Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KAM4

Protein Details
Accession R0KAM4    Localization Confidence High Confidence Score 17.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-155VEKPAAEKKRRGRPKKQPKTEEVAIBasic
189-216AAEKPAVEKKRRGRPKKQPKSEEAPAHEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-149KKASKGKKPAVEKPAAEKKRRGRPKKQPK
187-208KPAAEKPAVEKKRRGRPKKQPK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Amino Acid Sequences MPPKKDTGGDTHELVAGFTDRETKLLAAAFLSSTAPDKYDYDLMAALTNNTTGSLKKMWPIVKRKAIDSHSSFAKFMGHSESADGGSSKSPFTPKSKKRKVSDDAAEEADESDQEPSESEKKASKGKKPAVEKPAAEKKRRGRPKKQPKTEEVAIYEDNDHAKASEGTNDEVAESEQDKFDSPKVNKPAAEKPAVEKKRRGRPKKQPKSEEAPAHEDKGNAEDKDNDENSADGGDGLGEFIFTKNIEAWLENTDSELDAQAETAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.22
3 0.16
4 0.12
5 0.11
6 0.15
7 0.13
8 0.14
9 0.16
10 0.14
11 0.15
12 0.16
13 0.16
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.09
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.12
24 0.13
25 0.15
26 0.17
27 0.17
28 0.16
29 0.17
30 0.16
31 0.16
32 0.15
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.08
40 0.11
41 0.14
42 0.14
43 0.17
44 0.23
45 0.28
46 0.36
47 0.44
48 0.5
49 0.56
50 0.57
51 0.58
52 0.59
53 0.58
54 0.58
55 0.53
56 0.48
57 0.44
58 0.44
59 0.4
60 0.32
61 0.31
62 0.23
63 0.19
64 0.21
65 0.16
66 0.15
67 0.16
68 0.16
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.09
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.1
77 0.12
78 0.15
79 0.23
80 0.33
81 0.41
82 0.52
83 0.62
84 0.69
85 0.73
86 0.79
87 0.76
88 0.75
89 0.73
90 0.66
91 0.58
92 0.5
93 0.44
94 0.35
95 0.29
96 0.2
97 0.13
98 0.08
99 0.06
100 0.05
101 0.04
102 0.05
103 0.07
104 0.1
105 0.11
106 0.12
107 0.15
108 0.17
109 0.25
110 0.3
111 0.35
112 0.42
113 0.47
114 0.53
115 0.56
116 0.61
117 0.61
118 0.6
119 0.53
120 0.52
121 0.56
122 0.55
123 0.52
124 0.51
125 0.52
126 0.58
127 0.68
128 0.69
129 0.69
130 0.74
131 0.83
132 0.87
133 0.89
134 0.86
135 0.81
136 0.81
137 0.74
138 0.66
139 0.57
140 0.49
141 0.39
142 0.32
143 0.27
144 0.2
145 0.16
146 0.13
147 0.11
148 0.07
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.12
153 0.13
154 0.13
155 0.14
156 0.14
157 0.12
158 0.12
159 0.11
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.1
167 0.12
168 0.2
169 0.21
170 0.29
171 0.35
172 0.38
173 0.4
174 0.43
175 0.49
176 0.46
177 0.48
178 0.41
179 0.41
180 0.48
181 0.53
182 0.53
183 0.53
184 0.56
185 0.63
186 0.73
187 0.77
188 0.77
189 0.81
190 0.88
191 0.91
192 0.93
193 0.91
194 0.88
195 0.87
196 0.85
197 0.82
198 0.76
199 0.73
200 0.64
201 0.59
202 0.52
203 0.44
204 0.35
205 0.31
206 0.31
207 0.24
208 0.23
209 0.23
210 0.25
211 0.32
212 0.32
213 0.28
214 0.24
215 0.23
216 0.22
217 0.18
218 0.15
219 0.07
220 0.07
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.17
237 0.18
238 0.17
239 0.17
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.11
245 0.09