Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0JNQ1

Protein Details
Accession R0JNQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
80-104AAETKAAPKKTTKRKKDDESELEAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-36AKPVEKKSAKEVKANGTAPRKGAKK
64-96AKKPAARSRAKKTEAPAAETKAAPKKTTKRKKD
107-134PAPAVKKAKVNGTKAAPKTAPKAAPKPA
187-198NPKGPRRAKGKK
Subcellular Location(s) mito 11.5, cyto_mito 10, nucl 8, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009091  RCC1/BLIP-II  
IPR000408  Reg_chr_condens  
Pfam View protein in Pfam  
PF00415  RCC1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00625  RCC1_1  
PS00626  RCC1_2  
PS50012  RCC1_3  
Amino Acid Sequences MARTAASRAASAKPVEKKSAKEVKANGTAPRKGAKKAEDAPAANGVAEETEPADEKTEEVEAPAKKPAARSRAKKTEAPAAETKAAPKKTTKRKKDDESELEAGEAPAPAVKKAKVNGTKAAPKTAPKAAPKPAPEAAPEAAPEPAPEAAPEAAPEPSPESSSKVESKAPTPAPEPKTKVDPALVPNPKGPRRAKGKKTEINPIRYTEPLKVFVFGEGGSGELGFGATKKAIDVKRPRYNEALTNMNVVRIATGGMHVVALTKDNKILTWGVNDNGALGRDTSGSTIKMRDVDADDDSDSEDETGGLNDEEATPKPVPAEYFPEDTIFVDVAAGDSCSFALTTEGAVYGWGTFRKNEGILGFERGNHTAPRPVYLDSVKKVTQIVCGTNHVYVLDKDRHVYAWGNGQQNQLGRRVTERNLHQALQPNRIGFHDASIKRHSQRIASIASGDYHGLAIAEDGHIWAWGANNYCETGYTGNAGAEDASVLQPKIIHSLEGKSVESLAAGAHHNLAITKDGQVLVWGRCDGSQTGIPSSQLEAETDEEKVLKNNGKPKIVVEPVALPNLKNVVTGACGPDHSIVIDKDGKAYSWGFSANYQTGQGTDDDIEVPTMIDNTAVRETKLTWAGCGGQYSVLASKKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.51
3 0.53
4 0.54
5 0.6
6 0.67
7 0.63
8 0.63
9 0.64
10 0.63
11 0.68
12 0.67
13 0.65
14 0.63
15 0.62
16 0.57
17 0.59
18 0.53
19 0.5
20 0.54
21 0.51
22 0.52
23 0.55
24 0.6
25 0.6
26 0.58
27 0.56
28 0.52
29 0.47
30 0.37
31 0.31
32 0.22
33 0.14
34 0.13
35 0.1
36 0.07
37 0.08
38 0.09
39 0.09
40 0.12
41 0.11
42 0.12
43 0.13
44 0.14
45 0.13
46 0.14
47 0.19
48 0.19
49 0.21
50 0.25
51 0.26
52 0.26
53 0.33
54 0.39
55 0.43
56 0.51
57 0.58
58 0.64
59 0.72
60 0.75
61 0.73
62 0.69
63 0.69
64 0.63
65 0.61
66 0.55
67 0.5
68 0.49
69 0.45
70 0.47
71 0.45
72 0.44
73 0.4
74 0.44
75 0.48
76 0.56
77 0.67
78 0.71
79 0.73
80 0.81
81 0.89
82 0.9
83 0.9
84 0.87
85 0.84
86 0.77
87 0.66
88 0.57
89 0.47
90 0.37
91 0.27
92 0.19
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.1
97 0.13
98 0.15
99 0.19
100 0.22
101 0.32
102 0.38
103 0.41
104 0.47
105 0.51
106 0.58
107 0.55
108 0.59
109 0.52
110 0.48
111 0.49
112 0.49
113 0.49
114 0.47
115 0.52
116 0.53
117 0.57
118 0.56
119 0.57
120 0.52
121 0.47
122 0.42
123 0.39
124 0.32
125 0.26
126 0.24
127 0.19
128 0.17
129 0.15
130 0.13
131 0.11
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.14
146 0.14
147 0.17
148 0.18
149 0.23
150 0.25
151 0.24
152 0.28
153 0.28
154 0.29
155 0.33
156 0.34
157 0.32
158 0.33
159 0.39
160 0.4
161 0.45
162 0.48
163 0.43
164 0.47
165 0.45
166 0.44
167 0.37
168 0.36
169 0.34
170 0.39
171 0.4
172 0.36
173 0.39
174 0.45
175 0.46
176 0.5
177 0.48
178 0.46
179 0.53
180 0.62
181 0.66
182 0.69
183 0.76
184 0.74
185 0.76
186 0.79
187 0.75
188 0.73
189 0.66
190 0.59
191 0.51
192 0.46
193 0.44
194 0.39
195 0.34
196 0.31
197 0.29
198 0.27
199 0.24
200 0.22
201 0.21
202 0.15
203 0.12
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.12
218 0.13
219 0.22
220 0.32
221 0.41
222 0.5
223 0.53
224 0.56
225 0.54
226 0.55
227 0.51
228 0.45
229 0.4
230 0.32
231 0.33
232 0.3
233 0.25
234 0.23
235 0.17
236 0.14
237 0.09
238 0.08
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.04
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.1
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.11
263 0.11
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.11
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.11
284 0.11
285 0.1
286 0.08
287 0.06
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.06
298 0.06
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.1
305 0.11
306 0.16
307 0.16
308 0.18
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.1
315 0.08
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.04
320 0.04
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.08
341 0.1
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.12
346 0.12
347 0.16
348 0.15
349 0.14
350 0.16
351 0.15
352 0.17
353 0.15
354 0.15
355 0.16
356 0.16
357 0.18
358 0.18
359 0.18
360 0.19
361 0.22
362 0.25
363 0.22
364 0.26
365 0.23
366 0.23
367 0.23
368 0.21
369 0.23
370 0.21
371 0.22
372 0.2
373 0.22
374 0.22
375 0.21
376 0.2
377 0.15
378 0.14
379 0.12
380 0.16
381 0.17
382 0.16
383 0.17
384 0.17
385 0.18
386 0.18
387 0.19
388 0.15
389 0.2
390 0.25
391 0.27
392 0.29
393 0.3
394 0.3
395 0.31
396 0.32
397 0.27
398 0.22
399 0.19
400 0.21
401 0.24
402 0.25
403 0.29
404 0.31
405 0.35
406 0.38
407 0.38
408 0.37
409 0.42
410 0.42
411 0.42
412 0.41
413 0.32
414 0.31
415 0.3
416 0.31
417 0.22
418 0.21
419 0.24
420 0.24
421 0.28
422 0.31
423 0.35
424 0.34
425 0.38
426 0.37
427 0.3
428 0.32
429 0.32
430 0.3
431 0.25
432 0.25
433 0.21
434 0.2
435 0.18
436 0.15
437 0.1
438 0.08
439 0.07
440 0.06
441 0.05
442 0.05
443 0.04
444 0.04
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.08
453 0.1
454 0.1
455 0.11
456 0.12
457 0.12
458 0.12
459 0.12
460 0.11
461 0.1
462 0.11
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.09
467 0.08
468 0.07
469 0.06
470 0.06
471 0.06
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.14
478 0.13
479 0.14
480 0.14
481 0.17
482 0.22
483 0.23
484 0.23
485 0.18
486 0.19
487 0.17
488 0.15
489 0.12
490 0.08
491 0.07
492 0.08
493 0.08
494 0.08
495 0.08
496 0.09
497 0.09
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.12
503 0.12
504 0.11
505 0.13
506 0.16
507 0.15
508 0.17
509 0.16
510 0.15
511 0.15
512 0.18
513 0.16
514 0.16
515 0.18
516 0.18
517 0.21
518 0.21
519 0.22
520 0.2
521 0.21
522 0.19
523 0.16
524 0.15
525 0.13
526 0.15
527 0.15
528 0.15
529 0.14
530 0.13
531 0.13
532 0.15
533 0.18
534 0.22
535 0.26
536 0.34
537 0.4
538 0.44
539 0.44
540 0.44
541 0.48
542 0.46
543 0.42
544 0.37
545 0.36
546 0.35
547 0.4
548 0.38
549 0.28
550 0.27
551 0.28
552 0.26
553 0.19
554 0.17
555 0.12
556 0.14
557 0.16
558 0.16
559 0.14
560 0.14
561 0.15
562 0.16
563 0.16
564 0.14
565 0.17
566 0.15
567 0.19
568 0.23
569 0.22
570 0.24
571 0.24
572 0.24
573 0.23
574 0.23
575 0.2
576 0.17
577 0.18
578 0.16
579 0.17
580 0.23
581 0.22
582 0.22
583 0.22
584 0.21
585 0.19
586 0.2
587 0.18
588 0.15
589 0.13
590 0.13
591 0.13
592 0.13
593 0.13
594 0.11
595 0.11
596 0.09
597 0.09
598 0.07
599 0.08
600 0.08
601 0.11
602 0.18
603 0.19
604 0.19
605 0.2
606 0.22
607 0.27
608 0.34
609 0.3
610 0.24
611 0.26
612 0.29
613 0.29
614 0.3
615 0.24
616 0.18
617 0.18
618 0.2
619 0.22