FuNGI

R0KA91

Protein Details

Accession

R0KA91

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
180-206	VDGDKTPPMKKTRKRRRWDEVADDEAP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
188-196	MKKTRKRRR

Subcellular Location(s)

plas 14, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR021133 HEAT_type_2 IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50077 HEAT_REPEAT

Amino Acid Sequences

MAGPRAGNPRANGASGDTSNNKQSLTEAFDKELYGGNNGDYVSSIAVGDQDDDMDDVQLNGRSLVGQYTASKEMMNEFAHGDAGEADILDSREKQAQIASRETDYQRRRFDRALSPARADPFAKDGDEAGQSYKDVMKQREFEREEARVQKLIEDKERSGGNEVLDHKPTLKDDDAPAAVDGDKTPPMKKTRKRRRWDEVADDEAPAAKQDGKEEEEEEEEGAEPKKRSRWSPAPEDTKEAAAPARSRWDTTAVAPASTATPAPAASGAHPVSQTFAFGTDISSRNAPLSDEQLDMMLPGEAEGYKILEPPPGYEPVRRPVGMPALPTGYQGFLIPEADNSLAAMGKQLPTEIPGVGDLQFFKNEDMKYFGKLTDGADENEMTVEELKERKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARQFGAGALFNQILPLLMERTLEDQERHLLVKVIDRVLYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLAHMISTMRPDLDHQDEYVRNTTARAFAVVASALGIPALLPFLRAVCRSKKSWHARHTGVKIIQQIPILMGCAILPHLKGLVECIGENLNDEQPKVRMVTALSLAALAEAASPYGIESFDDILNPLWTGARRQRGKALASFLKAVGYVIPLMDEEYSNYYTSQIMEIVIREFQSPDEEMKKVVLKVVSQCSNTAGVTPVYLKDNVLPEFFKHFWVRRMALDKRNYRQVVDTTVDLAQKAGVSEIVGRIVNNMKDENEAYRKMTVETIDKVISTLGAHDVDQRLEEQLIDGVLVAFQDQTIEDPIVIDGFATVVNALGERTKTYLPQIVATVLARLNNKSATVRQQAADLISRITFVMQKCDEDPQLIKLAQALYEYLGEEYPEVLGSILGALRAIVTVVGLHAMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGANYVNPREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGYIAKAIGPQDVLATLLGNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFMFEYIGEMAKDYVYAITPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHVALGCVGLDCEDAMIHLLNLLWPNLFETSPHVIDRIIEAIEGVRNAIGTPLVMNYVWAGLFHPARKVRQPYWRIYNDAYVQSADAMVPAYPAFEEDQVKRHELDIFI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.3
3	0.34
4	0.3
5	0.32
6	0.35
7	0.35
8	0.32
9	0.26
10	0.27
11	0.26
12	0.29
13	0.33
14	0.31
15	0.32
16	0.33
17	0.33
18	0.32
19	0.32
20	0.25
21	0.2
22	0.19
23	0.16
24	0.17
25	0.17
26	0.16
27	0.12
28	0.12
29	0.1
30	0.09
31	0.09
32	0.07
33	0.08
34	0.08
35	0.09
36	0.08
37	0.08
38	0.08
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.08
43	0.08
44	0.1
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.11
49	0.11
50	0.12
51	0.13
52	0.12
53	0.12
54	0.13
55	0.18
56	0.21
57	0.21
58	0.2
59	0.19
60	0.21
61	0.24
62	0.23
63	0.19
64	0.18
65	0.18
66	0.18
67	0.17
68	0.15
69	0.09
70	0.09
71	0.08
72	0.07
73	0.06
74	0.08
75	0.09
76	0.1
77	0.1
78	0.12
79	0.18
80	0.18
81	0.19
82	0.22
83	0.28
84	0.31
85	0.36
86	0.37
87	0.34
88	0.4
89	0.43
90	0.48
91	0.49
92	0.53
93	0.57
94	0.59
95	0.63
96	0.61
97	0.64
98	0.64
99	0.66
100	0.68
101	0.63
102	0.62
103	0.6
104	0.59
105	0.55
106	0.46
107	0.37
108	0.31
109	0.28
110	0.25
111	0.21
112	0.19
113	0.19
114	0.2
115	0.19
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.16
120	0.18
121	0.2
122	0.25
123	0.3
124	0.35
125	0.41
126	0.45
127	0.54
128	0.54
129	0.54
130	0.54
131	0.52
132	0.53
133	0.52
134	0.52
135	0.45
136	0.41
137	0.41
138	0.41
139	0.43
140	0.43
141	0.42
142	0.4
143	0.41
144	0.43
145	0.4
146	0.38
147	0.35
148	0.27
149	0.28
150	0.31
151	0.31
152	0.31
153	0.3
154	0.27
155	0.27
156	0.28
157	0.28
158	0.26
159	0.25
160	0.25
161	0.3
162	0.29
163	0.28
164	0.26
165	0.22
166	0.2
167	0.17
168	0.15
169	0.12
170	0.15
171	0.16
172	0.18
173	0.23
174	0.32
175	0.42
176	0.51
177	0.6
178	0.67
179	0.76
180	0.84
181	0.88
182	0.9
183	0.9
184	0.9
185	0.89
186	0.85
187	0.8
188	0.71
189	0.6
190	0.5
191	0.4
192	0.31
193	0.21
194	0.15
195	0.11
196	0.11
197	0.14
198	0.18
199	0.19
200	0.21
201	0.22
202	0.22
203	0.22
204	0.21
205	0.18
206	0.15
207	0.13
208	0.13
209	0.14
210	0.17
211	0.16
212	0.19
213	0.26
214	0.3
215	0.34
216	0.42
217	0.5
218	0.54
219	0.63
220	0.69
221	0.71
222	0.68
223	0.7
224	0.62
225	0.54
226	0.46
227	0.37
228	0.29
229	0.23
230	0.23
231	0.18
232	0.25
233	0.24
234	0.26
235	0.26
236	0.29
237	0.27
238	0.27
239	0.34
240	0.26
241	0.24
242	0.23
243	0.22
244	0.18
245	0.17
246	0.15
247	0.07
248	0.07
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.14
255	0.14
256	0.15
257	0.16
258	0.15
259	0.16
260	0.16
261	0.15
262	0.1
263	0.1
264	0.09
265	0.09
266	0.11
267	0.14
268	0.15
269	0.17
270	0.17
271	0.16
272	0.16
273	0.17
274	0.16
275	0.13
276	0.15
277	0.16
278	0.16
279	0.16
280	0.15
281	0.14
282	0.13
283	0.12
284	0.07
285	0.05
286	0.04
287	0.05
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.06
292	0.06
293	0.08
294	0.09
295	0.11
296	0.11
297	0.14
298	0.16
299	0.21
300	0.22
301	0.26
302	0.29
303	0.32
304	0.37
305	0.35
306	0.33
307	0.31
308	0.37
309	0.34
310	0.31
311	0.27
312	0.25
313	0.25
314	0.25
315	0.21
316	0.14
317	0.13
318	0.12
319	0.1
320	0.08
321	0.09
322	0.08
323	0.08
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.06
333	0.07
334	0.07
335	0.08
336	0.08
337	0.09
338	0.11
339	0.09
340	0.09
341	0.08
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.11
348	0.11
349	0.12
350	0.16
351	0.15
352	0.16
353	0.2
354	0.2
355	0.22
356	0.23
357	0.21
358	0.18
359	0.19
360	0.18
361	0.18
362	0.19
363	0.17
364	0.16
365	0.16
366	0.15
367	0.14
368	0.13
369	0.08
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.09
374	0.09
375	0.14
376	0.14
377	0.16
378	0.19
379	0.24
380	0.27
381	0.35
382	0.42
383	0.44
384	0.49
385	0.5
386	0.48
387	0.49
388	0.49
389	0.46
390	0.45
391	0.43
392	0.43
393	0.45
394	0.45
395	0.43
396	0.48
397	0.51
398	0.46
399	0.43
400	0.42
401	0.45
402	0.52
403	0.51
404	0.42
405	0.33
406	0.31
407	0.3
408	0.26
409	0.2
410	0.12
411	0.09
412	0.09
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.08
417	0.06
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.06
423	0.07
424	0.09
425	0.11
426	0.12
427	0.12
428	0.12
429	0.14
430	0.15
431	0.16
432	0.13
433	0.14
434	0.13
435	0.17
436	0.19
437	0.17
438	0.18
439	0.18
440	0.18
441	0.18
442	0.18
443	0.13
444	0.13
445	0.14
446	0.14
447	0.15
448	0.17
449	0.16
450	0.17
451	0.19
452	0.19
453	0.17
454	0.15
455	0.13
456	0.14
457	0.14
458	0.14
459	0.12
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.09
464	0.06
465	0.04
466	0.03
467	0.04
468	0.05
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.09
475	0.1
476	0.12
477	0.12
478	0.14
479	0.14
480	0.14
481	0.14
482	0.12
483	0.1
484	0.07
485	0.07
486	0.05
487	0.05
488	0.04
489	0.04
490	0.05
491	0.05
492	0.05
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.07
498	0.1
499	0.14
500	0.15
501	0.14
502	0.18
503	0.2
504	0.22
505	0.23
506	0.2
507	0.15
508	0.16
509	0.16
510	0.14
511	0.13
512	0.11
513	0.09
514	0.09
515	0.09
516	0.09
517	0.07
518	0.06
519	0.05
520	0.04
521	0.04
522	0.03
523	0.03
524	0.03
525	0.03
526	0.02
527	0.03
528	0.03
529	0.04
530	0.06
531	0.08
532	0.11
533	0.16
534	0.2
535	0.22
536	0.26
537	0.36
538	0.45
539	0.52
540	0.57
541	0.58
542	0.6
543	0.65
544	0.64
545	0.61
546	0.52
547	0.46
548	0.44
549	0.38
550	0.34
551	0.27
552	0.24
553	0.18
554	0.16
555	0.13
556	0.08
557	0.06
558	0.04
559	0.04
560	0.04
561	0.05
562	0.05
563	0.04
564	0.05
565	0.05
566	0.05
567	0.06
568	0.07
569	0.07
570	0.07
571	0.08
572	0.08
573	0.08
574	0.09
575	0.09
576	0.09
577	0.09
578	0.09
579	0.09
580	0.09
581	0.1
582	0.1
583	0.09
584	0.08
585	0.08
586	0.09
587	0.1
588	0.09
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.06
593	0.05
594	0.04
595	0.03
596	0.02
597	0.02
598	0.02
599	0.02
600	0.02
601	0.03
602	0.03
603	0.03
604	0.04
605	0.05
606	0.06
607	0.06
608	0.06
609	0.06
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.05
614	0.06
615	0.09
616	0.14
617	0.22
618	0.24
619	0.26
620	0.31
621	0.35
622	0.37
623	0.36
624	0.37
625	0.31
626	0.3
627	0.3
628	0.25
629	0.2
630	0.18
631	0.15
632	0.09
633	0.07
634	0.05
635	0.04
636	0.04
637	0.04
638	0.05
639	0.05
640	0.05
641	0.05
642	0.08
643	0.09
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.09
648	0.1
649	0.09
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.07
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.07
658	0.07
659	0.07
660	0.09
661	0.09
662	0.11
663	0.13
664	0.13
665	0.13
666	0.14
667	0.16
668	0.14
669	0.16
670	0.14
671	0.13
672	0.17
673	0.23
674	0.25
675	0.23
676	0.24
677	0.23
678	0.23
679	0.21
680	0.17
681	0.13
682	0.09
683	0.09
684	0.09
685	0.09
686	0.09
687	0.1
688	0.09
689	0.1
690	0.14
691	0.14
692	0.15
693	0.14
694	0.14
695	0.19
696	0.2
697	0.21
698	0.21
699	0.23
700	0.26
701	0.3
702	0.31
703	0.29
704	0.36
705	0.39
706	0.43
707	0.49
708	0.52
709	0.51
710	0.59
711	0.55
712	0.49
713	0.46
714	0.4
715	0.36
716	0.3
717	0.27
718	0.19
719	0.21
720	0.2
721	0.16
722	0.15
723	0.1
724	0.09
725	0.08
726	0.06
727	0.05
728	0.04
729	0.05
730	0.06
731	0.07
732	0.07
733	0.07
734	0.08
735	0.11
736	0.12
737	0.13
738	0.13
739	0.13
740	0.14
741	0.15
742	0.18
743	0.19
744	0.19
745	0.19
746	0.2
747	0.2
748	0.19
749	0.2
750	0.18
751	0.17
752	0.17
753	0.18
754	0.17
755	0.16
756	0.16
757	0.14
758	0.12
759	0.09
760	0.07
761	0.07
762	0.07
763	0.07
764	0.1
765	0.11
766	0.11
767	0.11
768	0.11
769	0.1
770	0.1
771	0.09
772	0.07
773	0.07
774	0.06
775	0.06
776	0.05
777	0.04
778	0.04
779	0.04
780	0.04
781	0.03
782	0.03
783	0.03
784	0.03
785	0.04
786	0.06
787	0.06
788	0.06
789	0.06
790	0.06
791	0.06
792	0.06
793	0.05
794	0.03
795	0.03
796	0.03
797	0.03
798	0.03
799	0.03
800	0.03
801	0.04
802	0.04
803	0.05
804	0.06
805	0.06
806	0.09
807	0.09
808	0.1
809	0.13
810	0.18
811	0.17
812	0.18
813	0.18
814	0.16
815	0.17
816	0.16
817	0.15
818	0.11
819	0.14
820	0.13
821	0.13
822	0.15
823	0.14
824	0.16
825	0.16
826	0.19
827	0.23
828	0.27
829	0.29
830	0.27
831	0.28
832	0.28
833	0.27
834	0.26
835	0.19
836	0.15
837	0.13
838	0.13
839	0.11
840	0.11
841	0.13
842	0.11
843	0.17
844	0.17
845	0.19
846	0.2
847	0.23
848	0.23
849	0.22
850	0.23
851	0.19
852	0.22
853	0.21
854	0.19
855	0.18
856	0.17
857	0.15
858	0.15
859	0.12
860	0.09
861	0.09
862	0.1
863	0.08
864	0.08
865	0.07
866	0.07
867	0.07
868	0.06
869	0.05
870	0.05
871	0.04
872	0.04
873	0.04
874	0.04
875	0.04
876	0.04
877	0.04
878	0.04
879	0.03
880	0.04
881	0.04
882	0.03
883	0.03
884	0.03
885	0.03
886	0.04
887	0.04
888	0.05
889	0.07
890	0.08
891	0.09
892	0.1
893	0.12
894	0.13
895	0.14
896	0.15
897	0.14
898	0.2
899	0.21
900	0.22
901	0.24
902	0.26
903	0.31
904	0.37
905	0.45
906	0.45
907	0.5
908	0.53
909	0.59
910	0.61
911	0.63
912	0.61
913	0.6
914	0.57
915	0.52
916	0.5
917	0.42
918	0.35
919	0.28
920	0.23
921	0.14
922	0.11
923	0.08
924	0.07
925	0.08
926	0.07
927	0.1
928	0.1
929	0.14
930	0.16
931	0.2
932	0.21
933	0.23
934	0.25
935	0.28
936	0.28
937	0.27
938	0.29
939	0.28
940	0.27
941	0.24
942	0.23
943	0.23
944	0.22
945	0.22
946	0.17
947	0.18
948	0.22
949	0.22
950	0.24
951	0.22
952	0.27
953	0.33
954	0.43
955	0.49
956	0.5
957	0.59
958	0.65
959	0.71
960	0.67
961	0.6
962	0.51
963	0.41
964	0.38
965	0.29
966	0.21
967	0.13
968	0.15
969	0.14
970	0.13
971	0.13
972	0.11
973	0.11
974	0.1
975	0.09
976	0.07
977	0.07
978	0.07
979	0.08
980	0.09
981	0.09
982	0.09
983	0.11
984	0.13
985	0.14
986	0.21
987	0.24
988	0.3
989	0.34
990	0.37
991	0.37
992	0.36
993	0.34
994	0.28
995	0.25
996	0.19
997	0.15
998	0.11
999	0.09
1000	0.08
1001	0.07
1002	0.06
1003	0.04
1004	0.04
1005	0.04
1006	0.05
1007	0.05
1008	0.06
1009	0.09
1010	0.1
1011	0.1
1012	0.11
1013	0.16
1014	0.16
1015	0.18
1016	0.18
1017	0.17
1018	0.18
1019	0.18
1020	0.19
1021	0.2
1022	0.23
1023	0.25
1024	0.26
1025	0.24
1026	0.27
1027	0.26
1028	0.26
1029	0.2
1030	0.17
1031	0.14
1032	0.14
1033	0.15
1034	0.11
1035	0.11
1036	0.11
1037	0.11
1038	0.13
1039	0.12
1040	0.12
1041	0.11
1042	0.11
1043	0.11
1044	0.1
1045	0.1
1046	0.09
1047	0.08
1048	0.07
1049	0.08
1050	0.08
1051	0.08
1052	0.08
1053	0.08
1054	0.08
1055	0.07
1056	0.06
1057	0.07
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.1
1061	0.11
1062	0.14
1063	0.19
1064	0.21
1065	0.23
1066	0.2
1067	0.2
1068	0.22
1069	0.27
1070	0.3
1071	0.26
1072	0.27
1073	0.26
1074	0.25
1075	0.26
1076	0.25
1077	0.2
1078	0.13
1079	0.12
1080	0.1
1081	0.09
1082	0.08
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.06
1086	0.06
1087	0.06
1088	0.06
1089	0.06
1090	0.06
1091	0.06
1092	0.06
1093	0.06
1094	0.08
1095	0.1
1096	0.1
1097	0.09
1098	0.09
1099	0.11
1100	0.13
1101	0.13
1102	0.11
1103	0.16
1104	0.21
1105	0.24
1106	0.24
1107	0.23
1108	0.21
1109	0.22
1110	0.23
1111	0.2
1112	0.14
1113	0.11
1114	0.11
1115	0.12
1116	0.14
1117	0.13
1118	0.11
1119	0.09
1120	0.09
1121	0.09
1122	0.09
1123	0.08
1124	0.06
1125	0.07
1126	0.07
1127	0.09
1128	0.09
1129	0.09
1130	0.09
1131	0.1
1132	0.09
1133	0.09
1134	0.09
1135	0.13
1136	0.17
1137	0.19
1138	0.26
1139	0.31
1140	0.36
1141	0.45
1142	0.53
1143	0.55
1144	0.62
1145	0.67
1146	0.69
1147	0.74
1148	0.74
1149	0.71
1150	0.66
1151	0.66
1152	0.61
1153	0.56
1154	0.49
1155	0.39
1156	0.34
1157	0.28
1158	0.25
1159	0.17
1160	0.12
1161	0.1
1162	0.08
1163	0.08
1164	0.07
1165	0.07
1166	0.07
1167	0.09
1168	0.1
1169	0.13
1170	0.19
1171	0.2
1172	0.27
1173	0.31
1174	0.33
1175	0.33
1176	0.33

R0KA91

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer