FuNGI

R0ISL1

Protein Details

Accession

R0ISL1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
400-432	DVVLVKKFYQRSRKSKNKRNWRVKRMNKDEGEM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
410-425	RSRKSKNKRNWRVKRM

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 10, mito 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MTDAQRSFAPAPKNAATILCADCGAPVDGTISGAFCYDCIKLKTDVTGGIQREAILLMCRDCDRWLSPPSTWVVAPPESRELLALCLRKLRGLNKLRIIDANFIWTEPHSRRIKVKITVQSEINEGAIMQQTFEVEYTQNYNQCPDCAKSYTHNTWRACVQVRQKVPHKRTFLYLEQLILKHGAHKDTINIKEVHDGIDFFFAQRNHAVAFCDFLKAVIPVNIKRSEELISHDIHTSTKNYKFSFSCEIVPICKDDLVVLPIPLAKKIGNISPLTICSRIGTSVQLLDPATLQTADVATDIYWRTPFRPLADVQELTEFVVLDIEPLGKQSGRHFLAEATIARASDMGVNDTTYYCRTHLGGILHVGDSVMGYLLANTNFNNELFDVLEQNNKYASAIPDVVLVKKFYQRSRKSKNKRNWRVKRMNKDEGEMLPRKQDQERMERDFEMFLQDVEEDQELRQTMALYKAQHKQRDVDAMDTESSLGDDEDEGIQIPMDQLLDDFEDMTMED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.33
3	0.29
4	0.28
5	0.26
6	0.2
7	0.18
8	0.16
9	0.15
10	0.16
11	0.16
12	0.11
13	0.09
14	0.1
15	0.1
16	0.11
17	0.11
18	0.09
19	0.08
20	0.08
21	0.08
22	0.07
23	0.09
24	0.1
25	0.16
26	0.17
27	0.21
28	0.23
29	0.25
30	0.28
31	0.27
32	0.29
33	0.28
34	0.33
35	0.32
36	0.3
37	0.29
38	0.26
39	0.24
40	0.22
41	0.18
42	0.13
43	0.13
44	0.12
45	0.14
46	0.15
47	0.15
48	0.16
49	0.19
50	0.2
51	0.24
52	0.28
53	0.3
54	0.29
55	0.33
56	0.34
57	0.33
58	0.3
59	0.27
60	0.26
61	0.27
62	0.28
63	0.27
64	0.28
65	0.26
66	0.26
67	0.24
68	0.2
69	0.2
70	0.24
71	0.23
72	0.2
73	0.25
74	0.25
75	0.28
76	0.31
77	0.32
78	0.37
79	0.43
80	0.5
81	0.53
82	0.56
83	0.54
84	0.54
85	0.52
86	0.46
87	0.38
88	0.34
89	0.26
90	0.23
91	0.21
92	0.18
93	0.22
94	0.19
95	0.28
96	0.28
97	0.31
98	0.37
99	0.44
100	0.51
101	0.52
102	0.58
103	0.58
104	0.59
105	0.6
106	0.56
107	0.5
108	0.44
109	0.37
110	0.29
111	0.2
112	0.14
113	0.11
114	0.12
115	0.11
116	0.09
117	0.08
118	0.08
119	0.09
120	0.09
121	0.09
122	0.06
123	0.08
124	0.12
125	0.15
126	0.18
127	0.18
128	0.21
129	0.2
130	0.21
131	0.23
132	0.21
133	0.22
134	0.22
135	0.24
136	0.26
137	0.34
138	0.41
139	0.46
140	0.52
141	0.48
142	0.48
143	0.48
144	0.47
145	0.42
146	0.4
147	0.41
148	0.41
149	0.46
150	0.51
151	0.58
152	0.64
153	0.67
154	0.69
155	0.66
156	0.59
157	0.59
158	0.58
159	0.52
160	0.48
161	0.42
162	0.35
163	0.32
164	0.31
165	0.26
166	0.21
167	0.17
168	0.16
169	0.17
170	0.16
171	0.15
172	0.15
173	0.19
174	0.25
175	0.28
176	0.27
177	0.26
178	0.26
179	0.28
180	0.28
181	0.25
182	0.18
183	0.16
184	0.12
185	0.14
186	0.13
187	0.1
188	0.13
189	0.12
190	0.13
191	0.13
192	0.13
193	0.11
194	0.12
195	0.13
196	0.09
197	0.11
198	0.1
199	0.11
200	0.1
201	0.09
202	0.09
203	0.08
204	0.09
205	0.11
206	0.13
207	0.14
208	0.19
209	0.21
210	0.21
211	0.21
212	0.22
213	0.2
214	0.18
215	0.21
216	0.18
217	0.16
218	0.17
219	0.17
220	0.16
221	0.15
222	0.15
223	0.14
224	0.17
225	0.2
226	0.23
227	0.23
228	0.27
229	0.27
230	0.29
231	0.32
232	0.29
233	0.26
234	0.24
235	0.24
236	0.21
237	0.21
238	0.18
239	0.13
240	0.11
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.07
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.09
252	0.07
253	0.08
254	0.09
255	0.11
256	0.13
257	0.13
258	0.15
259	0.15
260	0.16
261	0.17
262	0.16
263	0.14
264	0.11
265	0.11
266	0.11
267	0.1
268	0.09
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.1
273	0.09
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.06
279	0.06
280	0.04
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.09
290	0.09
291	0.11
292	0.15
293	0.17
294	0.17
295	0.2
296	0.21
297	0.25
298	0.29
299	0.28
300	0.24
301	0.24
302	0.22
303	0.19
304	0.18
305	0.12
306	0.07
307	0.07
308	0.06
309	0.05
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.05
314	0.06
315	0.06
316	0.07
317	0.1
318	0.18
319	0.19
320	0.2
321	0.2
322	0.2
323	0.2
324	0.22
325	0.2
326	0.14
327	0.13
328	0.12
329	0.11
330	0.11
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.1
338	0.11
339	0.11
340	0.1
341	0.11
342	0.1
343	0.11
344	0.12
345	0.12
346	0.16
347	0.16
348	0.16
349	0.17
350	0.18
351	0.16
352	0.15
353	0.14
354	0.1
355	0.08
356	0.06
357	0.04
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.06
362	0.06
363	0.07
364	0.07
365	0.09
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.1
370	0.1
371	0.1
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.16
376	0.15
377	0.16
378	0.16
379	0.15
380	0.15
381	0.15
382	0.16
383	0.15
384	0.16
385	0.15
386	0.19
387	0.2
388	0.22
389	0.2
390	0.2
391	0.18
392	0.24
393	0.29
394	0.32
395	0.42
396	0.5
397	0.59
398	0.69
399	0.78
400	0.83
401	0.88
402	0.91
403	0.92
404	0.93
405	0.94
406	0.94
407	0.94
408	0.94
409	0.95
410	0.95
411	0.93
412	0.92
413	0.83
414	0.76
415	0.69
416	0.63
417	0.61
418	0.54
419	0.45
420	0.42
421	0.42
422	0.42
423	0.4
424	0.43
425	0.41
426	0.47
427	0.54
428	0.54
429	0.55
430	0.53
431	0.51
432	0.45
433	0.39
434	0.33
435	0.25
436	0.18
437	0.15
438	0.14
439	0.13
440	0.13
441	0.14
442	0.1
443	0.1
444	0.13
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.12
449	0.14
450	0.19
451	0.23
452	0.24
453	0.3
454	0.38
455	0.45
456	0.51
457	0.52
458	0.51
459	0.53
460	0.58
461	0.54
462	0.5
463	0.45
464	0.41
465	0.38
466	0.34
467	0.28
468	0.19
469	0.16
470	0.12
471	0.09
472	0.07
473	0.06
474	0.08
475	0.08
476	0.08
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.08
482	0.08
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.08
487	0.1
488	0.1
489	0.1
490	0.09

R0ISL1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer