969	0.2
970	0.17
971	0.16
972	0.17
973	0.17
974	0.16
975	0.15
976	0.13
977	0.13
978	0.13
979	0.13
980	0.13
981	0.12
982	0.14
983	0.17
984	0.17
985	0.18
986	0.22
987	0.21
988	0.22
989	0.23
990	0.19
991	0.17
992	0.17
993	0.17
994	0.15
995	0.14
996	0.12
997	0.11
998	0.1
999	0.09
1000	0.08
1001	0.07
1002	0.04
1003	0.05
1004	0.05
1005	0.05
1006	0.05
1007	0.05
1008	0.06
1009	0.06
1010	0.08
1011	0.11
1012	0.14
1013	0.2
1014	0.24
1015	0.27
1016	0.33
1017	0.34
1018	0.34
1019	0.35
1020	0.34
1021	0.3
1022	0.29
1023	0.29
1024	0.23
1025	0.22
1026	0.2
1027	0.17
1028	0.16
1029	0.15
1030	0.12
1031	0.1

B0D368

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer