Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CXV5

Protein Details
Accession B0CXV5    Localization Confidence Low Confidence Score 9.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
142-164ETYWNPPKKAKPQHPSTRKQYGQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023251  Brr1  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0030532  C:small nuclear ribonucleoprotein complex  
GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_311626  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MAPFKRKRGEDDEDDEDDLAYGKQILPVANLPDDFDEEPLDGMQYLFTVRRDARYLPHVVRAVNPYEIPEVAKTTIQDTIAPHPSLPSREWCRLLETRLSNFRKNLNQPTIHVGPAHAAHQKLMPDKKERDHWWDFLAGKPETYWNPPKKAKPQHPSTRKQYGQGLRAWESHSMVGPPEMQQSVVLHGNDDDEVRQLPSGEPTETPPSPKGTTGDLECPDELVSPNVWSKLPGHPPREPSTTLLKLIDERMALHLLMYFTHWINLYLQQRDQAHYPEESHARWIFALLARVDDHISADDMNLLRNVARACLAFLKFLIKGRITSTVQGLSPTNGLNERSCWIIVSTIIGNWKQRDLWMDAEDMLKEMACEIPQTVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.49
3 0.4
4 0.31
5 0.24
6 0.17
7 0.11
8 0.09
9 0.08
10 0.1
11 0.12
12 0.13
13 0.15
14 0.18
15 0.21
16 0.23
17 0.22
18 0.21
19 0.2
20 0.23
21 0.21
22 0.19
23 0.16
24 0.14
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.08
33 0.09
34 0.1
35 0.15
36 0.17
37 0.21
38 0.24
39 0.26
40 0.29
41 0.33
42 0.4
43 0.36
44 0.42
45 0.41
46 0.38
47 0.41
48 0.4
49 0.36
50 0.32
51 0.29
52 0.24
53 0.24
54 0.23
55 0.2
56 0.17
57 0.17
58 0.16
59 0.17
60 0.15
61 0.15
62 0.17
63 0.16
64 0.17
65 0.17
66 0.23
67 0.27
68 0.27
69 0.25
70 0.25
71 0.27
72 0.28
73 0.28
74 0.3
75 0.31
76 0.36
77 0.4
78 0.38
79 0.42
80 0.43
81 0.44
82 0.43
83 0.41
84 0.42
85 0.48
86 0.52
87 0.5
88 0.49
89 0.52
90 0.52
91 0.55
92 0.58
93 0.56
94 0.53
95 0.51
96 0.55
97 0.51
98 0.43
99 0.36
100 0.27
101 0.21
102 0.2
103 0.21
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.16
108 0.19
109 0.24
110 0.28
111 0.3
112 0.35
113 0.39
114 0.43
115 0.49
116 0.51
117 0.52
118 0.52
119 0.49
120 0.43
121 0.43
122 0.4
123 0.34
124 0.36
125 0.27
126 0.22
127 0.21
128 0.22
129 0.19
130 0.24
131 0.31
132 0.3
133 0.38
134 0.44
135 0.5
136 0.57
137 0.66
138 0.7
139 0.7
140 0.74
141 0.78
142 0.81
143 0.83
144 0.81
145 0.81
146 0.73
147 0.67
148 0.65
149 0.6
150 0.55
151 0.49
152 0.46
153 0.38
154 0.37
155 0.35
156 0.28
157 0.23
158 0.19
159 0.16
160 0.12
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.08
165 0.09
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.12
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.07
179 0.05
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.08
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.12
190 0.17
191 0.17
192 0.19
193 0.18
194 0.21
195 0.21
196 0.21
197 0.2
198 0.17
199 0.19
200 0.19
201 0.22
202 0.2
203 0.21
204 0.19
205 0.18
206 0.16
207 0.15
208 0.13
209 0.09
210 0.08
211 0.08
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.12
217 0.18
218 0.27
219 0.33
220 0.38
221 0.41
222 0.46
223 0.5
224 0.52
225 0.47
226 0.4
227 0.41
228 0.38
229 0.35
230 0.31
231 0.26
232 0.24
233 0.23
234 0.22
235 0.14
236 0.13
237 0.13
238 0.13
239 0.12
240 0.11
241 0.11
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.08
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.11
251 0.17
252 0.21
253 0.22
254 0.23
255 0.27
256 0.28
257 0.29
258 0.3
259 0.26
260 0.24
261 0.23
262 0.24
263 0.24
264 0.26
265 0.25
266 0.28
267 0.25
268 0.24
269 0.22
270 0.2
271 0.18
272 0.16
273 0.2
274 0.15
275 0.16
276 0.15
277 0.16
278 0.16
279 0.14
280 0.13
281 0.1
282 0.1
283 0.08
284 0.08
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.13
292 0.13
293 0.1
294 0.12
295 0.11
296 0.13
297 0.19
298 0.2
299 0.17
300 0.18
301 0.2
302 0.21
303 0.24
304 0.27
305 0.22
306 0.23
307 0.25
308 0.32
309 0.3
310 0.31
311 0.31
312 0.28
313 0.27
314 0.28
315 0.27
316 0.21
317 0.21
318 0.19
319 0.18
320 0.18
321 0.2
322 0.19
323 0.2
324 0.19
325 0.2
326 0.2
327 0.18
328 0.16
329 0.15
330 0.14
331 0.15
332 0.15
333 0.14
334 0.19
335 0.21
336 0.25
337 0.26
338 0.28
339 0.26
340 0.27
341 0.3
342 0.29
343 0.32
344 0.29
345 0.29
346 0.28
347 0.28
348 0.26
349 0.22
350 0.18
351 0.13
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.09
356 0.1