FuNGI

R0JV11

Protein Details

Accession

R0JV11

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
412-431	GIQFKNCKRKIPKYCVLQRA	Hydrophilic
1189-1210	NGIQSQQRQKKHSRPAHAEADV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13, nucl 8, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MQRNRQRPMLAGGAKNWAHSQEVKIKLYGIRKNYWTKEVYQAMSRYGNVFKIDMEPNSRDCNAFVVFRPPPHKPIPQQNLRIGDGVVRSELRNSLLATIPSPTNPTKRYYEFNTLFAKRIDFGTRVADMAMLAMRTESSKDIQMTLHLRRKDLEIEFPIRIDNQWRKFCFRLPISLISHVYKTEDESTGQPAIVIPCDSPPQFYMQKREGEELGGGRKYTSFTTRDKIWKDWDTWHRATDIVSRTVGDAFQQFPLMNHKDTAIIDIGQWTNYRLVFDRSTLAGPQFQEFSDALADHGVTIETVGRYAIRPKMASPLWSLLQEEIHGTHPHLDFTSGSRKLSSDDLSTTKVYLNFPVRYQLEVCLSNGYLREHNITIEFLQKLESLESQEAVCLLEKVADRQHTYYDPMEIFGIQFKNCKRKIPKYCVLQRAVTITPTTMHVSMPIMETSNRIIRKHEADSDRFIRVRFSDEKNEGQLRTLPNGKADAMFDRVLRAMKKGIVVAGRKYEFLAFGNSQFREHGAYFYAPTSSKSADDIRLSLGQFDHIKTVSKFAARLGQCFSTTRAMGVTVNLERIPDVERNGYVFTDGVGKLSFFLAQMAAQELGLPNAFTDPPTLFQFRLGGCKGVLALDMKLNRKEVHIRQSQYKFQAPYTGLEIIRSSYLATPYFNRQIIVVLSYLGVQDAIFLRKQQEMMNDYARAMIDEGAALQKLKKHIDMNQTTLTIASMVLDGFMKSQEPFVMSLLTLWRACTIKNLKEKARIAIDDGAFVLGCVDETSTLKGHRNDPQCRQSATRDEKLATLPEIFLQVDDTSKKGDYIIVEGVCILARNPSLHPGDVRIVRAVNVPALHHLKNVVVLPQTGDRDLANMCSGGDLDGDDYMVLWDRDIIPEIINVPPMDFKPEKPFETDKPITAVDMSEFFVTYMKNDSLGQIAHAHLAQADWNSDGVGSAVCLELAQLHSRAVDFPKSGIPAEMRRDLKPKRWPHFMEKKHLGADQVYHSRNILGRLFDEVQLVDFKPLWENPFDRRILNAYDLEEELLNKAANLKVLYDEALRRLMAKHGIQTEFEAWTVFVLGHNHESRDYKFAEEFGRTVGALKHQYRGECRDAAELKDGNDWERLGPFVAAMYTVTAREMESALDECSKTKVVGGQEQPCHIKDPEHMPLISFPWLFPGELGKIATGGSTSYQVNGIQSQQRQKKHSRPAHAEADVGTVETEAGITQYGELLDLDFSLPALKLTESTRTSENTKERSDAAEDDPGAQGISASLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.44
3	0.4
4	0.32
5	0.29
6	0.29
7	0.33
8	0.34
9	0.41
10	0.41
11	0.4
12	0.42
13	0.44
14	0.5
15	0.5
16	0.47
17	0.47
18	0.52
19	0.61
20	0.63
21	0.65
22	0.59
23	0.56
24	0.59
25	0.58
26	0.54
27	0.51
28	0.48
29	0.46
30	0.45
31	0.42
32	0.36
33	0.32
34	0.32
35	0.27
36	0.26
37	0.22
38	0.25
39	0.28
40	0.28
41	0.32
42	0.32
43	0.34
44	0.39
45	0.39
46	0.34
47	0.31
48	0.31
49	0.27
50	0.27
51	0.25
52	0.28
53	0.3
54	0.36
55	0.41
56	0.41
57	0.45
58	0.5
59	0.57
60	0.57
61	0.64
62	0.69
63	0.72
64	0.76
65	0.77
66	0.76
67	0.69
68	0.62
69	0.51
70	0.44
71	0.36
72	0.29
73	0.24
74	0.2
75	0.18
76	0.19
77	0.2
78	0.19
79	0.19
80	0.19
81	0.19
82	0.21
83	0.21
84	0.2
85	0.21
86	0.2
87	0.19
88	0.24
89	0.25
90	0.3
91	0.31
92	0.35
93	0.39
94	0.43
95	0.48
96	0.5
97	0.56
98	0.52
99	0.55
100	0.59
101	0.54
102	0.52
103	0.47
104	0.42
105	0.32
106	0.33
107	0.31
108	0.24
109	0.23
110	0.25
111	0.25
112	0.23
113	0.22
114	0.19
115	0.14
116	0.14
117	0.13
118	0.08
119	0.07
120	0.07
121	0.07
122	0.08
123	0.1
124	0.11
125	0.12
126	0.16
127	0.17
128	0.19
129	0.19
130	0.25
131	0.29
132	0.37
133	0.43
134	0.4
135	0.4
136	0.41
137	0.44
138	0.44
139	0.41
140	0.39
141	0.38
142	0.41
143	0.4
144	0.39
145	0.37
146	0.3
147	0.29
148	0.3
149	0.33
150	0.38
151	0.46
152	0.49
153	0.54
154	0.56
155	0.6
156	0.61
157	0.55
158	0.54
159	0.5
160	0.54
161	0.52
162	0.55
163	0.52
164	0.44
165	0.42
166	0.34
167	0.31
168	0.24
169	0.24
170	0.22
171	0.2
172	0.2
173	0.21
174	0.24
175	0.23
176	0.22
177	0.18
178	0.16
179	0.16
180	0.16
181	0.15
182	0.11
183	0.12
184	0.17
185	0.17
186	0.18
187	0.17
188	0.22
189	0.28
190	0.32
191	0.38
192	0.39
193	0.45
194	0.46
195	0.48
196	0.43
197	0.37
198	0.35
199	0.3
200	0.3
201	0.25
202	0.23
203	0.2
204	0.2
205	0.2
206	0.21
207	0.23
208	0.22
209	0.25
210	0.3
211	0.37
212	0.44
213	0.47
214	0.49
215	0.51
216	0.52
217	0.51
218	0.55
219	0.57
220	0.58
221	0.55
222	0.52
223	0.45
224	0.41
225	0.39
226	0.37
227	0.33
228	0.27
229	0.25
230	0.23
231	0.23
232	0.24
233	0.22
234	0.16
235	0.14
236	0.12
237	0.13
238	0.14
239	0.13
240	0.13
241	0.21
242	0.23
243	0.22
244	0.21
245	0.21
246	0.23
247	0.23
248	0.24
249	0.18
250	0.14
251	0.13
252	0.16
253	0.16
254	0.14
255	0.14
256	0.13
257	0.14
258	0.14
259	0.16
260	0.14
261	0.18
262	0.18
263	0.2
264	0.21
265	0.2
266	0.21
267	0.21
268	0.2
269	0.19
270	0.19
271	0.19
272	0.17
273	0.15
274	0.17
275	0.16
276	0.15
277	0.13
278	0.13
279	0.11
280	0.11
281	0.1
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.04
286	0.05
287	0.06
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.07
292	0.08
293	0.13
294	0.16
295	0.18
296	0.19
297	0.2
298	0.27
299	0.28
300	0.29
301	0.28
302	0.28
303	0.26
304	0.26
305	0.26
306	0.2
307	0.19
308	0.17
309	0.14
310	0.12
311	0.13
312	0.13
313	0.13
314	0.18
315	0.17
316	0.18
317	0.17
318	0.17
319	0.14
320	0.17
321	0.26
322	0.22
323	0.22
324	0.22
325	0.22
326	0.23
327	0.26
328	0.25
329	0.18
330	0.2
331	0.22
332	0.24
333	0.24
334	0.23
335	0.21
336	0.21
337	0.2
338	0.22
339	0.26
340	0.25
341	0.25
342	0.31
343	0.3
344	0.29
345	0.29
346	0.26
347	0.24
348	0.23
349	0.23
350	0.18
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.17
355	0.15
356	0.15
357	0.18
358	0.16
359	0.17
360	0.16
361	0.16
362	0.14
363	0.17
364	0.16
365	0.13
366	0.13
367	0.13
368	0.13
369	0.13
370	0.13
371	0.12
372	0.12
373	0.13
374	0.12
375	0.11
376	0.11
377	0.1
378	0.09
379	0.06
380	0.06
381	0.09
382	0.09
383	0.11
384	0.15
385	0.18
386	0.2
387	0.21
388	0.24
389	0.21
390	0.25
391	0.23
392	0.22
393	0.19
394	0.18
395	0.17
396	0.14
397	0.13
398	0.14
399	0.14
400	0.12
401	0.16
402	0.2
403	0.29
404	0.3
405	0.39
406	0.44
407	0.53
408	0.63
409	0.68
410	0.72
411	0.73
412	0.81
413	0.8
414	0.75
415	0.66
416	0.57
417	0.51
418	0.44
419	0.34
420	0.26
421	0.18
422	0.15
423	0.15
424	0.16
425	0.12
426	0.11
427	0.11
428	0.11
429	0.11
430	0.12
431	0.1
432	0.09
433	0.09
434	0.1
435	0.12
436	0.17
437	0.19
438	0.18
439	0.2
440	0.24
441	0.28
442	0.3
443	0.36
444	0.35
445	0.36
446	0.41
447	0.42
448	0.41
449	0.38
450	0.34
451	0.29
452	0.24
453	0.27
454	0.26
455	0.28
456	0.32
457	0.34
458	0.36
459	0.39
460	0.42
461	0.36
462	0.32
463	0.31
464	0.26
465	0.26
466	0.28
467	0.24
468	0.22
469	0.23
470	0.22
471	0.19
472	0.18
473	0.16
474	0.15
475	0.15
476	0.14
477	0.13
478	0.14
479	0.15
480	0.15
481	0.14
482	0.13
483	0.14
484	0.15
485	0.14
486	0.15
487	0.18
488	0.19
489	0.2
490	0.24
491	0.23
492	0.22
493	0.22
494	0.21
495	0.17
496	0.15
497	0.18
498	0.13
499	0.15
500	0.19
501	0.19
502	0.19
503	0.18
504	0.18
505	0.17
506	0.17
507	0.14
508	0.12
509	0.12
510	0.12
511	0.12
512	0.13
513	0.1
514	0.12
515	0.13
516	0.12
517	0.12
518	0.14
519	0.15
520	0.17
521	0.17
522	0.16
523	0.16
524	0.18
525	0.18
526	0.16
527	0.14
528	0.13
529	0.14
530	0.14
531	0.13
532	0.11
533	0.13
534	0.13
535	0.16
536	0.15
537	0.15
538	0.15
539	0.14
540	0.21
541	0.19
542	0.2
543	0.2
544	0.2
545	0.2
546	0.2
547	0.22
548	0.17
549	0.16
550	0.15
551	0.12
552	0.12
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.09
557	0.1
558	0.09
559	0.09
560	0.08
561	0.09
562	0.11
563	0.09
564	0.11
565	0.11
566	0.11
567	0.12
568	0.13
569	0.12
570	0.1
571	0.08
572	0.07
573	0.09
574	0.09
575	0.09
576	0.08
577	0.08
578	0.08
579	0.08
580	0.08
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.05
588	0.05
589	0.05
590	0.05
591	0.05
592	0.05
593	0.05
594	0.04
595	0.04
596	0.05
597	0.05
598	0.06
599	0.06
600	0.08
601	0.11
602	0.12
603	0.12
604	0.12
605	0.15
606	0.14
607	0.18
608	0.16
609	0.14
610	0.13
611	0.13
612	0.12
613	0.1
614	0.1
615	0.06
616	0.07
617	0.08
618	0.12
619	0.14
620	0.15
621	0.16
622	0.16
623	0.17
624	0.23
625	0.25
626	0.31
627	0.35
628	0.36
629	0.43
630	0.47
631	0.5
632	0.47
633	0.47
634	0.39
635	0.33
636	0.36
637	0.29
638	0.25
639	0.24
640	0.23
641	0.19
642	0.18
643	0.18
644	0.13
645	0.12
646	0.11
647	0.09
648	0.07
649	0.08
650	0.08
651	0.09
652	0.1
653	0.14
654	0.18
655	0.18
656	0.17
657	0.15
658	0.16
659	0.15
660	0.15
661	0.11
662	0.07
663	0.07
664	0.07
665	0.07
666	0.05
667	0.05
668	0.03
669	0.04
670	0.05
671	0.06
672	0.06
673	0.07
674	0.09
675	0.1
676	0.11
677	0.12
678	0.15
679	0.17
680	0.2
681	0.22
682	0.21
683	0.2
684	0.2
685	0.18
686	0.14
687	0.11
688	0.08
689	0.06
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.05
695	0.05
696	0.07
697	0.1
698	0.12
699	0.15
700	0.16
701	0.23
702	0.32
703	0.35
704	0.37
705	0.36
706	0.35
707	0.32
708	0.3
709	0.24
710	0.14
711	0.1
712	0.06
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.06
723	0.06
724	0.07
725	0.07
726	0.08
727	0.08
728	0.07
729	0.08
730	0.08
731	0.1
732	0.09
733	0.08
734	0.1
735	0.1
736	0.1
737	0.17
738	0.22
739	0.27
740	0.35
741	0.4
742	0.42
743	0.5
744	0.52
745	0.48
746	0.47
747	0.4
748	0.35
749	0.35
750	0.31
751	0.23
752	0.21
753	0.17
754	0.13
755	0.12
756	0.09
757	0.04
758	0.03
759	0.03
760	0.03
761	0.04
762	0.05
763	0.06
764	0.08
765	0.1
766	0.14
767	0.17
768	0.21
769	0.28
770	0.37
771	0.42
772	0.49
773	0.55
774	0.54
775	0.54
776	0.53
777	0.51
778	0.52
779	0.52
780	0.49
781	0.44
782	0.4
783	0.39
784	0.37
785	0.33
786	0.24
787	0.18
788	0.13
789	0.11
790	0.12
791	0.11
792	0.09
793	0.09
794	0.08
795	0.09
796	0.09
797	0.1
798	0.1
799	0.1
800	0.1
801	0.09
802	0.11
803	0.09
804	0.12
805	0.15
806	0.13
807	0.13
808	0.12
809	0.12
810	0.1
811	0.1
812	0.07
813	0.05
814	0.06
815	0.08
816	0.08
817	0.13
818	0.15
819	0.16
820	0.16
821	0.17
822	0.22
823	0.22
824	0.23
825	0.19
826	0.18
827	0.18
828	0.2
829	0.17
830	0.14
831	0.13
832	0.12
833	0.16
834	0.2
835	0.19
836	0.17
837	0.17
838	0.16
839	0.17
840	0.18
841	0.15
842	0.12
843	0.12
844	0.13
845	0.16
846	0.17
847	0.15
848	0.15
849	0.12
850	0.13
851	0.13
852	0.12
853	0.09
854	0.08
855	0.08
856	0.07
857	0.07
858	0.06
859	0.06
860	0.05
861	0.05
862	0.05
863	0.05
864	0.04
865	0.04
866	0.04
867	0.06
868	0.05
869	0.05
870	0.06
871	0.06
872	0.07
873	0.09
874	0.09
875	0.08
876	0.09
877	0.11
878	0.1
879	0.11
880	0.11
881	0.1
882	0.11
883	0.11
884	0.17
885	0.17
886	0.18
887	0.26
888	0.3
889	0.31
890	0.35
891	0.4
892	0.37
893	0.45
894	0.45
895	0.37
896	0.36
897	0.34
898	0.29
899	0.25
900	0.22
901	0.13
902	0.12
903	0.12
904	0.09
905	0.09
906	0.09
907	0.09
908	0.09
909	0.09
910	0.11
911	0.1
912	0.11
913	0.12
914	0.12
915	0.13
916	0.13
917	0.14
918	0.12
919	0.12
920	0.12
921	0.12
922	0.11
923	0.09
924	0.09
925	0.09
926	0.08
927	0.08
928	0.07
929	0.08
930	0.07
931	0.07
932	0.07
933	0.06
934	0.05
935	0.04
936	0.04
937	0.04
938	0.04
939	0.04
940	0.04
941	0.05
942	0.07
943	0.09
944	0.09
945	0.09
946	0.1
947	0.1
948	0.13
949	0.14
950	0.16
951	0.14
952	0.15
953	0.18
954	0.2
955	0.2
956	0.2
957	0.2
958	0.22
959	0.27
960	0.34
961	0.33
962	0.35
963	0.43
964	0.46
965	0.51
966	0.56
967	0.61
968	0.6
969	0.67
970	0.7
971	0.72
972	0.78
973	0.77
974	0.77
975	0.74
976	0.71
977	0.63
978	0.59
979	0.5
980	0.41
981	0.37
982	0.33
983	0.34
984	0.31
985	0.29
986	0.28
987	0.28
988	0.29
989	0.29
990	0.25
991	0.19
992	0.18
993	0.23
994	0.24
995	0.23
996	0.22
997	0.18
998	0.17
999	0.18
1000	0.17
1001	0.13
1002	0.12
1003	0.12
1004	0.14
1005	0.16
1006	0.17
1007	0.19
1008	0.21
1009	0.25
1010	0.32
1011	0.33
1012	0.3
1013	0.3
1014	0.31
1015	0.3
1016	0.31
1017	0.28
1018	0.23
1019	0.23
1020	0.23
1021	0.22
1022	0.18
1023	0.16
1024	0.13
1025	0.12
1026	0.1
1027	0.08
1028	0.11
1029	0.11
1030	0.13
1031	0.13
1032	0.13
1033	0.13
1034	0.14
1035	0.15
1036	0.16
1037	0.17
1038	0.16
1039	0.18
1040	0.17
1041	0.17
1042	0.17
1043	0.2
1044	0.23
1045	0.24
1046	0.27
1047	0.31
1048	0.32
1049	0.32
1050	0.34
1051	0.32
1052	0.27
1053	0.25
1054	0.19
1055	0.13
1056	0.12
1057	0.11
1058	0.08
1059	0.08
1060	0.09
1061	0.11
1062	0.17
1063	0.19
1064	0.2
1065	0.22
1066	0.26
1067	0.26
1068	0.29
1069	0.28
1070	0.25
1071	0.24
1072	0.26
1073	0.27
1074	0.26
1075	0.24
1076	0.21
1077	0.21
1078	0.18
1079	0.19
1080	0.17
1081	0.2
1082	0.26
1083	0.27
1084	0.31
1085	0.33
1086	0.37
1087	0.42
1088	0.46
1089	0.46
1090	0.4
1091	0.4
1092	0.43
1093	0.42
1094	0.4
1095	0.41
1096	0.36
1097	0.32
1098	0.34
1099	0.33
1100	0.27
1101	0.26
1102	0.25
1103	0.2
1104	0.19
1105	0.18
1106	0.15
1107	0.14
1108	0.12
1109	0.1
1110	0.09
1111	0.08
1112	0.07
1113	0.08
1114	0.08
1115	0.08
1116	0.09
1117	0.09
1118	0.09
1119	0.1
1120	0.1
1121	0.08
1122	0.1
1123	0.11
1124	0.12
1125	0.14
1126	0.14
1127	0.14
1128	0.17
1129	0.17
1130	0.15
1131	0.16
1132	0.19
1133	0.21
1134	0.3
1135	0.37
1136	0.42
1137	0.44
1138	0.5
1139	0.52
1140	0.48
1141	0.48
1142	0.4
1143	0.35
1144	0.32
1145	0.37
1146	0.39
1147	0.4
1148	0.39
1149	0.36
1150	0.37
1151	0.37
1152	0.36
1153	0.28
1154	0.21
1155	0.21
1156	0.22
1157	0.21
1158	0.19
1159	0.21
1160	0.17
1161	0.2
1162	0.2
1163	0.15
1164	0.15
1165	0.14
1166	0.14
1167	0.1
1168	0.09
1169	0.08
1170	0.1
1171	0.1
1172	0.11
1173	0.13
1174	0.13
1175	0.15
1176	0.16
1177	0.2
1178	0.25
1179	0.31
1180	0.41
1181	0.47
1182	0.54
1183	0.59
1184	0.67
1185	0.72
1186	0.76
1187	0.79
1188	0.8
1189	0.81
1190	0.81
1191	0.83
1192	0.74
1193	0.66
1194	0.55
1195	0.49
1196	0.38
1197	0.29
1198	0.21
1199	0.12
1200	0.1
1201	0.09
1202	0.08
1203	0.04
1204	0.05
1205	0.05
1206	0.05
1207	0.05
1208	0.06
1209	0.06
1210	0.07
1211	0.07
1212	0.07
1213	0.07
1214	0.07
1215	0.08
1216	0.07
1217	0.07
1218	0.07
1219	0.07
1220	0.07
1221	0.09
1222	0.09
1223	0.1
1224	0.13
1225	0.22
1226	0.22
1227	0.25
1228	0.28
1229	0.31
1230	0.34
1231	0.41
1232	0.47
1233	0.45
1234	0.47
1235	0.47
1236	0.45
1237	0.45
1238	0.46
1239	0.41
1240	0.37
1241	0.37
1242	0.34
1243	0.32
1244	0.31
1245	0.28
1246	0.23
1247	0.19
1248	0.15

R0JV11

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer