Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KQP8

Protein Details
Accession R0KQP8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-53SPSLLRSPGKRTRRQMPSRTPSGLSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
1200-1217PTAPRGGRGRGKPGLGRP
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 4, cyto 3, pero 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000048  IQ_motif_EF-hand-BS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR034397  Prp24_RRM1  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR031766  RRM_occluded  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0015629  C:actin cytoskeleton  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16842  RRM_occluded  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50096  IQ  
PS50102  RRM  
CDD cd12296  RRM1_Prp24  
cd12299  RRM4_Prp24  
cd00590  RRM_SF  
Amino Acid Sequences MDINSLLSPSDSPAGTPTPQPAPPPAALSPSLLRSPGKRTRRQMPSRTPSGLSQHVMSSPAPPPQHVHSRGPSPAFSHAANGARPIHSAMGTPQHVSSPHESRVTPPNPMYRQTSTPGMDTLADLASMQHQQAARQSSGVHQRPVTLQHLGQNLSGESVASIMSEASPRPRNFVTRSLEPQLIDWLNQLDKTLLENPFDYYSHVSLVTTLHQGLQNHLTSFDADPNAYELVQTLRDAYKTMSDKYPLGELLWHYRLNDEKTLARDVEERMGVLELHKQATQEEPYSAKLWAAYGEHVSYLVACSWEQVPPEEWPEEERLIGRELFQPQHLLDVLQQGAERVKYNLQESNLVWDRYLQVLEEDLERGGFSQEKAKRVAAIYNERLGQPHATWANTLSRYSSFNSRYNQSHYEQVMDDAVQKNTHIKQQYANREEYEFKLLQAIQAGDQAAEYSAMTRYLKWEKRTMGVYSFHLVNALYERATLRFPVDPSLWEDHVEFLVWQDNRSVDLLNVLERATRHCPWSGALWSHRLLTLEAENKPFEDLELVKHTATGSGLLEHTDLDELIKVQLAWCGYLRRRAFNDPRATEDDVDVAEVGIRSALEFVREVGMKKHGREWTDPKYRLERTHVKFWLQRGDIDQARQIHESVAKHQEDSYDFWYRYYIFEMLIWAPHSARNKQNAGHQLLPPTLATAVLERAMKRLHTIDHPEPLIEMYVNHCEQHETALKVRSAAMEGRRAERIVSVRREKECAHAAATAVPQDTPDSQAADASGKRKREDGDEEAVLKKSKHRDAEAPKTVVNGEARVASEAPSEARSAGPKRDREHTSIIVKKLPANTPQNRIRQFFTDAGTVRNLVLKEEKDSLTAVVEFETPEEADYALTKEAKGFDGHEISIERGQSTTLYVTNYPAHADEAWLRKLYCPFGEIVGIRFPSLKYDAHRRFCYVQFASAEAAIAATQLDGTDVEGLKLVSKISDPNAKKKRDNATAEGRELYIWHLSFKVKEREVRETFAKFGKIERIKCPIIKPTGNNRGFCYIVYEDKASADAAVAEMHENEFHGFKLMVEIATDRPATKPKTQSTLENPAASSSAQGDAPSEAAIKPASFMDRSIAILNLPDTVPDVRIKPLVEEYGFKKIKLEPHHGGAIIEFTTIEGAGKAQFALEGKEFEGRKLRIGTIQDLNKQKGEWRPSTSFVQPNRVSRPTAPRGGRGRGKPGLGRPMIPKSALAGPVEPKSNADFRAQFLKEPAKDDSSTKDTDKMEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.22
4 0.25
5 0.27
6 0.3
7 0.32
8 0.34
9 0.35
10 0.35
11 0.38
12 0.34
13 0.33
14 0.32
15 0.33
16 0.31
17 0.3
18 0.3
19 0.27
20 0.29
21 0.28
22 0.36
23 0.43
24 0.5
25 0.55
26 0.62
27 0.69
28 0.78
29 0.85
30 0.86
31 0.87
32 0.87
33 0.85
34 0.82
35 0.74
36 0.68
37 0.64
38 0.6
39 0.51
40 0.43
41 0.37
42 0.34
43 0.33
44 0.28
45 0.26
46 0.23
47 0.27
48 0.27
49 0.26
50 0.29
51 0.34
52 0.44
53 0.45
54 0.49
55 0.49
56 0.54
57 0.58
58 0.58
59 0.53
60 0.46
61 0.46
62 0.41
63 0.35
64 0.32
65 0.31
66 0.31
67 0.3
68 0.31
69 0.29
70 0.26
71 0.27
72 0.26
73 0.23
74 0.19
75 0.2
76 0.19
77 0.25
78 0.25
79 0.26
80 0.24
81 0.25
82 0.26
83 0.29
84 0.32
85 0.3
86 0.33
87 0.35
88 0.35
89 0.37
90 0.46
91 0.44
92 0.44
93 0.43
94 0.48
95 0.48
96 0.52
97 0.55
98 0.49
99 0.5
100 0.48
101 0.5
102 0.42
103 0.4
104 0.37
105 0.31
106 0.27
107 0.23
108 0.2
109 0.13
110 0.11
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.13
117 0.13
118 0.15
119 0.21
120 0.26
121 0.24
122 0.23
123 0.24
124 0.27
125 0.38
126 0.41
127 0.4
128 0.35
129 0.37
130 0.39
131 0.44
132 0.41
133 0.34
134 0.3
135 0.31
136 0.35
137 0.34
138 0.32
139 0.29
140 0.25
141 0.22
142 0.2
143 0.14
144 0.09
145 0.08
146 0.07
147 0.05
148 0.05
149 0.04
150 0.05
151 0.07
152 0.08
153 0.15
154 0.24
155 0.24
156 0.29
157 0.32
158 0.38
159 0.41
160 0.48
161 0.49
162 0.48
163 0.54
164 0.54
165 0.54
166 0.47
167 0.44
168 0.42
169 0.36
170 0.29
171 0.23
172 0.22
173 0.2
174 0.2
175 0.19
176 0.13
177 0.12
178 0.16
179 0.2
180 0.19
181 0.2
182 0.21
183 0.23
184 0.24
185 0.24
186 0.23
187 0.2
188 0.19
189 0.19
190 0.18
191 0.16
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.13
196 0.13
197 0.14
198 0.17
199 0.17
200 0.2
201 0.24
202 0.24
203 0.23
204 0.23
205 0.21
206 0.2
207 0.2
208 0.21
209 0.17
210 0.14
211 0.14
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.12
216 0.09
217 0.1
218 0.11
219 0.11
220 0.11
221 0.12
222 0.13
223 0.14
224 0.14
225 0.2
226 0.22
227 0.25
228 0.27
229 0.28
230 0.29
231 0.29
232 0.31
233 0.23
234 0.21
235 0.2
236 0.19
237 0.23
238 0.26
239 0.25
240 0.23
241 0.25
242 0.3
243 0.31
244 0.32
245 0.27
246 0.27
247 0.3
248 0.33
249 0.31
250 0.27
251 0.26
252 0.25
253 0.27
254 0.23
255 0.2
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.14
260 0.17
261 0.14
262 0.16
263 0.17
264 0.16
265 0.16
266 0.21
267 0.23
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.21
272 0.22
273 0.21
274 0.18
275 0.15
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.11
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.07
289 0.06
290 0.08
291 0.09
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.15
297 0.19
298 0.18
299 0.17
300 0.18
301 0.21
302 0.2
303 0.18
304 0.17
305 0.15
306 0.17
307 0.17
308 0.16
309 0.17
310 0.2
311 0.21
312 0.21
313 0.22
314 0.19
315 0.21
316 0.2
317 0.16
318 0.13
319 0.15
320 0.15
321 0.13
322 0.13
323 0.11
324 0.13
325 0.14
326 0.13
327 0.11
328 0.14
329 0.16
330 0.19
331 0.22
332 0.22
333 0.25
334 0.24
335 0.31
336 0.32
337 0.3
338 0.27
339 0.24
340 0.24
341 0.22
342 0.22
343 0.13
344 0.09
345 0.1
346 0.11
347 0.1
348 0.09
349 0.08
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.16
357 0.2
358 0.23
359 0.26
360 0.26
361 0.27
362 0.27
363 0.31
364 0.29
365 0.33
366 0.33
367 0.34
368 0.34
369 0.32
370 0.32
371 0.29
372 0.24
373 0.16
374 0.19
375 0.18
376 0.17
377 0.17
378 0.18
379 0.23
380 0.22
381 0.22
382 0.18
383 0.17
384 0.19
385 0.21
386 0.27
387 0.26
388 0.31
389 0.34
390 0.37
391 0.38
392 0.42
393 0.44
394 0.38
395 0.4
396 0.35
397 0.34
398 0.29
399 0.27
400 0.22
401 0.18
402 0.2
403 0.16
404 0.16
405 0.13
406 0.13
407 0.17
408 0.18
409 0.23
410 0.22
411 0.21
412 0.27
413 0.36
414 0.46
415 0.46
416 0.46
417 0.42
418 0.42
419 0.43
420 0.38
421 0.36
422 0.26
423 0.21
424 0.22
425 0.2
426 0.18
427 0.18
428 0.16
429 0.11
430 0.12
431 0.12
432 0.09
433 0.09
434 0.08
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.13
444 0.22
445 0.27
446 0.3
447 0.35
448 0.35
449 0.39
450 0.42
451 0.39
452 0.35
453 0.32
454 0.3
455 0.27
456 0.25
457 0.21
458 0.18
459 0.16
460 0.12
461 0.11
462 0.1
463 0.07
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.09
468 0.09
469 0.09
470 0.11
471 0.12
472 0.15
473 0.15
474 0.15
475 0.18
476 0.22
477 0.2
478 0.19
479 0.18
480 0.16
481 0.15
482 0.14
483 0.1
484 0.07
485 0.12
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.12
490 0.12
491 0.13
492 0.13
493 0.07
494 0.09
495 0.09
496 0.09
497 0.09
498 0.08
499 0.09
500 0.09
501 0.13
502 0.16
503 0.17
504 0.18
505 0.18
506 0.19
507 0.19
508 0.23
509 0.22
510 0.21
511 0.21
512 0.22
513 0.22
514 0.22
515 0.22
516 0.19
517 0.16
518 0.14
519 0.16
520 0.17
521 0.18
522 0.19
523 0.18
524 0.18
525 0.18
526 0.16
527 0.12
528 0.1
529 0.09
530 0.1
531 0.14
532 0.15
533 0.14
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.1
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.06
545 0.06
546 0.05
547 0.05
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.05
553 0.04
554 0.04
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.07
559 0.12
560 0.13
561 0.21
562 0.22
563 0.24
564 0.28
565 0.36
566 0.42
567 0.45
568 0.53
569 0.46
570 0.5
571 0.5
572 0.48
573 0.4
574 0.34
575 0.26
576 0.17
577 0.16
578 0.11
579 0.06
580 0.05
581 0.04
582 0.04
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.04
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.07
592 0.08
593 0.08
594 0.09
595 0.17
596 0.18
597 0.19
598 0.25
599 0.26
600 0.28
601 0.34
602 0.39
603 0.41
604 0.49
605 0.51
606 0.48
607 0.51
608 0.51
609 0.49
610 0.49
611 0.49
612 0.44
613 0.5
614 0.49
615 0.46
616 0.46
617 0.45
618 0.46
619 0.36
620 0.33
621 0.27
622 0.3
623 0.27
624 0.25
625 0.26
626 0.2
627 0.21
628 0.21
629 0.18
630 0.14
631 0.17
632 0.16
633 0.17
634 0.23
635 0.21
636 0.21
637 0.21
638 0.22
639 0.2
640 0.22
641 0.22
642 0.2
643 0.2
644 0.2
645 0.2
646 0.19
647 0.18
648 0.18
649 0.14
650 0.09
651 0.09
652 0.1
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.08
657 0.08
658 0.11
659 0.14
660 0.16
661 0.21
662 0.26
663 0.28
664 0.29
665 0.35
666 0.39
667 0.4
668 0.39
669 0.36
670 0.32
671 0.3
672 0.29
673 0.23
674 0.16
675 0.11
676 0.08
677 0.07
678 0.05
679 0.06
680 0.07
681 0.08
682 0.08
683 0.1
684 0.1
685 0.1
686 0.11
687 0.12
688 0.12
689 0.15
690 0.22
691 0.23
692 0.26
693 0.26
694 0.25
695 0.23
696 0.21
697 0.18
698 0.11
699 0.08
700 0.07
701 0.11
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.11
706 0.11
707 0.15
708 0.17
709 0.15
710 0.18
711 0.22
712 0.22
713 0.21
714 0.22
715 0.18
716 0.16
717 0.17
718 0.17
719 0.19
720 0.2
721 0.22
722 0.23
723 0.22
724 0.21
725 0.21
726 0.23
727 0.24
728 0.3
729 0.35
730 0.39
731 0.41
732 0.44
733 0.41
734 0.41
735 0.39
736 0.32
737 0.27
738 0.23
739 0.21
740 0.2
741 0.2
742 0.16
743 0.12
744 0.1
745 0.09
746 0.09
747 0.1
748 0.1
749 0.1
750 0.1
751 0.1
752 0.1
753 0.1
754 0.11
755 0.13
756 0.15
757 0.18
758 0.19
759 0.2
760 0.23
761 0.24
762 0.27
763 0.32
764 0.32
765 0.33
766 0.33
767 0.34
768 0.33
769 0.33
770 0.28
771 0.22
772 0.22
773 0.24
774 0.28
775 0.3
776 0.32
777 0.4
778 0.48
779 0.58
780 0.6
781 0.55
782 0.5
783 0.46
784 0.43
785 0.37
786 0.28
787 0.19
788 0.12
789 0.11
790 0.12
791 0.12
792 0.12
793 0.09
794 0.09
795 0.09
796 0.09
797 0.08
798 0.09
799 0.08
800 0.09
801 0.13
802 0.15
803 0.22
804 0.28
805 0.33
806 0.35
807 0.43
808 0.46
809 0.47
810 0.5
811 0.48
812 0.5
813 0.5
814 0.5
815 0.45
816 0.42
817 0.4
818 0.39
819 0.36
820 0.35
821 0.39
822 0.42
823 0.47
824 0.54
825 0.6
826 0.6
827 0.59
828 0.54
829 0.48
830 0.47
831 0.41
832 0.35
833 0.32
834 0.28
835 0.27
836 0.25
837 0.22
838 0.17
839 0.18
840 0.16
841 0.13
842 0.16
843 0.15
844 0.18
845 0.21
846 0.21
847 0.19
848 0.19
849 0.18
850 0.15
851 0.15
852 0.12
853 0.09
854 0.09
855 0.08
856 0.08
857 0.08
858 0.07
859 0.06
860 0.07
861 0.06
862 0.06
863 0.06
864 0.07
865 0.08
866 0.09
867 0.08
868 0.1
869 0.11
870 0.12
871 0.12
872 0.13
873 0.14
874 0.16
875 0.16
876 0.16
877 0.16
878 0.17
879 0.18
880 0.16
881 0.13
882 0.11
883 0.11
884 0.1
885 0.1
886 0.1
887 0.09
888 0.11
889 0.11
890 0.14
891 0.15
892 0.15
893 0.15
894 0.14
895 0.14
896 0.12
897 0.13
898 0.16
899 0.19
900 0.21
901 0.22
902 0.21
903 0.23
904 0.26
905 0.27
906 0.22
907 0.19
908 0.17
909 0.17
910 0.2
911 0.17
912 0.16
913 0.17
914 0.17
915 0.16
916 0.16
917 0.15
918 0.15
919 0.18
920 0.18
921 0.19
922 0.3
923 0.38
924 0.45
925 0.47
926 0.49
927 0.5
928 0.5
929 0.55
930 0.45
931 0.41
932 0.34
933 0.33
934 0.3
935 0.25
936 0.22
937 0.13
938 0.12
939 0.07
940 0.06
941 0.04
942 0.03
943 0.03
944 0.03
945 0.04
946 0.03
947 0.04
948 0.07
949 0.07
950 0.07
951 0.08
952 0.08
953 0.09
954 0.09
955 0.09
956 0.07
957 0.08
958 0.1
959 0.14
960 0.23
961 0.25
962 0.36
963 0.45
964 0.51
965 0.54
966 0.6
967 0.66
968 0.66
969 0.69
970 0.66
971 0.68
972 0.66
973 0.64
974 0.57
975 0.48
976 0.38
977 0.32
978 0.27
979 0.2
980 0.15
981 0.14
982 0.15
983 0.16
984 0.2
985 0.27
986 0.33
987 0.33
988 0.39
989 0.43
990 0.51
991 0.53
992 0.54
993 0.52
994 0.46
995 0.45
996 0.43
997 0.41
998 0.31
999 0.31
1000 0.36
1001 0.38
1002 0.4
1003 0.43
1004 0.46
1005 0.47
1006 0.51
1007 0.52
1008 0.5
1009 0.5
1010 0.51
1011 0.53
1012 0.56
1013 0.63
1014 0.64
1015 0.62
1016 0.58
1017 0.54
1018 0.49
1019 0.42
1020 0.37
1021 0.29
1022 0.27
1023 0.28
1024 0.26
1025 0.22
1026 0.22
1027 0.22
1028 0.16
1029 0.14
1030 0.1
1031 0.07
1032 0.06
1033 0.06
1034 0.06
1035 0.06
1036 0.07
1037 0.07
1038 0.07
1039 0.07
1040 0.08
1041 0.09
1042 0.08
1043 0.1
1044 0.09
1045 0.09
1046 0.12
1047 0.12
1048 0.11
1049 0.11
1050 0.13
1051 0.13
1052 0.16
1053 0.16
1054 0.14
1055 0.15
1056 0.22
1057 0.27
1058 0.33
1059 0.4
1060 0.42
1061 0.49
1062 0.51
1063 0.57
1064 0.58
1065 0.63
1066 0.6
1067 0.53
1068 0.48
1069 0.41
1070 0.4
1071 0.31
1072 0.24
1073 0.16
1074 0.13
1075 0.11
1076 0.11
1077 0.11
1078 0.11
1079 0.11
1080 0.11
1081 0.1
1082 0.09
1083 0.1
1084 0.11
1085 0.09
1086 0.1
1087 0.11
1088 0.14
1089 0.13
1090 0.14
1091 0.15
1092 0.15
1093 0.17
1094 0.17
1095 0.16
1096 0.13
1097 0.14
1098 0.14
1099 0.13
1100 0.11
1101 0.1
1102 0.11
1103 0.12
1104 0.13
1105 0.15
1106 0.16
1107 0.17
1108 0.2
1109 0.21
1110 0.21
1111 0.24
1112 0.27
1113 0.25
1114 0.28
1115 0.29
1116 0.37
1117 0.37
1118 0.34
1119 0.34
1120 0.33
1121 0.4
1122 0.43
1123 0.48
1124 0.43
1125 0.47
1126 0.51
1127 0.48
1128 0.44
1129 0.37
1130 0.31
1131 0.22
1132 0.17
1133 0.12
1134 0.08
1135 0.08
1136 0.08
1137 0.07
1138 0.05
1139 0.06
1140 0.07
1141 0.07
1142 0.07
1143 0.06
1144 0.08
1145 0.09
1146 0.12
1147 0.14
1148 0.14
1149 0.15
1150 0.22
1151 0.22
1152 0.24
1153 0.32
1154 0.3
1155 0.33
1156 0.35
1157 0.36
1158 0.35
1159 0.39
1160 0.42
1161 0.41
1162 0.47
1163 0.49
1164 0.53
1165 0.54
1166 0.5
1167 0.47
1168 0.47
1169 0.47
1170 0.49
1171 0.48
1172 0.49
1173 0.5
1174 0.53
1175 0.58
1176 0.59
1177 0.59
1178 0.55
1179 0.59
1180 0.56
1181 0.59
1182 0.62
1183 0.6
1184 0.57
1185 0.56
1186 0.61
1187 0.59
1188 0.63
1189 0.59
1190 0.6
1191 0.64
1192 0.69
1193 0.71
1194 0.67
1195 0.68
1196 0.64
1197 0.66
1198 0.63
1199 0.63
1200 0.64
1201 0.58
1202 0.56
1203 0.54
1204 0.56
1205 0.54
1206 0.48
1207 0.41
1208 0.35
1209 0.38
1210 0.37
1211 0.32
1212 0.28
1213 0.29
1214 0.33
1215 0.35
1216 0.32
1217 0.28
1218 0.3
1219 0.32
1220 0.31
1221 0.34
1222 0.32
1223 0.32
1224 0.41
1225 0.4
1226 0.38
1227 0.41
1228 0.48
1229 0.44
1230 0.45
1231 0.47
1232 0.42
1233 0.43
1234 0.43
1235 0.44
1236 0.4
1237 0.41
1238 0.39
1239 0.42