Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DCB2

Protein Details
Accession B0DCB2    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
364-386VADHRAKKKQQAKLRRTESQRAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
370-372KKK
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13.5, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006073  GTP-bd  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025662  Sigma_54_int_dom_ATP-bd_1  
Gene Ontology GO:0005525  F:GTP binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_294476  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01926  MMR_HSR1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00675  SIGMA54_INTERACT_1  
Amino Acid Sequences MSQDSEAPTKNGVGEATPPFVSTIPELKSWSDSESDLESDSGDDAGVNAEAGAPVQQKSVTVLLMGQTGTGKSSFIRLLTGNKDVKIGKSIEPETSDISTFDYAQNDGLEVSLVDTPGFDDNRAHMSDSKLLQDLIEFLLKRRNAKTVNGLIYLHRISDVRFGGTATRNLRMFSRLCGPDAMKNVVILTTRWDETRRDVAEKTEADLTNSHFKEFVNNGAKVLRHDNTVASARNVISSIMDLPPIGEIKVVNEIVGGRSLAETDAGRELDSQLTQLKTQHVEDINGLREQYKAARLAQDEEQQAEIKRLRDELLAKLEKVDKDKKNLEGMKQWTFASHGAQIGLNIPFVPSVIGTMVGGAVGAVADHRAKKKQQAKLRRTESQRAAAGGAGVVDEAEKETVEVEVEQLEDLTFKEQGARIGKNIPFVPSVIGSLAGEALGTVADYRKGTKDRAKAKRESGQTTDPVAWFKGKLPL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.23
4 0.22
5 0.21
6 0.21
7 0.21
8 0.21
9 0.19
10 0.22
11 0.21
12 0.23
13 0.25
14 0.25
15 0.28
16 0.28
17 0.26
18 0.23
19 0.21
20 0.21
21 0.22
22 0.21
23 0.19
24 0.17
25 0.15
26 0.14
27 0.13
28 0.11
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.07
33 0.06
34 0.05
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.14
46 0.16
47 0.13
48 0.11
49 0.12
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.12
61 0.13
62 0.12
63 0.15
64 0.15
65 0.21
66 0.25
67 0.33
68 0.32
69 0.31
70 0.35
71 0.34
72 0.33
73 0.32
74 0.31
75 0.27
76 0.31
77 0.33
78 0.32
79 0.33
80 0.33
81 0.31
82 0.29
83 0.26
84 0.19
85 0.19
86 0.17
87 0.16
88 0.16
89 0.14
90 0.13
91 0.14
92 0.13
93 0.11
94 0.1
95 0.09
96 0.07
97 0.06
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.1
105 0.11
106 0.1
107 0.1
108 0.12
109 0.16
110 0.17
111 0.18
112 0.16
113 0.19
114 0.23
115 0.24
116 0.24
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.17
121 0.15
122 0.12
123 0.14
124 0.12
125 0.12
126 0.18
127 0.2
128 0.24
129 0.25
130 0.31
131 0.3
132 0.33
133 0.41
134 0.42
135 0.44
136 0.42
137 0.4
138 0.34
139 0.35
140 0.32
141 0.23
142 0.17
143 0.13
144 0.12
145 0.17
146 0.17
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.17
151 0.19
152 0.24
153 0.2
154 0.23
155 0.23
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.2
161 0.26
162 0.23
163 0.23
164 0.25
165 0.26
166 0.26
167 0.28
168 0.28
169 0.2
170 0.19
171 0.18
172 0.17
173 0.16
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.16
181 0.19
182 0.27
183 0.25
184 0.25
185 0.25
186 0.26
187 0.3
188 0.29
189 0.26
190 0.25
191 0.23
192 0.21
193 0.21
194 0.22
195 0.25
196 0.25
197 0.24
198 0.18
199 0.18
200 0.22
201 0.22
202 0.27
203 0.24
204 0.24
205 0.25
206 0.26
207 0.26
208 0.23
209 0.27
210 0.19
211 0.15
212 0.15
213 0.15
214 0.16
215 0.18
216 0.17
217 0.14
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.1
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.07
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.13
263 0.14
264 0.15
265 0.16
266 0.2
267 0.18
268 0.18
269 0.19
270 0.21
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.18
282 0.19
283 0.22
284 0.24
285 0.28
286 0.25
287 0.24
288 0.24
289 0.22
290 0.21
291 0.22
292 0.21
293 0.18
294 0.18
295 0.18
296 0.18
297 0.2
298 0.22
299 0.22
300 0.28
301 0.28
302 0.27
303 0.28
304 0.31
305 0.3
306 0.34
307 0.39
308 0.35
309 0.4
310 0.45
311 0.46
312 0.51
313 0.53
314 0.51
315 0.49
316 0.51
317 0.48
318 0.45
319 0.42
320 0.33
321 0.31
322 0.29
323 0.23
324 0.19
325 0.15
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.14
331 0.11
332 0.09
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.05
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.02
349 0.02
350 0.02
351 0.04
352 0.06
353 0.1
354 0.14
355 0.19
356 0.23
357 0.33
358 0.42
359 0.5
360 0.58
361 0.66
362 0.72
363 0.77
364 0.82
365 0.81
366 0.8
367 0.81
368 0.78
369 0.74
370 0.67
371 0.57
372 0.5
373 0.41
374 0.33
375 0.24
376 0.17
377 0.09
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.05
387 0.06
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.07
393 0.07
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.07
398 0.08
399 0.08
400 0.08
401 0.12
402 0.13
403 0.19
404 0.25
405 0.26
406 0.27
407 0.34
408 0.36
409 0.38
410 0.38
411 0.35
412 0.3
413 0.28
414 0.29
415 0.21
416 0.21
417 0.16
418 0.15
419 0.12
420 0.11
421 0.11
422 0.08
423 0.07
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.08
431 0.09
432 0.12
433 0.19
434 0.23
435 0.31
436 0.39
437 0.47
438 0.55
439 0.65
440 0.71
441 0.73
442 0.78
443 0.8
444 0.79
445 0.77
446 0.73
447 0.7
448 0.66
449 0.62
450 0.57
451 0.5
452 0.44
453 0.39
454 0.34
455 0.28