Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IMR9

Protein Details
Accession R0IMR9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1039-1058GPSILSPQPHRQPHRLSNPSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR033133  PUM-HD  
IPR033712  Pumilio_RNA-bd  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00806  PUF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50302  PUM  
PS50303  PUM_HD  
CDD cd07920  Pumilio  
Amino Acid Sequences MAYHGMGGASGLRSPRDESSFFSLNRAAHNADGRATLHRRFTTNNIPTLSTPLSPIGQQRRQAAEPTEFTTAPGEHAPALESTLHVETRAASTALGSSKQPQAPAFGIQRVCSSVMSMRCEQEWPLTTNLNRRTISSKSAPHPTPPKPPLISSWNEYYSRQLERKRIEHEYLKEAKRRFDAEMELLNLQAQHGEADINRFPNDAHYGGPAHSQPTTPPEYNEANGFPSALSRPNRFSMSSINPTMTTTRSSRANSQVTSPPSNLQGGTNGKFPSQSMPGSRRNSEEDHDDFENDDFTPLSPAARKSNRMSMPVTRMDYGIRPDLPDLSSVLGHIDTAGFLFGQEDRSITSQDRNGFLQMGNTKDDFPVLVRRDGAGNGTKLSASSAALDLALSQSPGPETQSTGWNGYRHRQAQQSLPANTFRKAPPVDDYESGRSNTNGDNTPKKSANSNRRSVEFSFASPTNAMPKLTQSYSTNDVPTLKNSAGINGANGIGFTSHAQQHFHNHNASLGRIPQNAMSNRNSRDLSIGNREAEYRPPQSGLHASAAPFGPSVTSAAPNGGVSASVGSPAMSQYSGVSAANPGYYGYGMSMLNGAMNNLNLGPGAAPGPGQGPGPGAQYGAPQAYGPNGMYGGGPQYNPYATYGPGGRVQDSQARVIQSRRLQNDANKYMNYDLKSMPRQDIYSLCKDQHGCRFLQKKLEERNAENIQIIFDETAPHVVELMTDPFGNYLCQKLLEFCNDEQRNTLVRNAAPAMVQIAFNQHGTRALQKMIEFISTDDQTQMIIRALSGQVVDLIQDLNGNHVIQKCLNHLKSPDAQFIFDAVGEHCITVGTHRHGCCVLQRCIDHASGFQKVDLIRKITAHSFHLVQDPFGNYVVQYILDLNDASFTTPMCQGFQGKICELSKQKFSSNVIEKCIRCAEPHVKSMMIEELLDVEQLEQLMRDSYGNYVIQTALEFAPAELCVHLIEAMRPILPSIRQTPYGRRIMSKVGERESRLAAYTGRHSSGHASPGTAQGSSESSSAYGPQHQAPIYTSNANYGPSILSPQPHRQPHRLSNPSVPQLMHNSMHNNQGYQQQQQQQYGTAQPNGGQGQWF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.26
4 0.27
5 0.3
6 0.36
7 0.42
8 0.4
9 0.41
10 0.4
11 0.36
12 0.38
13 0.37
14 0.31
15 0.29
16 0.33
17 0.31
18 0.28
19 0.29
20 0.27
21 0.31
22 0.34
23 0.35
24 0.38
25 0.4
26 0.41
27 0.43
28 0.49
29 0.52
30 0.54
31 0.56
32 0.5
33 0.49
34 0.47
35 0.49
36 0.44
37 0.34
38 0.29
39 0.25
40 0.24
41 0.24
42 0.31
43 0.35
44 0.4
45 0.44
46 0.49
47 0.53
48 0.54
49 0.57
50 0.54
51 0.5
52 0.47
53 0.45
54 0.43
55 0.36
56 0.35
57 0.33
58 0.28
59 0.23
60 0.21
61 0.19
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.12
66 0.14
67 0.12
68 0.11
69 0.13
70 0.15
71 0.15
72 0.14
73 0.14
74 0.13
75 0.15
76 0.17
77 0.14
78 0.11
79 0.12
80 0.15
81 0.17
82 0.17
83 0.16
84 0.18
85 0.25
86 0.28
87 0.3
88 0.27
89 0.3
90 0.3
91 0.36
92 0.36
93 0.34
94 0.34
95 0.32
96 0.33
97 0.3
98 0.3
99 0.23
100 0.21
101 0.21
102 0.24
103 0.29
104 0.3
105 0.3
106 0.29
107 0.31
108 0.3
109 0.31
110 0.3
111 0.28
112 0.28
113 0.32
114 0.34
115 0.41
116 0.47
117 0.48
118 0.44
119 0.44
120 0.45
121 0.43
122 0.48
123 0.46
124 0.47
125 0.45
126 0.54
127 0.53
128 0.57
129 0.63
130 0.61
131 0.65
132 0.61
133 0.63
134 0.56
135 0.57
136 0.54
137 0.52
138 0.5
139 0.44
140 0.46
141 0.43
142 0.42
143 0.4
144 0.4
145 0.38
146 0.41
147 0.43
148 0.44
149 0.47
150 0.54
151 0.59
152 0.6
153 0.62
154 0.62
155 0.63
156 0.62
157 0.62
158 0.63
159 0.63
160 0.64
161 0.59
162 0.58
163 0.55
164 0.54
165 0.47
166 0.42
167 0.41
168 0.38
169 0.39
170 0.36
171 0.31
172 0.28
173 0.25
174 0.21
175 0.16
176 0.12
177 0.08
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.12
183 0.14
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.16
188 0.19
189 0.22
190 0.18
191 0.17
192 0.17
193 0.18
194 0.19
195 0.22
196 0.19
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.15
201 0.2
202 0.26
203 0.24
204 0.24
205 0.28
206 0.3
207 0.3
208 0.31
209 0.27
210 0.22
211 0.21
212 0.2
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.18
217 0.22
218 0.23
219 0.27
220 0.31
221 0.33
222 0.32
223 0.32
224 0.33
225 0.37
226 0.39
227 0.37
228 0.35
229 0.33
230 0.33
231 0.33
232 0.27
233 0.23
234 0.18
235 0.2
236 0.25
237 0.27
238 0.32
239 0.39
240 0.42
241 0.4
242 0.42
243 0.45
244 0.45
245 0.46
246 0.41
247 0.34
248 0.31
249 0.32
250 0.28
251 0.21
252 0.22
253 0.24
254 0.24
255 0.27
256 0.25
257 0.24
258 0.24
259 0.24
260 0.22
261 0.2
262 0.22
263 0.24
264 0.3
265 0.38
266 0.43
267 0.44
268 0.43
269 0.44
270 0.44
271 0.4
272 0.4
273 0.34
274 0.33
275 0.32
276 0.29
277 0.26
278 0.23
279 0.22
280 0.15
281 0.13
282 0.09
283 0.08
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.14
289 0.23
290 0.27
291 0.32
292 0.34
293 0.43
294 0.45
295 0.46
296 0.47
297 0.44
298 0.46
299 0.46
300 0.44
301 0.36
302 0.33
303 0.3
304 0.29
305 0.26
306 0.24
307 0.19
308 0.18
309 0.18
310 0.19
311 0.18
312 0.16
313 0.14
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.08
319 0.07
320 0.06
321 0.05
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.04
328 0.05
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.1
334 0.12
335 0.12
336 0.16
337 0.18
338 0.21
339 0.23
340 0.22
341 0.22
342 0.21
343 0.2
344 0.21
345 0.2
346 0.19
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.18
351 0.18
352 0.13
353 0.12
354 0.18
355 0.18
356 0.19
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.2
361 0.22
362 0.17
363 0.16
364 0.15
365 0.15
366 0.14
367 0.13
368 0.13
369 0.11
370 0.07
371 0.08
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.06
384 0.08
385 0.07
386 0.09
387 0.11
388 0.15
389 0.16
390 0.19
391 0.21
392 0.22
393 0.24
394 0.27
395 0.33
396 0.32
397 0.34
398 0.36
399 0.36
400 0.39
401 0.46
402 0.48
403 0.43
404 0.42
405 0.44
406 0.41
407 0.39
408 0.37
409 0.29
410 0.28
411 0.27
412 0.26
413 0.24
414 0.27
415 0.3
416 0.28
417 0.31
418 0.28
419 0.29
420 0.29
421 0.25
422 0.2
423 0.19
424 0.18
425 0.18
426 0.19
427 0.21
428 0.27
429 0.29
430 0.34
431 0.34
432 0.33
433 0.38
434 0.43
435 0.5
436 0.5
437 0.56
438 0.53
439 0.54
440 0.57
441 0.5
442 0.47
443 0.37
444 0.3
445 0.26
446 0.24
447 0.22
448 0.19
449 0.18
450 0.16
451 0.16
452 0.16
453 0.12
454 0.14
455 0.16
456 0.16
457 0.19
458 0.16
459 0.19
460 0.23
461 0.24
462 0.22
463 0.2
464 0.22
465 0.2
466 0.2
467 0.19
468 0.14
469 0.16
470 0.16
471 0.16
472 0.16
473 0.15
474 0.13
475 0.11
476 0.11
477 0.07
478 0.07
479 0.06
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.06
484 0.09
485 0.1
486 0.11
487 0.12
488 0.18
489 0.22
490 0.24
491 0.23
492 0.21
493 0.23
494 0.22
495 0.22
496 0.17
497 0.16
498 0.16
499 0.15
500 0.16
501 0.15
502 0.2
503 0.22
504 0.24
505 0.25
506 0.28
507 0.29
508 0.33
509 0.31
510 0.25
511 0.26
512 0.24
513 0.23
514 0.24
515 0.25
516 0.21
517 0.21
518 0.22
519 0.21
520 0.23
521 0.24
522 0.19
523 0.17
524 0.18
525 0.18
526 0.18
527 0.2
528 0.18
529 0.16
530 0.15
531 0.14
532 0.14
533 0.14
534 0.13
535 0.1
536 0.08
537 0.06
538 0.06
539 0.07
540 0.05
541 0.06
542 0.06
543 0.06
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.05
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.04
556 0.04
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.04
561 0.05
562 0.06
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.06
569 0.05
570 0.04
571 0.05
572 0.04
573 0.04
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.06
578 0.05
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.05
583 0.05
584 0.05
585 0.04
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.03
590 0.03
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.06
600 0.07
601 0.08
602 0.08
603 0.08
604 0.08
605 0.08
606 0.09
607 0.08
608 0.08
609 0.06
610 0.06
611 0.06
612 0.07
613 0.07
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.06
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.08
625 0.09
626 0.1
627 0.09
628 0.09
629 0.11
630 0.11
631 0.11
632 0.15
633 0.15
634 0.15
635 0.15
636 0.16
637 0.19
638 0.2
639 0.21
640 0.19
641 0.2
642 0.2
643 0.21
644 0.25
645 0.26
646 0.32
647 0.32
648 0.33
649 0.35
650 0.39
651 0.47
652 0.47
653 0.44
654 0.38
655 0.37
656 0.36
657 0.37
658 0.32
659 0.25
660 0.21
661 0.24
662 0.27
663 0.28
664 0.28
665 0.26
666 0.25
667 0.24
668 0.27
669 0.27
670 0.3
671 0.3
672 0.28
673 0.3
674 0.32
675 0.34
676 0.37
677 0.34
678 0.29
679 0.35
680 0.41
681 0.4
682 0.46
683 0.46
684 0.46
685 0.52
686 0.59
687 0.55
688 0.51
689 0.57
690 0.51
691 0.49
692 0.41
693 0.33
694 0.24
695 0.2
696 0.18
697 0.1
698 0.07
699 0.07
700 0.06
701 0.08
702 0.08
703 0.08
704 0.07
705 0.07
706 0.07
707 0.07
708 0.09
709 0.08
710 0.07
711 0.07
712 0.07
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.09
719 0.09
720 0.12
721 0.14
722 0.17
723 0.2
724 0.2
725 0.3
726 0.3
727 0.3
728 0.29
729 0.29
730 0.28
731 0.25
732 0.27
733 0.2
734 0.19
735 0.21
736 0.21
737 0.19
738 0.16
739 0.14
740 0.14
741 0.11
742 0.11
743 0.08
744 0.1
745 0.11
746 0.11
747 0.11
748 0.1
749 0.12
750 0.12
751 0.16
752 0.15
753 0.15
754 0.17
755 0.17
756 0.19
757 0.17
758 0.17
759 0.14
760 0.13
761 0.16
762 0.15
763 0.15
764 0.13
765 0.12
766 0.12
767 0.12
768 0.12
769 0.08
770 0.07
771 0.07
772 0.08
773 0.08
774 0.09
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.07
779 0.07
780 0.05
781 0.05
782 0.05
783 0.06
784 0.06
785 0.08
786 0.09
787 0.09
788 0.11
789 0.13
790 0.14
791 0.15
792 0.17
793 0.2
794 0.29
795 0.3
796 0.31
797 0.31
798 0.35
799 0.4
800 0.42
801 0.43
802 0.35
803 0.35
804 0.31
805 0.3
806 0.26
807 0.19
808 0.16
809 0.09
810 0.11
811 0.1
812 0.1
813 0.08
814 0.08
815 0.08
816 0.09
817 0.14
818 0.16
819 0.22
820 0.23
821 0.25
822 0.25
823 0.26
824 0.31
825 0.34
826 0.34
827 0.34
828 0.34
829 0.35
830 0.37
831 0.37
832 0.31
833 0.27
834 0.26
835 0.24
836 0.24
837 0.22
838 0.21
839 0.21
840 0.26
841 0.26
842 0.26
843 0.23
844 0.24
845 0.27
846 0.28
847 0.3
848 0.27
849 0.26
850 0.24
851 0.24
852 0.3
853 0.27
854 0.24
855 0.24
856 0.23
857 0.21
858 0.2
859 0.19
860 0.12
861 0.12
862 0.12
863 0.09
864 0.08
865 0.07
866 0.07
867 0.08
868 0.08
869 0.07
870 0.08
871 0.08
872 0.08
873 0.08
874 0.07
875 0.09
876 0.12
877 0.13
878 0.12
879 0.14
880 0.16
881 0.19
882 0.24
883 0.26
884 0.24
885 0.29
886 0.29
887 0.34
888 0.37
889 0.38
890 0.41
891 0.4
892 0.41
893 0.41
894 0.44
895 0.47
896 0.51
897 0.5
898 0.49
899 0.53
900 0.51
901 0.5
902 0.51
903 0.43
904 0.34
905 0.39
906 0.42
907 0.4
908 0.44
909 0.42
910 0.37
911 0.36
912 0.37
913 0.32
914 0.23
915 0.17
916 0.14
917 0.13
918 0.13
919 0.13
920 0.11
921 0.07
922 0.07
923 0.08
924 0.08
925 0.06
926 0.06
927 0.07
928 0.08
929 0.08
930 0.08
931 0.09
932 0.13
933 0.14
934 0.13
935 0.13
936 0.13
937 0.13
938 0.12
939 0.13
940 0.09
941 0.1
942 0.1
943 0.09
944 0.1
945 0.1
946 0.1
947 0.08
948 0.08
949 0.07
950 0.07
951 0.09
952 0.08
953 0.09
954 0.11
955 0.12
956 0.12
957 0.12
958 0.12
959 0.14
960 0.15
961 0.19
962 0.23
963 0.26
964 0.32
965 0.36
966 0.45
967 0.5
968 0.56
969 0.54
970 0.51
971 0.51
972 0.52
973 0.55
974 0.54
975 0.52
976 0.51
977 0.54
978 0.54
979 0.54
980 0.49
981 0.44
982 0.37
983 0.32
984 0.27
985 0.25
986 0.29
987 0.29
988 0.28
989 0.27
990 0.27
991 0.3
992 0.32
993 0.34
994 0.28
995 0.26
996 0.25
997 0.3
998 0.3
999 0.25
1000 0.21
1001 0.17
1002 0.19
1003 0.19
1004 0.17
1005 0.12
1006 0.12
1007 0.12
1008 0.15
1009 0.15
1010 0.18
1011 0.19
1012 0.22
1013 0.26
1014 0.26
1015 0.27
1016 0.27
1017 0.29
1018 0.28
1019 0.29
1020 0.26
1021 0.26
1022 0.27
1023 0.26
1024 0.24
1025 0.21
1026 0.19
1027 0.15
1028 0.2
1029 0.18
1030 0.21
1031 0.26
1032 0.35
1033 0.44
1034 0.52
1035 0.58
1036 0.62
1037 0.7
1038 0.75
1039 0.8
1040 0.79
1041 0.75
1042 0.75
1043 0.77
1044 0.74
1045 0.68
1046 0.58
1047 0.51
1048 0.5
1049 0.5
1050 0.43
1051 0.37
1052 0.38
1053 0.37
1054 0.44
1055 0.42
1056 0.36
1057 0.33
1058 0.39
1059 0.39
1060 0.38
1061 0.44
1062 0.44
1063 0.49
1064 0.52
1065 0.51
1066 0.47
1067 0.47
1068 0.48
1069 0.46
1070 0.4
1071 0.35
1072 0.32
1073 0.37
1074 0.35