Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D396

Protein Details
Accession B0D396    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
129-148EVHASPAKKRKRSQERSSSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-141AKKRKRS
258-266NARGKQKKK
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039577  Rad18  
IPR004580  Rad18_fungi  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0006301  P:postreplication repair  
GO:0006513  P:protein monoubiquitination  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_315822  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13923  zf-C3HC4_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MPFGVSASDDTKPANDFLLADVPDPTDFLPAAEAPGLRSIDGAFRCTICGELFDGPVTLPCGHCFCSGCIRPAMSHKQECPICRKVANEGHLRPNPIVEEIINGWKDARPYILSLVKQEARRKVADQPEVHASPAKKRKRSQERSSSELGSVPGLPHTPIKPRSFKKMSHSPSKPNPVKYPSDGGAGPSRIPTSDGDEEDLPSTLGLNPKSDDLVKCPLCEKRVRYKNLNGHMDRSCKDPVPVSSSSQWSKIMAPKGNARGKQKKKSSETDEDFPLPKASYATLKDKQLKEMLQEHDLPITGDRPQWEQRHQRWVMMYNANLDRSLANRKTKNELRRDVKKWEEEMSRKKKPVVEDLVKYQQTHKPEFDRLLKLAKSTRDKSALEPNAAPSSSDDNHKPVSTDASLVGPPSSMTGVDDVIDLNSDKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.14
4 0.16
5 0.21
6 0.2
7 0.19
8 0.19
9 0.19
10 0.18
11 0.18
12 0.16
13 0.11
14 0.11
15 0.1
16 0.12
17 0.11
18 0.12
19 0.14
20 0.13
21 0.12
22 0.17
23 0.18
24 0.15
25 0.15
26 0.15
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.18
31 0.18
32 0.19
33 0.19
34 0.2
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.14
39 0.15
40 0.14
41 0.14
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.13
46 0.12
47 0.14
48 0.16
49 0.18
50 0.21
51 0.22
52 0.21
53 0.3
54 0.33
55 0.34
56 0.35
57 0.33
58 0.33
59 0.39
60 0.46
61 0.44
62 0.47
63 0.46
64 0.52
65 0.55
66 0.57
67 0.56
68 0.53
69 0.49
70 0.45
71 0.45
72 0.45
73 0.48
74 0.51
75 0.52
76 0.51
77 0.56
78 0.56
79 0.57
80 0.49
81 0.43
82 0.37
83 0.29
84 0.25
85 0.16
86 0.15
87 0.14
88 0.2
89 0.18
90 0.17
91 0.17
92 0.17
93 0.18
94 0.16
95 0.16
96 0.12
97 0.14
98 0.19
99 0.23
100 0.23
101 0.24
102 0.3
103 0.32
104 0.36
105 0.41
106 0.42
107 0.41
108 0.43
109 0.43
110 0.45
111 0.48
112 0.51
113 0.46
114 0.43
115 0.45
116 0.44
117 0.42
118 0.38
119 0.31
120 0.32
121 0.41
122 0.45
123 0.46
124 0.52
125 0.62
126 0.7
127 0.79
128 0.8
129 0.81
130 0.79
131 0.76
132 0.74
133 0.65
134 0.54
135 0.45
136 0.35
137 0.25
138 0.19
139 0.14
140 0.11
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.12
145 0.19
146 0.25
147 0.3
148 0.38
149 0.41
150 0.5
151 0.53
152 0.55
153 0.56
154 0.61
155 0.61
156 0.63
157 0.65
158 0.63
159 0.66
160 0.72
161 0.69
162 0.64
163 0.64
164 0.58
165 0.57
166 0.52
167 0.48
168 0.38
169 0.35
170 0.3
171 0.26
172 0.25
173 0.21
174 0.19
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.14
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.17
186 0.16
187 0.16
188 0.1
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.2
202 0.19
203 0.19
204 0.22
205 0.23
206 0.25
207 0.3
208 0.32
209 0.35
210 0.43
211 0.48
212 0.52
213 0.58
214 0.63
215 0.67
216 0.7
217 0.6
218 0.56
219 0.54
220 0.52
221 0.44
222 0.4
223 0.33
224 0.25
225 0.24
226 0.22
227 0.21
228 0.23
229 0.24
230 0.23
231 0.24
232 0.27
233 0.28
234 0.27
235 0.26
236 0.21
237 0.22
238 0.24
239 0.27
240 0.26
241 0.28
242 0.32
243 0.4
244 0.45
245 0.47
246 0.51
247 0.55
248 0.62
249 0.69
250 0.71
251 0.72
252 0.72
253 0.76
254 0.75
255 0.75
256 0.71
257 0.65
258 0.61
259 0.54
260 0.49
261 0.41
262 0.34
263 0.24
264 0.19
265 0.15
266 0.13
267 0.15
268 0.18
269 0.25
270 0.27
271 0.34
272 0.41
273 0.42
274 0.44
275 0.44
276 0.42
277 0.39
278 0.42
279 0.38
280 0.34
281 0.34
282 0.31
283 0.27
284 0.26
285 0.21
286 0.15
287 0.13
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.16
292 0.23
293 0.28
294 0.36
295 0.45
296 0.49
297 0.58
298 0.58
299 0.56
300 0.53
301 0.52
302 0.5
303 0.45
304 0.4
305 0.36
306 0.37
307 0.34
308 0.31
309 0.27
310 0.21
311 0.19
312 0.28
313 0.27
314 0.33
315 0.38
316 0.41
317 0.5
318 0.57
319 0.64
320 0.65
321 0.69
322 0.7
323 0.75
324 0.77
325 0.76
326 0.76
327 0.74
328 0.66
329 0.64
330 0.63
331 0.63
332 0.68
333 0.69
334 0.7
335 0.67
336 0.68
337 0.65
338 0.61
339 0.62
340 0.61
341 0.6
342 0.56
343 0.6
344 0.64
345 0.62
346 0.58
347 0.53
348 0.47
349 0.46
350 0.46
351 0.45
352 0.41
353 0.45
354 0.52
355 0.54
356 0.55
357 0.52
358 0.54
359 0.49
360 0.47
361 0.47
362 0.48
363 0.5
364 0.48
365 0.53
366 0.52
367 0.53
368 0.53
369 0.58
370 0.56
371 0.51
372 0.49
373 0.46
374 0.44
375 0.42
376 0.38
377 0.3
378 0.31
379 0.28
380 0.32
381 0.3
382 0.3
383 0.34
384 0.34
385 0.32
386 0.27
387 0.31
388 0.27
389 0.26
390 0.23
391 0.22
392 0.22
393 0.21
394 0.2
395 0.14
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.09
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.11
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.1