Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KRN2

Protein Details
Accession R0KRN2    Localization Confidence High Confidence Score 21.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
369-396LERLKEKETKAKKKQRRAENERRQKEITBasic
480-499QRSARDAKYRAKRARKQDDDBasic
728-760LNARPIKKVREAQARKKFKAAQRLEKLKKKSALHydrophilic
774-839ASIARLMSRAAKKKPKQKVSVIVAKGGNKGIKNRPKGTKGKYKMVDARLKKDVRGEKRAAKKQKKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-22KHGKGRLDKWYKLAKEK
238-239KR
373-391KEKETKAKKKQRRAENERR
722-758KEKLRALNARPIKKVREAQARKKFKAAQRLEKLKKKS
775-839SIARLMSRAAKKKPKQKVSVIVAKGGNKGIKNRPKGTKGKYKMVDARLKKDVRGEKRAAKKQKKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHGKGRLDKWYKLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYNFLEKSKVLIDLCAAPGSWCQVASEVMPANSLIVGVDLAPIKPIPRCITFQSDITTDKCRATLRQHLKHLKCDTVLHDGAPNVGTAWVQDAFTQAELVLQSMKLATEFLVEGGTFVTKVFRSKDYNSLLWVFNQLFTKVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGYKAPKHLDPKFLDARSVFAELADPTPNNEAKVFKPEVKKRKREGYEEGDWTQFKEAPVSEFIQTVDPIAMLGGLNKLSFDQKPNGDIAVATIDKLPETTKEIRECCADLKVLGRADFKRLLRWRLRVREIFGFATKKAKTEEDKAKEAQEGDEVAEVESMDEEMQIEEELERLKEKETKAKKKQRRAENERRQKEITRLQMNMATPFDIGLEQVGPTGEDAMFGLKAVDKAGALNKIARGKMAQIVEKEKPEEVEEEPETDDEEDRLERDLDAMYGDYVEQRSARDAKYRAKRARKQDDDGEWNGFSDDDKEQSDDDELVQDADSDWSSDEEDGPNELITDLDREDQPKQGLTKRAARFFDQDIFKDIDGLEDMDEDDDSGIDVEDSAGVKKESATPTRTSEKELSIRTSKKTAPPLAASDEDSSDDDDDKIEEVARDETQWEQDSMPMKNGKPDIDIITAEAMTLAHQMATGQKTKYDLLDESFNRYSHRDVDGLPDWFLDDENKHSKLQRPTTAAAAAAIKEKLRALNARPIKKVREAQARKKFKAAQRLEKLKKKSALLADEEGMTEKEKAASIARLMSRAAKKKPKQKVSVIVAKGGNKGIKNRPKGTKGKYKMVDARLKKDVRGEKRAAKKQKKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.75
3 0.73
4 0.72
5 0.71
6 0.7
7 0.71
8 0.77
9 0.79
10 0.77
11 0.78
12 0.73
13 0.74
14 0.67
15 0.65
16 0.59
17 0.55
18 0.57
19 0.57
20 0.62
21 0.6
22 0.65
23 0.6
24 0.63
25 0.6
26 0.58
27 0.58
28 0.54
29 0.56
30 0.5
31 0.52
32 0.47
33 0.49
34 0.41
35 0.35
36 0.32
37 0.27
38 0.26
39 0.21
40 0.19
41 0.15
42 0.16
43 0.18
44 0.17
45 0.13
46 0.12
47 0.13
48 0.14
49 0.14
50 0.18
51 0.17
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.13
57 0.12
58 0.07
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.13
69 0.19
70 0.21
71 0.25
72 0.29
73 0.32
74 0.4
75 0.41
76 0.42
77 0.4
78 0.38
79 0.37
80 0.36
81 0.36
82 0.3
83 0.28
84 0.29
85 0.27
86 0.3
87 0.34
88 0.42
89 0.48
90 0.55
91 0.64
92 0.72
93 0.74
94 0.78
95 0.76
96 0.7
97 0.62
98 0.57
99 0.5
100 0.48
101 0.44
102 0.35
103 0.33
104 0.28
105 0.27
106 0.23
107 0.19
108 0.11
109 0.11
110 0.09
111 0.07
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.06
142 0.08
143 0.08
144 0.12
145 0.15
146 0.2
147 0.25
148 0.29
149 0.38
150 0.41
151 0.41
152 0.41
153 0.42
154 0.38
155 0.33
156 0.33
157 0.25
158 0.22
159 0.23
160 0.2
161 0.17
162 0.18
163 0.2
164 0.17
165 0.19
166 0.22
167 0.27
168 0.34
169 0.37
170 0.4
171 0.45
172 0.49
173 0.51
174 0.47
175 0.47
176 0.41
177 0.38
178 0.35
179 0.28
180 0.22
181 0.19
182 0.17
183 0.11
184 0.1
185 0.11
186 0.16
187 0.18
188 0.25
189 0.33
190 0.39
191 0.49
192 0.52
193 0.59
194 0.56
195 0.61
196 0.61
197 0.54
198 0.49
199 0.4
200 0.38
201 0.32
202 0.3
203 0.23
204 0.15
205 0.16
206 0.13
207 0.15
208 0.14
209 0.12
210 0.11
211 0.16
212 0.17
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.17
217 0.25
218 0.26
219 0.28
220 0.37
221 0.46
222 0.55
223 0.63
224 0.71
225 0.71
226 0.79
227 0.79
228 0.76
229 0.75
230 0.72
231 0.69
232 0.65
233 0.59
234 0.52
235 0.46
236 0.4
237 0.33
238 0.27
239 0.2
240 0.17
241 0.16
242 0.15
243 0.18
244 0.19
245 0.17
246 0.16
247 0.17
248 0.15
249 0.15
250 0.13
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.09
264 0.1
265 0.13
266 0.17
267 0.18
268 0.2
269 0.21
270 0.2
271 0.18
272 0.16
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.1
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.09
282 0.07
283 0.13
284 0.17
285 0.21
286 0.27
287 0.28
288 0.29
289 0.31
290 0.31
291 0.27
292 0.24
293 0.2
294 0.15
295 0.15
296 0.18
297 0.17
298 0.18
299 0.2
300 0.19
301 0.23
302 0.28
303 0.27
304 0.32
305 0.35
306 0.41
307 0.44
308 0.52
309 0.57
310 0.59
311 0.66
312 0.61
313 0.6
314 0.57
315 0.54
316 0.47
317 0.42
318 0.35
319 0.29
320 0.32
321 0.28
322 0.24
323 0.23
324 0.25
325 0.25
326 0.32
327 0.41
328 0.4
329 0.44
330 0.43
331 0.43
332 0.4
333 0.37
334 0.29
335 0.2
336 0.15
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.08
341 0.08
342 0.07
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.04
351 0.03
352 0.04
353 0.03
354 0.04
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.08
360 0.12
361 0.14
362 0.23
363 0.33
364 0.43
365 0.53
366 0.64
367 0.71
368 0.77
369 0.85
370 0.85
371 0.86
372 0.86
373 0.87
374 0.87
375 0.89
376 0.84
377 0.8
378 0.73
379 0.64
380 0.6
381 0.55
382 0.52
383 0.46
384 0.42
385 0.38
386 0.38
387 0.37
388 0.32
389 0.25
390 0.17
391 0.12
392 0.11
393 0.1
394 0.07
395 0.06
396 0.04
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.04
401 0.04
402 0.03
403 0.04
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.04
410 0.04
411 0.04
412 0.04
413 0.05
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.08
418 0.09
419 0.09
420 0.1
421 0.12
422 0.15
423 0.15
424 0.15
425 0.13
426 0.13
427 0.17
428 0.18
429 0.18
430 0.17
431 0.22
432 0.24
433 0.25
434 0.24
435 0.2
436 0.19
437 0.17
438 0.17
439 0.13
440 0.16
441 0.15
442 0.15
443 0.15
444 0.14
445 0.14
446 0.12
447 0.11
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.09
469 0.12
470 0.13
471 0.18
472 0.22
473 0.31
474 0.4
475 0.49
476 0.55
477 0.63
478 0.7
479 0.74
480 0.81
481 0.79
482 0.75
483 0.72
484 0.7
485 0.66
486 0.61
487 0.52
488 0.41
489 0.35
490 0.29
491 0.22
492 0.15
493 0.11
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.11
498 0.1
499 0.11
500 0.12
501 0.1
502 0.09
503 0.08
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.06
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.07
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.08
529 0.09
530 0.11
531 0.12
532 0.15
533 0.16
534 0.17
535 0.2
536 0.24
537 0.29
538 0.32
539 0.4
540 0.42
541 0.48
542 0.48
543 0.47
544 0.46
545 0.43
546 0.45
547 0.39
548 0.34
549 0.31
550 0.31
551 0.28
552 0.25
553 0.21
554 0.15
555 0.13
556 0.12
557 0.08
558 0.06
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.05
563 0.05
564 0.04
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.04
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.06
576 0.07
577 0.07
578 0.13
579 0.17
580 0.22
581 0.25
582 0.27
583 0.32
584 0.39
585 0.39
586 0.39
587 0.37
588 0.38
589 0.4
590 0.39
591 0.4
592 0.42
593 0.44
594 0.42
595 0.44
596 0.43
597 0.43
598 0.49
599 0.48
600 0.44
601 0.44
602 0.44
603 0.43
604 0.41
605 0.36
606 0.29
607 0.25
608 0.22
609 0.2
610 0.18
611 0.14
612 0.13
613 0.11
614 0.1
615 0.1
616 0.09
617 0.09
618 0.08
619 0.08
620 0.09
621 0.11
622 0.11
623 0.11
624 0.12
625 0.13
626 0.15
627 0.17
628 0.16
629 0.14
630 0.17
631 0.21
632 0.21
633 0.25
634 0.26
635 0.25
636 0.3
637 0.32
638 0.29
639 0.27
640 0.29
641 0.27
642 0.25
643 0.25
644 0.2
645 0.19
646 0.17
647 0.15
648 0.12
649 0.09
650 0.06
651 0.07
652 0.06
653 0.05
654 0.05
655 0.05
656 0.1
657 0.13
658 0.17
659 0.17
660 0.18
661 0.21
662 0.22
663 0.23
664 0.22
665 0.21
666 0.2
667 0.28
668 0.27
669 0.32
670 0.34
671 0.33
672 0.31
673 0.32
674 0.31
675 0.27
676 0.29
677 0.23
678 0.21
679 0.28
680 0.31
681 0.3
682 0.28
683 0.24
684 0.21
685 0.2
686 0.2
687 0.15
688 0.12
689 0.17
690 0.23
691 0.25
692 0.27
693 0.31
694 0.38
695 0.45
696 0.52
697 0.53
698 0.53
699 0.53
700 0.55
701 0.52
702 0.45
703 0.37
704 0.3
705 0.23
706 0.2
707 0.19
708 0.15
709 0.15
710 0.17
711 0.17
712 0.2
713 0.25
714 0.26
715 0.35
716 0.44
717 0.49
718 0.55
719 0.59
720 0.59
721 0.63
722 0.65
723 0.64
724 0.67
725 0.7
726 0.74
727 0.79
728 0.84
729 0.78
730 0.79
731 0.78
732 0.73
733 0.74
734 0.73
735 0.73
736 0.74
737 0.82
738 0.84
739 0.85
740 0.85
741 0.83
742 0.8
743 0.72
744 0.69
745 0.65
746 0.62
747 0.58
748 0.55
749 0.47
750 0.41
751 0.38
752 0.32
753 0.25
754 0.2
755 0.15
756 0.12
757 0.12
758 0.12
759 0.14
760 0.15
761 0.17
762 0.18
763 0.24
764 0.24
765 0.24
766 0.25
767 0.32
768 0.38
769 0.44
770 0.51
771 0.55
772 0.63
773 0.72
774 0.82
775 0.84
776 0.84
777 0.85
778 0.86
779 0.84
780 0.85
781 0.78
782 0.73
783 0.68
784 0.62
785 0.55
786 0.49
787 0.44
788 0.38
789 0.43
790 0.47
791 0.52
792 0.58
793 0.64
794 0.69
795 0.74
796 0.81
797 0.82
798 0.83
799 0.81
800 0.83
801 0.79
802 0.79
803 0.79
804 0.79
805 0.79
806 0.75
807 0.75
808 0.74
809 0.71
810 0.64
811 0.64
812 0.65
813 0.64
814 0.66
815 0.67
816 0.66
817 0.75
818 0.83
819 0.85