Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IM98

Protein Details
Accession R0IM98    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-323NSRARLIWNRYRREKPQRPGEGKSTHydrophilic
328-353LTNERGVQKTWKKPRRDGPDHKGPNWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
312-318EKPQRPG
335-354QKTWKKPRRDGPDHKGPNWG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSSDNARMTRSRQRTAPPAEERTPPNQSNRNGADLRVATPERTSVDLIDPEGTAEAQSEPTQPDVAGDEPTGLSTTQRLQELRAWFQKVQEEQELHRLLEIKRRVEQGDTSALQEGQPSAPQPYTAPAEPNNKTPRPEKPTQFANRDRAEYNRWERECEATFRGSPKNFYSEATKIDFGIRYISNTLRTLWDAYSHDNQRKSDRWQPTWTEFKTVMLNALGPQEQRKLAAHQALKSIKQDWNQDPNDLLSKLDTLWTELGQSYPEEQRIMDFVGALLPTVQKDLLLLEPEQRSSITDVNSRARLIWNRYRREKPQRPGEGKSTHSRTLTNERGVQKTWKKPRRDGPDHKGPNWGNKAGNREKPSNENCFKCGKPGHIARGCRESNVSNSGAPDDNSEKGKGSKGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.69
3 0.73
4 0.71
5 0.7
6 0.68
7 0.69
8 0.66
9 0.63
10 0.64
11 0.58
12 0.59
13 0.59
14 0.58
15 0.61
16 0.59
17 0.6
18 0.52
19 0.48
20 0.47
21 0.4
22 0.39
23 0.36
24 0.34
25 0.27
26 0.27
27 0.29
28 0.23
29 0.24
30 0.23
31 0.18
32 0.21
33 0.21
34 0.22
35 0.2
36 0.18
37 0.16
38 0.15
39 0.13
40 0.09
41 0.09
42 0.08
43 0.09
44 0.1
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.12
58 0.12
59 0.09
60 0.09
61 0.09
62 0.13
63 0.15
64 0.19
65 0.19
66 0.21
67 0.27
68 0.32
69 0.38
70 0.4
71 0.42
72 0.39
73 0.42
74 0.46
75 0.43
76 0.42
77 0.4
78 0.36
79 0.33
80 0.41
81 0.4
82 0.33
83 0.32
84 0.31
85 0.26
86 0.32
87 0.36
88 0.31
89 0.33
90 0.37
91 0.37
92 0.35
93 0.36
94 0.31
95 0.32
96 0.3
97 0.26
98 0.24
99 0.23
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.1
104 0.11
105 0.1
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.14
111 0.17
112 0.17
113 0.18
114 0.22
115 0.3
116 0.31
117 0.39
118 0.43
119 0.42
120 0.44
121 0.46
122 0.5
123 0.5
124 0.57
125 0.54
126 0.52
127 0.59
128 0.64
129 0.68
130 0.65
131 0.65
132 0.6
133 0.58
134 0.53
135 0.47
136 0.43
137 0.43
138 0.44
139 0.44
140 0.42
141 0.42
142 0.42
143 0.43
144 0.41
145 0.37
146 0.31
147 0.25
148 0.26
149 0.27
150 0.31
151 0.27
152 0.28
153 0.26
154 0.27
155 0.26
156 0.25
157 0.27
158 0.23
159 0.26
160 0.25
161 0.24
162 0.2
163 0.21
164 0.2
165 0.15
166 0.16
167 0.13
168 0.12
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.16
174 0.13
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.15
179 0.14
180 0.16
181 0.22
182 0.26
183 0.29
184 0.31
185 0.32
186 0.34
187 0.36
188 0.38
189 0.4
190 0.43
191 0.43
192 0.45
193 0.48
194 0.49
195 0.54
196 0.49
197 0.44
198 0.36
199 0.33
200 0.3
201 0.25
202 0.21
203 0.13
204 0.13
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.14
215 0.16
216 0.23
217 0.24
218 0.23
219 0.3
220 0.31
221 0.32
222 0.3
223 0.31
224 0.28
225 0.3
226 0.35
227 0.34
228 0.41
229 0.4
230 0.4
231 0.37
232 0.34
233 0.33
234 0.26
235 0.21
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.11
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.13
257 0.1
258 0.08
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.1
273 0.1
274 0.15
275 0.16
276 0.16
277 0.17
278 0.16
279 0.15
280 0.17
281 0.19
282 0.17
283 0.2
284 0.24
285 0.28
286 0.3
287 0.29
288 0.27
289 0.29
290 0.33
291 0.36
292 0.42
293 0.46
294 0.54
295 0.62
296 0.69
297 0.74
298 0.79
299 0.82
300 0.81
301 0.83
302 0.85
303 0.83
304 0.81
305 0.79
306 0.73
307 0.68
308 0.68
309 0.63
310 0.57
311 0.52
312 0.48
313 0.46
314 0.49
315 0.52
316 0.48
317 0.49
318 0.48
319 0.5
320 0.51
321 0.55
322 0.54
323 0.58
324 0.63
325 0.65
326 0.69
327 0.74
328 0.82
329 0.83
330 0.85
331 0.85
332 0.84
333 0.86
334 0.86
335 0.78
336 0.78
337 0.7
338 0.69
339 0.65
340 0.6
341 0.54
342 0.5
343 0.59
344 0.58
345 0.64
346 0.6
347 0.59
348 0.59
349 0.63
350 0.66
351 0.67
352 0.66
353 0.61
354 0.58
355 0.59
356 0.55
357 0.54
358 0.52
359 0.47
360 0.48
361 0.52
362 0.6
363 0.61
364 0.65
365 0.63
366 0.67
367 0.63
368 0.55
369 0.51
370 0.44
371 0.42
372 0.42
373 0.38
374 0.31
375 0.31
376 0.32
377 0.3
378 0.27
379 0.27
380 0.25
381 0.26
382 0.28
383 0.28
384 0.27
385 0.28