Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IFN6

Protein Details
Accession R0IFN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-112AASSSSSRSRPKRSEPKRPEPRSYPAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
94-105SRPKRSEPKRPE
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MDDNLDIPEESMRHIEALLAKHPPHLIQRMFSQAIDSRRTSTASSFMSTSTASSAATSSSSSSWRSRLSMASAFSSSSTTSRASTAASSSSSRSRPKRSEPKRPEPRSYPAGLDPTRPVPAAMPSDTDSPLDLKIEPSSTPTDDISVASPVLFADDDKSQSQSGESYMFCTYCAEQKNTKTFKAKSDWKKHEMRMHETGQDWPCVVNGCSRIFDRQKDFIKHHQRYHTGRPLPSLTDIGISLLPRRVFGCGFDKCKEVSIGWDERCDHVAKHMKNGATADQWKYSNVIRNLIRQEALYDTWKELIACLDERLRESRSQISWCPDNTRILRQKLQCCDLRPSREEVLITALSLRSDVPLDPVHQQLPPGFVTPSRDSVPHVEKLSREQRMHILIGNSNPHAARARLATINAALLRASSSLSHVPDHDCASSPFLEPQSPAGDTTNQRISYMDVDPGDYLAVAQPAIPDLPPAMTTATMHTPNPHTPIMDHDHQAHMYSNEYIDQAKATPNPLGAMYPNYFGQPPQFEESQYYDRPSFGQIISKPLHKIGSRLNGSRSSSTHSRSPSNMSQAMSDMNTDYPVAALGMRHTPEQQQQQLSPHHQMQHHVQQQQTQQHMMHQQSQVYRHMAPQMHEHLHMYATHN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.16
3 0.18
4 0.21
5 0.23
6 0.27
7 0.26
8 0.29
9 0.31
10 0.31
11 0.34
12 0.39
13 0.38
14 0.36
15 0.4
16 0.45
17 0.45
18 0.41
19 0.38
20 0.35
21 0.38
22 0.4
23 0.37
24 0.33
25 0.34
26 0.36
27 0.33
28 0.3
29 0.31
30 0.28
31 0.29
32 0.26
33 0.24
34 0.24
35 0.22
36 0.21
37 0.15
38 0.13
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.14
48 0.18
49 0.2
50 0.24
51 0.26
52 0.28
53 0.29
54 0.3
55 0.33
56 0.34
57 0.33
58 0.32
59 0.3
60 0.28
61 0.26
62 0.24
63 0.2
64 0.16
65 0.16
66 0.14
67 0.14
68 0.15
69 0.15
70 0.15
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.2
77 0.25
78 0.3
79 0.38
80 0.43
81 0.51
82 0.56
83 0.66
84 0.74
85 0.78
86 0.83
87 0.85
88 0.88
89 0.9
90 0.9
91 0.89
92 0.84
93 0.82
94 0.77
95 0.69
96 0.62
97 0.55
98 0.56
99 0.48
100 0.44
101 0.4
102 0.36
103 0.35
104 0.31
105 0.27
106 0.2
107 0.23
108 0.24
109 0.22
110 0.21
111 0.21
112 0.24
113 0.24
114 0.23
115 0.19
116 0.16
117 0.16
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.14
123 0.13
124 0.15
125 0.18
126 0.18
127 0.19
128 0.18
129 0.18
130 0.17
131 0.18
132 0.16
133 0.13
134 0.12
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.08
139 0.07
140 0.06
141 0.07
142 0.09
143 0.12
144 0.13
145 0.15
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.12
153 0.13
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.17
160 0.21
161 0.23
162 0.28
163 0.34
164 0.44
165 0.46
166 0.51
167 0.53
168 0.51
169 0.54
170 0.58
171 0.61
172 0.62
173 0.69
174 0.72
175 0.72
176 0.77
177 0.77
178 0.74
179 0.71
180 0.67
181 0.63
182 0.57
183 0.53
184 0.46
185 0.46
186 0.41
187 0.35
188 0.28
189 0.22
190 0.19
191 0.18
192 0.17
193 0.14
194 0.16
195 0.16
196 0.18
197 0.19
198 0.26
199 0.28
200 0.33
201 0.34
202 0.39
203 0.45
204 0.48
205 0.52
206 0.55
207 0.62
208 0.64
209 0.65
210 0.65
211 0.65
212 0.66
213 0.71
214 0.7
215 0.65
216 0.59
217 0.56
218 0.51
219 0.44
220 0.4
221 0.31
222 0.22
223 0.17
224 0.15
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.13
234 0.12
235 0.15
236 0.2
237 0.22
238 0.26
239 0.27
240 0.28
241 0.27
242 0.28
243 0.26
244 0.2
245 0.18
246 0.19
247 0.23
248 0.22
249 0.25
250 0.24
251 0.24
252 0.26
253 0.23
254 0.18
255 0.2
256 0.28
257 0.26
258 0.31
259 0.34
260 0.32
261 0.33
262 0.34
263 0.28
264 0.24
265 0.26
266 0.23
267 0.22
268 0.22
269 0.21
270 0.21
271 0.21
272 0.24
273 0.22
274 0.26
275 0.25
276 0.3
277 0.32
278 0.31
279 0.29
280 0.22
281 0.22
282 0.17
283 0.17
284 0.14
285 0.13
286 0.12
287 0.13
288 0.13
289 0.12
290 0.1
291 0.09
292 0.08
293 0.08
294 0.09
295 0.09
296 0.1
297 0.11
298 0.13
299 0.14
300 0.14
301 0.16
302 0.19
303 0.2
304 0.22
305 0.24
306 0.25
307 0.26
308 0.26
309 0.28
310 0.25
311 0.29
312 0.28
313 0.34
314 0.37
315 0.38
316 0.44
317 0.45
318 0.5
319 0.48
320 0.51
321 0.46
322 0.42
323 0.46
324 0.45
325 0.44
326 0.4
327 0.4
328 0.37
329 0.35
330 0.32
331 0.25
332 0.23
333 0.18
334 0.16
335 0.11
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.1
346 0.12
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.14
351 0.13
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.11
356 0.11
357 0.16
358 0.17
359 0.2
360 0.18
361 0.18
362 0.19
363 0.24
364 0.27
365 0.26
366 0.26
367 0.24
368 0.24
369 0.31
370 0.37
371 0.38
372 0.34
373 0.32
374 0.34
375 0.36
376 0.36
377 0.31
378 0.25
379 0.2
380 0.22
381 0.23
382 0.19
383 0.18
384 0.16
385 0.16
386 0.15
387 0.14
388 0.13
389 0.12
390 0.14
391 0.14
392 0.15
393 0.14
394 0.13
395 0.14
396 0.13
397 0.11
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.07
403 0.05
404 0.08
405 0.1
406 0.12
407 0.13
408 0.13
409 0.15
410 0.17
411 0.18
412 0.17
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.16
417 0.15
418 0.16
419 0.15
420 0.15
421 0.14
422 0.16
423 0.16
424 0.15
425 0.15
426 0.14
427 0.18
428 0.19
429 0.23
430 0.27
431 0.25
432 0.25
433 0.24
434 0.24
435 0.23
436 0.23
437 0.21
438 0.15
439 0.15
440 0.15
441 0.15
442 0.13
443 0.09
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.1
462 0.14
463 0.16
464 0.16
465 0.18
466 0.22
467 0.24
468 0.28
469 0.26
470 0.23
471 0.21
472 0.27
473 0.3
474 0.29
475 0.29
476 0.26
477 0.28
478 0.28
479 0.28
480 0.25
481 0.19
482 0.17
483 0.16
484 0.14
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.11
489 0.11
490 0.1
491 0.13
492 0.14
493 0.15
494 0.15
495 0.15
496 0.16
497 0.16
498 0.16
499 0.14
500 0.17
501 0.16
502 0.17
503 0.17
504 0.17
505 0.17
506 0.16
507 0.2
508 0.18
509 0.21
510 0.23
511 0.24
512 0.23
513 0.27
514 0.32
515 0.34
516 0.32
517 0.33
518 0.29
519 0.29
520 0.29
521 0.28
522 0.26
523 0.21
524 0.26
525 0.23
526 0.29
527 0.31
528 0.34
529 0.33
530 0.32
531 0.37
532 0.3
533 0.33
534 0.35
535 0.42
536 0.45
537 0.46
538 0.49
539 0.49
540 0.52
541 0.52
542 0.45
543 0.42
544 0.42
545 0.43
546 0.44
547 0.42
548 0.43
549 0.43
550 0.49
551 0.48
552 0.49
553 0.49
554 0.44
555 0.4
556 0.37
557 0.36
558 0.29
559 0.23
560 0.17
561 0.14
562 0.14
563 0.13
564 0.11
565 0.09
566 0.08
567 0.08
568 0.07
569 0.07
570 0.09
571 0.14
572 0.15
573 0.17
574 0.19
575 0.23
576 0.31
577 0.39
578 0.44
579 0.44
580 0.46
581 0.51
582 0.57
583 0.58
584 0.57
585 0.54
586 0.53
587 0.5
588 0.52
589 0.54
590 0.56
591 0.58
592 0.56
593 0.52
594 0.52
595 0.58
596 0.61
597 0.57
598 0.5
599 0.44
600 0.45
601 0.51
602 0.49
603 0.49
604 0.44
605 0.45
606 0.45
607 0.49
608 0.48
609 0.44
610 0.41
611 0.37
612 0.41
613 0.4
614 0.37
615 0.41
616 0.44
617 0.43
618 0.44
619 0.42
620 0.35
621 0.33