FuNGI

R0JWB2

Protein Details

Accession

R0JWB2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
7-28	VARPSQPPRLRRESQRPGVTRT	Hydrophilic
323-342	HPNNKNPAPPRKTRKRTTAE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3.5, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR021950 Spt20 IPR046468 Spt20-like_SEP
Gene Ontology	GO:0000124 C:SAGA complex GO:0003712 F:transcription coregulator activity
Pfam	View protein in Pfam PF12090 Spt20

Amino Acid Sequences

MSGSVAVARPSQPPRLRRESQRPGVTRTATRQSTMEDDGAKQEEARKYVYTQQDILAKHKGKPPSLRVYLHPKHFRLNDSQETLSYASPMRELLQAIKDKQVPHNMVEELYEFNTPWYDNCLIVEVHDYRSTGVKPKDDTNSTGEGGTNAFSIHNYNNFITPSPYAPFPANKPDAKPTQAPAPAKEAEVKEDKENMPAPGQSGTPNKQSGLGKIRTVVLFPTPQSQLADMQLLATTPVPDMAALKRLQAQGRAAGMPPTPMTAVPSTPAFSNGPSPKRQKMVLDDSNLHEFEAEVLNATCPPLYLEPTKSFGQSLALMDAITHPNNKNPAPPRKTRKRTTAELAADEAEAQGLQRFMLAGDEYQGIMTAAATGNDDNAVRAAANSQTFARFKTIANIRANHEENDRRKKEEDARNAQTKRQAQIEAEIQRKRELEARQQAEVAERQQAALRQQAQHQAQLQQNQLQQNQLQQNEALRAAAAAQHQMSTAAASQVTQTPQSATQSQFSPTVRQQTPMAASAASPRVGGQASHPIGGTPMVPSASNQAVNSPARPPSSVSHHQNQMARSVSQQQNPSRTSTPHIVQGTPVMNPSMPNRNMTPTPSRMNQNSPSMAIQGQTPMMMQTPQPGQNMTLEAIQQLRMQQMRMQHLQQQQGGSPGNQQQQMQQLAFQKAGQHIQQTGVPPNQNPQAYRQQLAQHYFRQLQQQQQQQQQQQQQQQQNQQQQQQMGMQNMTSQGALPQNGMPQQGMAFANMSLQQMRLRYQQQKATVMQNYSNTQSIPPQIMQQMQQMELQIKQREQREQQSQMAHMQNGMGNQMNGGQMSGMQNATPNNPMQMQQYQQMLQQQRQAAANQNRIMQMRQQAMANGGQLPQGMMGNVSAMNGMQNTMQGMNMGNMGNVQGMGMGQMGQMNGGMGGMQNGQMNGVMSGMQGMQGMQGMSQMNQMNQQQMQQMMMMRQAQQQAAQRMGQPGGQQGGDMGWNG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.62
3	0.69
4	0.72
5	0.79
6	0.79
7	0.82
8	0.85
9	0.81
10	0.78
11	0.78
12	0.73
13	0.68
14	0.65
15	0.64
16	0.56
17	0.54
18	0.48
19	0.44
20	0.44
21	0.41
22	0.37
23	0.29
24	0.29
25	0.31
26	0.32
27	0.29
28	0.25
29	0.28
30	0.3
31	0.3
32	0.32
33	0.29
34	0.3
35	0.38
36	0.45
37	0.43
38	0.39
39	0.41
40	0.44
41	0.44
42	0.45
43	0.46
44	0.41
45	0.42
46	0.47
47	0.49
48	0.51
49	0.58
50	0.62
51	0.63
52	0.68
53	0.66
54	0.66
55	0.7
56	0.7
57	0.71
58	0.72
59	0.64
60	0.65
61	0.66
62	0.64
63	0.63
64	0.63
65	0.61
66	0.58
67	0.56
68	0.48
69	0.46
70	0.43
71	0.34
72	0.27
73	0.21
74	0.16
75	0.15
76	0.16
77	0.14
78	0.15
79	0.16
80	0.18
81	0.24
82	0.3
83	0.31
84	0.37
85	0.39
86	0.4
87	0.45
88	0.5
89	0.46
90	0.42
91	0.45
92	0.39
93	0.36
94	0.34
95	0.28
96	0.21
97	0.2
98	0.18
99	0.13
100	0.13
101	0.14
102	0.13
103	0.12
104	0.16
105	0.16
106	0.15
107	0.16
108	0.18
109	0.16
110	0.16
111	0.22
112	0.17
113	0.19
114	0.21
115	0.2
116	0.19
117	0.23
118	0.25
119	0.27
120	0.31
121	0.33
122	0.34
123	0.4
124	0.48
125	0.47
126	0.48
127	0.45
128	0.44
129	0.39
130	0.37
131	0.31
132	0.23
133	0.2
134	0.17
135	0.13
136	0.09
137	0.08
138	0.08
139	0.1
140	0.12
141	0.15
142	0.18
143	0.19
144	0.21
145	0.22
146	0.23
147	0.22
148	0.21
149	0.21
150	0.19
151	0.19
152	0.19
153	0.21
154	0.24
155	0.25
156	0.32
157	0.36
158	0.36
159	0.39
160	0.44
161	0.47
162	0.48
163	0.48
164	0.41
165	0.44
166	0.48
167	0.47
168	0.42
169	0.42
170	0.38
171	0.36
172	0.39
173	0.31
174	0.3
175	0.33
176	0.33
177	0.31
178	0.36
179	0.35
180	0.34
181	0.36
182	0.32
183	0.28
184	0.26
185	0.25
186	0.2
187	0.2
188	0.2
189	0.24
190	0.26
191	0.29
192	0.3
193	0.29
194	0.34
195	0.34
196	0.37
197	0.39
198	0.38
199	0.34
200	0.34
201	0.37
202	0.31
203	0.3
204	0.25
205	0.2
206	0.19
207	0.19
208	0.22
209	0.2
210	0.21
211	0.21
212	0.21
213	0.2
214	0.18
215	0.19
216	0.14
217	0.13
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.08
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.06
227	0.08
228	0.08
229	0.13
230	0.13
231	0.14
232	0.19
233	0.22
234	0.24
235	0.26
236	0.27
237	0.25
238	0.27
239	0.27
240	0.23
241	0.21
242	0.2
243	0.18
244	0.16
245	0.13
246	0.12
247	0.11
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.13
253	0.13
254	0.12
255	0.15
256	0.13
257	0.13
258	0.21
259	0.26
260	0.29
261	0.36
262	0.41
263	0.44
264	0.47
265	0.48
266	0.44
267	0.46
268	0.51
269	0.5
270	0.49
271	0.46
272	0.46
273	0.47
274	0.43
275	0.34
276	0.25
277	0.18
278	0.15
279	0.14
280	0.1
281	0.07
282	0.08
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.07
287	0.05
288	0.07
289	0.08
290	0.11
291	0.14
292	0.18
293	0.2
294	0.24
295	0.25
296	0.24
297	0.23
298	0.2
299	0.19
300	0.16
301	0.15
302	0.12
303	0.11
304	0.1
305	0.1
306	0.11
307	0.12
308	0.11
309	0.13
310	0.13
311	0.16
312	0.21
313	0.21
314	0.27
315	0.33
316	0.43
317	0.46
318	0.55
319	0.63
320	0.7
321	0.79
322	0.79
323	0.81
324	0.77
325	0.77
326	0.75
327	0.74
328	0.65
329	0.57
330	0.51
331	0.41
332	0.34
333	0.27
334	0.19
335	0.1
336	0.07
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.04
344	0.05
345	0.06
346	0.05
347	0.06
348	0.07
349	0.07
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.05
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.06
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.04
367	0.05
368	0.06
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.09
373	0.12
374	0.13
375	0.14
376	0.16
377	0.15
378	0.15
379	0.22
380	0.27
381	0.31
382	0.35
383	0.36
384	0.36
385	0.42
386	0.43
387	0.37
388	0.37
389	0.37
390	0.41
391	0.49
392	0.48
393	0.45
394	0.44
395	0.49
396	0.53
397	0.55
398	0.57
399	0.55
400	0.6
401	0.65
402	0.65
403	0.61
404	0.59
405	0.53
406	0.46
407	0.4
408	0.35
409	0.27
410	0.29
411	0.33
412	0.32
413	0.34
414	0.34
415	0.31
416	0.32
417	0.32
418	0.3
419	0.29
420	0.27
421	0.3
422	0.37
423	0.39
424	0.37
425	0.37
426	0.36
427	0.32
428	0.3
429	0.22
430	0.16
431	0.14
432	0.13
433	0.14
434	0.15
435	0.15
436	0.18
437	0.2
438	0.17
439	0.2
440	0.27
441	0.27
442	0.28
443	0.29
444	0.3
445	0.29
446	0.32
447	0.31
448	0.28
449	0.3
450	0.31
451	0.3
452	0.26
453	0.24
454	0.26
455	0.28
456	0.24
457	0.22
458	0.19
459	0.19
460	0.19
461	0.18
462	0.12
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.07
472	0.07
473	0.07
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.09
486	0.11
487	0.13
488	0.13
489	0.14
490	0.15
491	0.16
492	0.19
493	0.19
494	0.21
495	0.2
496	0.27
497	0.25
498	0.26
499	0.25
500	0.24
501	0.25
502	0.22
503	0.21
504	0.12
505	0.12
506	0.13
507	0.14
508	0.12
509	0.1
510	0.08
511	0.09
512	0.09
513	0.09
514	0.08
515	0.15
516	0.16
517	0.16
518	0.16
519	0.14
520	0.15
521	0.15
522	0.13
523	0.06
524	0.06
525	0.05
526	0.06
527	0.06
528	0.09
529	0.1
530	0.11
531	0.1
532	0.1
533	0.14
534	0.15
535	0.15
536	0.14
537	0.15
538	0.15
539	0.16
540	0.18
541	0.17
542	0.24
543	0.31
544	0.34
545	0.37
546	0.4
547	0.43
548	0.44
549	0.42
550	0.38
551	0.32
552	0.27
553	0.23
554	0.29
555	0.29
556	0.3
557	0.36
558	0.35
559	0.4
560	0.41
561	0.44
562	0.37
563	0.34
564	0.34
565	0.32
566	0.3
567	0.3
568	0.3
569	0.26
570	0.24
571	0.27
572	0.24
573	0.19
574	0.18
575	0.12
576	0.11
577	0.12
578	0.14
579	0.19
580	0.19
581	0.21
582	0.22
583	0.25
584	0.26
585	0.29
586	0.32
587	0.27
588	0.31
589	0.32
590	0.36
591	0.35
592	0.4
593	0.4
594	0.39
595	0.36
596	0.33
597	0.3
598	0.27
599	0.24
600	0.18
601	0.14
602	0.11
603	0.1
604	0.08
605	0.07
606	0.06
607	0.07
608	0.07
609	0.07
610	0.09
611	0.13
612	0.16
613	0.17
614	0.17
615	0.17
616	0.18
617	0.19
618	0.17
619	0.14
620	0.11
621	0.11
622	0.11
623	0.11
624	0.11
625	0.1
626	0.13
627	0.13
628	0.13
629	0.15
630	0.2
631	0.25
632	0.27
633	0.28
634	0.32
635	0.36
636	0.4
637	0.4
638	0.36
639	0.3
640	0.31
641	0.31
642	0.24
643	0.22
644	0.24
645	0.26
646	0.27
647	0.27
648	0.26
649	0.3
650	0.33
651	0.29
652	0.27
653	0.28
654	0.28
655	0.28
656	0.26
657	0.22
658	0.21
659	0.24
660	0.22
661	0.18
662	0.18
663	0.18
664	0.2
665	0.2
666	0.22
667	0.24
668	0.24
669	0.22
670	0.26
671	0.3
672	0.3
673	0.28
674	0.29
675	0.35
676	0.37
677	0.37
678	0.37
679	0.37
680	0.41
681	0.45
682	0.44
683	0.38
684	0.4
685	0.41
686	0.4
687	0.43
688	0.4
689	0.44
690	0.47
691	0.52
692	0.54
693	0.6
694	0.65
695	0.61
696	0.66
697	0.65
698	0.65
699	0.64
700	0.66
701	0.66
702	0.65
703	0.68
704	0.69
705	0.7
706	0.68
707	0.66
708	0.62
709	0.55
710	0.5
711	0.47
712	0.42
713	0.35
714	0.29
715	0.23
716	0.2
717	0.2
718	0.18
719	0.13
720	0.09
721	0.1
722	0.12
723	0.13
724	0.13
725	0.13
726	0.15
727	0.17
728	0.18
729	0.15
730	0.13
731	0.12
732	0.15
733	0.14
734	0.12
735	0.11
736	0.1
737	0.11
738	0.12
739	0.13
740	0.1
741	0.11
742	0.12
743	0.13
744	0.16
745	0.21
746	0.28
747	0.34
748	0.4
749	0.45
750	0.49
751	0.53
752	0.53
753	0.54
754	0.51
755	0.46
756	0.43
757	0.41
758	0.38
759	0.35
760	0.33
761	0.26
762	0.22
763	0.23
764	0.23
765	0.22
766	0.2
767	0.21
768	0.23
769	0.25
770	0.26
771	0.27
772	0.26
773	0.24
774	0.25
775	0.23
776	0.22
777	0.23
778	0.27
779	0.26
780	0.27
781	0.32
782	0.35
783	0.42
784	0.47
785	0.53
786	0.56
787	0.58
788	0.6
789	0.59
790	0.56
791	0.55
792	0.52
793	0.43
794	0.35
795	0.3
796	0.26
797	0.22
798	0.22
799	0.16
800	0.12
801	0.11
802	0.13
803	0.12
804	0.11
805	0.1
806	0.08
807	0.08
808	0.1
809	0.12
810	0.1
811	0.09
812	0.12
813	0.13
814	0.15
815	0.16
816	0.15
817	0.16
818	0.17
819	0.19
820	0.21
821	0.24
822	0.25
823	0.27
824	0.3
825	0.29
826	0.3
827	0.37
828	0.37
829	0.35
830	0.39
831	0.37
832	0.37
833	0.38
834	0.38
835	0.4
836	0.43
837	0.48
838	0.45
839	0.45
840	0.46
841	0.45
842	0.45
843	0.4
844	0.39
845	0.35
846	0.34
847	0.32
848	0.29
849	0.3
850	0.3
851	0.26
852	0.2
853	0.16
854	0.15
855	0.14
856	0.13
857	0.12
858	0.1
859	0.09
860	0.08
861	0.07
862	0.07
863	0.07
864	0.07
865	0.06
866	0.06
867	0.07
868	0.07
869	0.07
870	0.07
871	0.07
872	0.09
873	0.09
874	0.09
875	0.09
876	0.09
877	0.09
878	0.11
879	0.11
880	0.09
881	0.09
882	0.1
883	0.09
884	0.08
885	0.07
886	0.05
887	0.05
888	0.05
889	0.05
890	0.05
891	0.05
892	0.06
893	0.06
894	0.06
895	0.06
896	0.06
897	0.06
898	0.05
899	0.05
900	0.04
901	0.05
902	0.06
903	0.08
904	0.09
905	0.09
906	0.09
907	0.1
908	0.11
909	0.09
910	0.09
911	0.07
912	0.06
913	0.07
914	0.07
915	0.07
916	0.06
917	0.06
918	0.06
919	0.08
920	0.08
921	0.07
922	0.1
923	0.1
924	0.11
925	0.16
926	0.18
927	0.17
928	0.23
929	0.26
930	0.28
931	0.28
932	0.31
933	0.29
934	0.28
935	0.28
936	0.24
937	0.25
938	0.22
939	0.25
940	0.25
941	0.24
942	0.28
943	0.31
944	0.3
945	0.33
946	0.39
947	0.39
948	0.4
949	0.39
950	0.38
951	0.38
952	0.38
953	0.35
954	0.29
955	0.28
956	0.28
957	0.26
958	0.22
959	0.18
960	0.18

R0JWB2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer