Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KTZ5

Protein Details
Accession R0KTZ5    Localization Confidence High Confidence Score 18.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-148DKSVEVTKGKKRKREKKEKDPNAPKKPLTBasic
264-287KAPSPPAKTPRKRQKTTPATNGNSHydrophilic
321-344VAETPAKKDNKKKKEKAAPQPIAPHydrophilic
356-377EETGNKKKTKSGRTTRNTEADGHydrophilic
385-409EKAEKAEKAGKEKKRDRSKRKVDSTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-145KGKKRKREKKEKDPNAPKK
271-276KTPRKR
327-339KKDNKKKKEKAAP
361-365KKKTK
386-405KAEKAEKAGKEKKRDRSKRK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 9.5, mito 7, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MAPTTTTTTAAAAAASAAAAAISTTKKKEATGDRGTNDRATAYHHDQVIASLHNLQAGLIHVQHGITDLLTNYRKHCASVLGGEEGEIPPFNDVAAVAASVMEAGRNAVDETKQLVVPLDKSVEVTKGKKRKREKKEKDPNAPKKPLTAAFLYHQHARPIVKADLEAALPPGGQIEKNAVQIEVNKRWNELPEEEKEQWKASYRNSMEEYKAELAEYVANKGIKATELVEEDEASDDAEPDIEAEVGAADTEASSEDEEEAPAKAPSPPAKTPRKRQKTTPATNGNSAPVAIAPAGSGSTPVPLPSSRTTSQAPAPAVTAVAETPAKKDNKKKKEKAAPQPIAPAPAAANDEPAPEETGNKKKTKSGRTTRNTEADGDKENAAQEKAEKAEKAGKEKKRDRSKRKVDST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.05
4 0.03
5 0.03
6 0.03
7 0.03
8 0.05
9 0.08
10 0.13
11 0.15
12 0.19
13 0.21
14 0.22
15 0.31
16 0.39
17 0.45
18 0.52
19 0.57
20 0.56
21 0.61
22 0.62
23 0.55
24 0.46
25 0.38
26 0.28
27 0.26
28 0.31
29 0.32
30 0.34
31 0.33
32 0.33
33 0.32
34 0.33
35 0.3
36 0.23
37 0.18
38 0.15
39 0.15
40 0.15
41 0.14
42 0.13
43 0.11
44 0.11
45 0.12
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.09
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.14
57 0.18
58 0.19
59 0.2
60 0.26
61 0.26
62 0.26
63 0.27
64 0.24
65 0.24
66 0.26
67 0.27
68 0.23
69 0.23
70 0.22
71 0.22
72 0.18
73 0.16
74 0.11
75 0.09
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.06
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.06
96 0.07
97 0.08
98 0.1
99 0.12
100 0.12
101 0.11
102 0.13
103 0.13
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.12
108 0.13
109 0.14
110 0.17
111 0.2
112 0.23
113 0.3
114 0.39
115 0.44
116 0.52
117 0.62
118 0.69
119 0.76
120 0.83
121 0.85
122 0.87
123 0.92
124 0.94
125 0.94
126 0.95
127 0.94
128 0.93
129 0.89
130 0.78
131 0.7
132 0.64
133 0.56
134 0.47
135 0.38
136 0.3
137 0.26
138 0.31
139 0.3
140 0.3
141 0.28
142 0.26
143 0.27
144 0.25
145 0.23
146 0.23
147 0.22
148 0.18
149 0.17
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.09
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.18
169 0.24
170 0.26
171 0.29
172 0.27
173 0.28
174 0.29
175 0.3
176 0.28
177 0.25
178 0.22
179 0.21
180 0.27
181 0.27
182 0.29
183 0.28
184 0.26
185 0.24
186 0.24
187 0.23
188 0.19
189 0.27
190 0.26
191 0.29
192 0.31
193 0.32
194 0.29
195 0.27
196 0.28
197 0.2
198 0.19
199 0.15
200 0.12
201 0.1
202 0.12
203 0.11
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.07
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.02
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.11
253 0.16
254 0.22
255 0.27
256 0.35
257 0.46
258 0.54
259 0.64
260 0.72
261 0.77
262 0.75
263 0.79
264 0.81
265 0.81
266 0.82
267 0.82
268 0.8
269 0.73
270 0.73
271 0.65
272 0.55
273 0.44
274 0.35
275 0.25
276 0.15
277 0.12
278 0.08
279 0.06
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.07
289 0.09
290 0.09
291 0.14
292 0.16
293 0.23
294 0.23
295 0.27
296 0.29
297 0.3
298 0.33
299 0.34
300 0.32
301 0.26
302 0.26
303 0.22
304 0.2
305 0.17
306 0.14
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.12
312 0.19
313 0.23
314 0.29
315 0.4
316 0.48
317 0.58
318 0.69
319 0.76
320 0.8
321 0.86
322 0.91
323 0.92
324 0.92
325 0.88
326 0.8
327 0.79
328 0.69
329 0.62
330 0.51
331 0.41
332 0.29
333 0.25
334 0.26
335 0.17
336 0.19
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.18
341 0.18
342 0.14
343 0.18
344 0.22
345 0.31
346 0.38
347 0.41
348 0.42
349 0.46
350 0.56
351 0.62
352 0.67
353 0.68
354 0.72
355 0.77
356 0.82
357 0.83
358 0.81
359 0.73
360 0.66
361 0.6
362 0.52
363 0.48
364 0.43
365 0.35
366 0.29
367 0.29
368 0.28
369 0.24
370 0.22
371 0.19
372 0.21
373 0.24
374 0.28
375 0.26
376 0.27
377 0.35
378 0.39
379 0.47
380 0.52
381 0.56
382 0.63
383 0.72
384 0.79
385 0.82
386 0.88
387 0.88
388 0.9
389 0.93