Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IIM9

Protein Details
Accession R0IIM9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
107-132YQEVDEKMDKRRRARREAREQQEREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-122KRRRARR
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 10.5, cyto 5.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
Amino Acid Sequences MSRRDFLSMPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQMKEMLAKRAASLGQAAPSAYGVTEKKEEERDEDEDRFQDPDNEVGLFSSGMNYDKDDDEADRIYQEVDEKMDKRRRARREAREQQEREEYERNNPKIQLQFADLKRALGGVSEEEWAALPEVGDMTGKAKRAREARMANARSYAVPDSVLSAASKSGELDTSISTNDADGMTTNLASIGAAQLSALTVRLDSAASTPGTQTSTTSGTSTSVDPKGYMTALSKKEAMGEEVPVEDINRARVLLESAVKTNVHNGPGYVALARLEEVAGKIHTAKKVIARGCELCPRSVVVWEEAIRLNRDNLHNAKIIAASGIKQNTKAVKLWQAAIELEQTPAARKKVTRQALDHNPQSVELWKTLINDTEELDAVRLLFAKATETVPLSEELWISYARVSEPEAAQQILNKARKAIPTSWAIWIHACRLQEELGKVEMLDTIMTRAVKSLIKENAMIKREEWITQAEICEEQGDKGTATAIIKATVGWGLDEDDERRDIWLEDARSVLNRNKPETARAILGFAVAVFPYSTTVWHAFADLEKHHGTMDSLLSVLERAVNACPTSESLWLLYAREMWQSGDPEGARKVLGRSFEALPGNEMLYTRAVDFEVDAGNYEQARSFLQVARESAATDRIYMKSAVLERQLGNYETAIDICNQGLQNWPGSWKLHAIKGQVYEQLSKLPEAHEAFNIGTRAAPKAPVLFLLLSRLQVKQGAIVKARSTLDRGRQQNPKSEQILLEQVRLERRQNNTSAAQQLMAGALQQCPNSGLLWAEKIMHLEGRTQRKPRALEAIKKVEKDALLFVVVARIFWAERRLDKAATWFVKAVTLDSDFGDAWIWYYKFLLQHGTDEKKQDTLSKAALAEPRHGEIWQAVAKDPKNARKSVEEILKIAAEIAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.2
3 0.15
4 0.12
5 0.1
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.08
11 0.09
12 0.1
13 0.11
14 0.15
15 0.15
16 0.16
17 0.21
18 0.23
19 0.25
20 0.3
21 0.31
22 0.29
23 0.31
24 0.32
25 0.31
26 0.36
27 0.38
28 0.33
29 0.32
30 0.29
31 0.28
32 0.32
33 0.33
34 0.31
35 0.29
36 0.29
37 0.28
38 0.32
39 0.31
40 0.26
41 0.26
42 0.21
43 0.2
44 0.2
45 0.19
46 0.16
47 0.15
48 0.14
49 0.11
50 0.13
51 0.12
52 0.15
53 0.19
54 0.21
55 0.25
56 0.31
57 0.34
58 0.34
59 0.39
60 0.4
61 0.42
62 0.43
63 0.42
64 0.37
65 0.36
66 0.32
67 0.28
68 0.27
69 0.23
70 0.22
71 0.21
72 0.2
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.12
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.1
81 0.11
82 0.12
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.15
87 0.16
88 0.17
89 0.18
90 0.17
91 0.15
92 0.15
93 0.14
94 0.13
95 0.14
96 0.13
97 0.14
98 0.2
99 0.21
100 0.31
101 0.39
102 0.45
103 0.52
104 0.6
105 0.66
106 0.72
107 0.8
108 0.82
109 0.85
110 0.89
111 0.9
112 0.91
113 0.84
114 0.8
115 0.78
116 0.7
117 0.64
118 0.61
119 0.53
120 0.52
121 0.59
122 0.56
123 0.52
124 0.51
125 0.51
126 0.49
127 0.5
128 0.43
129 0.37
130 0.43
131 0.39
132 0.47
133 0.41
134 0.36
135 0.33
136 0.3
137 0.25
138 0.17
139 0.17
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.07
154 0.06
155 0.08
156 0.11
157 0.14
158 0.18
159 0.2
160 0.26
161 0.32
162 0.38
163 0.44
164 0.48
165 0.54
166 0.61
167 0.61
168 0.56
169 0.52
170 0.48
171 0.38
172 0.36
173 0.28
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.15
178 0.14
179 0.14
180 0.11
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.06
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.12
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.13
237 0.14
238 0.15
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.17
243 0.17
244 0.17
245 0.16
246 0.15
247 0.14
248 0.2
249 0.22
250 0.23
251 0.23
252 0.22
253 0.25
254 0.24
255 0.24
256 0.17
257 0.16
258 0.14
259 0.14
260 0.14
261 0.11
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.11
272 0.14
273 0.13
274 0.14
275 0.16
276 0.16
277 0.16
278 0.2
279 0.2
280 0.19
281 0.17
282 0.16
283 0.16
284 0.16
285 0.17
286 0.11
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.09
299 0.12
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.2
304 0.27
305 0.29
306 0.29
307 0.3
308 0.31
309 0.33
310 0.38
311 0.35
312 0.29
313 0.27
314 0.26
315 0.22
316 0.22
317 0.2
318 0.14
319 0.16
320 0.16
321 0.17
322 0.18
323 0.19
324 0.18
325 0.17
326 0.17
327 0.18
328 0.19
329 0.23
330 0.24
331 0.26
332 0.26
333 0.25
334 0.25
335 0.2
336 0.19
337 0.14
338 0.11
339 0.09
340 0.11
341 0.14
342 0.13
343 0.14
344 0.17
345 0.19
346 0.21
347 0.21
348 0.21
349 0.25
350 0.26
351 0.27
352 0.25
353 0.24
354 0.22
355 0.21
356 0.2
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.09
361 0.1
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.15
366 0.22
367 0.31
368 0.38
369 0.4
370 0.41
371 0.49
372 0.57
373 0.62
374 0.57
375 0.5
376 0.42
377 0.38
378 0.35
379 0.29
380 0.2
381 0.14
382 0.13
383 0.12
384 0.13
385 0.14
386 0.15
387 0.13
388 0.12
389 0.13
390 0.13
391 0.12
392 0.1
393 0.1
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.05
402 0.06
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.08
407 0.09
408 0.1
409 0.09
410 0.09
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.07
415 0.07
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.08
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.11
428 0.13
429 0.18
430 0.21
431 0.19
432 0.2
433 0.22
434 0.24
435 0.27
436 0.25
437 0.22
438 0.23
439 0.25
440 0.27
441 0.25
442 0.23
443 0.21
444 0.19
445 0.18
446 0.17
447 0.15
448 0.12
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.13
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.06
460 0.06
461 0.04
462 0.04
463 0.06
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.08
468 0.09
469 0.1
470 0.15
471 0.16
472 0.17
473 0.19
474 0.22
475 0.27
476 0.27
477 0.27
478 0.21
479 0.22
480 0.22
481 0.21
482 0.19
483 0.15
484 0.14
485 0.15
486 0.15
487 0.12
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.08
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.06
512 0.07
513 0.07
514 0.07
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.09
521 0.13
522 0.12
523 0.12
524 0.13
525 0.13
526 0.13
527 0.16
528 0.18
529 0.2
530 0.22
531 0.25
532 0.29
533 0.29
534 0.32
535 0.33
536 0.3
537 0.27
538 0.24
539 0.22
540 0.17
541 0.16
542 0.13
543 0.09
544 0.07
545 0.04
546 0.04
547 0.03
548 0.03
549 0.05
550 0.05
551 0.05
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.11
557 0.1
558 0.11
559 0.13
560 0.11
561 0.14
562 0.13
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.12
567 0.11
568 0.11
569 0.07
570 0.07
571 0.06
572 0.06
573 0.06
574 0.06
575 0.05
576 0.04
577 0.05
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.09
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.1
588 0.12
589 0.12
590 0.12
591 0.11
592 0.11
593 0.1
594 0.11
595 0.11
596 0.1
597 0.12
598 0.13
599 0.13
600 0.15
601 0.14
602 0.15
603 0.15
604 0.15
605 0.13
606 0.12
607 0.14
608 0.13
609 0.15
610 0.15
611 0.17
612 0.18
613 0.22
614 0.23
615 0.21
616 0.2
617 0.19
618 0.17
619 0.14
620 0.13
621 0.1
622 0.09
623 0.09
624 0.08
625 0.08
626 0.08
627 0.08
628 0.07
629 0.07
630 0.07
631 0.07
632 0.07
633 0.07
634 0.09
635 0.08
636 0.09
637 0.08
638 0.08
639 0.09
640 0.09
641 0.11
642 0.13
643 0.16
644 0.18
645 0.19
646 0.2
647 0.19
648 0.18
649 0.17
650 0.19
651 0.16
652 0.15
653 0.16
654 0.16
655 0.17
656 0.17
657 0.16
658 0.15
659 0.17
660 0.19
661 0.18
662 0.21
663 0.19
664 0.22
665 0.24
666 0.21
667 0.19
668 0.16
669 0.15
670 0.12
671 0.12
672 0.1
673 0.09
674 0.08
675 0.08
676 0.11
677 0.1
678 0.1
679 0.14
680 0.14
681 0.16
682 0.16
683 0.17
684 0.17
685 0.18
686 0.19
687 0.21
688 0.23
689 0.26
690 0.29
691 0.3
692 0.31
693 0.33
694 0.34
695 0.32
696 0.31
697 0.28
698 0.25
699 0.27
700 0.24
701 0.21
702 0.2
703 0.17
704 0.21
705 0.21
706 0.22
707 0.19
708 0.19
709 0.19
710 0.21
711 0.21
712 0.15
713 0.14
714 0.13
715 0.15
716 0.14
717 0.15
718 0.13
719 0.15
720 0.15
721 0.15
722 0.16
723 0.14
724 0.14
725 0.17
726 0.17
727 0.17
728 0.18
729 0.17
730 0.16
731 0.18
732 0.18
733 0.19
734 0.24
735 0.28
736 0.29
737 0.31
738 0.31
739 0.33
740 0.34
741 0.3
742 0.29
743 0.3
744 0.36
745 0.43
746 0.48
747 0.51
748 0.58
749 0.61
750 0.66
751 0.65
752 0.64
753 0.57
754 0.55
755 0.48
756 0.42
757 0.48
758 0.39
759 0.36
760 0.3
761 0.3
762 0.33
763 0.35
764 0.36
765 0.33
766 0.38
767 0.42
768 0.44
769 0.46
770 0.44
771 0.46
772 0.45
773 0.4
774 0.34
775 0.27
776 0.24
777 0.19
778 0.15
779 0.12
780 0.08
781 0.1
782 0.12
783 0.12
784 0.12
785 0.13
786 0.14
787 0.12
788 0.12
789 0.12
790 0.11
791 0.13
792 0.13
793 0.14
794 0.14
795 0.15
796 0.15
797 0.17
798 0.15
799 0.21
800 0.28
801 0.37
802 0.44
803 0.48
804 0.53
805 0.57
806 0.6
807 0.57
808 0.61
809 0.59
810 0.61
811 0.65
812 0.7
813 0.68
814 0.65
815 0.62
816 0.55
817 0.47
818 0.4
819 0.33
820 0.24
821 0.19
822 0.18
823 0.17
824 0.18
825 0.16
826 0.14
827 0.12
828 0.11
829 0.11
830 0.13
831 0.18
832 0.17
833 0.21
834 0.27
835 0.3
836 0.3
837 0.31
838 0.36
839 0.41
840 0.39
841 0.39
842 0.34
843 0.31
844 0.33
845 0.32
846 0.27
847 0.21
848 0.2
849 0.18
850 0.18
851 0.2
852 0.15
853 0.15
854 0.15
855 0.11
856 0.11
857 0.16
858 0.15
859 0.14
860 0.15
861 0.18
862 0.19
863 0.21
864 0.26
865 0.21
866 0.28
867 0.36
868 0.43
869 0.44
870 0.47
871 0.47
872 0.44
873 0.44
874 0.43
875 0.39
876 0.37
877 0.36
878 0.35
879 0.34
880 0.35
881 0.38
882 0.34
883 0.36
884 0.34
885 0.34
886 0.31
887 0.3
888 0.27
889 0.23
890 0.27
891 0.24
892 0.23
893 0.22
894 0.29
895 0.3
896 0.37
897 0.44
898 0.48
899 0.51
900 0.53
901 0.55
902 0.54
903 0.58
904 0.58
905 0.59
906 0.53
907 0.48
908 0.47
909 0.43
910 0.36