Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KCP0

Protein Details
Accession R0KCP0    Localization Confidence High Confidence Score 18.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
28-79LSSPPPTPEARNPRKRKAVKEENSPRIKTKDPSPTRRNNKRTKTSAVKQEDAHydrophilic
97-124EDGDKKASKNTRKPAKHTTPKKEKAETLBasic
465-490ASPVKGGSTKKVRPKKKIVEEYESDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-70ARNPRKRKAVKEENSPRIKTKDPSPTRRNNKRTK
101-121KKASKNTRKPAKHTTPKKEKA
136-143PKKKGKGK
461-481KGDGASPVKGGSTKKVRPKKK
Subcellular Location(s) cyto_mito 11.166, cyto 10.5, mito 9.5, cyto_nucl 9.499, mito_nucl 8.999, nucl 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MARTTRSSAAKAQAVHVLPVHDNEPVQLSSPPPTPEARNPRKRKAVKEENSPRIKTKDPSPTRRNNKRTKTSAVKQEDANELPHNLGAIPEIAIKQEDGDKKASKNTRKPAKHTTPKKEKAETLVSKAATTSDEAPKKKGKGKTGGYGLTPGQTPYPNYPHPTAEECEEVTRILSKVHGKVEAPKTIPAPSLDVSGCGEVPSVLDALIRTRLSAATSGTNSSRAFAGLVAKFGVLKEGIGKGSVDWNKVRQADQKEVFEAIKSGGLADVKSKDIKKILQMVWEENQARRQELLSSGKAAGSANEAEEDKHAEIEKAKQNIISLDHLHQLSTDDAFDALTKYPGIGPKTASCVLLFCLQRPSFAVDTHVFRLCKWLGWVPATSDPAGLAPGAKGAFAGPTRNSTYAHCEVRVPDHLKYPLHQLLIKHGKTCPRCRAITGESSEGWDEGCPIEHLVQRTGGRKGDGASPVKGGSTKKVRPKKKIVEEYESDAESSGASDAESSILSDIVSDAEVEHSEQEDFEVED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.37
3 0.33
4 0.28
5 0.25
6 0.26
7 0.24
8 0.19
9 0.18
10 0.17
11 0.19
12 0.17
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.2
17 0.24
18 0.26
19 0.24
20 0.28
21 0.32
22 0.4
23 0.5
24 0.56
25 0.63
26 0.7
27 0.78
28 0.85
29 0.87
30 0.87
31 0.87
32 0.88
33 0.85
34 0.87
35 0.88
36 0.87
37 0.88
38 0.81
39 0.76
40 0.69
41 0.67
42 0.6
43 0.58
44 0.59
45 0.61
46 0.68
47 0.72
48 0.78
49 0.83
50 0.9
51 0.91
52 0.9
53 0.91
54 0.91
55 0.88
56 0.87
57 0.86
58 0.84
59 0.84
60 0.81
61 0.74
62 0.66
63 0.64
64 0.6
65 0.51
66 0.45
67 0.37
68 0.3
69 0.26
70 0.24
71 0.19
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.07
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.09
82 0.1
83 0.16
84 0.19
85 0.2
86 0.26
87 0.29
88 0.3
89 0.39
90 0.47
91 0.51
92 0.56
93 0.64
94 0.69
95 0.73
96 0.78
97 0.81
98 0.83
99 0.84
100 0.85
101 0.86
102 0.86
103 0.88
104 0.89
105 0.84
106 0.76
107 0.72
108 0.72
109 0.65
110 0.6
111 0.55
112 0.48
113 0.42
114 0.39
115 0.32
116 0.23
117 0.2
118 0.19
119 0.22
120 0.28
121 0.3
122 0.34
123 0.4
124 0.45
125 0.5
126 0.52
127 0.52
128 0.55
129 0.59
130 0.62
131 0.63
132 0.59
133 0.52
134 0.49
135 0.41
136 0.33
137 0.27
138 0.2
139 0.15
140 0.14
141 0.16
142 0.18
143 0.24
144 0.26
145 0.3
146 0.31
147 0.31
148 0.33
149 0.34
150 0.31
151 0.27
152 0.25
153 0.22
154 0.21
155 0.19
156 0.16
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.09
161 0.12
162 0.15
163 0.18
164 0.21
165 0.22
166 0.21
167 0.3
168 0.35
169 0.36
170 0.34
171 0.32
172 0.32
173 0.31
174 0.32
175 0.24
176 0.22
177 0.17
178 0.18
179 0.16
180 0.15
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.09
185 0.09
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.06
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.11
202 0.1
203 0.11
204 0.13
205 0.13
206 0.15
207 0.15
208 0.14
209 0.13
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.13
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.05
222 0.05
223 0.06
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.14
230 0.16
231 0.17
232 0.17
233 0.19
234 0.23
235 0.24
236 0.26
237 0.26
238 0.28
239 0.34
240 0.36
241 0.35
242 0.31
243 0.31
244 0.29
245 0.23
246 0.19
247 0.11
248 0.09
249 0.07
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.12
258 0.13
259 0.14
260 0.16
261 0.18
262 0.2
263 0.26
264 0.26
265 0.28
266 0.29
267 0.3
268 0.29
269 0.33
270 0.3
271 0.23
272 0.27
273 0.22
274 0.22
275 0.2
276 0.19
277 0.15
278 0.18
279 0.22
280 0.18
281 0.19
282 0.19
283 0.18
284 0.18
285 0.17
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.09
294 0.11
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.09
299 0.11
300 0.17
301 0.22
302 0.22
303 0.23
304 0.22
305 0.22
306 0.23
307 0.24
308 0.2
309 0.17
310 0.17
311 0.2
312 0.19
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.13
317 0.12
318 0.1
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.07
328 0.09
329 0.13
330 0.14
331 0.15
332 0.16
333 0.17
334 0.23
335 0.24
336 0.22
337 0.18
338 0.17
339 0.18
340 0.22
341 0.2
342 0.16
343 0.24
344 0.23
345 0.23
346 0.24
347 0.27
348 0.22
349 0.22
350 0.26
351 0.2
352 0.24
353 0.26
354 0.29
355 0.25
356 0.23
357 0.29
358 0.25
359 0.24
360 0.23
361 0.24
362 0.23
363 0.25
364 0.26
365 0.23
366 0.27
367 0.28
368 0.25
369 0.21
370 0.17
371 0.15
372 0.15
373 0.11
374 0.07
375 0.05
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.07
380 0.06
381 0.09
382 0.1
383 0.13
384 0.12
385 0.17
386 0.21
387 0.22
388 0.23
389 0.22
390 0.29
391 0.33
392 0.35
393 0.31
394 0.3
395 0.3
396 0.34
397 0.4
398 0.36
399 0.31
400 0.35
401 0.38
402 0.38
403 0.37
404 0.41
405 0.37
406 0.36
407 0.37
408 0.31
409 0.37
410 0.46
411 0.45
412 0.4
413 0.39
414 0.45
415 0.5
416 0.59
417 0.58
418 0.55
419 0.55
420 0.56
421 0.6
422 0.56
423 0.56
424 0.52
425 0.46
426 0.39
427 0.39
428 0.37
429 0.29
430 0.24
431 0.16
432 0.13
433 0.09
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.14
438 0.16
439 0.19
440 0.19
441 0.24
442 0.27
443 0.31
444 0.34
445 0.33
446 0.31
447 0.3
448 0.31
449 0.32
450 0.36
451 0.35
452 0.32
453 0.32
454 0.3
455 0.3
456 0.32
457 0.27
458 0.28
459 0.35
460 0.41
461 0.5
462 0.6
463 0.68
464 0.75
465 0.84
466 0.86
467 0.87
468 0.9
469 0.87
470 0.86
471 0.81
472 0.78
473 0.71
474 0.61
475 0.49
476 0.39
477 0.31
478 0.22
479 0.18
480 0.11
481 0.07
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.1
501 0.11
502 0.11
503 0.11
504 0.11