Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0JSS6

Protein Details
Accession R0JSS6    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-152KAEQKAQRDEEKRKKNEERDEKKRLKEEEBasic
534-555ASSSTSSKPSKNKRMVPAEQLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-90RRR
95-165EKEAQRLEKEAKAKAREEKKAQKEAEEKLKAEQKAQRDEEKRKKNEERDEKKRLKEEEQQRLEEEKAKKAR
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022043  CAF1A  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF12253  CAF1A  
Amino Acid Sequences MEDPAPAAPVSQKRPLEEEVQPPITPAKSTISSQASTPLSEVSVQTPSPLRNKASNPTGPTNTKPGDDQPLSSQNASTMIVTHQPAKRRRLTTQEKEAQRLEKEAKAKAREEKKAQKEAEEKLKAEQKAQRDEEKRKKNEERDEKKRLKEEEQQRLEEEKAKKARSQMKLNAFFTKPKTGPSSGQAAVASSQNPAASVSLPDTSGANSDLIPPSPQKTIAKNAQSDYERYFLPFNVPAHTILAPTNCLLNSPEKLEAARQRLDNIIAQNNAPGKTITPETLASLFPQRDVRGHKTATISEVVDCVNSSSDHPIHVTAEKGATSRHPLEMLREIPIKYIHFCTDVRPPYCGTYTRPYTDAQARRLARNPLSKARQDTDYDYDSEAEWDEPEEGEDLDSDGEDDNEEDAEDDMDGFLDDEEDPQLKRGLISGDLVPVNTGLCWEDADSVSRLNDGSDAICTEFKEFKMEFLLDPQMRSIDPFSTAYWTPEPAVVAPAASVVTKETSGSGAMNPPRAPLTQRTMNGLLNTLNGPQNASSSTSSKPSKNKRMVPAEQLPAFKAEIEGKDLTKLGMIESLKKAFPKLPKDAISNTLSAVAARVGPTEKEKRWVLINP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.47
3 0.47
4 0.46
5 0.48
6 0.48
7 0.49
8 0.46
9 0.42
10 0.43
11 0.37
12 0.32
13 0.26
14 0.24
15 0.23
16 0.25
17 0.31
18 0.32
19 0.32
20 0.32
21 0.37
22 0.33
23 0.3
24 0.29
25 0.22
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.15
30 0.17
31 0.16
32 0.18
33 0.21
34 0.24
35 0.3
36 0.34
37 0.36
38 0.4
39 0.45
40 0.5
41 0.55
42 0.58
43 0.58
44 0.6
45 0.63
46 0.6
47 0.59
48 0.58
49 0.52
50 0.46
51 0.43
52 0.4
53 0.42
54 0.39
55 0.38
56 0.36
57 0.41
58 0.43
59 0.41
60 0.36
61 0.27
62 0.28
63 0.26
64 0.2
65 0.14
66 0.12
67 0.16
68 0.18
69 0.24
70 0.25
71 0.33
72 0.4
73 0.47
74 0.54
75 0.55
76 0.6
77 0.64
78 0.71
79 0.73
80 0.76
81 0.77
82 0.74
83 0.74
84 0.72
85 0.67
86 0.58
87 0.55
88 0.48
89 0.45
90 0.44
91 0.45
92 0.48
93 0.48
94 0.51
95 0.54
96 0.59
97 0.62
98 0.67
99 0.71
100 0.72
101 0.77
102 0.73
103 0.71
104 0.69
105 0.67
106 0.68
107 0.63
108 0.55
109 0.52
110 0.58
111 0.5
112 0.5
113 0.48
114 0.45
115 0.49
116 0.53
117 0.56
118 0.57
119 0.67
120 0.71
121 0.77
122 0.76
123 0.77
124 0.82
125 0.82
126 0.84
127 0.85
128 0.85
129 0.84
130 0.88
131 0.86
132 0.83
133 0.82
134 0.76
135 0.72
136 0.71
137 0.71
138 0.71
139 0.7
140 0.65
141 0.6
142 0.58
143 0.52
144 0.5
145 0.43
146 0.41
147 0.42
148 0.42
149 0.42
150 0.47
151 0.55
152 0.55
153 0.61
154 0.61
155 0.64
156 0.7
157 0.7
158 0.68
159 0.6
160 0.57
161 0.51
162 0.51
163 0.41
164 0.36
165 0.39
166 0.36
167 0.37
168 0.35
169 0.38
170 0.3
171 0.31
172 0.27
173 0.23
174 0.21
175 0.19
176 0.16
177 0.1
178 0.11
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.08
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.13
201 0.14
202 0.18
203 0.18
204 0.21
205 0.28
206 0.34
207 0.39
208 0.39
209 0.39
210 0.41
211 0.4
212 0.39
213 0.34
214 0.28
215 0.22
216 0.21
217 0.21
218 0.15
219 0.16
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.19
226 0.19
227 0.16
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.11
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.12
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.14
241 0.14
242 0.18
243 0.22
244 0.24
245 0.26
246 0.24
247 0.24
248 0.25
249 0.26
250 0.24
251 0.21
252 0.2
253 0.17
254 0.17
255 0.18
256 0.19
257 0.18
258 0.16
259 0.13
260 0.11
261 0.12
262 0.13
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.13
268 0.12
269 0.11
270 0.14
271 0.13
272 0.13
273 0.15
274 0.14
275 0.16
276 0.22
277 0.27
278 0.28
279 0.28
280 0.3
281 0.3
282 0.3
283 0.28
284 0.24
285 0.18
286 0.14
287 0.14
288 0.11
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.09
296 0.09
297 0.09
298 0.1
299 0.1
300 0.11
301 0.11
302 0.11
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.08
308 0.08
309 0.12
310 0.13
311 0.13
312 0.14
313 0.14
314 0.16
315 0.21
316 0.2
317 0.19
318 0.2
319 0.19
320 0.19
321 0.21
322 0.19
323 0.16
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.16
328 0.17
329 0.24
330 0.29
331 0.28
332 0.28
333 0.28
334 0.27
335 0.29
336 0.29
337 0.25
338 0.26
339 0.28
340 0.29
341 0.29
342 0.28
343 0.3
344 0.36
345 0.37
346 0.33
347 0.37
348 0.37
349 0.39
350 0.43
351 0.44
352 0.41
353 0.44
354 0.45
355 0.46
356 0.5
357 0.5
358 0.5
359 0.47
360 0.45
361 0.4
362 0.39
363 0.35
364 0.31
365 0.29
366 0.25
367 0.23
368 0.2
369 0.18
370 0.14
371 0.1
372 0.08
373 0.07
374 0.07
375 0.06
376 0.07
377 0.07
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.05
389 0.04
390 0.05
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.04
403 0.04
404 0.05
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.1
410 0.09
411 0.09
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.12
416 0.12
417 0.14
418 0.14
419 0.14
420 0.12
421 0.11
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.05
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.08
430 0.08
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.09
438 0.09
439 0.08
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.1
445 0.1
446 0.13
447 0.15
448 0.15
449 0.2
450 0.19
451 0.19
452 0.22
453 0.22
454 0.2
455 0.21
456 0.29
457 0.24
458 0.24
459 0.24
460 0.21
461 0.2
462 0.21
463 0.19
464 0.12
465 0.14
466 0.15
467 0.15
468 0.18
469 0.19
470 0.21
471 0.2
472 0.2
473 0.19
474 0.18
475 0.19
476 0.15
477 0.16
478 0.12
479 0.11
480 0.09
481 0.09
482 0.08
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.07
488 0.08
489 0.08
490 0.09
491 0.1
492 0.1
493 0.11
494 0.16
495 0.19
496 0.23
497 0.23
498 0.24
499 0.25
500 0.25
501 0.28
502 0.27
503 0.32
504 0.35
505 0.37
506 0.41
507 0.43
508 0.44
509 0.41
510 0.36
511 0.29
512 0.23
513 0.23
514 0.19
515 0.19
516 0.16
517 0.17
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.19
522 0.19
523 0.18
524 0.21
525 0.27
526 0.31
527 0.36
528 0.45
529 0.52
530 0.6
531 0.68
532 0.74
533 0.76
534 0.82
535 0.81
536 0.81
537 0.78
538 0.75
539 0.7
540 0.63
541 0.53
542 0.45
543 0.4
544 0.3
545 0.25
546 0.22
547 0.19
548 0.22
549 0.24
550 0.22
551 0.24
552 0.24
553 0.22
554 0.19
555 0.18
556 0.13
557 0.17
558 0.18
559 0.21
560 0.26
561 0.29
562 0.29
563 0.3
564 0.32
565 0.33
566 0.4
567 0.43
568 0.46
569 0.52
570 0.55
571 0.59
572 0.61
573 0.6
574 0.55
575 0.47
576 0.39
577 0.33
578 0.28
579 0.22
580 0.19
581 0.14
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.13
586 0.15
587 0.23
588 0.31
589 0.33
590 0.39
591 0.41
592 0.42