Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IIY9

Protein Details
Accession R0IIY9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-39LFAEGSRQPPHRHRHPRNSHNQGHQNQYGHydrophilic
100-119WDEHKEKKKEEEQRKKWEEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
104-125KEKKKEEEQRKKWEEEEERRKK
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011058  Cyanovirin-N  
IPR036673  Cyanovirin-N_sf  
IPR008816  Gly_zipper_2TM_dom  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
Gene Ontology GO:0019867  C:outer membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08881  CVNH  
PF01476  LysM  
PF05433  Rick_17kDa_Anti  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
CDD cd00118  LysM  
Amino Acid Sequences MDGGFVAEEGLFAEGSRQPPHRHRHPRNSHNQGHQNQYGGEGDPEGERGIMGGIAGAAAGGYGGHALGGKAGHGTAGTIIGALAGAFAGSKTQDAAEERWDEHKEKKKEEEQRKKWEEEEERRKKYGQQHHGGPPPPQQQQQQSHSSSSGQRSMGDFGGNFTASSRDIRIDAHGDFVLHAQCRRADGSYQASSLPLNRYLANIDGSFSWSGSGGGSCGGESSYTVQQGDTLRAIAARYSHCSYEDIARHNNIANADQIWPGQNLRIPGSGGSGGSNGGFGHSARNVRLSAGGQRLEAELEGHGQWRLREINLDERISNQDGCLVFI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.2
4 0.24
5 0.31
6 0.4
7 0.5
8 0.58
9 0.66
10 0.74
11 0.81
12 0.87
13 0.9
14 0.93
15 0.94
16 0.91
17 0.9
18 0.89
19 0.84
20 0.81
21 0.72
22 0.64
23 0.53
24 0.47
25 0.38
26 0.29
27 0.24
28 0.16
29 0.14
30 0.12
31 0.13
32 0.1
33 0.09
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.04
40 0.03
41 0.03
42 0.03
43 0.03
44 0.02
45 0.02
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.02
50 0.02
51 0.02
52 0.03
53 0.03
54 0.04
55 0.05
56 0.05
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.04
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.03
71 0.02
72 0.02
73 0.02
74 0.02
75 0.03
76 0.03
77 0.04
78 0.04
79 0.05
80 0.07
81 0.1
82 0.11
83 0.15
84 0.17
85 0.18
86 0.22
87 0.25
88 0.25
89 0.32
90 0.4
91 0.42
92 0.44
93 0.51
94 0.55
95 0.63
96 0.72
97 0.75
98 0.74
99 0.8
100 0.81
101 0.75
102 0.69
103 0.67
104 0.66
105 0.65
106 0.67
107 0.66
108 0.65
109 0.65
110 0.64
111 0.61
112 0.61
113 0.6
114 0.58
115 0.55
116 0.57
117 0.62
118 0.67
119 0.64
120 0.57
121 0.54
122 0.5
123 0.47
124 0.44
125 0.41
126 0.43
127 0.48
128 0.51
129 0.49
130 0.45
131 0.43
132 0.4
133 0.38
134 0.34
135 0.29
136 0.27
137 0.21
138 0.2
139 0.2
140 0.21
141 0.19
142 0.15
143 0.13
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.11
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.09
166 0.1
167 0.09
168 0.1
169 0.11
170 0.12
171 0.12
172 0.11
173 0.14
174 0.2
175 0.2
176 0.2
177 0.18
178 0.18
179 0.17
180 0.18
181 0.17
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.14
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.12
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.05
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.11
213 0.14
214 0.15
215 0.17
216 0.13
217 0.12
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.1
222 0.12
223 0.12
224 0.16
225 0.18
226 0.19
227 0.2
228 0.21
229 0.22
230 0.26
231 0.29
232 0.28
233 0.3
234 0.3
235 0.3
236 0.3
237 0.31
238 0.25
239 0.21
240 0.18
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.13
248 0.14
249 0.15
250 0.15
251 0.17
252 0.18
253 0.17
254 0.16
255 0.18
256 0.17
257 0.15
258 0.14
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.1
268 0.14
269 0.17
270 0.17
271 0.21
272 0.2
273 0.2
274 0.23
275 0.21
276 0.24
277 0.28
278 0.28
279 0.25
280 0.26
281 0.26
282 0.24
283 0.22
284 0.16
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.13
290 0.14
291 0.14
292 0.19
293 0.2
294 0.19
295 0.24
296 0.27
297 0.36
298 0.41
299 0.43
300 0.38
301 0.39
302 0.43
303 0.4
304 0.36
305 0.26
306 0.25