Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0INN1

Protein Details
Accession R0INN1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-31KSDRGESKSKSRRKSSSSDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-25KRKRDASKSDRGESKSKSRRK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MSGAKRKRDASKSDRGESKSKSRRKSSSSDDGEDIQSEIVQLEAQILESRRHYNNIATLLQRAKQSDAENEGPILAAVALCRVFSRLLVTGDMVKSKGMSEAEGVIVSWLKERYRELCQVLLDDFLRSEHPPKQSVALTLLMRLAKEEAKSQKDYKLKHGILPRLVEVLLRLPLDDLNREEFAEKYLKQFDDIRYQTFQTIKNTLDEDLDITTRQLVAANSMSLLSTLGEVPKSKAEIQNFYIEVQGKSPIPSLQAYKEKAQGAWLATMRTGLSKEQRKSILTTFSYQIAPWFQQPEILSDFLTDSYNVGGATSLLALSGIYYLISEKNLDYPSFYVKLYSLLDEGLLHSKHRSRFFRLLDTFMSSSHLPATLVASFIKRLSRLALHGPPAGVVVVVPWVYNMFKRHPACTFMMHREIRDPALKNEVEQEGMDDPFDMEEMDPFLTNAIESSVWELEALQAHYHPNVATLAKIISEQFTKRAYNLEDFLDHSYTALLDVELDRDLKKEPEIEFEIPKRILTADEGLNPLGQLLTQVIEAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.78
2 0.74
3 0.73
4 0.7
5 0.72
6 0.72
7 0.73
8 0.74
9 0.76
10 0.8
11 0.79
12 0.81
13 0.79
14 0.79
15 0.78
16 0.73
17 0.66
18 0.6
19 0.54
20 0.46
21 0.37
22 0.27
23 0.19
24 0.14
25 0.11
26 0.08
27 0.07
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.07
32 0.11
33 0.12
34 0.15
35 0.19
36 0.24
37 0.25
38 0.29
39 0.31
40 0.31
41 0.35
42 0.38
43 0.38
44 0.34
45 0.37
46 0.37
47 0.38
48 0.37
49 0.33
50 0.31
51 0.32
52 0.33
53 0.33
54 0.36
55 0.36
56 0.34
57 0.32
58 0.29
59 0.24
60 0.21
61 0.16
62 0.09
63 0.06
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.08
71 0.09
72 0.12
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.17
77 0.2
78 0.21
79 0.22
80 0.19
81 0.16
82 0.15
83 0.14
84 0.17
85 0.13
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.13
91 0.13
92 0.1
93 0.1
94 0.09
95 0.11
96 0.12
97 0.11
98 0.14
99 0.17
100 0.21
101 0.27
102 0.33
103 0.33
104 0.34
105 0.34
106 0.34
107 0.31
108 0.3
109 0.23
110 0.17
111 0.15
112 0.12
113 0.13
114 0.13
115 0.17
116 0.2
117 0.23
118 0.25
119 0.26
120 0.29
121 0.29
122 0.29
123 0.28
124 0.27
125 0.23
126 0.22
127 0.24
128 0.2
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.14
133 0.14
134 0.2
135 0.25
136 0.29
137 0.34
138 0.36
139 0.42
140 0.46
141 0.48
142 0.49
143 0.53
144 0.49
145 0.5
146 0.55
147 0.53
148 0.52
149 0.51
150 0.43
151 0.34
152 0.33
153 0.27
154 0.2
155 0.16
156 0.14
157 0.12
158 0.11
159 0.1
160 0.11
161 0.13
162 0.14
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.15
167 0.16
168 0.14
169 0.16
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.21
174 0.21
175 0.22
176 0.27
177 0.27
178 0.33
179 0.34
180 0.34
181 0.31
182 0.32
183 0.32
184 0.31
185 0.32
186 0.26
187 0.27
188 0.25
189 0.25
190 0.25
191 0.23
192 0.2
193 0.16
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.09
198 0.08
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.08
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.06
211 0.07
212 0.04
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.07
218 0.08
219 0.09
220 0.11
221 0.13
222 0.16
223 0.18
224 0.22
225 0.23
226 0.26
227 0.26
228 0.24
229 0.24
230 0.22
231 0.19
232 0.16
233 0.16
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.13
241 0.16
242 0.22
243 0.24
244 0.25
245 0.29
246 0.28
247 0.26
248 0.26
249 0.23
250 0.18
251 0.19
252 0.18
253 0.13
254 0.12
255 0.13
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.09
260 0.15
261 0.22
262 0.24
263 0.28
264 0.3
265 0.31
266 0.33
267 0.34
268 0.33
269 0.27
270 0.28
271 0.25
272 0.25
273 0.24
274 0.21
275 0.19
276 0.14
277 0.13
278 0.12
279 0.13
280 0.11
281 0.14
282 0.14
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.12
288 0.13
289 0.11
290 0.11
291 0.08
292 0.06
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.04
311 0.04
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.1
316 0.11
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.16
321 0.17
322 0.17
323 0.13
324 0.12
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.11
329 0.09
330 0.1
331 0.09
332 0.1
333 0.12
334 0.11
335 0.11
336 0.13
337 0.18
338 0.23
339 0.31
340 0.35
341 0.38
342 0.46
343 0.49
344 0.57
345 0.54
346 0.52
347 0.45
348 0.45
349 0.38
350 0.29
351 0.29
352 0.19
353 0.17
354 0.14
355 0.13
356 0.09
357 0.09
358 0.11
359 0.08
360 0.09
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.11
365 0.13
366 0.11
367 0.12
368 0.14
369 0.15
370 0.17
371 0.23
372 0.26
373 0.27
374 0.28
375 0.27
376 0.25
377 0.23
378 0.2
379 0.13
380 0.08
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.1
389 0.14
390 0.16
391 0.25
392 0.27
393 0.31
394 0.32
395 0.36
396 0.36
397 0.39
398 0.41
399 0.39
400 0.46
401 0.44
402 0.42
403 0.41
404 0.41
405 0.37
406 0.38
407 0.35
408 0.28
409 0.35
410 0.34
411 0.31
412 0.33
413 0.31
414 0.25
415 0.22
416 0.22
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.11
421 0.1
422 0.09
423 0.09
424 0.07
425 0.05
426 0.06
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.06
435 0.07
436 0.06
437 0.06
438 0.1
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.1
443 0.1
444 0.13
445 0.14
446 0.11
447 0.12
448 0.14
449 0.14
450 0.15
451 0.13
452 0.12
453 0.13
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.13
460 0.12
461 0.12
462 0.16
463 0.17
464 0.2
465 0.24
466 0.25
467 0.25
468 0.3
469 0.31
470 0.32
471 0.33
472 0.32
473 0.29
474 0.3
475 0.33
476 0.28
477 0.24
478 0.19
479 0.17
480 0.14
481 0.13
482 0.11
483 0.07
484 0.07
485 0.08
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.14
492 0.15
493 0.17
494 0.21
495 0.21
496 0.28
497 0.34
498 0.36
499 0.41
500 0.43
501 0.47
502 0.42
503 0.41
504 0.35
505 0.29
506 0.27
507 0.23
508 0.25
509 0.22
510 0.25
511 0.27
512 0.26
513 0.26
514 0.24
515 0.2
516 0.15
517 0.11
518 0.08
519 0.07
520 0.07