Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0JYP1

Protein Details
Accession R0JYP1    Localization Confidence High Confidence Score 16.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-152AGEGEEPKKKKKRADKPRRKKNKDGEEDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-170HKRKRTAGEGEEPKKKKKRADKPRRKKNKDGEEDGDIAEGGERRSKRSKKAGRV
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MEDVEFTKSHSQSPLPEAGNDPADPLRPEIDEENTTPNPPIGDPDQDMEVTEDRPGEMPDQDDVEAGLSDNESVLSEALNDDQMDEQFGDFDINNVAIDERPAQIIDEDNVKQIGVHKRKRTAGEGEEPKKKKKRADKPRRKKNKDGEEDGDIAEGGERRSKRSKKAGRVRDVSPEGDPDENLTPEERRKKALNAQIDSIVKGSSNRRRKKDGIDLEQMADQEIEEMRRRMAQAAEADNEGRKRNEPARHKLKLLPEVTALLNKNNLRDTIVDPEVNLLESVRFFLEPLSDGSLPAYDIQKDLFASLAKLPVNKDTLVASGIGKVIMFYIKSKKPELSIKRQAERLFTDWTRPILRRTDDYRKKEFAQADYDPSQMNSGDRTVNSQQAAIAASRQKALEAPRAFQRARMESGPTTYTIAPKSNVVFNENARSRSTNVDIMKQIKGGRGGGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.36
3 0.37
4 0.38
5 0.37
6 0.38
7 0.33
8 0.29
9 0.23
10 0.24
11 0.24
12 0.22
13 0.21
14 0.18
15 0.22
16 0.22
17 0.25
18 0.25
19 0.26
20 0.31
21 0.3
22 0.31
23 0.29
24 0.27
25 0.23
26 0.2
27 0.23
28 0.19
29 0.23
30 0.23
31 0.24
32 0.25
33 0.24
34 0.24
35 0.22
36 0.2
37 0.16
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.14
42 0.14
43 0.14
44 0.14
45 0.15
46 0.15
47 0.17
48 0.16
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.11
53 0.1
54 0.08
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.05
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.06
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.08
84 0.06
85 0.08
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.15
95 0.15
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.14
100 0.2
101 0.29
102 0.34
103 0.41
104 0.47
105 0.54
106 0.6
107 0.64
108 0.62
109 0.59
110 0.56
111 0.58
112 0.61
113 0.61
114 0.65
115 0.64
116 0.68
117 0.69
118 0.69
119 0.67
120 0.68
121 0.72
122 0.74
123 0.82
124 0.85
125 0.88
126 0.93
127 0.96
128 0.94
129 0.93
130 0.92
131 0.92
132 0.89
133 0.85
134 0.78
135 0.71
136 0.64
137 0.53
138 0.43
139 0.31
140 0.22
141 0.15
142 0.12
143 0.08
144 0.11
145 0.12
146 0.16
147 0.26
148 0.31
149 0.38
150 0.48
151 0.57
152 0.63
153 0.73
154 0.79
155 0.79
156 0.78
157 0.73
158 0.71
159 0.64
160 0.55
161 0.45
162 0.37
163 0.29
164 0.25
165 0.22
166 0.16
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.18
173 0.26
174 0.25
175 0.27
176 0.29
177 0.33
178 0.4
179 0.45
180 0.47
181 0.41
182 0.41
183 0.43
184 0.41
185 0.36
186 0.29
187 0.22
188 0.14
189 0.14
190 0.2
191 0.24
192 0.34
193 0.41
194 0.46
195 0.53
196 0.57
197 0.61
198 0.65
199 0.64
200 0.61
201 0.6
202 0.56
203 0.5
204 0.47
205 0.4
206 0.29
207 0.2
208 0.13
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.11
219 0.12
220 0.14
221 0.16
222 0.17
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.16
231 0.23
232 0.31
233 0.38
234 0.46
235 0.54
236 0.56
237 0.58
238 0.58
239 0.57
240 0.57
241 0.49
242 0.4
243 0.32
244 0.3
245 0.28
246 0.27
247 0.22
248 0.15
249 0.19
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.18
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.19
258 0.2
259 0.19
260 0.17
261 0.18
262 0.17
263 0.15
264 0.13
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.09
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.07
292 0.09
293 0.09
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.15
298 0.18
299 0.2
300 0.18
301 0.18
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.11
307 0.1
308 0.1
309 0.09
310 0.08
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.09
316 0.17
317 0.21
318 0.25
319 0.28
320 0.29
321 0.33
322 0.43
323 0.49
324 0.52
325 0.58
326 0.63
327 0.65
328 0.68
329 0.65
330 0.6
331 0.56
332 0.48
333 0.45
334 0.38
335 0.38
336 0.36
337 0.38
338 0.38
339 0.35
340 0.36
341 0.36
342 0.39
343 0.4
344 0.46
345 0.53
346 0.58
347 0.64
348 0.67
349 0.65
350 0.64
351 0.65
352 0.62
353 0.54
354 0.52
355 0.47
356 0.46
357 0.43
358 0.41
359 0.34
360 0.3
361 0.27
362 0.2
363 0.19
364 0.14
365 0.14
366 0.16
367 0.15
368 0.22
369 0.23
370 0.27
371 0.27
372 0.26
373 0.24
374 0.22
375 0.23
376 0.17
377 0.19
378 0.18
379 0.19
380 0.2
381 0.2
382 0.19
383 0.21
384 0.26
385 0.3
386 0.29
387 0.31
388 0.37
389 0.44
390 0.44
391 0.45
392 0.48
393 0.43
394 0.46
395 0.45
396 0.43
397 0.38
398 0.42
399 0.39
400 0.32
401 0.3
402 0.27
403 0.28
404 0.26
405 0.28
406 0.25
407 0.27
408 0.29
409 0.31
410 0.31
411 0.3
412 0.31
413 0.31
414 0.4
415 0.41
416 0.4
417 0.39
418 0.4
419 0.38
420 0.41
421 0.42
422 0.39
423 0.37
424 0.42
425 0.45
426 0.46
427 0.46
428 0.43
429 0.41
430 0.38
431 0.39
432 0.37