FuNGI

R0JK48

Protein Details

Accession

R0JK48

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
498-522	FMNQEKKRAERAKTRAKKKMGVANG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
503-517	KKRAERAKTRAKKKM

Subcellular Location(s)

extr 11, cyto 8, cyto_mito 6.833, cyto_nucl 5.833, mito 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf IPR045227 WDR18/Ipi3/RID3
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0097344 C:Rix1 complex GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION

Amino Acid Sequences

MLTEHFVAAISASTKPNTGILKDAGIFVHEFQPLAAQRHVFKKSTAAPNGIAVSATHVFAAQAEKAVVHVYSREKGNQEALVPFPERIHSIALAAQDSVLLLGTESGRILAWEVCSGRLVSTSTSHLQPVTCIAVDPSSTFFLSGSSDAMIHVWALPSILSFSPDASRSPVHTLSTHRGPISAIACGHSSSSANIAVSISGDKSAIVWDYQNGQALRTYLLPEVPTAVTLDPADRAFFVAYADGSLQTIDFYDEVQKSTPVNVLRDSALSHRPIQPSPKTRFGADSQKLGAALSLSLSWDGTTLISGHASGKVATWDVAKSNYLSTPANLPGPVSNLQFLPPTGFPHAPEPTFTIQAIVKPKQDAGLASSGNGLVPPHYTLNMQLTGRLRSPHVSATEKRSVGTSAFEEAFAHPSFPADMLEESLAELSSWIPQTKGGAAPAADFMALDADGADSSGPTSNAQQAEVKELKKQLASLQRIQKITFSQLSELREENNYFMNQEKKRAERAKTRAKKKMGVANGSSRSHEAGDVEMNDYTDVTSDSDLDDARANGKP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.16
3	0.21
4	0.23
5	0.23
6	0.25
7	0.24
8	0.27
9	0.27
10	0.28
11	0.22
12	0.21
13	0.2
14	0.17
15	0.2
16	0.17
17	0.16
18	0.14
19	0.21
20	0.23
21	0.27
22	0.28
23	0.26
24	0.3
25	0.39
26	0.44
27	0.39
28	0.36
29	0.39
30	0.46
31	0.53
32	0.53
33	0.49
34	0.45
35	0.47
36	0.47
37	0.39
38	0.31
39	0.21
40	0.21
41	0.18
42	0.17
43	0.13
44	0.11
45	0.11
46	0.12
47	0.15
48	0.1
49	0.1
50	0.1
51	0.1
52	0.11
53	0.12
54	0.11
55	0.09
56	0.13
57	0.16
58	0.2
59	0.23
60	0.27
61	0.28
62	0.31
63	0.34
64	0.32
65	0.3
66	0.28
67	0.27
68	0.27
69	0.26
70	0.24
71	0.21
72	0.2
73	0.19
74	0.18
75	0.19
76	0.15
77	0.14
78	0.16
79	0.16
80	0.15
81	0.14
82	0.12
83	0.1
84	0.09
85	0.08
86	0.06
87	0.04
88	0.03
89	0.05
90	0.05
91	0.06
92	0.06
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.11
100	0.12
101	0.12
102	0.14
103	0.14
104	0.13
105	0.13
106	0.13
107	0.11
108	0.13
109	0.16
110	0.18
111	0.19
112	0.2
113	0.19
114	0.18
115	0.17
116	0.18
117	0.16
118	0.13
119	0.12
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.12
124	0.12
125	0.12
126	0.11
127	0.11
128	0.11
129	0.1
130	0.11
131	0.11
132	0.09
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.08
137	0.08
138	0.06
139	0.06
140	0.05
141	0.05
142	0.05
143	0.05
144	0.05
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.09
150	0.11
151	0.12
152	0.13
153	0.13
154	0.15
155	0.16
156	0.2
157	0.21
158	0.21
159	0.22
160	0.26
161	0.3
162	0.34
163	0.34
164	0.29
165	0.28
166	0.26
167	0.28
168	0.24
169	0.2
170	0.15
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.14
175	0.11
176	0.1
177	0.08
178	0.1
179	0.09
180	0.09
181	0.09
182	0.09
183	0.08
184	0.08
185	0.08
186	0.06
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.06
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.07
196	0.09
197	0.1
198	0.15
199	0.14
200	0.14
201	0.15
202	0.15
203	0.15
204	0.13
205	0.14
206	0.1
207	0.11
208	0.11
209	0.1
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.08
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.07
222	0.07
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.05
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.04
239	0.08
240	0.09
241	0.1
242	0.1
243	0.11
244	0.11
245	0.12
246	0.15
247	0.13
248	0.14
249	0.14
250	0.15
251	0.15
252	0.15
253	0.15
254	0.14
255	0.15
256	0.16
257	0.18
258	0.21
259	0.23
260	0.24
261	0.29
262	0.34
263	0.38
264	0.42
265	0.47
266	0.44
267	0.42
268	0.44
269	0.41
270	0.44
271	0.38
272	0.35
273	0.28
274	0.27
275	0.26
276	0.23
277	0.19
278	0.09
279	0.07
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.06
296	0.06
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.08
303	0.07
304	0.08
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.1
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.13
314	0.14
315	0.14
316	0.13
317	0.13
318	0.11
319	0.14
320	0.16
321	0.13
322	0.13
323	0.12
324	0.13
325	0.13
326	0.13
327	0.12
328	0.11
329	0.13
330	0.16
331	0.16
332	0.16
333	0.21
334	0.23
335	0.2
336	0.21
337	0.22
338	0.21
339	0.22
340	0.2
341	0.17
342	0.15
343	0.19
344	0.24
345	0.23
346	0.23
347	0.22
348	0.23
349	0.22
350	0.23
351	0.19
352	0.16
353	0.17
354	0.15
355	0.15
356	0.15
357	0.13
358	0.12
359	0.12
360	0.09
361	0.05
362	0.06
363	0.08
364	0.08
365	0.09
366	0.09
367	0.11
368	0.14
369	0.18
370	0.17
371	0.19
372	0.2
373	0.22
374	0.24
375	0.24
376	0.22
377	0.2
378	0.22
379	0.22
380	0.25
381	0.28
382	0.3
383	0.36
384	0.42
385	0.4
386	0.38
387	0.35
388	0.32
389	0.26
390	0.26
391	0.19
392	0.16
393	0.16
394	0.16
395	0.16
396	0.15
397	0.18
398	0.15
399	0.15
400	0.11
401	0.11
402	0.11
403	0.11
404	0.1
405	0.08
406	0.08
407	0.09
408	0.1
409	0.09
410	0.09
411	0.08
412	0.08
413	0.06
414	0.06
415	0.05
416	0.07
417	0.09
418	0.09
419	0.09
420	0.1
421	0.12
422	0.14
423	0.16
424	0.14
425	0.14
426	0.14
427	0.15
428	0.15
429	0.14
430	0.11
431	0.09
432	0.08
433	0.07
434	0.06
435	0.05
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.03
442	0.05
443	0.06
444	0.07
445	0.08
446	0.1
447	0.15
448	0.16
449	0.18
450	0.21
451	0.2
452	0.27
453	0.32
454	0.31
455	0.31
456	0.33
457	0.34
458	0.32
459	0.32
460	0.32
461	0.37
462	0.42
463	0.46
464	0.52
465	0.55
466	0.56
467	0.56
468	0.52
469	0.45
470	0.45
471	0.41
472	0.34
473	0.32
474	0.34
475	0.37
476	0.36
477	0.34
478	0.3
479	0.3
480	0.29
481	0.26
482	0.26
483	0.24
484	0.22
485	0.26
486	0.32
487	0.31
488	0.38
489	0.44
490	0.44
491	0.54
492	0.61
493	0.65
494	0.66
495	0.74
496	0.77
497	0.8
498	0.85
499	0.85
500	0.84
501	0.83
502	0.81
503	0.8
504	0.78
505	0.75
506	0.71
507	0.71
508	0.71
509	0.65
510	0.59
511	0.51
512	0.44
513	0.37
514	0.32
515	0.23
516	0.19
517	0.21
518	0.2
519	0.2
520	0.19
521	0.18
522	0.17
523	0.16
524	0.14
525	0.1
526	0.1
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.11
532	0.11
533	0.12
534	0.14
535	0.13

R0JK48

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer