Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IN10

Protein Details
Accession R0IN10    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
331-351AEENRLKREKEERKKKLAAMABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
163-225KAKEKDASKPVAPPIKHEPTKILTRKERLALKAEAGVKGKKPVAGLPSKPVDPKVDPSKEKKK
335-358RLKREKEERKKKLAAMAAKAKKRY
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 10.166, cyto 8, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MSSLKDIMSIIDPSAKSTASAPKQAALGVTPKPAPRPVGGANGATQAPQLKRKASSPAENGQAKMQRKEAVGGPAQANGAVRATSKPASSAPTTSVPYRGTAAPASSKAANPPVRKPLQSSSAPAAAPKAPAPAPKAAPAATGSAAAASSAAPKKGYLAMLQKAKEKDASKPVAPPIKHEPTKILTRKERLALKAEAGVKGKKPVAGLPSKPVDPKVDPSKEKKKVDVGYQGTARPAKKPVEVGYKGTARPTSVPATSSRNGVPAAKPKPNPTKGRYDGYADWDDLDAMEDEEDDYESDASSDMEGGIWDVEEEEQLALKAAKKEDAEALAEENRLKREKEERKKKLAAMAAKAKKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.18
4 0.21
5 0.3
6 0.29
7 0.35
8 0.34
9 0.34
10 0.35
11 0.35
12 0.32
13 0.24
14 0.24
15 0.2
16 0.23
17 0.24
18 0.26
19 0.29
20 0.32
21 0.33
22 0.3
23 0.33
24 0.33
25 0.37
26 0.38
27 0.35
28 0.33
29 0.32
30 0.31
31 0.24
32 0.22
33 0.2
34 0.21
35 0.26
36 0.29
37 0.31
38 0.33
39 0.36
40 0.45
41 0.46
42 0.51
43 0.5
44 0.53
45 0.57
46 0.57
47 0.55
48 0.52
49 0.52
50 0.48
51 0.45
52 0.42
53 0.38
54 0.36
55 0.38
56 0.36
57 0.35
58 0.33
59 0.33
60 0.3
61 0.27
62 0.26
63 0.24
64 0.21
65 0.15
66 0.13
67 0.09
68 0.1
69 0.09
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.15
74 0.15
75 0.19
76 0.2
77 0.21
78 0.21
79 0.23
80 0.26
81 0.25
82 0.27
83 0.24
84 0.23
85 0.24
86 0.21
87 0.19
88 0.17
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.19
93 0.18
94 0.17
95 0.18
96 0.25
97 0.3
98 0.31
99 0.34
100 0.41
101 0.43
102 0.44
103 0.46
104 0.42
105 0.42
106 0.41
107 0.4
108 0.34
109 0.34
110 0.33
111 0.29
112 0.26
113 0.2
114 0.19
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.16
119 0.19
120 0.21
121 0.21
122 0.23
123 0.25
124 0.22
125 0.21
126 0.19
127 0.18
128 0.14
129 0.13
130 0.09
131 0.08
132 0.07
133 0.06
134 0.05
135 0.04
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.11
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.17
146 0.22
147 0.26
148 0.28
149 0.31
150 0.3
151 0.3
152 0.32
153 0.28
154 0.28
155 0.31
156 0.34
157 0.3
158 0.32
159 0.36
160 0.37
161 0.35
162 0.35
163 0.35
164 0.4
165 0.4
166 0.38
167 0.36
168 0.34
169 0.43
170 0.44
171 0.43
172 0.4
173 0.42
174 0.45
175 0.47
176 0.48
177 0.41
178 0.41
179 0.35
180 0.3
181 0.31
182 0.29
183 0.27
184 0.24
185 0.24
186 0.2
187 0.22
188 0.22
189 0.19
190 0.18
191 0.18
192 0.22
193 0.26
194 0.26
195 0.28
196 0.29
197 0.29
198 0.3
199 0.29
200 0.27
201 0.23
202 0.28
203 0.32
204 0.37
205 0.4
206 0.47
207 0.56
208 0.61
209 0.62
210 0.59
211 0.58
212 0.54
213 0.56
214 0.57
215 0.51
216 0.46
217 0.46
218 0.43
219 0.38
220 0.39
221 0.33
222 0.26
223 0.27
224 0.25
225 0.25
226 0.28
227 0.3
228 0.36
229 0.38
230 0.39
231 0.4
232 0.41
233 0.39
234 0.38
235 0.34
236 0.25
237 0.25
238 0.25
239 0.23
240 0.2
241 0.21
242 0.21
243 0.27
244 0.27
245 0.27
246 0.24
247 0.23
248 0.23
249 0.24
250 0.26
251 0.28
252 0.34
253 0.39
254 0.41
255 0.48
256 0.57
257 0.63
258 0.67
259 0.63
260 0.67
261 0.65
262 0.68
263 0.61
264 0.57
265 0.51
266 0.49
267 0.47
268 0.36
269 0.32
270 0.26
271 0.24
272 0.17
273 0.16
274 0.1
275 0.07
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.08
305 0.09
306 0.13
307 0.17
308 0.18
309 0.23
310 0.23
311 0.25
312 0.27
313 0.28
314 0.27
315 0.23
316 0.25
317 0.23
318 0.24
319 0.24
320 0.24
321 0.27
322 0.28
323 0.28
324 0.31
325 0.4
326 0.49
327 0.58
328 0.67
329 0.71
330 0.78
331 0.84
332 0.82
333 0.8
334 0.77
335 0.74
336 0.72
337 0.73
338 0.72