Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D756

Protein Details
Accession B0D756    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-201QTYRKQMKERHKKYNTPVRQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_318813  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MDVAQDDERKPFDAETGNDEDAQPDPDEHLMLDQGNGKVWLVKIPKFLMERWASVNVEDAHLATLRVYTNNDPTTGRPRIILFLPPNINPNTPNAPLPYNPNRPLFQTTTYYPTTGAEPDCYELDMVHDNVENQIVVAERPKDPSLSVSTSAAAATVNSRARTTVLTGRIKHECNLRPAFSQTYRKQMKERHKKYNTPVRQIRMIEDAGVPGGRGGVNRLSSGVGVGAGAAFGDLIKVKPKQPKGTFERMARMPRNQLLDQIFSLFRETPHWGIRPLREKTQQPEAYLKEVLSEVAFLHRSGEHSGFFELKENYKDEGMKGENVPGPLPGDTKMEDEDDDDDEDEDMEEVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.35
4 0.33
5 0.33
6 0.32
7 0.29
8 0.24
9 0.24
10 0.19
11 0.13
12 0.14
13 0.14
14 0.14
15 0.13
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.12
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.16
26 0.16
27 0.21
28 0.22
29 0.25
30 0.29
31 0.3
32 0.36
33 0.36
34 0.36
35 0.38
36 0.37
37 0.36
38 0.34
39 0.37
40 0.32
41 0.3
42 0.34
43 0.26
44 0.24
45 0.22
46 0.18
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.09
51 0.1
52 0.09
53 0.11
54 0.14
55 0.15
56 0.22
57 0.23
58 0.25
59 0.24
60 0.27
61 0.34
62 0.34
63 0.32
64 0.27
65 0.27
66 0.28
67 0.28
68 0.32
69 0.26
70 0.3
71 0.33
72 0.32
73 0.35
74 0.34
75 0.33
76 0.27
77 0.29
78 0.27
79 0.26
80 0.26
81 0.24
82 0.25
83 0.25
84 0.32
85 0.36
86 0.39
87 0.42
88 0.45
89 0.43
90 0.45
91 0.49
92 0.44
93 0.38
94 0.34
95 0.32
96 0.33
97 0.33
98 0.3
99 0.24
100 0.22
101 0.2
102 0.18
103 0.16
104 0.13
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.13
109 0.12
110 0.09
111 0.1
112 0.11
113 0.1
114 0.09
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.1
119 0.08
120 0.05
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.08
125 0.09
126 0.1
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.16
132 0.18
133 0.18
134 0.19
135 0.17
136 0.16
137 0.16
138 0.15
139 0.13
140 0.08
141 0.06
142 0.05
143 0.09
144 0.1
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.15
151 0.16
152 0.22
153 0.26
154 0.28
155 0.31
156 0.34
157 0.35
158 0.34
159 0.36
160 0.32
161 0.34
162 0.36
163 0.34
164 0.31
165 0.33
166 0.34
167 0.31
168 0.37
169 0.32
170 0.39
171 0.42
172 0.43
173 0.46
174 0.5
175 0.57
176 0.59
177 0.65
178 0.66
179 0.7
180 0.74
181 0.78
182 0.81
183 0.77
184 0.76
185 0.74
186 0.66
187 0.65
188 0.59
189 0.52
190 0.44
191 0.37
192 0.28
193 0.22
194 0.18
195 0.12
196 0.11
197 0.09
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.04
202 0.06
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.08
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.02
218 0.02
219 0.02
220 0.02
221 0.03
222 0.04
223 0.08
224 0.1
225 0.16
226 0.24
227 0.31
228 0.41
229 0.46
230 0.56
231 0.6
232 0.68
233 0.69
234 0.65
235 0.65
236 0.61
237 0.64
238 0.59
239 0.55
240 0.51
241 0.48
242 0.5
243 0.44
244 0.44
245 0.38
246 0.36
247 0.32
248 0.29
249 0.25
250 0.2
251 0.22
252 0.17
253 0.14
254 0.16
255 0.19
256 0.2
257 0.25
258 0.26
259 0.28
260 0.32
261 0.4
262 0.45
263 0.46
264 0.5
265 0.53
266 0.57
267 0.58
268 0.64
269 0.6
270 0.54
271 0.57
272 0.52
273 0.48
274 0.44
275 0.38
276 0.29
277 0.25
278 0.22
279 0.15
280 0.12
281 0.09
282 0.12
283 0.13
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.15
288 0.19
289 0.2
290 0.17
291 0.18
292 0.21
293 0.2
294 0.2
295 0.23
296 0.22
297 0.24
298 0.26
299 0.27
300 0.27
301 0.29
302 0.3
303 0.25
304 0.3
305 0.29
306 0.3
307 0.28
308 0.31
309 0.31
310 0.31
311 0.3
312 0.24
313 0.23
314 0.21
315 0.21
316 0.17
317 0.17
318 0.18
319 0.19
320 0.2
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.2
325 0.19
326 0.19
327 0.17
328 0.16
329 0.14
330 0.14
331 0.12