Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IDN0

Protein Details
Accession R0IDN0    Localization Confidence High Confidence Score 22.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-62PTPTPRSSTRKQAGKRELESLETPTQTKRQRKAPKATPKKGSAKEPKGQHydrophilic
175-194SAAAKKGRGRPKKSVQKELAHydrophilic
451-494QNKVLPPKANRNTKNVREHWLKGRQADKKNKKAVGKPRFGKMERHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-60KRQRKAPKATPKKGSAKEPK
177-187AAKKGRGRPKK
332-353AKREREEKKAKKLAKQAAKEAK
408-420RRGKTEEERRREK
458-497KANRNTKNVREHWLKGRQADKKNKKAVGKPRFGKMERRQH
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR013268  U3_snoRNA_assoc  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030515  F:snoRNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08297  U3_snoRNA_assoc  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVTTRGGTETPGAPTPTPRSSTRKQAGKRELESLETPTQTKRQRKAPKATPKKGSAKEPKGQEGSADEPSQDSSNETSDTTAIAAPTSEAPQTPRQGGVPARRRSTRQSAAGGESADQSSNTEGKEDEEPSTAQNPGFYTPAQAPGSVYATPATHRQPEGSPTPKANAMKDHTPSAAAKKGRGRPKKSVQKELAEVVEEAGEEVPSSTYESEMAPIPSQDSIPPSAQPEKTHMRFGSEEPAPTQDTPVVNKQGSKLSEATKSAIEPSQVESEKDDEASDSDDEAPEVVTTAAASSKALAARTEAERAQKAQQAKEQAKRQAREEFLAAQQAAKREREEKKAKKLAKQAAKEAKANAAAAAEEEEGPTANEESDAEPPRMNLDTSNGLLPASLLETIDDQRPPTPPPERRGKTEEERRREKLNQHIKFLERTDKPTKDVKKGRLSVAVLAQQNKVLPPKANRNTKNVREHWLKGRQADKKNKKAVGKPRFGKMERRQHGNRGFLRDGDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.37
4 0.39
5 0.41
6 0.46
7 0.49
8 0.59
9 0.63
10 0.66
11 0.69
12 0.75
13 0.8
14 0.81
15 0.78
16 0.75
17 0.67
18 0.62
19 0.56
20 0.52
21 0.46
22 0.39
23 0.37
24 0.33
25 0.4
26 0.44
27 0.51
28 0.53
29 0.58
30 0.67
31 0.76
32 0.83
33 0.85
34 0.87
35 0.89
36 0.91
37 0.89
38 0.88
39 0.88
40 0.84
41 0.84
42 0.83
43 0.81
44 0.79
45 0.76
46 0.75
47 0.68
48 0.62
49 0.53
50 0.47
51 0.42
52 0.39
53 0.33
54 0.25
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.18
59 0.16
60 0.13
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.12
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.1
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.14
78 0.2
79 0.24
80 0.25
81 0.25
82 0.24
83 0.28
84 0.34
85 0.4
86 0.44
87 0.48
88 0.52
89 0.55
90 0.58
91 0.61
92 0.65
93 0.62
94 0.58
95 0.56
96 0.54
97 0.53
98 0.51
99 0.43
100 0.34
101 0.28
102 0.23
103 0.17
104 0.14
105 0.11
106 0.11
107 0.13
108 0.12
109 0.11
110 0.11
111 0.13
112 0.16
113 0.17
114 0.16
115 0.17
116 0.17
117 0.19
118 0.2
119 0.2
120 0.16
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.21
129 0.2
130 0.19
131 0.17
132 0.18
133 0.2
134 0.18
135 0.17
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.19
143 0.21
144 0.21
145 0.26
146 0.32
147 0.33
148 0.32
149 0.3
150 0.32
151 0.35
152 0.35
153 0.33
154 0.31
155 0.31
156 0.34
157 0.35
158 0.35
159 0.3
160 0.3
161 0.29
162 0.27
163 0.29
164 0.24
165 0.27
166 0.32
167 0.4
168 0.48
169 0.56
170 0.59
171 0.62
172 0.72
173 0.78
174 0.78
175 0.8
176 0.76
177 0.71
178 0.67
179 0.6
180 0.5
181 0.4
182 0.33
183 0.23
184 0.17
185 0.12
186 0.09
187 0.06
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.09
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.11
210 0.12
211 0.14
212 0.19
213 0.2
214 0.2
215 0.24
216 0.3
217 0.31
218 0.35
219 0.32
220 0.3
221 0.3
222 0.3
223 0.31
224 0.25
225 0.23
226 0.19
227 0.21
228 0.19
229 0.17
230 0.17
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.18
235 0.19
236 0.18
237 0.19
238 0.2
239 0.22
240 0.22
241 0.22
242 0.2
243 0.19
244 0.22
245 0.22
246 0.22
247 0.18
248 0.17
249 0.16
250 0.15
251 0.13
252 0.1
253 0.12
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.16
259 0.16
260 0.16
261 0.13
262 0.08
263 0.08
264 0.09
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.04
273 0.05
274 0.04
275 0.03
276 0.03
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.07
286 0.08
287 0.11
288 0.12
289 0.15
290 0.15
291 0.17
292 0.18
293 0.2
294 0.22
295 0.23
296 0.25
297 0.26
298 0.28
299 0.34
300 0.39
301 0.44
302 0.48
303 0.53
304 0.57
305 0.56
306 0.57
307 0.55
308 0.51
309 0.45
310 0.4
311 0.34
312 0.28
313 0.29
314 0.25
315 0.19
316 0.19
317 0.21
318 0.22
319 0.21
320 0.22
321 0.26
322 0.32
323 0.4
324 0.5
325 0.54
326 0.62
327 0.7
328 0.73
329 0.73
330 0.77
331 0.76
332 0.75
333 0.7
334 0.7
335 0.7
336 0.68
337 0.63
338 0.55
339 0.49
340 0.42
341 0.37
342 0.28
343 0.18
344 0.14
345 0.12
346 0.12
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.06
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.14
360 0.17
361 0.17
362 0.17
363 0.17
364 0.19
365 0.2
366 0.18
367 0.13
368 0.14
369 0.16
370 0.17
371 0.18
372 0.15
373 0.14
374 0.13
375 0.13
376 0.09
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.06
381 0.08
382 0.1
383 0.13
384 0.13
385 0.13
386 0.15
387 0.17
388 0.19
389 0.24
390 0.32
391 0.36
392 0.43
393 0.53
394 0.55
395 0.6
396 0.63
397 0.65
398 0.66
399 0.7
400 0.73
401 0.71
402 0.76
403 0.73
404 0.75
405 0.74
406 0.7
407 0.7
408 0.71
409 0.67
410 0.65
411 0.67
412 0.63
413 0.61
414 0.58
415 0.56
416 0.49
417 0.51
418 0.53
419 0.51
420 0.51
421 0.56
422 0.59
423 0.6
424 0.65
425 0.67
426 0.68
427 0.7
428 0.71
429 0.7
430 0.64
431 0.58
432 0.54
433 0.51
434 0.45
435 0.42
436 0.39
437 0.32
438 0.32
439 0.3
440 0.29
441 0.27
442 0.29
443 0.35
444 0.45
445 0.53
446 0.63
447 0.64
448 0.69
449 0.76
450 0.79
451 0.81
452 0.75
453 0.75
454 0.72
455 0.73
456 0.73
457 0.73
458 0.68
459 0.65
460 0.7
461 0.7
462 0.73
463 0.78
464 0.79
465 0.8
466 0.84
467 0.84
468 0.83
469 0.84
470 0.84
471 0.84
472 0.84
473 0.79
474 0.79
475 0.82
476 0.77
477 0.78
478 0.77
479 0.78
480 0.74
481 0.78
482 0.74
483 0.75
484 0.79
485 0.78
486 0.74
487 0.72
488 0.67