FuNGI

B0CVD1

Protein Details

Accession

B0CVD1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
269-295	LSSEKSQEKQRGKRKRLESRKSSKDVT	Hydrophilic
297-323	IAKAREKEKEREGRRRKPKSSIEWPFS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
277-315	KQRGKRKRLESRKSSKDVTEIAKAREKEKEREGRRRKPK

Subcellular Location(s)

mito 10, nucl 9, cyto_nucl 8.5, cyto 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_309027 -
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MKIVTTFHQSSSVLSSFKCQLGTRDTEHLVVAKLNRLDVYSLKPQGLHHECGVEIWGKVLTVKAIPQIGSARSTIVLMIAHPDPELVFFTYIDRQGDNPALEVSKKLSLFERIARPAEFFNDVLVHPSGKLALVSCYSGKLKIIRLKCGTYDKDYDVQLPEVNVFSVTFLSSFNGEYAVAILYLDYQERVQLVARDILVNGDDITVSEEPSTLLHPTPISNKTLPFPTESVPQLVSVPPEELDEDTDVDDAFLGGVLVVGGRQILLFELSSEKSQEKQRGKRKRLESRKSSKDVTEIAKAREKEKEREGRRRKPKSSIEWPFSELAAWCAIDKAPYRYLIGDSFGRLSILSLDKVQRIGLVLIPFGEASSPTSLTYLTNQLVYVGSHSGDSQLIRLSPLPISSSESPTLPIPPEIKTVSPNLLEALGHRKGKSKSVAEDHMDEDHDDEDDASQGYIVETHGSFIEVLSSYKNLAPILDAILVDTDGSGQQHIVTCSGARSTGSINIVRNGADFQEIGHVPGLTGVVGVWSVRTMLEDTTDRYILVSTNRSTHLFEIDDSGSTSTITPVDSTTIRSLVTTEATLAFSNLARRSSVGGSSVYKNSPLAVQVVASGARLLKSNTAFGGYELVAQYSMLSSVPYGQRPLEVVAASANASQLVMAASGGKLTLWRLGENVDALEMIAGCQRKEGPEISAVSCAPLNTTKRTSPTIIVSYWQSNTIEILQVSLKGLESVYKSPTLPALVRSVLLYNFGSDTNPKGTDHHPYLLAGLANGTVASFRWKDKQLTDKKIIPLGHAPVNLMPCQVEGRHAVFAAGNRATVLSFENKRLVHSPIMLKDISSAARLNTPTFASSLILSTPTGLFIGRVQGLGKLHIRSIPFGFDNPRKIAHEPSIKAFGVAFTTMEPNRVNDPEISRSSFKLLDDTSFANLCQFNCDPDEETTAVVSFSQKIAGKPMPFFCVGTYVYKAGEVEPSAGRLMIFTATTSTSSNLALSLMASTKVPGCVYALTVVQNQIVAAVNSSVMLFRLESSSDSLSPSLIKVSEWHHNYLVTSLGSYADRVVVGDQPSSISLLQVTQSKLISQARDYGPLWPVCVEALDERHIIGANDSLNLFTFSLEKAMGRSRLERDGCYHVADLVTKFLRGSLSSSDASTTSPLTSEAMFFTSSGRIGVVVDVKDEELSLQLTNMQRNLANVIQGVGGSSHSKYRAPKTTRGTSDADSGAIGFLDGDFLEQFLTHVLSPQQSEKVIQGQSPPERLTITREALQMVIEDLQSLH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.27
3	0.27
4	0.29
5	0.3
6	0.25
7	0.27
8	0.33
9	0.39
10	0.38
11	0.41
12	0.41
13	0.39
14	0.38
15	0.35
16	0.29
17	0.28
18	0.26
19	0.25
20	0.25
21	0.25
22	0.24
23	0.24
24	0.25
25	0.24
26	0.28
27	0.3
28	0.32
29	0.32
30	0.33
31	0.33
32	0.41
33	0.44
34	0.42
35	0.35
36	0.33
37	0.32
38	0.31
39	0.32
40	0.24
41	0.18
42	0.15
43	0.13
44	0.11
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.11
49	0.14
50	0.17
51	0.19
52	0.19
53	0.22
54	0.25
55	0.25
56	0.26
57	0.24
58	0.21
59	0.18
60	0.19
61	0.15
62	0.13
63	0.11
64	0.09
65	0.12
66	0.12
67	0.12
68	0.12
69	0.12
70	0.11
71	0.12
72	0.14
73	0.12
74	0.12
75	0.12
76	0.15
77	0.19
78	0.22
79	0.22
80	0.21
81	0.2
82	0.23
83	0.28
84	0.25
85	0.22
86	0.21
87	0.21
88	0.21
89	0.21
90	0.2
91	0.21
92	0.21
93	0.21
94	0.23
95	0.27
96	0.31
97	0.37
98	0.42
99	0.41
100	0.44
101	0.44
102	0.43
103	0.38
104	0.38
105	0.33
106	0.25
107	0.22
108	0.21
109	0.2
110	0.21
111	0.21
112	0.18
113	0.14
114	0.15
115	0.13
116	0.12
117	0.12
118	0.09
119	0.11
120	0.12
121	0.14
122	0.14
123	0.18
124	0.19
125	0.19
126	0.22
127	0.23
128	0.29
129	0.35
130	0.39
131	0.45
132	0.48
133	0.5
134	0.53
135	0.58
136	0.54
137	0.52
138	0.53
139	0.48
140	0.47
141	0.46
142	0.43
143	0.37
144	0.34
145	0.29
146	0.25
147	0.22
148	0.18
149	0.17
150	0.14
151	0.11
152	0.1
153	0.09
154	0.08
155	0.08
156	0.08
157	0.09
158	0.09
159	0.1
160	0.09
161	0.09
162	0.09
163	0.08
164	0.09
165	0.08
166	0.07
167	0.06
168	0.06
169	0.06
170	0.06
171	0.07
172	0.07
173	0.07
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.11
178	0.13
179	0.15
180	0.17
181	0.18
182	0.17
183	0.17
184	0.17
185	0.15
186	0.13
187	0.11
188	0.08
189	0.07
190	0.06
191	0.1
192	0.1
193	0.1
194	0.09
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.12
199	0.09
200	0.1
201	0.11
202	0.11
203	0.14
204	0.2
205	0.22
206	0.26
207	0.26
208	0.28
209	0.29
210	0.34
211	0.33
212	0.3
213	0.3
214	0.27
215	0.3
216	0.3
217	0.29
218	0.25
219	0.24
220	0.21
221	0.2
222	0.19
223	0.15
224	0.14
225	0.12
226	0.12
227	0.13
228	0.12
229	0.13
230	0.12
231	0.12
232	0.11
233	0.11
234	0.1
235	0.09
236	0.08
237	0.06
238	0.05
239	0.04
240	0.03
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.02
246	0.03
247	0.03
248	0.03
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.09
256	0.1
257	0.11
258	0.13
259	0.14
260	0.17
261	0.24
262	0.33
263	0.4
264	0.48
265	0.58
266	0.67
267	0.74
268	0.8
269	0.83
270	0.86
271	0.87
272	0.88
273	0.88
274	0.88
275	0.9
276	0.86
277	0.79
278	0.7
279	0.63
280	0.58
281	0.51
282	0.49
283	0.44
284	0.42
285	0.45
286	0.44
287	0.42
288	0.45
289	0.46
290	0.43
291	0.49
292	0.56
293	0.58
294	0.68
295	0.76
296	0.78
297	0.84
298	0.88
299	0.84
300	0.84
301	0.85
302	0.83
303	0.84
304	0.83
305	0.77
306	0.69
307	0.66
308	0.57
309	0.48
310	0.39
311	0.28
312	0.2
313	0.15
314	0.12
315	0.09
316	0.09
317	0.09
318	0.11
319	0.13
320	0.16
321	0.18
322	0.19
323	0.2
324	0.2
325	0.22
326	0.2
327	0.21
328	0.18
329	0.16
330	0.16
331	0.15
332	0.14
333	0.12
334	0.11
335	0.11
336	0.12
337	0.12
338	0.13
339	0.16
340	0.16
341	0.17
342	0.17
343	0.14
344	0.13
345	0.13
346	0.13
347	0.12
348	0.11
349	0.1
350	0.11
351	0.1
352	0.09
353	0.08
354	0.05
355	0.07
356	0.08
357	0.09
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.12
363	0.14
364	0.13
365	0.13
366	0.13
367	0.13
368	0.13
369	0.12
370	0.12
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.08
376	0.09
377	0.09
378	0.08
379	0.09
380	0.09
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.11
388	0.16
389	0.17
390	0.2
391	0.2
392	0.19
393	0.2
394	0.19
395	0.2
396	0.16
397	0.17
398	0.15
399	0.15
400	0.18
401	0.19
402	0.19
403	0.19
404	0.2
405	0.2
406	0.19
407	0.18
408	0.15
409	0.14
410	0.13
411	0.12
412	0.17
413	0.19
414	0.2
415	0.2
416	0.27
417	0.28
418	0.34
419	0.39
420	0.37
421	0.38
422	0.42
423	0.47
424	0.43
425	0.44
426	0.39
427	0.34
428	0.3
429	0.24
430	0.19
431	0.13
432	0.11
433	0.09
434	0.07
435	0.06
436	0.06
437	0.06
438	0.05
439	0.05
440	0.04
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.07
452	0.06
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.08
457	0.09
458	0.1
459	0.09
460	0.08
461	0.09
462	0.08
463	0.09
464	0.09
465	0.08
466	0.07
467	0.07
468	0.07
469	0.06
470	0.05
471	0.04
472	0.04
473	0.04
474	0.04
475	0.04
476	0.05
477	0.07
478	0.07
479	0.08
480	0.07
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.11
489	0.13
490	0.15
491	0.16
492	0.17
493	0.17
494	0.16
495	0.15
496	0.13
497	0.1
498	0.09
499	0.08
500	0.06
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.1
506	0.09
507	0.09
508	0.09
509	0.05
510	0.05
511	0.04
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.04
520	0.05
521	0.05
522	0.07
523	0.08
524	0.1
525	0.12
526	0.12
527	0.12
528	0.11
529	0.11
530	0.1
531	0.12
532	0.13
533	0.12
534	0.14
535	0.16
536	0.17
537	0.18
538	0.18
539	0.18
540	0.15
541	0.14
542	0.15
543	0.14
544	0.13
545	0.12
546	0.12
547	0.09
548	0.09
549	0.09
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.06
554	0.05
555	0.07
556	0.07
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.1
563	0.09
564	0.09
565	0.07
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.08
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.1
574	0.11
575	0.11
576	0.1
577	0.1
578	0.13
579	0.13
580	0.13
581	0.11
582	0.11
583	0.13
584	0.15
585	0.17
586	0.15
587	0.14
588	0.14
589	0.13
590	0.12
591	0.1
592	0.09
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.06
599	0.06
600	0.05
601	0.05
602	0.06
603	0.06
604	0.08
605	0.09
606	0.1
607	0.1
608	0.11
609	0.1
610	0.1
611	0.12
612	0.08
613	0.09
614	0.08
615	0.08
616	0.07
617	0.06
618	0.06
619	0.04
620	0.04
621	0.03
622	0.03
623	0.03
624	0.06
625	0.08
626	0.09
627	0.1
628	0.1
629	0.1
630	0.11
631	0.12
632	0.1
633	0.09
634	0.08
635	0.07
636	0.08
637	0.08
638	0.07
639	0.06
640	0.04
641	0.04
642	0.04
643	0.04
644	0.03
645	0.03
646	0.03
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.03
652	0.03
653	0.04
654	0.07
655	0.07
656	0.07
657	0.08
658	0.09
659	0.09
660	0.09
661	0.09
662	0.06
663	0.05
664	0.05
665	0.04
666	0.03
667	0.03
668	0.05
669	0.06
670	0.06
671	0.07
672	0.07
673	0.08
674	0.1
675	0.11
676	0.1
677	0.13
678	0.15
679	0.15
680	0.17
681	0.16
682	0.14
683	0.14
684	0.12
685	0.1
686	0.12
687	0.14
688	0.16
689	0.19
690	0.2
691	0.23
692	0.26
693	0.26
694	0.24
695	0.25
696	0.25
697	0.22
698	0.21
699	0.21
700	0.2
701	0.18
702	0.18
703	0.14
704	0.12
705	0.12
706	0.11
707	0.1
708	0.08
709	0.09
710	0.07
711	0.07
712	0.08
713	0.07
714	0.06
715	0.05
716	0.05
717	0.07
718	0.08
719	0.1
720	0.11
721	0.12
722	0.13
723	0.13
724	0.14
725	0.14
726	0.12
727	0.12
728	0.13
729	0.12
730	0.13
731	0.13
732	0.13
733	0.11
734	0.12
735	0.11
736	0.08
737	0.09
738	0.09
739	0.09
740	0.09
741	0.11
742	0.11
743	0.12
744	0.12
745	0.14
746	0.16
747	0.22
748	0.24
749	0.24
750	0.22
751	0.21
752	0.21
753	0.19
754	0.18
755	0.11
756	0.08
757	0.06
758	0.05
759	0.05
760	0.04
761	0.03
762	0.03
763	0.07
764	0.08
765	0.09
766	0.15
767	0.18
768	0.21
769	0.26
770	0.36
771	0.42
772	0.49
773	0.54
774	0.54
775	0.53
776	0.55
777	0.51
778	0.43
779	0.37
780	0.33
781	0.3
782	0.25
783	0.23
784	0.2
785	0.21
786	0.19
787	0.15
788	0.12
789	0.09
790	0.1
791	0.1
792	0.1
793	0.11
794	0.13
795	0.13
796	0.13
797	0.13
798	0.12
799	0.13
800	0.16
801	0.13
802	0.11
803	0.11
804	0.11
805	0.1
806	0.1
807	0.11
808	0.12
809	0.14
810	0.16
811	0.21
812	0.21
813	0.23
814	0.25
815	0.26
816	0.22
817	0.24
818	0.27
819	0.24
820	0.27
821	0.25
822	0.22
823	0.21
824	0.2
825	0.17
826	0.14
827	0.13
828	0.1
829	0.14
830	0.15
831	0.14
832	0.14
833	0.14
834	0.13
835	0.13
836	0.13
837	0.1
838	0.1
839	0.09
840	0.08
841	0.08
842	0.08
843	0.08
844	0.07
845	0.07
846	0.07
847	0.06
848	0.06
849	0.06
850	0.09
851	0.09
852	0.09
853	0.09
854	0.11
855	0.12
856	0.15
857	0.17
858	0.15
859	0.16
860	0.18
861	0.18
862	0.18
863	0.19
864	0.19
865	0.17
866	0.18
867	0.24
868	0.26
869	0.3
870	0.29
871	0.31
872	0.31
873	0.32
874	0.34
875	0.36
876	0.39
877	0.36
878	0.38
879	0.41
880	0.37
881	0.36
882	0.31
883	0.24
884	0.17
885	0.16
886	0.12
887	0.08
888	0.12
889	0.12
890	0.15
891	0.15
892	0.15
893	0.18
894	0.19
895	0.19
896	0.18
897	0.22
898	0.25
899	0.27
900	0.29
901	0.27
902	0.27
903	0.29
904	0.28
905	0.24
906	0.23
907	0.21
908	0.18
909	0.19
910	0.19
911	0.18
912	0.17
913	0.17
914	0.15
915	0.16
916	0.15
917	0.18
918	0.17
919	0.16
920	0.17
921	0.19
922	0.19
923	0.19
924	0.22
925	0.17
926	0.17
927	0.16
928	0.15
929	0.13
930	0.11
931	0.1
932	0.08
933	0.07
934	0.12
935	0.13
936	0.13
937	0.19
938	0.24
939	0.25
940	0.28
941	0.3
942	0.29
943	0.28
944	0.28
945	0.22
946	0.22
947	0.21
948	0.2
949	0.2
950	0.18
951	0.17
952	0.17
953	0.17
954	0.13
955	0.14
956	0.12
957	0.13
958	0.12
959	0.13
960	0.13
961	0.13
962	0.12
963	0.09
964	0.1
965	0.08
966	0.07
967	0.06
968	0.07
969	0.08
970	0.09
971	0.1
972	0.11
973	0.11
974	0.11
975	0.11
976	0.1
977	0.09
978	0.08
979	0.07
980	0.07
981	0.07
982	0.07
983	0.07
984	0.07
985	0.08
986	0.1
987	0.1
988	0.09
989	0.1
990	0.1
991	0.11
992	0.12
993	0.12
994	0.12
995	0.14
996	0.14
997	0.13
998	0.13
999	0.11
1000	0.11
1001	0.11
1002	0.09
1003	0.08
1004	0.07
1005	0.07
1006	0.07
1007	0.07
1008	0.06
1009	0.06
1010	0.06
1011	0.06
1012	0.06
1013	0.08
1014	0.08
1015	0.09
1016	0.13
1017	0.15
1018	0.15
1019	0.16
1020	0.16
1021	0.15
1022	0.15
1023	0.14
1024	0.13
1025	0.1
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.15
1029	0.23
1030	0.26
1031	0.29
1032	0.28
1033	0.29
1034	0.29
1035	0.27
1036	0.26
1037	0.17
1038	0.14
1039	0.11
1040	0.11
1041	0.11
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.08
1045	0.08
1046	0.08
1047	0.09
1048	0.11
1049	0.12
1050	0.13
1051	0.12
1052	0.12
1053	0.13
1054	0.14
1055	0.13
1056	0.09
1057	0.08
1058	0.09
1059	0.11
1060	0.15
1061	0.16
1062	0.16
1063	0.17
1064	0.17
1065	0.22
1066	0.25
1067	0.25
1068	0.22
1069	0.29
1070	0.28
1071	0.33
1072	0.33
1073	0.32
1074	0.33
1075	0.32
1076	0.31
1077	0.24
1078	0.22
1079	0.18
1080	0.17
1081	0.15
1082	0.12
1083	0.14
1084	0.16
1085	0.16
1086	0.15
1087	0.16
1088	0.16
1089	0.15
1090	0.13
1091	0.13
1092	0.11
1093	0.12
1094	0.12
1095	0.11
1096	0.11
1097	0.13
1098	0.12
1099	0.09
1100	0.1
1101	0.09
1102	0.11
1103	0.11
1104	0.11
1105	0.12
1106	0.18
1107	0.22
1108	0.23
1109	0.28
1110	0.31
1111	0.39
1112	0.42
1113	0.41
1114	0.4
1115	0.43
1116	0.42
1117	0.39
1118	0.35
1119	0.27
1120	0.26
1121	0.26
1122	0.22
1123	0.21
1124	0.2
1125	0.18
1126	0.17
1127	0.17
1128	0.18
1129	0.16
1130	0.19
1131	0.17
1132	0.21
1133	0.21
1134	0.22
1135	0.22
1136	0.21
1137	0.21
1138	0.19
1139	0.16
1140	0.12
1141	0.11
1142	0.12
1143	0.12
1144	0.12
1145	0.12
1146	0.12
1147	0.12
1148	0.12
1149	0.11
1150	0.12
1151	0.13
1152	0.12
1153	0.12
1154	0.11
1155	0.09
1156	0.09
1157	0.12
1158	0.15
1159	0.13
1160	0.14
1161	0.15
1162	0.15
1163	0.15
1164	0.14
1165	0.12
1166	0.09
1167	0.1
1168	0.09
1169	0.08
1170	0.13
1171	0.16
1172	0.19
1173	0.2
1174	0.21
1175	0.21
1176	0.22
1177	0.26
1178	0.23
1179	0.21
1180	0.18
1181	0.18
1182	0.16
1183	0.15
1184	0.14
1185	0.1
1186	0.1
1187	0.1
1188	0.11
1189	0.15
1190	0.17
1191	0.21
1192	0.28
1193	0.36
1194	0.45
1195	0.49
1196	0.57
1197	0.62
1198	0.7
1199	0.71
1200	0.69
1201	0.65
1202	0.57
1203	0.57
1204	0.49
1205	0.4
1206	0.3
1207	0.25
1208	0.2
1209	0.15
1210	0.12
1211	0.06
1212	0.05
1213	0.05
1214	0.05
1215	0.06
1216	0.06
1217	0.06
1218	0.06
1219	0.06
1220	0.06
1221	0.07
1222	0.09
1223	0.08
1224	0.11
1225	0.13
1226	0.16
1227	0.19
1228	0.23
1229	0.25
1230	0.24
1231	0.26
1232	0.27
1233	0.31
1234	0.31
1235	0.3
1236	0.31
1237	0.36
1238	0.41
1239	0.45
1240	0.43
1241	0.38
1242	0.38
1243	0.38
1244	0.39
1245	0.38
1246	0.37
1247	0.36
1248	0.36
1249	0.36
1250	0.33
1251	0.32
1252	0.26
1253	0.2
1254	0.17
1255	0.12

B0CVD1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer