FuNGI

R0KAG6

Protein Details

Accession

R0KAG6

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
256-295	HQVGINKKTKKKSRELKQAAATMKKKEKKKNAPHPLNFSA	Hydrophilic
679-703	ETNHMSQTAKRKEKRHAEGKSTTNQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
261-287	NKKTKKKSRELKQAAATMKKKEKKKNA
688-751	KRKEKRHAEGKSTTNQDKARKKNFMMTLGKAKSKNKRSLGDVKKTLLGHVERKKRGGKRGNKGH

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027312 Sda1 IPR007949 SDA1_C IPR012977 SDA1_N
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0015031 P:protein transport GO:0042273 P:ribosomal large subunit biogenesis GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08158 NUC130_3NT PF05285 SDA1

Amino Acid Sequences

MKRKVGALEKLESDHAALRFKLKRDPQSYRDDFEQQYQQYRTLLDLFLADPSTTDGGLVALKDLIEFVSHTANLYPDLTLPEFPQSLIDLLATHHEVLEMDLRDKVVGAICLLKNKDVIDSVTLLNTLFPILVATNSKSLRALLFQKIVSDVRSSNAKATNHKVNKALQTTLYNLLEADTTSPRGFLAVKIVRDLWKRQVWADARTVEVMRLAALSDNEKTIAGGVRFFLGGDQEREAAAEDSDDDNELDMAKLRHQVGINKKTKKKSRELKQAAATMKKKEKKKNAPHPLNFSALHLLHDPQGFAETLFSKHIQNSKNKLSLETKLLALQLVTRLVGLHQLTVLPLYSYFLKHLTPRQASVTTYLACLAQATHTYVPPDVLEPLIQKIANEFVSEASASEVAAAGLNAIREICARQPLAMTDTLLQDLVMYRKSKDKGTMMAAKGLLSLYREVGADLLKKRDRGKDATMGIRAGTIQERRYGEEAIGEIEGIELLEKWKEEERRKKLEAAGLDPDADNGDVELEDDEDDWKKWEVESDGDSDDSGGWINVESDGEDIQISDSEDEKEDNKERPSKKAKLNSATPAPGTDASKSEEPEAKSISKLLTTTILTPADLKQLQALRASSTITSSLASHKRAQLLAARHPDEAITAETIELAASLGKKNTKEEKIAMAKQDRETNHMSQTAKRKEKRHAEGKSTTNQDKARKKNFMMTLGKAKSKNKRSLGDVKKTLLGHVERKKRGGKRGNKGH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.27
3	0.26
4	0.24
5	0.3
6	0.34
7	0.37
8	0.45
9	0.48
10	0.56
11	0.61
12	0.7
13	0.68
14	0.73
15	0.75
16	0.71
17	0.67
18	0.64
19	0.57
20	0.54
21	0.56
22	0.49
23	0.52
24	0.49
25	0.46
26	0.41
27	0.39
28	0.35
29	0.29
30	0.26
31	0.18
32	0.17
33	0.16
34	0.16
35	0.16
36	0.13
37	0.11
38	0.13
39	0.14
40	0.12
41	0.11
42	0.09
43	0.09
44	0.1
45	0.1
46	0.08
47	0.07
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.07
52	0.06
53	0.07
54	0.08
55	0.11
56	0.11
57	0.12
58	0.13
59	0.13
60	0.14
61	0.15
62	0.14
63	0.11
64	0.15
65	0.16
66	0.16
67	0.17
68	0.19
69	0.19
70	0.18
71	0.18
72	0.15
73	0.15
74	0.14
75	0.13
76	0.09
77	0.09
78	0.12
79	0.13
80	0.11
81	0.11
82	0.11
83	0.1
84	0.12
85	0.17
86	0.15
87	0.15
88	0.16
89	0.16
90	0.15
91	0.16
92	0.15
93	0.11
94	0.1
95	0.1
96	0.16
97	0.17
98	0.23
99	0.24
100	0.24
101	0.24
102	0.24
103	0.25
104	0.2
105	0.21
106	0.17
107	0.18
108	0.17
109	0.16
110	0.16
111	0.14
112	0.12
113	0.1
114	0.08
115	0.06
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.07
120	0.1
121	0.11
122	0.17
123	0.17
124	0.18
125	0.18
126	0.19
127	0.18
128	0.21
129	0.24
130	0.24
131	0.28
132	0.27
133	0.27
134	0.3
135	0.3
136	0.26
137	0.24
138	0.19
139	0.17
140	0.22
141	0.22
142	0.24
143	0.29
144	0.31
145	0.34
146	0.4
147	0.48
148	0.48
149	0.51
150	0.51
151	0.5
152	0.55
153	0.52
154	0.48
155	0.4
156	0.37
157	0.37
158	0.39
159	0.33
160	0.25
161	0.22
162	0.2
163	0.17
164	0.15
165	0.14
166	0.1
167	0.12
168	0.12
169	0.12
170	0.11
171	0.12
172	0.13
173	0.1
174	0.19
175	0.21
176	0.21
177	0.23
178	0.25
179	0.29
180	0.32
181	0.36
182	0.34
183	0.34
184	0.35
185	0.34
186	0.41
187	0.39
188	0.4
189	0.41
190	0.34
191	0.3
192	0.31
193	0.3
194	0.22
195	0.19
196	0.15
197	0.1
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.12
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.09
217	0.08
218	0.1
219	0.11
220	0.12
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.13
225	0.11
226	0.09
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.09
232	0.08
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.06
237	0.07
238	0.08
239	0.09
240	0.13
241	0.14
242	0.17
243	0.19
244	0.25
245	0.33
246	0.43
247	0.5
248	0.55
249	0.61
250	0.67
251	0.74
252	0.75
253	0.75
254	0.75
255	0.78
256	0.8
257	0.81
258	0.79
259	0.77
260	0.75
261	0.69
262	0.67
263	0.6
264	0.56
265	0.57
266	0.56
267	0.59
268	0.62
269	0.68
270	0.71
271	0.79
272	0.83
273	0.85
274	0.89
275	0.86
276	0.85
277	0.77
278	0.7
279	0.59
280	0.49
281	0.42
282	0.32
283	0.27
284	0.2
285	0.17
286	0.16
287	0.16
288	0.14
289	0.1
290	0.11
291	0.09
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.08
296	0.1
297	0.11
298	0.11
299	0.14
300	0.2
301	0.24
302	0.3
303	0.36
304	0.4
305	0.45
306	0.44
307	0.45
308	0.43
309	0.4
310	0.37
311	0.31
312	0.26
313	0.21
314	0.21
315	0.17
316	0.14
317	0.12
318	0.08
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.05
323	0.06
324	0.09
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.07
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.08
339	0.09
340	0.11
341	0.16
342	0.23
343	0.23
344	0.24
345	0.26
346	0.27
347	0.26
348	0.27
349	0.24
350	0.17
351	0.16
352	0.15
353	0.11
354	0.1
355	0.09
356	0.07
357	0.05
358	0.05
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.07
368	0.06
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.08
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.04
388	0.04
389	0.04
390	0.04
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.04
395	0.04
396	0.03
397	0.04
398	0.04
399	0.05
400	0.06
401	0.09
402	0.09
403	0.1
404	0.1
405	0.11
406	0.13
407	0.12
408	0.12
409	0.1
410	0.11
411	0.1
412	0.1
413	0.09
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.09
418	0.1
419	0.11
420	0.17
421	0.19
422	0.21
423	0.25
424	0.26
425	0.27
426	0.32
427	0.38
428	0.33
429	0.34
430	0.33
431	0.28
432	0.25
433	0.22
434	0.16
435	0.1
436	0.09
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.07
441	0.07
442	0.08
443	0.11
444	0.13
445	0.19
446	0.2
447	0.24
448	0.28
449	0.34
450	0.37
451	0.38
452	0.41
453	0.42
454	0.44
455	0.45
456	0.43
457	0.37
458	0.32
459	0.27
460	0.22
461	0.16
462	0.15
463	0.14
464	0.13
465	0.18
466	0.19
467	0.22
468	0.23
469	0.23
470	0.19
471	0.17
472	0.17
473	0.12
474	0.11
475	0.09
476	0.07
477	0.06
478	0.06
479	0.04
480	0.04
481	0.03
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.06
486	0.12
487	0.2
488	0.29
489	0.4
490	0.48
491	0.56
492	0.58
493	0.61
494	0.59
495	0.57
496	0.5
497	0.44
498	0.39
499	0.31
500	0.3
501	0.25
502	0.22
503	0.17
504	0.14
505	0.1
506	0.05
507	0.05
508	0.04
509	0.05
510	0.05
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.07
515	0.07
516	0.08
517	0.09
518	0.1
519	0.1
520	0.1
521	0.13
522	0.13
523	0.15
524	0.17
525	0.18
526	0.18
527	0.17
528	0.17
529	0.15
530	0.13
531	0.1
532	0.08
533	0.05
534	0.04
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.06
542	0.06
543	0.06
544	0.06
545	0.06
546	0.06
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.09
551	0.1
552	0.11
553	0.12
554	0.16
555	0.2
556	0.23
557	0.28
558	0.36
559	0.38
560	0.46
561	0.54
562	0.58
563	0.63
564	0.68
565	0.72
566	0.71
567	0.75
568	0.72
569	0.69
570	0.63
571	0.54
572	0.46
573	0.39
574	0.34
575	0.29
576	0.23
577	0.19
578	0.2
579	0.22
580	0.22
581	0.24
582	0.26
583	0.26
584	0.28
585	0.3
586	0.27
587	0.25
588	0.26
589	0.23
590	0.2
591	0.18
592	0.16
593	0.16
594	0.16
595	0.17
596	0.2
597	0.19
598	0.18
599	0.19
600	0.19
601	0.22
602	0.21
603	0.19
604	0.2
605	0.23
606	0.25
607	0.27
608	0.26
609	0.21
610	0.22
611	0.23
612	0.18
613	0.16
614	0.16
615	0.13
616	0.13
617	0.12
618	0.19
619	0.23
620	0.26
621	0.3
622	0.32
623	0.36
624	0.35
625	0.37
626	0.36
627	0.36
628	0.42
629	0.46
630	0.44
631	0.41
632	0.4
633	0.38
634	0.32
635	0.28
636	0.21
637	0.13
638	0.11
639	0.1
640	0.1
641	0.1
642	0.09
643	0.07
644	0.05
645	0.06
646	0.07
647	0.09
648	0.13
649	0.17
650	0.19
651	0.26
652	0.35
653	0.39
654	0.43
655	0.44
656	0.51
657	0.56
658	0.59
659	0.61
660	0.59
661	0.58
662	0.58
663	0.61
664	0.53
665	0.5
666	0.5
667	0.45
668	0.43
669	0.44
670	0.41
671	0.41
672	0.51
673	0.55
674	0.6
675	0.64
676	0.66
677	0.71
678	0.8
679	0.83
680	0.83
681	0.81
682	0.8
683	0.81
684	0.8
685	0.79
686	0.76
687	0.69
688	0.67
689	0.64
690	0.65
691	0.66
692	0.7
693	0.71
694	0.72
695	0.72
696	0.73
697	0.74
698	0.73
699	0.7
700	0.66
701	0.67
702	0.63
703	0.67
704	0.64
705	0.65
706	0.66
707	0.69
708	0.73
709	0.71
710	0.71
711	0.73
712	0.78
713	0.8
714	0.8
715	0.76
716	0.7
717	0.67
718	0.61
719	0.55
720	0.52
721	0.47
722	0.47
723	0.5
724	0.57
725	0.57
726	0.64
727	0.72
728	0.72
729	0.76
730	0.77
731	0.78

R0KAG6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer