FuNGI

R0I700

Protein Details

Accession

R0I700

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
422-441	AERQRQEMRNQKPQKEHSTP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20, cyto 4.5, cyto_mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035426 Gemin2/Brr1
Gene Ontology	GO:0000387 P:spliceosomal snRNP assembly
Pfam	View protein in Pfam PF04938 SIP1

Amino Acid Sequences

MAASGSNLAVTKDGEAYNKLSRPDGYLTSTQPPLPSALAPSPAVASSKRKYEQENASETKRARIDRNGPRSKGQLRAHEQFREPGVRSALPGLDGEEQLSDESIDEAVAYLRSVRSEASTIPTLLTAPNNPHGANRDHGNAKGISTNKYSGSSRRVVYNDGTWVALESEGDGESEYWDEDADYLDPQESSQWALVRRFCNLRSKLSAFRDHKPLPTKTMGPRKSRRSEQSNKYEWAETIDRGYPELKEITQLDEPTLYVALHGCTLALDRSTEISRQKSCWIWTLLALTGDFGTLDHERIGKIRDLGLAASRLAKRLQAERSSKEQSTLEAEDSVHVVKDTPDMDSSVESGEAVDDSAEDSGAEMVISEDEAEAAETAEVGDLETARARLLAQLGDRLVHSEVPSSEPSSTPKFHMLSRAEAERQRQEMRNQKPQKEHSTPILTPTSDTTRARNPALKSTPLTESELETKAAIDMILTVVAECYGQKDLFNFIEAW

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.19
3	0.23
4	0.29
5	0.32
6	0.33
7	0.32
8	0.32
9	0.34
10	0.36
11	0.35
12	0.33
13	0.34
14	0.36
15	0.39
16	0.4
17	0.37
18	0.33
19	0.31
20	0.27
21	0.25
22	0.21
23	0.21
24	0.21
25	0.23
26	0.22
27	0.22
28	0.21
29	0.2
30	0.21
31	0.19
32	0.24
33	0.25
34	0.33
35	0.37
36	0.4
37	0.45
38	0.52
39	0.59
40	0.59
41	0.64
42	0.6
43	0.6
44	0.62
45	0.57
46	0.55
47	0.51
48	0.48
49	0.45
50	0.49
51	0.55
52	0.6
53	0.7
54	0.72
55	0.7
56	0.7
57	0.73
58	0.68
59	0.68
60	0.64
61	0.63
62	0.61
63	0.67
64	0.68
65	0.66
66	0.63
67	0.57
68	0.55
69	0.51
70	0.45
71	0.41
72	0.39
73	0.33
74	0.32
75	0.3
76	0.26
77	0.21
78	0.19
79	0.17
80	0.15
81	0.15
82	0.14
83	0.12
84	0.12
85	0.11
86	0.11
87	0.08
88	0.06
89	0.06
90	0.06
91	0.05
92	0.05
93	0.05
94	0.05
95	0.05
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.07
100	0.08
101	0.08
102	0.09
103	0.11
104	0.12
105	0.16
106	0.17
107	0.17
108	0.17
109	0.16
110	0.15
111	0.15
112	0.15
113	0.13
114	0.14
115	0.19
116	0.2
117	0.2
118	0.22
119	0.25
120	0.25
121	0.26
122	0.25
123	0.26
124	0.26
125	0.26
126	0.28
127	0.24
128	0.23
129	0.25
130	0.24
131	0.22
132	0.23
133	0.25
134	0.22
135	0.25
136	0.26
137	0.26
138	0.3
139	0.31
140	0.29
141	0.33
142	0.33
143	0.32
144	0.33
145	0.3
146	0.27
147	0.23
148	0.22
149	0.17
150	0.16
151	0.13
152	0.11
153	0.08
154	0.06
155	0.05
156	0.05
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.05
161	0.06
162	0.05
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.05
171	0.06
172	0.06
173	0.06
174	0.07
175	0.06
176	0.07
177	0.08
178	0.1
179	0.13
180	0.16
181	0.21
182	0.22
183	0.25
184	0.27
185	0.28
186	0.35
187	0.35
188	0.36
189	0.37
190	0.4
191	0.45
192	0.46
193	0.54
194	0.48
195	0.49
196	0.53
197	0.49
198	0.51
199	0.5
200	0.47
201	0.42
202	0.42
203	0.42
204	0.41
205	0.5
206	0.52
207	0.54
208	0.61
209	0.65
210	0.69
211	0.71
212	0.71
213	0.7
214	0.73
215	0.73
216	0.74
217	0.71
218	0.66
219	0.6
220	0.54
221	0.44
222	0.39
223	0.31
224	0.21
225	0.18
226	0.18
227	0.16
228	0.16
229	0.16
230	0.11
231	0.11
232	0.12
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.13
237	0.14
238	0.14
239	0.12
240	0.12
241	0.12
242	0.1
243	0.1
244	0.06
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.05
249	0.05
250	0.04
251	0.04
252	0.05
253	0.05
254	0.05
255	0.05
256	0.05
257	0.07
258	0.08
259	0.11
260	0.14
261	0.18
262	0.19
263	0.2
264	0.23
265	0.24
266	0.25
267	0.27
268	0.26
269	0.22
270	0.22
271	0.22
272	0.19
273	0.17
274	0.15
275	0.11
276	0.09
277	0.08
278	0.06
279	0.05
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.08
285	0.09
286	0.1
287	0.12
288	0.11
289	0.12
290	0.12
291	0.13
292	0.13
293	0.13
294	0.14
295	0.12
296	0.11
297	0.15
298	0.14
299	0.15
300	0.15
301	0.16
302	0.17
303	0.22
304	0.27
305	0.31
306	0.36
307	0.39
308	0.45
309	0.48
310	0.46
311	0.43
312	0.38
313	0.31
314	0.3
315	0.28
316	0.22
317	0.18
318	0.18
319	0.15
320	0.16
321	0.14
322	0.09
323	0.08
324	0.07
325	0.06
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.1
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.09
335	0.09
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.04
342	0.03
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.03
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.03
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.07
376	0.08
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.14
381	0.15
382	0.15
383	0.15
384	0.16
385	0.15
386	0.14
387	0.14
388	0.14
389	0.14
390	0.17
391	0.19
392	0.19
393	0.19
394	0.19
395	0.23
396	0.25
397	0.26
398	0.26
399	0.3
400	0.3
401	0.31
402	0.38
403	0.37
404	0.37
405	0.4
406	0.42
407	0.41
408	0.44
409	0.48
410	0.46
411	0.48
412	0.49
413	0.49
414	0.53
415	0.58
416	0.63
417	0.68
418	0.71
419	0.73
420	0.76
421	0.79
422	0.8
423	0.78
424	0.74
425	0.71
426	0.7
427	0.63
428	0.59
429	0.56
430	0.46
431	0.4
432	0.4
433	0.37
434	0.35
435	0.36
436	0.35
437	0.38
438	0.43
439	0.47
440	0.49
441	0.46
442	0.5
443	0.54
444	0.55
445	0.49
446	0.48
447	0.48
448	0.45
449	0.45
450	0.36
451	0.35
452	0.34
453	0.33
454	0.29
455	0.25
456	0.22
457	0.18
458	0.17
459	0.13
460	0.08
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.07
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.07
469	0.06
470	0.08
471	0.11
472	0.12
473	0.13
474	0.14
475	0.19
476	0.2

R0I700

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer