FuNGI

R0KBC9

Protein Details

Accession

R0KBC9

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
213-232	MEPPKFKHKRIPRGPPSPPP	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
217-231	KFKHKRIPRGPPSPP

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 12, cyto 5.5, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MSVAALSKSLPKPKYSGQDEELTNSTRVLSSDQYEAQVARKQNGPPPYGSRQSWRPRAPDDFGDGGAFPEVHVAQYPLDMGKKGTPSTSNALVRRVDGEGKTKYDEIARRGHSDSRIVQASFKDLIPLRQQADAGQLDLSRPSQEVVQATKEKTEQALMALVAGQTAAQRPKNVQGRKDDEPTFVRYTPTAQMGEAQGKTRIFKIQQRQIDPMEPPKFKHKRIPRGPPSPPPPVLHSPPRKLTAEDQEMWKIPPPISNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDITINDKFAQFGEALQAADRHAREEVKQRAIMQQRLAEKEKLQKEEHLRNLAKQAREERANASQRRARSDSETDSEEEEVRKRMDARKERREDFQRELRQSRMGTERKIQMLAREQNRDISEKVALGLAKPTQSGESMYDARLFNQSSGFNAGFNEDNHYDKPLFAAQDAISSIYRPSVQQDDGEDDGQTYDRLTKTSKFEVLGKAKEGFKGADLQEARDGPVQFEKDTDDPFNINQMIDEVRGEKKGEKRYGIQEPEGRTAKRARVDDDSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.56
3	0.58
4	0.53
5	0.58
6	0.57
7	0.56
8	0.51
9	0.45
10	0.38
11	0.31
12	0.27
13	0.2
14	0.2
15	0.19
16	0.18
17	0.18
18	0.22
19	0.23
20	0.24
21	0.25
22	0.25
23	0.25
24	0.28
25	0.28
26	0.26
27	0.3
28	0.33
29	0.37
30	0.44
31	0.44
32	0.43
33	0.48
34	0.53
35	0.54
36	0.53
37	0.54
38	0.56
39	0.63
40	0.68
41	0.67
42	0.65
43	0.65
44	0.69
45	0.67
46	0.61
47	0.58
48	0.5
49	0.43
50	0.38
51	0.32
52	0.25
53	0.21
54	0.17
55	0.1
56	0.11
57	0.1
58	0.09
59	0.1
60	0.1
61	0.1
62	0.1
63	0.11
64	0.1
65	0.12
66	0.12
67	0.13
68	0.17
69	0.2
70	0.21
71	0.23
72	0.23
73	0.26
74	0.31
75	0.37
76	0.39
77	0.38
78	0.42
79	0.39
80	0.38
81	0.36
82	0.33
83	0.29
84	0.25
85	0.3
86	0.29
87	0.31
88	0.33
89	0.31
90	0.29
91	0.32
92	0.35
93	0.32
94	0.37
95	0.37
96	0.39
97	0.41
98	0.45
99	0.4
100	0.41
101	0.39
102	0.37
103	0.38
104	0.34
105	0.33
106	0.29
107	0.31
108	0.27
109	0.24
110	0.23
111	0.2
112	0.24
113	0.27
114	0.3
115	0.28
116	0.28
117	0.28
118	0.24
119	0.29
120	0.25
121	0.2
122	0.17
123	0.15
124	0.14
125	0.15
126	0.15
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.12
132	0.15
133	0.16
134	0.22
135	0.25
136	0.25
137	0.27
138	0.27
139	0.26
140	0.24
141	0.23
142	0.16
143	0.13
144	0.14
145	0.11
146	0.1
147	0.1
148	0.09
149	0.07
150	0.06
151	0.05
152	0.04
153	0.08
154	0.12
155	0.13
156	0.15
157	0.17
158	0.25
159	0.34
160	0.39
161	0.41
162	0.46
163	0.51
164	0.55
165	0.6
166	0.53
167	0.48
168	0.46
169	0.46
170	0.41
171	0.36
172	0.31
173	0.25
174	0.26
175	0.24
176	0.25
177	0.2
178	0.16
179	0.17
180	0.18
181	0.22
182	0.2
183	0.18
184	0.18
185	0.19
186	0.19
187	0.19
188	0.21
189	0.21
190	0.27
191	0.35
192	0.4
193	0.46
194	0.49
195	0.52
196	0.5
197	0.49
198	0.45
199	0.44
200	0.43
201	0.38
202	0.36
203	0.43
204	0.47
205	0.46
206	0.54
207	0.55
208	0.59
209	0.67
210	0.77
211	0.75
212	0.79
213	0.81
214	0.8
215	0.76
216	0.72
217	0.65
218	0.56
219	0.52
220	0.48
221	0.47
222	0.48
223	0.49
224	0.47
225	0.48
226	0.5
227	0.45
228	0.42
229	0.42
230	0.41
231	0.39
232	0.36
233	0.34
234	0.32
235	0.32
236	0.3
237	0.28
238	0.21
239	0.16
240	0.18
241	0.19
242	0.27
243	0.3
244	0.38
245	0.42
246	0.47
247	0.52
248	0.49
249	0.49
250	0.42
251	0.41
252	0.37
253	0.4
254	0.37
255	0.37
256	0.39
257	0.35
258	0.32
259	0.32
260	0.28
261	0.19
262	0.17
263	0.14
264	0.14
265	0.14
266	0.13
267	0.11
268	0.12
269	0.12
270	0.15
271	0.13
272	0.12
273	0.12
274	0.12
275	0.13
276	0.11
277	0.12
278	0.06
279	0.06
280	0.07
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.08
285	0.07
286	0.1
287	0.1
288	0.09
289	0.1
290	0.1
291	0.13
292	0.22
293	0.27
294	0.28
295	0.3
296	0.3
297	0.36
298	0.4
299	0.41
300	0.34
301	0.33
302	0.33
303	0.36
304	0.38
305	0.33
306	0.3
307	0.36
308	0.39
309	0.39
310	0.36
311	0.38
312	0.42
313	0.49
314	0.51
315	0.52
316	0.47
317	0.44
318	0.52
319	0.5
320	0.44
321	0.4
322	0.4
323	0.36
324	0.38
325	0.38
326	0.33
327	0.37
328	0.44
329	0.42
330	0.43
331	0.41
332	0.41
333	0.46
334	0.45
335	0.39
336	0.36
337	0.39
338	0.37
339	0.37
340	0.37
341	0.31
342	0.29
343	0.28
344	0.23
345	0.2
346	0.17
347	0.17
348	0.15
349	0.15
350	0.18
351	0.23
352	0.32
353	0.41
354	0.49
355	0.58
356	0.65
357	0.66
358	0.72
359	0.74
360	0.7
361	0.67
362	0.68
363	0.66
364	0.64
365	0.65
366	0.58
367	0.55
368	0.49
369	0.46
370	0.45
371	0.41
372	0.37
373	0.41
374	0.43
375	0.4
376	0.42
377	0.38
378	0.34
379	0.39
380	0.44
381	0.44
382	0.44
383	0.43
384	0.45
385	0.46
386	0.44
387	0.35
388	0.29
389	0.24
390	0.19
391	0.19
392	0.16
393	0.14
394	0.12
395	0.14
396	0.13
397	0.12
398	0.12
399	0.13
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.13
404	0.16
405	0.17
406	0.17
407	0.21
408	0.2
409	0.21
410	0.23
411	0.22
412	0.18
413	0.19
414	0.19
415	0.16
416	0.21
417	0.2
418	0.16
419	0.16
420	0.17
421	0.16
422	0.16
423	0.2
424	0.17
425	0.2
426	0.2
427	0.23
428	0.22
429	0.2
430	0.22
431	0.19
432	0.19
433	0.16
434	0.19
435	0.15
436	0.17
437	0.17
438	0.17
439	0.14
440	0.13
441	0.13
442	0.12
443	0.13
444	0.11
445	0.15
446	0.17
447	0.18
448	0.2
449	0.22
450	0.25
451	0.27
452	0.27
453	0.23
454	0.18
455	0.18
456	0.17
457	0.14
458	0.1
459	0.12
460	0.12
461	0.14
462	0.17
463	0.22
464	0.28
465	0.34
466	0.37
467	0.34
468	0.39
469	0.47
470	0.51
471	0.49
472	0.46
473	0.45
474	0.43
475	0.42
476	0.4
477	0.31
478	0.25
479	0.28
480	0.25
481	0.29
482	0.28
483	0.28
484	0.31
485	0.31
486	0.32
487	0.3
488	0.3
489	0.24
490	0.3
491	0.3
492	0.25
493	0.25
494	0.28
495	0.25
496	0.29
497	0.29
498	0.25
499	0.25
500	0.25
501	0.3
502	0.26
503	0.23
504	0.2
505	0.19
506	0.18
507	0.17
508	0.17
509	0.15
510	0.16
511	0.19
512	0.21
513	0.25
514	0.32
515	0.41
516	0.47
517	0.5
518	0.54
519	0.6
520	0.68
521	0.68
522	0.68
523	0.64
524	0.62
525	0.65
526	0.64
527	0.57
528	0.51
529	0.52
530	0.51
531	0.53
532	0.52
533	0.48

R0KBC9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer