Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KH29

Protein Details
Accession R0KH29    Localization Confidence High Confidence Score 16.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-24SDNERSRDRYRERDSRREPREGRBasic
28-62GTPTERRNRSRSPRERGGRRDNRHRSRSPYRKDERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-120YRERDSRREPREGRERGGTPTERRNRSRSPRERGGRRDNRHRSRSPYRKDEREGASRGGDRGRPGHDRGRGRDDRRGGRDDRSHFRDRSPQPPKGPRGSARGPFSGAVKP
Subcellular Location(s) nucl 26, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDNERSRDRYRERDSRREPREGRERGGTPTERRNRSRSPRERGGRRDNRHRSRSPYRKDEREGASRGGDRGRPGHDRGRGRDDRRGGRDDRSHFRDRSPQPPKGPRGSARGPFSGAVKPPSGPRPSADSAVKEETPDVEMKDERQKPEDMDDDEWEMLKVMGFGGFKSTKNTKVPGNDKNYGVRKDKQLQARQYMNRQGGFNRPLSPSRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.84
3 0.85
4 0.84
5 0.84
6 0.78
7 0.78
8 0.79
9 0.73
10 0.68
11 0.65
12 0.61
13 0.55
14 0.59
15 0.55
16 0.5
17 0.56
18 0.6
19 0.6
20 0.63
21 0.65
22 0.67
23 0.72
24 0.78
25 0.78
26 0.77
27 0.8
28 0.85
29 0.87
30 0.86
31 0.87
32 0.86
33 0.85
34 0.87
35 0.88
36 0.88
37 0.87
38 0.83
39 0.81
40 0.82
41 0.83
42 0.81
43 0.81
44 0.8
45 0.79
46 0.78
47 0.76
48 0.71
49 0.68
50 0.62
51 0.54
52 0.49
53 0.42
54 0.38
55 0.33
56 0.28
57 0.23
58 0.23
59 0.25
60 0.25
61 0.28
62 0.33
63 0.38
64 0.42
65 0.44
66 0.51
67 0.54
68 0.54
69 0.57
70 0.57
71 0.57
72 0.57
73 0.57
74 0.49
75 0.48
76 0.51
77 0.5
78 0.51
79 0.5
80 0.51
81 0.47
82 0.47
83 0.5
84 0.47
85 0.52
86 0.52
87 0.51
88 0.52
89 0.59
90 0.62
91 0.57
92 0.58
93 0.51
94 0.5
95 0.5
96 0.48
97 0.43
98 0.39
99 0.35
100 0.31
101 0.3
102 0.25
103 0.22
104 0.18
105 0.15
106 0.15
107 0.17
108 0.22
109 0.22
110 0.21
111 0.21
112 0.25
113 0.27
114 0.3
115 0.29
116 0.25
117 0.27
118 0.3
119 0.28
120 0.22
121 0.2
122 0.16
123 0.16
124 0.15
125 0.12
126 0.11
127 0.11
128 0.14
129 0.24
130 0.27
131 0.28
132 0.3
133 0.31
134 0.3
135 0.34
136 0.36
137 0.3
138 0.28
139 0.28
140 0.27
141 0.26
142 0.24
143 0.2
144 0.15
145 0.11
146 0.09
147 0.07
148 0.05
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.12
153 0.14
154 0.15
155 0.21
156 0.25
157 0.29
158 0.33
159 0.36
160 0.36
161 0.44
162 0.52
163 0.55
164 0.59
165 0.58
166 0.56
167 0.62
168 0.64
169 0.61
170 0.59
171 0.56
172 0.56
173 0.6
174 0.64
175 0.66
176 0.67
177 0.69
178 0.71
179 0.75
180 0.74
181 0.74
182 0.76
183 0.71
184 0.66
185 0.6
186 0.54
187 0.54
188 0.52
189 0.46
190 0.42
191 0.4