FuNGI

R0IKT1

Protein Details

Accession

R0IKT1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
264-284	AAPPAQRKNKKAKSSGRDRED	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
263-289	KAAPPAQRKNKKAKSSGRDREDQGRRR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001656 PsdUridine_synth_TruD IPR011760 PsdUridine_synth_TruD_insert IPR042214 TruD_catalytic
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis
Pfam	View protein in Pfam PF01142 TruD
PROSITE	View protein in PROSITE PS50984 TRUD
CDD	cd02576 PseudoU_synth_ScPUS7

Amino Acid Sequences

MSNPPEDAARPAKRARLDDDSAPAFSPSTSTGTPAAAEKPISTATAAIDADLEREVRAGITEYVCPDNLGFTGVLKQRYTDFLVNEIGLDGRVLHLTSTEVETKKNQKPVESVNATRILEEANSVETSAKDDKADAVMQDGGVDEVTLPVPAPVPAEAKETEINGEEILCQVKATKQEPGEALADADRETLHSIFGRETTDAIVKLVQQIRKSESKKAKDFKAVISPPITDKEMRTQAHQSLRRMFPNLLESAMENDQTIRIKAAPPAQRKNKKAKSSGRDREDQGRRRGGLDWEELGGEYLHFNLYKENKDTMEVVGFLGSKLNCGARGFGFAGTKDRRACTVQRVCVKRQTAQRIQSFNKVLFNAAVGDFEHSHHELKLGDLVGNEFTITLRDCHFQSEQSLDFEQRLKLANDVVGKAITDFSERGFINYYGLQRFGSFAASTDAIGRKMLQDDLKGAVEDLLAYSDVALAAADGTSTDPSIQVSQDDRNRAKALHIWKTKGSGSEALDLLPRKFTAERNIIQHLSSRNSKTGRHDRKTDWQGALMTIPRTLRLMYVHAYQSLVWNTVAGKRWATYGAQVVEGDLVLVHEHRDKETSSTTCAPADSTLDQDGETIINPLGSENAHASSAANFERARALSAEEAASGAYTIWDIVLPQPGFDVEYPRNTIGAFYESFMASETGGGLDPHNMRRSWREISLSGGYRKVLARPLQPVTYQVHGYERVDKQFVETDLQRLRHAAAAAAAAKDNNNNNNNNHTEDMGNDNNNNNDDDDDDDTQGVAEKKIAIVLSLQLASSQYATMALRELMKAGGVKAFKPEFMGGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.55
3	0.54
4	0.53
5	0.51
6	0.54
7	0.5
8	0.45
9	0.41
10	0.35
11	0.27
12	0.22
13	0.19
14	0.15
15	0.17
16	0.16
17	0.17
18	0.18
19	0.19
20	0.2
21	0.2
22	0.21
23	0.18
24	0.19
25	0.17
26	0.18
27	0.19
28	0.18
29	0.16
30	0.15
31	0.13
32	0.17
33	0.16
34	0.13
35	0.14
36	0.13
37	0.13
38	0.13
39	0.13
40	0.08
41	0.09
42	0.09
43	0.08
44	0.09
45	0.1
46	0.12
47	0.13
48	0.15
49	0.18
50	0.2
51	0.2
52	0.2
53	0.17
54	0.16
55	0.14
56	0.14
57	0.11
58	0.1
59	0.17
60	0.21
61	0.25
62	0.23
63	0.25
64	0.25
65	0.29
66	0.34
67	0.31
68	0.27
69	0.27
70	0.29
71	0.27
72	0.25
73	0.22
74	0.16
75	0.12
76	0.11
77	0.08
78	0.06
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.08
84	0.1
85	0.13
86	0.18
87	0.18
88	0.21
89	0.28
90	0.37
91	0.43
92	0.49
93	0.47
94	0.45
95	0.5
96	0.55
97	0.59
98	0.57
99	0.52
100	0.5
101	0.54
102	0.5
103	0.44
104	0.37
105	0.27
106	0.2
107	0.19
108	0.15
109	0.11
110	0.11
111	0.11
112	0.11
113	0.1
114	0.15
115	0.17
116	0.17
117	0.15
118	0.15
119	0.16
120	0.19
121	0.2
122	0.15
123	0.15
124	0.14
125	0.14
126	0.13
127	0.12
128	0.09
129	0.07
130	0.07
131	0.05
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.06
138	0.06
139	0.07
140	0.08
141	0.1
142	0.12
143	0.15
144	0.15
145	0.18
146	0.19
147	0.18
148	0.18
149	0.17
150	0.16
151	0.13
152	0.12
153	0.1
154	0.09
155	0.1
156	0.09
157	0.07
158	0.08
159	0.11
160	0.17
161	0.18
162	0.24
163	0.23
164	0.28
165	0.29
166	0.31
167	0.29
168	0.23
169	0.22
170	0.17
171	0.16
172	0.12
173	0.11
174	0.08
175	0.08
176	0.1
177	0.09
178	0.1
179	0.1
180	0.11
181	0.12
182	0.13
183	0.14
184	0.12
185	0.12
186	0.13
187	0.14
188	0.14
189	0.13
190	0.13
191	0.12
192	0.18
193	0.23
194	0.23
195	0.24
196	0.27
197	0.31
198	0.4
199	0.42
200	0.45
201	0.5
202	0.56
203	0.63
204	0.67
205	0.68
206	0.68
207	0.68
208	0.63
209	0.63
210	0.56
211	0.5
212	0.45
213	0.4
214	0.33
215	0.33
216	0.31
217	0.22
218	0.21
219	0.26
220	0.32
221	0.31
222	0.33
223	0.35
224	0.39
225	0.47
226	0.51
227	0.48
228	0.48
229	0.52
230	0.51
231	0.49
232	0.44
233	0.37
234	0.36
235	0.32
236	0.24
237	0.2
238	0.17
239	0.18
240	0.18
241	0.15
242	0.11
243	0.1
244	0.12
245	0.13
246	0.12
247	0.1
248	0.1
249	0.11
250	0.15
251	0.22
252	0.29
253	0.36
254	0.46
255	0.55
256	0.63
257	0.69
258	0.76
259	0.78
260	0.78
261	0.79
262	0.79
263	0.78
264	0.81
265	0.84
266	0.78
267	0.75
268	0.7
269	0.7
270	0.7
271	0.68
272	0.64
273	0.61
274	0.56
275	0.52
276	0.51
277	0.44
278	0.38
279	0.33
280	0.26
281	0.2
282	0.2
283	0.18
284	0.16
285	0.12
286	0.08
287	0.06
288	0.05
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.1
293	0.13
294	0.17
295	0.19
296	0.21
297	0.21
298	0.22
299	0.23
300	0.19
301	0.17
302	0.14
303	0.11
304	0.1
305	0.1
306	0.08
307	0.1
308	0.09
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.09
316	0.12
317	0.13
318	0.13
319	0.14
320	0.13
321	0.19
322	0.2
323	0.23
324	0.22
325	0.22
326	0.23
327	0.25
328	0.28
329	0.31
330	0.37
331	0.4
332	0.46
333	0.5
334	0.5
335	0.54
336	0.53
337	0.49
338	0.49
339	0.52
340	0.52
341	0.55
342	0.58
343	0.58
344	0.58
345	0.59
346	0.53
347	0.45
348	0.4
349	0.33
350	0.27
351	0.2
352	0.19
353	0.13
354	0.11
355	0.1
356	0.07
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.11
361	0.11
362	0.11
363	0.11
364	0.12
365	0.1
366	0.1
367	0.12
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.09
372	0.08
373	0.08
374	0.07
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.06
380	0.07
381	0.09
382	0.09
383	0.12
384	0.13
385	0.13
386	0.13
387	0.15
388	0.15
389	0.15
390	0.16
391	0.13
392	0.14
393	0.15
394	0.13
395	0.12
396	0.13
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.12
402	0.13
403	0.12
404	0.1
405	0.09
406	0.09
407	0.08
408	0.06
409	0.06
410	0.06
411	0.06
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.13
416	0.13
417	0.13
418	0.15
419	0.17
420	0.13
421	0.14
422	0.13
423	0.11
424	0.12
425	0.11
426	0.1
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.09
431	0.09
432	0.1
433	0.11
434	0.1
435	0.1
436	0.1
437	0.09
438	0.1
439	0.12
440	0.1
441	0.1
442	0.11
443	0.13
444	0.13
445	0.12
446	0.11
447	0.09
448	0.08
449	0.07
450	0.06
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.04
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.02
460	0.02
461	0.02
462	0.02
463	0.02
464	0.03
465	0.03
466	0.04
467	0.04
468	0.04
469	0.05
470	0.06
471	0.06
472	0.07
473	0.09
474	0.15
475	0.19
476	0.26
477	0.26
478	0.28
479	0.29
480	0.28
481	0.28
482	0.28
483	0.31
484	0.34
485	0.38
486	0.37
487	0.37
488	0.4
489	0.39
490	0.36
491	0.31
492	0.26
493	0.23
494	0.24
495	0.22
496	0.2
497	0.21
498	0.2
499	0.18
500	0.15
501	0.13
502	0.12
503	0.13
504	0.15
505	0.2
506	0.26
507	0.29
508	0.32
509	0.36
510	0.35
511	0.33
512	0.35
513	0.3
514	0.28
515	0.3
516	0.28
517	0.3
518	0.31
519	0.34
520	0.4
521	0.48
522	0.55
523	0.55
524	0.59
525	0.59
526	0.67
527	0.71
528	0.68
529	0.58
530	0.49
531	0.44
532	0.38
533	0.35
534	0.27
535	0.21
536	0.16
537	0.15
538	0.13
539	0.13
540	0.13
541	0.12
542	0.11
543	0.13
544	0.13
545	0.17
546	0.18
547	0.17
548	0.18
549	0.16
550	0.19
551	0.17
552	0.16
553	0.12
554	0.12
555	0.12
556	0.16
557	0.19
558	0.16
559	0.16
560	0.15
561	0.16
562	0.17
563	0.17
564	0.15
565	0.17
566	0.17
567	0.17
568	0.17
569	0.16
570	0.14
571	0.13
572	0.11
573	0.05
574	0.05
575	0.04
576	0.04
577	0.05
578	0.09
579	0.1
580	0.11
581	0.13
582	0.13
583	0.16
584	0.22
585	0.22
586	0.24
587	0.27
588	0.27
589	0.26
590	0.26
591	0.23
592	0.18
593	0.2
594	0.15
595	0.14
596	0.14
597	0.14
598	0.14
599	0.13
600	0.13
601	0.1
602	0.09
603	0.08
604	0.06
605	0.06
606	0.06
607	0.06
608	0.07
609	0.06
610	0.07
611	0.08
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.12
618	0.12
619	0.13
620	0.12
621	0.13
622	0.17
623	0.17
624	0.17
625	0.15
626	0.16
627	0.14
628	0.16
629	0.15
630	0.11
631	0.11
632	0.09
633	0.09
634	0.07
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.04
640	0.04
641	0.04
642	0.06
643	0.13
644	0.13
645	0.13
646	0.13
647	0.14
648	0.15
649	0.15
650	0.2
651	0.15
652	0.2
653	0.23
654	0.24
655	0.24
656	0.22
657	0.22
658	0.18
659	0.19
660	0.15
661	0.12
662	0.14
663	0.13
664	0.13
665	0.14
666	0.12
667	0.09
668	0.08
669	0.08
670	0.06
671	0.07
672	0.07
673	0.07
674	0.12
675	0.15
676	0.2
677	0.24
678	0.24
679	0.26
680	0.31
681	0.37
682	0.37
683	0.38
684	0.38
685	0.35
686	0.41
687	0.45
688	0.45
689	0.41
690	0.38
691	0.34
692	0.32
693	0.32
694	0.29
695	0.29
696	0.29
697	0.32
698	0.37
699	0.41
700	0.41
701	0.4
702	0.41
703	0.38
704	0.36
705	0.32
706	0.26
707	0.26
708	0.26
709	0.28
710	0.33
711	0.33
712	0.34
713	0.35
714	0.33
715	0.32
716	0.34
717	0.34
718	0.31
719	0.29
720	0.31
721	0.36
722	0.38
723	0.35
724	0.32
725	0.31
726	0.29
727	0.28
728	0.21
729	0.16
730	0.18
731	0.19
732	0.18
733	0.18
734	0.15
735	0.16
736	0.2
737	0.24
738	0.29
739	0.33
740	0.37
741	0.39
742	0.46
743	0.48
744	0.47
745	0.43
746	0.37
747	0.31
748	0.28
749	0.32
750	0.3
751	0.3
752	0.28
753	0.29
754	0.31
755	0.32
756	0.31
757	0.25
758	0.2
759	0.19
760	0.2
761	0.22
762	0.21
763	0.2
764	0.19
765	0.18
766	0.17
767	0.2
768	0.18
769	0.14
770	0.13
771	0.13
772	0.13
773	0.16
774	0.16
775	0.12
776	0.12
777	0.13
778	0.15
779	0.15
780	0.14
781	0.13
782	0.13
783	0.14
784	0.13
785	0.11
786	0.08
787	0.1
788	0.11
789	0.11
790	0.12
791	0.13
792	0.14
793	0.14
794	0.15
795	0.13
796	0.14
797	0.15
798	0.14
799	0.18
800	0.18
801	0.18
802	0.26
803	0.27
804	0.25
805	0.28

R0IKT1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer