FuNGI

R0KG46

Protein Details

Accession

R0KG46

Localization Confidence

High

Confidence Score

15.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
103-129	DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
869-880	RGGFRGRGRGGG
1055-1063	RGGRNGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 13, cyto 8, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPAMFRWLSQKYPKIVSTVQEELPKKVGDAVIPVDRTGPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDKPAPKTEADMMLAIFEYTDRVLGMVRPRKLLYMAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKEAKEKDEERAEFQKILNSQKASRGEDITSLEQVVEKTWDSNAITPGTPFMHLLAESLQYWCAYKFTTDPSWKDMKVIISDASVPGEGEHKIMNFIRSQRAMPTHDPNTSHVIYGLDADLIMLSLATHEPYFRVLREDVFYDSGKDKVCTRCGRKGHIRTNCEFPDDGKKLTEEEAEEEWATSEHQLKPFIWLHTNILREYLAVEMDTPKRTFKYDLERSLDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLEIRDQGIDLLISIWRDLAAEMDDYVTKDGFPDMRRVQQILSALAIREAGIFKKRKEVQDRQAANRARREAQNKRQRTDENGLSAPGFKRAKETTDTYTSAGIVFFDPKQAQSKEVRDVHKDIMHTRDAQANKSAAAKLKELMKAKADGTSVPEPEPTPASEPVSESASGTDTPVHLGKRKADDIEDADNGTPGRNTPIVPGSPKKNGDGTPEDTIRLWEDGYEERYYEQKFGVAPNDIAFRNKVARQYAEGLCWVLAYYMQGCPSWTWYFPHHYAPFAADFVGLEDMDPRKLFEKGKPFHPYEQLMGVLPAASNHAIPEPFRILMEDPNSSIVDFYPEDFPIDLNGKKFAWQGVAILPFIDENRLLAAMATKYPELSDDERKRNEFGKETLMFSQECSLFDDVEKALYRKGQQKHRIDPAKSRALHGDVEPHDLFVMDSQLVPPFDADGVTDFEITQDRSMRVYYEMPTVTSSRAHKSVLLEGVKLPKPALNPGEAESVRRSNERGGFRGRGRGGGGRGGYNDRRNNDNMRNDYQNGGGRGGHQNGRGGGSWDNSRGGYGGQGGYPPPPPNFAPPFPGGNFPPPPGGANFFPPPPPGWVPPPGVGGWQGGAPPYGAPPIPPVGQRPAWMGNSNQQHGAPPPRQAPNNSSLRDERFYRPADELLGRSGGGSGGYQGSNPYSDRPPRDDRGNRGGRNGRGGHRSGGGGHQGNRPSYNSNDYR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.52
3	0.53
4	0.53
5	0.5
6	0.48
7	0.45
8	0.44
9	0.46
10	0.46
11	0.43
12	0.44
13	0.4
14	0.33
15	0.32
16	0.29
17	0.22
18	0.24
19	0.26
20	0.28
21	0.28
22	0.28
23	0.27
24	0.26
25	0.27
26	0.3
27	0.29
28	0.26
29	0.28
30	0.3
31	0.3
32	0.3
33	0.32
34	0.28
35	0.27
36	0.24
37	0.21
38	0.21
39	0.18
40	0.16
41	0.13
42	0.1
43	0.08
44	0.09
45	0.09
46	0.09
47	0.1
48	0.13
49	0.18
50	0.21
51	0.22
52	0.29
53	0.38
54	0.46
55	0.53
56	0.56
57	0.54
58	0.51
59	0.53
60	0.5
61	0.45
62	0.38
63	0.31
64	0.25
65	0.22
66	0.21
67	0.17
68	0.12
69	0.08
70	0.07
71	0.06
72	0.07
73	0.06
74	0.06
75	0.07
76	0.11
77	0.21
78	0.28
79	0.3
80	0.34
81	0.35
82	0.37
83	0.38
84	0.38
85	0.32
86	0.32
87	0.3
88	0.27
89	0.27
90	0.25
91	0.25
92	0.23
93	0.19
94	0.12
95	0.15
96	0.21
97	0.29
98	0.39
99	0.47
100	0.55
101	0.66
102	0.74
103	0.8
104	0.84
105	0.83
106	0.79
107	0.8
108	0.8
109	0.8
110	0.82
111	0.79
112	0.74
113	0.77
114	0.72
115	0.68
116	0.66
117	0.58
118	0.53
119	0.53
120	0.51
121	0.43
122	0.42
123	0.41
124	0.36
125	0.41
126	0.41
127	0.38
128	0.37
129	0.43
130	0.48
131	0.47
132	0.46
133	0.42
134	0.36
135	0.36
136	0.38
137	0.33
138	0.28
139	0.23
140	0.2
141	0.19
142	0.18
143	0.15
144	0.13
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.15
149	0.15
150	0.19
151	0.2
152	0.2
153	0.2
154	0.19
155	0.22
156	0.19
157	0.18
158	0.15
159	0.13
160	0.12
161	0.12
162	0.13
163	0.12
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.12
168	0.11
169	0.12
170	0.11
171	0.11
172	0.1
173	0.11
174	0.12
175	0.18
176	0.26
177	0.32
178	0.34
179	0.39
180	0.45
181	0.43
182	0.43
183	0.4
184	0.34
185	0.3
186	0.3
187	0.24
188	0.19
189	0.2
190	0.19
191	0.17
192	0.13
193	0.11
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.1
199	0.09
200	0.13
201	0.15
202	0.16
203	0.18
204	0.21
205	0.27
206	0.28
207	0.29
208	0.3
209	0.34
210	0.38
211	0.4
212	0.44
213	0.42
214	0.44
215	0.45
216	0.42
217	0.44
218	0.39
219	0.34
220	0.26
221	0.22
222	0.18
223	0.18
224	0.15
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.06
229	0.05
230	0.04
231	0.03
232	0.02
233	0.03
234	0.04
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.06
239	0.1
240	0.12
241	0.12
242	0.16
243	0.16
244	0.18
245	0.2
246	0.21
247	0.2
248	0.21
249	0.21
250	0.2
251	0.2
252	0.21
253	0.2
254	0.2
255	0.22
256	0.25
257	0.33
258	0.39
259	0.45
260	0.51
261	0.55
262	0.63
263	0.68
264	0.73
265	0.74
266	0.74
267	0.74
268	0.69
269	0.72
270	0.65
271	0.57
272	0.47
273	0.4
274	0.41
275	0.37
276	0.35
277	0.28
278	0.27
279	0.25
280	0.26
281	0.25
282	0.16
283	0.17
284	0.17
285	0.17
286	0.17
287	0.16
288	0.14
289	0.12
290	0.12
291	0.1
292	0.13
293	0.15
294	0.17
295	0.19
296	0.19
297	0.25
298	0.28
299	0.29
300	0.28
301	0.26
302	0.28
303	0.31
304	0.33
305	0.27
306	0.25
307	0.22
308	0.19
309	0.18
310	0.14
311	0.09
312	0.07
313	0.08
314	0.1
315	0.13
316	0.16
317	0.16
318	0.17
319	0.18
320	0.21
321	0.23
322	0.25
323	0.33
324	0.38
325	0.45
326	0.48
327	0.49
328	0.48
329	0.5
330	0.45
331	0.34
332	0.26
333	0.19
334	0.14
335	0.13
336	0.12
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.06
343	0.08
344	0.07
345	0.08
346	0.08
347	0.08
348	0.07
349	0.08
350	0.12
351	0.14
352	0.15
353	0.14
354	0.15
355	0.14
356	0.14
357	0.13
358	0.08
359	0.05
360	0.05
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.08
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.07
380	0.1
381	0.11
382	0.17
383	0.19
384	0.25
385	0.26
386	0.27
387	0.26
388	0.25
389	0.26
390	0.19
391	0.18
392	0.13
393	0.12
394	0.11
395	0.11
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.08
400	0.14
401	0.18
402	0.18
403	0.27
404	0.32
405	0.39
406	0.48
407	0.55
408	0.57
409	0.65
410	0.69
411	0.65
412	0.69
413	0.66
414	0.61
415	0.58
416	0.52
417	0.45
418	0.46
419	0.5
420	0.52
421	0.57
422	0.63
423	0.64
424	0.62
425	0.65
426	0.6
427	0.59
428	0.56
429	0.49
430	0.43
431	0.37
432	0.36
433	0.3
434	0.3
435	0.23
436	0.23
437	0.2
438	0.16
439	0.2
440	0.2
441	0.23
442	0.25
443	0.28
444	0.26
445	0.3
446	0.32
447	0.28
448	0.27
449	0.24
450	0.2
451	0.17
452	0.12
453	0.08
454	0.08
455	0.07
456	0.09
457	0.09
458	0.1
459	0.16
460	0.16
461	0.19
462	0.23
463	0.26
464	0.32
465	0.38
466	0.39
467	0.37
468	0.4
469	0.4
470	0.37
471	0.35
472	0.29
473	0.26
474	0.25
475	0.23
476	0.21
477	0.23
478	0.22
479	0.22
480	0.23
481	0.19
482	0.18
483	0.19
484	0.19
485	0.17
486	0.18
487	0.18
488	0.16
489	0.21
490	0.25
491	0.25
492	0.25
493	0.23
494	0.23
495	0.23
496	0.24
497	0.2
498	0.15
499	0.18
500	0.19
501	0.18
502	0.17
503	0.17
504	0.15
505	0.15
506	0.16
507	0.11
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.13
512	0.13
513	0.13
514	0.14
515	0.13
516	0.1
517	0.09
518	0.09
519	0.09
520	0.08
521	0.08
522	0.06
523	0.07
524	0.09
525	0.1
526	0.12
527	0.14
528	0.17
529	0.2
530	0.22
531	0.21
532	0.2
533	0.21
534	0.21
535	0.22
536	0.2
537	0.16
538	0.15
539	0.14
540	0.14
541	0.11
542	0.08
543	0.06
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.09
548	0.12
549	0.13
550	0.16
551	0.19
552	0.21
553	0.26
554	0.27
555	0.27
556	0.27
557	0.27
558	0.3
559	0.31
560	0.3
561	0.29
562	0.28
563	0.27
564	0.24
565	0.23
566	0.19
567	0.14
568	0.1
569	0.07
570	0.08
571	0.09
572	0.12
573	0.11
574	0.11
575	0.11
576	0.14
577	0.15
578	0.14
579	0.12
580	0.11
581	0.11
582	0.12
583	0.14
584	0.12
585	0.12
586	0.12
587	0.15
588	0.14
589	0.14
590	0.13
591	0.12
592	0.14
593	0.16
594	0.19
595	0.18
596	0.19
597	0.21
598	0.26
599	0.26
600	0.23
601	0.22
602	0.18
603	0.16
604	0.14
605	0.12
606	0.06
607	0.05
608	0.05
609	0.05
610	0.06
611	0.07
612	0.07
613	0.07
614	0.08
615	0.12
616	0.13
617	0.13
618	0.14
619	0.16
620	0.22
621	0.23
622	0.31
623	0.27
624	0.27
625	0.26
626	0.26
627	0.24
628	0.18
629	0.16
630	0.09
631	0.08
632	0.08
633	0.08
634	0.06
635	0.05
636	0.07
637	0.08
638	0.09
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.13
643	0.15
644	0.19
645	0.28
646	0.3
647	0.38
648	0.44
649	0.46
650	0.47
651	0.5
652	0.46
653	0.37
654	0.36
655	0.29
656	0.22
657	0.19
658	0.15
659	0.1
660	0.08
661	0.06
662	0.06
663	0.06
664	0.05
665	0.06
666	0.07
667	0.07
668	0.08
669	0.11
670	0.11
671	0.11
672	0.11
673	0.12
674	0.12
675	0.15
676	0.17
677	0.15
678	0.14
679	0.16
680	0.16
681	0.14
682	0.13
683	0.1
684	0.1
685	0.1
686	0.11
687	0.11
688	0.11
689	0.12
690	0.12
691	0.12
692	0.11
693	0.14
694	0.14
695	0.13
696	0.15
697	0.14
698	0.16
699	0.17
700	0.16
701	0.14
702	0.13
703	0.13
704	0.15
705	0.16
706	0.14
707	0.13
708	0.12
709	0.11
710	0.1
711	0.1
712	0.06
713	0.05
714	0.06
715	0.06
716	0.06
717	0.06
718	0.08
719	0.07
720	0.08
721	0.09
722	0.09
723	0.09
724	0.09
725	0.1
726	0.12
727	0.16
728	0.25
729	0.32
730	0.39
731	0.44
732	0.45
733	0.46
734	0.47
735	0.47
736	0.41
737	0.35
738	0.36
739	0.34
740	0.35
741	0.34
742	0.31
743	0.27
744	0.24
745	0.26
746	0.18
747	0.17
748	0.18
749	0.17
750	0.15
751	0.15
752	0.17
753	0.12
754	0.14
755	0.15
756	0.12
757	0.13
758	0.16
759	0.2
760	0.26
761	0.34
762	0.42
763	0.5
764	0.58
765	0.65
766	0.73
767	0.77
768	0.72
769	0.74
770	0.72
771	0.71
772	0.63
773	0.57
774	0.5
775	0.43
776	0.42
777	0.33
778	0.33
779	0.25
780	0.31
781	0.29
782	0.25
783	0.22
784	0.21
785	0.2
786	0.12
787	0.13
788	0.06
789	0.07
790	0.07
791	0.1
792	0.1
793	0.1
794	0.09
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.08
799	0.07
800	0.09
801	0.1
802	0.1
803	0.09
804	0.1
805	0.12
806	0.12
807	0.13
808	0.13
809	0.13
810	0.14
811	0.15
812	0.15
813	0.16
814	0.18
815	0.18
816	0.2
817	0.2
818	0.2
819	0.21
820	0.21
821	0.2
822	0.22
823	0.23
824	0.23
825	0.24
826	0.24
827	0.25
828	0.26
829	0.3
830	0.33
831	0.31
832	0.27
833	0.27
834	0.34
835	0.34
836	0.32
837	0.27
838	0.22
839	0.22
840	0.28
841	0.28
842	0.23
843	0.22
844	0.24
845	0.32
846	0.29
847	0.31
848	0.28
849	0.29
850	0.29
851	0.29
852	0.28
853	0.27
854	0.34
855	0.37
856	0.37
857	0.4
858	0.45
859	0.46
860	0.53
861	0.47
862	0.42
863	0.4
864	0.4
865	0.35
866	0.34
867	0.33
868	0.26
869	0.27
870	0.31
871	0.35
872	0.38
873	0.42
874	0.4
875	0.43
876	0.46
877	0.51
878	0.53
879	0.56
880	0.55
881	0.54
882	0.56
883	0.53
884	0.51
885	0.48
886	0.44
887	0.36
888	0.31
889	0.27
890	0.25
891	0.29
892	0.31
893	0.3
894	0.27
895	0.29
896	0.28
897	0.31
898	0.28
899	0.24
900	0.22
901	0.22
902	0.23
903	0.22
904	0.22
905	0.2
906	0.19
907	0.17
908	0.15
909	0.13
910	0.13
911	0.12
912	0.11
913	0.12
914	0.12
915	0.14
916	0.18
917	0.2
918	0.18
919	0.21
920	0.23
921	0.3
922	0.35
923	0.35
924	0.37
925	0.36
926	0.4
927	0.38
928	0.41
929	0.36
930	0.36
931	0.37
932	0.33
933	0.33
934	0.28
935	0.29
936	0.27
937	0.29
938	0.23
939	0.26
940	0.27
941	0.26
942	0.27
943	0.27
944	0.26
945	0.28
946	0.31
947	0.29
948	0.31
949	0.36
950	0.38
951	0.38
952	0.39
953	0.33
954	0.3
955	0.27
956	0.23
957	0.18
958	0.15
959	0.13
960	0.11
961	0.11
962	0.1
963	0.09
964	0.09
965	0.11
966	0.11
967	0.11
968	0.13
969	0.17
970	0.19
971	0.21
972	0.24
973	0.28
974	0.3
975	0.31
976	0.33
977	0.35
978	0.36
979	0.37
980	0.35
981	0.37
982	0.43
983	0.43
984	0.41
985	0.35
986	0.34
987	0.38
988	0.44
989	0.39
990	0.38
991	0.43
992	0.48
993	0.52
994	0.55
995	0.55
996	0.55
997	0.61
998	0.56
999	0.54
1000	0.53
1001	0.53
1002	0.53
1003	0.52
1004	0.49
1005	0.47
1006	0.48
1007	0.46
1008	0.43
1009	0.39
1010	0.39
1011	0.38
1012	0.34
1013	0.3
1014	0.27
1015	0.24
1016	0.21
1017	0.19
1018	0.15
1019	0.11
1020	0.1
1021	0.09
1022	0.1
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.12
1026	0.13
1027	0.15
1028	0.16
1029	0.19
1030	0.25
1031	0.33
1032	0.39
1033	0.45
1034	0.51
1035	0.55
1036	0.65
1037	0.69
1038	0.69
1039	0.72
1040	0.76
1041	0.71
1042	0.73
1043	0.75
1044	0.68
1045	0.69
1046	0.66
1047	0.62
1048	0.59
1049	0.59
1050	0.53
1051	0.47
1052	0.45
1053	0.38
1054	0.36
1055	0.37
1056	0.36
1057	0.37
1058	0.4
1059	0.42
1060	0.44
1061	0.45
1062	0.43
1063	0.39
1064	0.39

R0KG46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer