Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IYF5

Protein Details
Accession R0IYF5    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
924-950EVQSLLAAKKKRKRRKGAGQMQKDCANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
931-940AKKKRKRRKG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001610  PAC  
IPR000014  PAS  
IPR035965  PAS-like_dom_sf  
IPR013655  PAS_fold_3  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00320  GATA  
PF08447  PAS_3  
PF13426  PAS_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00344  GATA_ZN_FINGER_1  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS50112  PAS  
CDD cd00130  PAS  
cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MNGYPYPTRPYSQAGNGPMMMSMESDAINGFDMSEGQSLDSMVAQNDKENRRRSMPPYARGPPQMTLGSPDTRRLSMMNFGDPNGGDMDDFRFDMSSATMENLMHSANNSATPAFPRSTGDMHTDQLPATDLAINNQFQGQASPFAHMAAPGSAYASPMHQKNSLDLDMSSYQNGINMSLDMDDSLNMMPADMNMFPGNQFNSPMLGSPLNQDFAGPMPPAPQDTNSNSNNTPNPQSQDQFKRPSVNNTPEVKSGRAGFLSRTVSQDQSSMRSTPRSQSERHSSNSVPTRMTMASLHNQQPIAQDPTQDLPKEVLNKHYRNGNVPPWPTPAGGFPSTMHQNPHMKTQFKNAYSSTGFDMLGVLMRVASRPDPQIDIGSVDLSCAFVVCDAELDDIPIVYCSENFERLTGYTRHMILGRNCRFLQAPDGKVESGIKRNYVDDDSVYYLKNMIESRSEAQISLINYRRGGQPFMNLLTMIPIAWEPGGKTKFFIGFQVDLVEQPGAMTNKNSDGTYRVNYQRGMSIPSYVFSDHLKPPQSEQGQTISKDEVSNVLAAYSGGGDSEMTRRVWDKVLLENSDDVVHVLSLKGLFLYLSPASNRILEYDPSELVGTALSSVCHPSDIVPVTRELKETTNGASVNVVFRIRRKKSGYMWFEGHGSLHTEQGKGRKCIILVGRERPVYTLSKAIVRESGGVGDNELWTKMSTSGMFLFVSSNVRQLLDKQPEDLVGTSIQSLMRQESKVNFGRILEFARGGRKGEVKHEMINKRGQVLQAFTTIYPGDAVEGQKPTFVVGQTRLLKYSRNSTAGRPSMYTNNKHDRDTHHSIHSQFSGGVSPRPPSGAGNNGTSGNTGNSTPSTATTNPLFVTTEESPATFAGHNGLQIGHQDQSLASDDNVFDELKTTRSTSWQYELRQMEKRNRYLAEEVQSLLAAKKKRKRRKGAGQMQKDCANCHTRQTPEWRRGPSGNRDLCNSCGLRWAKQQGRVSPRTSSAASDKSKKSASPRHLQTGHQNHQSILPNSKSEAGQPVYSPSTSMATPSKRSPQHGSISESHAPKAARTETASAQGFIPPPAIDEVTEPDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.44
3 0.43
4 0.4
5 0.35
6 0.3
7 0.22
8 0.16
9 0.12
10 0.1
11 0.09
12 0.09
13 0.08
14 0.08
15 0.09
16 0.08
17 0.07
18 0.06
19 0.07
20 0.09
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.1
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.13
31 0.13
32 0.18
33 0.26
34 0.34
35 0.41
36 0.47
37 0.51
38 0.54
39 0.61
40 0.63
41 0.66
42 0.67
43 0.67
44 0.69
45 0.7
46 0.71
47 0.7
48 0.67
49 0.58
50 0.54
51 0.47
52 0.39
53 0.38
54 0.35
55 0.35
56 0.33
57 0.37
58 0.35
59 0.34
60 0.35
61 0.31
62 0.29
63 0.31
64 0.33
65 0.34
66 0.31
67 0.31
68 0.33
69 0.31
70 0.3
71 0.23
72 0.19
73 0.12
74 0.12
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.1
84 0.09
85 0.1
86 0.11
87 0.11
88 0.11
89 0.11
90 0.11
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.1
95 0.12
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.15
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.19
104 0.22
105 0.24
106 0.25
107 0.28
108 0.27
109 0.27
110 0.29
111 0.27
112 0.23
113 0.21
114 0.21
115 0.15
116 0.14
117 0.15
118 0.13
119 0.15
120 0.2
121 0.19
122 0.18
123 0.19
124 0.18
125 0.15
126 0.17
127 0.15
128 0.17
129 0.17
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.18
134 0.16
135 0.16
136 0.1
137 0.11
138 0.08
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.12
144 0.16
145 0.18
146 0.21
147 0.24
148 0.25
149 0.27
150 0.33
151 0.31
152 0.28
153 0.25
154 0.27
155 0.26
156 0.27
157 0.23
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.09
179 0.08
180 0.1
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.13
185 0.15
186 0.13
187 0.15
188 0.13
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.14
194 0.14
195 0.16
196 0.18
197 0.17
198 0.17
199 0.16
200 0.14
201 0.14
202 0.16
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.16
209 0.17
210 0.2
211 0.25
212 0.32
213 0.32
214 0.35
215 0.34
216 0.37
217 0.38
218 0.36
219 0.37
220 0.34
221 0.37
222 0.37
223 0.39
224 0.43
225 0.49
226 0.53
227 0.55
228 0.54
229 0.57
230 0.55
231 0.61
232 0.62
233 0.59
234 0.6
235 0.58
236 0.58
237 0.55
238 0.56
239 0.48
240 0.41
241 0.35
242 0.29
243 0.26
244 0.24
245 0.19
246 0.23
247 0.26
248 0.25
249 0.27
250 0.27
251 0.26
252 0.26
253 0.28
254 0.23
255 0.23
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.26
260 0.27
261 0.3
262 0.38
263 0.38
264 0.38
265 0.44
266 0.52
267 0.52
268 0.53
269 0.52
270 0.43
271 0.47
272 0.53
273 0.47
274 0.38
275 0.34
276 0.33
277 0.29
278 0.29
279 0.23
280 0.19
281 0.22
282 0.27
283 0.3
284 0.29
285 0.29
286 0.29
287 0.29
288 0.29
289 0.3
290 0.24
291 0.22
292 0.21
293 0.25
294 0.27
295 0.26
296 0.22
297 0.17
298 0.2
299 0.25
300 0.24
301 0.3
302 0.35
303 0.37
304 0.39
305 0.43
306 0.42
307 0.41
308 0.45
309 0.43
310 0.41
311 0.42
312 0.42
313 0.41
314 0.41
315 0.36
316 0.31
317 0.26
318 0.24
319 0.22
320 0.21
321 0.17
322 0.2
323 0.23
324 0.24
325 0.23
326 0.24
327 0.29
328 0.29
329 0.39
330 0.4
331 0.39
332 0.38
333 0.47
334 0.5
335 0.44
336 0.47
337 0.38
338 0.38
339 0.36
340 0.37
341 0.29
342 0.22
343 0.2
344 0.16
345 0.16
346 0.1
347 0.1
348 0.09
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.08
355 0.09
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.1
366 0.08
367 0.07
368 0.06
369 0.06
370 0.05
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.05
382 0.06
383 0.05
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.07
388 0.09
389 0.12
390 0.12
391 0.12
392 0.13
393 0.13
394 0.18
395 0.16
396 0.17
397 0.17
398 0.17
399 0.18
400 0.19
401 0.23
402 0.24
403 0.34
404 0.35
405 0.37
406 0.37
407 0.37
408 0.36
409 0.32
410 0.35
411 0.31
412 0.29
413 0.26
414 0.28
415 0.26
416 0.26
417 0.28
418 0.22
419 0.21
420 0.21
421 0.2
422 0.2
423 0.2
424 0.22
425 0.21
426 0.19
427 0.14
428 0.15
429 0.16
430 0.16
431 0.15
432 0.13
433 0.13
434 0.12
435 0.14
436 0.12
437 0.1
438 0.11
439 0.13
440 0.15
441 0.16
442 0.17
443 0.14
444 0.14
445 0.16
446 0.15
447 0.19
448 0.21
449 0.19
450 0.19
451 0.21
452 0.24
453 0.23
454 0.25
455 0.19
456 0.19
457 0.2
458 0.21
459 0.2
460 0.16
461 0.14
462 0.13
463 0.12
464 0.08
465 0.06
466 0.05
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.04
471 0.11
472 0.13
473 0.13
474 0.13
475 0.15
476 0.17
477 0.17
478 0.18
479 0.15
480 0.14
481 0.14
482 0.15
483 0.13
484 0.11
485 0.12
486 0.1
487 0.06
488 0.05
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.07
494 0.1
495 0.11
496 0.11
497 0.09
498 0.11
499 0.14
500 0.16
501 0.21
502 0.22
503 0.23
504 0.24
505 0.24
506 0.23
507 0.22
508 0.23
509 0.18
510 0.17
511 0.15
512 0.15
513 0.15
514 0.13
515 0.13
516 0.1
517 0.14
518 0.13
519 0.17
520 0.2
521 0.19
522 0.21
523 0.28
524 0.28
525 0.26
526 0.25
527 0.27
528 0.27
529 0.27
530 0.27
531 0.2
532 0.18
533 0.17
534 0.16
535 0.11
536 0.09
537 0.09
538 0.07
539 0.06
540 0.06
541 0.06
542 0.05
543 0.04
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.03
548 0.03
549 0.05
550 0.07
551 0.07
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.12
556 0.13
557 0.14
558 0.17
559 0.21
560 0.21
561 0.21
562 0.19
563 0.19
564 0.17
565 0.15
566 0.1
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.08
582 0.09
583 0.1
584 0.11
585 0.11
586 0.1
587 0.12
588 0.11
589 0.13
590 0.14
591 0.13
592 0.13
593 0.13
594 0.1
595 0.08
596 0.07
597 0.06
598 0.04
599 0.05
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.1
608 0.12
609 0.12
610 0.12
611 0.14
612 0.17
613 0.18
614 0.18
615 0.16
616 0.16
617 0.16
618 0.16
619 0.16
620 0.16
621 0.16
622 0.15
623 0.14
624 0.12
625 0.12
626 0.12
627 0.11
628 0.09
629 0.14
630 0.24
631 0.26
632 0.33
633 0.37
634 0.42
635 0.49
636 0.59
637 0.59
638 0.54
639 0.53
640 0.47
641 0.43
642 0.37
643 0.29
644 0.19
645 0.17
646 0.13
647 0.14
648 0.14
649 0.14
650 0.16
651 0.23
652 0.28
653 0.26
654 0.28
655 0.26
656 0.25
657 0.29
658 0.32
659 0.33
660 0.32
661 0.35
662 0.38
663 0.37
664 0.37
665 0.32
666 0.31
667 0.25
668 0.22
669 0.2
670 0.17
671 0.2
672 0.2
673 0.2
674 0.19
675 0.17
676 0.17
677 0.14
678 0.15
679 0.12
680 0.11
681 0.11
682 0.1
683 0.1
684 0.09
685 0.09
686 0.07
687 0.06
688 0.08
689 0.08
690 0.08
691 0.08
692 0.1
693 0.1
694 0.11
695 0.11
696 0.1
697 0.1
698 0.1
699 0.13
700 0.12
701 0.13
702 0.12
703 0.12
704 0.12
705 0.15
706 0.23
707 0.27
708 0.28
709 0.27
710 0.27
711 0.27
712 0.28
713 0.25
714 0.17
715 0.1
716 0.1
717 0.09
718 0.09
719 0.09
720 0.08
721 0.09
722 0.1
723 0.13
724 0.13
725 0.16
726 0.17
727 0.23
728 0.27
729 0.28
730 0.27
731 0.24
732 0.26
733 0.25
734 0.25
735 0.19
736 0.16
737 0.16
738 0.19
739 0.2
740 0.19
741 0.21
742 0.23
743 0.23
744 0.27
745 0.33
746 0.31
747 0.35
748 0.42
749 0.44
750 0.43
751 0.47
752 0.42
753 0.38
754 0.37
755 0.33
756 0.27
757 0.25
758 0.23
759 0.2
760 0.2
761 0.17
762 0.17
763 0.15
764 0.13
765 0.11
766 0.09
767 0.08
768 0.09
769 0.1
770 0.12
771 0.14
772 0.14
773 0.14
774 0.14
775 0.14
776 0.14
777 0.14
778 0.14
779 0.14
780 0.23
781 0.27
782 0.28
783 0.3
784 0.28
785 0.32
786 0.31
787 0.37
788 0.34
789 0.35
790 0.35
791 0.37
792 0.46
793 0.46
794 0.45
795 0.38
796 0.36
797 0.4
798 0.45
799 0.47
800 0.46
801 0.52
802 0.53
803 0.53
804 0.54
805 0.51
806 0.54
807 0.56
808 0.52
809 0.48
810 0.5
811 0.49
812 0.49
813 0.43
814 0.35
815 0.27
816 0.23
817 0.21
818 0.18
819 0.2
820 0.17
821 0.18
822 0.17
823 0.18
824 0.19
825 0.17
826 0.19
827 0.24
828 0.25
829 0.25
830 0.27
831 0.26
832 0.26
833 0.24
834 0.21
835 0.15
836 0.13
837 0.11
838 0.11
839 0.11
840 0.12
841 0.12
842 0.12
843 0.16
844 0.15
845 0.18
846 0.18
847 0.19
848 0.18
849 0.18
850 0.18
851 0.14
852 0.2
853 0.18
854 0.2
855 0.18
856 0.18
857 0.18
858 0.17
859 0.19
860 0.12
861 0.11
862 0.11
863 0.11
864 0.11
865 0.11
866 0.11
867 0.1
868 0.11
869 0.13
870 0.11
871 0.1
872 0.1
873 0.1
874 0.12
875 0.14
876 0.13
877 0.12
878 0.12
879 0.13
880 0.14
881 0.15
882 0.13
883 0.1
884 0.11
885 0.12
886 0.12
887 0.14
888 0.15
889 0.14
890 0.2
891 0.24
892 0.26
893 0.33
894 0.37
895 0.38
896 0.45
897 0.49
898 0.49
899 0.53
900 0.55
901 0.58
902 0.61
903 0.64
904 0.62
905 0.58
906 0.58
907 0.55
908 0.54
909 0.5
910 0.42
911 0.38
912 0.32
913 0.3
914 0.26
915 0.22
916 0.21
917 0.21
918 0.28
919 0.36
920 0.47
921 0.58
922 0.68
923 0.77
924 0.83
925 0.89
926 0.92
927 0.94
928 0.94
929 0.94
930 0.91
931 0.85
932 0.8
933 0.69
934 0.6
935 0.55
936 0.5
937 0.4
938 0.4
939 0.42
940 0.4
941 0.45
942 0.55
943 0.58
944 0.62
945 0.68
946 0.66
947 0.65
948 0.68
949 0.7
950 0.69
951 0.7
952 0.68
953 0.62
954 0.62
955 0.59
956 0.54
957 0.53
958 0.44
959 0.34
960 0.35
961 0.36
962 0.35
963 0.4
964 0.48
965 0.48
966 0.55
967 0.62
968 0.62
969 0.7
970 0.71
971 0.66
972 0.61
973 0.58
974 0.54
975 0.48
976 0.43
977 0.4
978 0.43
979 0.45
980 0.49
981 0.48
982 0.5
983 0.52
984 0.51
985 0.54
986 0.56
987 0.58
988 0.6
989 0.64
990 0.69
991 0.69
992 0.69
993 0.7
994 0.71
995 0.71
996 0.69
997 0.63
998 0.53
999 0.57
1000 0.6
1001 0.53
1002 0.5
1003 0.45
1004 0.39
1005 0.39
1006 0.42
1007 0.35
1008 0.3
1009 0.34
1010 0.3
1011 0.28
1012 0.27
1013 0.31
1014 0.3
1015 0.3
1016 0.28
1017 0.22
1018 0.21
1019 0.19
1020 0.22
1021 0.25
1022 0.27
1023 0.32
1024 0.37
1025 0.45
1026 0.48
1027 0.55
1028 0.59
1029 0.59
1030 0.63
1031 0.64
1032 0.64
1033 0.59
1034 0.61
1035 0.62
1036 0.56
1037 0.49
1038 0.44
1039 0.39
1040 0.33
1041 0.36
1042 0.32
1043 0.29
1044 0.31
1045 0.35
1046 0.33
1047 0.41
1048 0.41
1049 0.35
1050 0.32
1051 0.32
1052 0.29
1053 0.25
1054 0.24
1055 0.16
1056 0.16
1057 0.18
1058 0.18
1059 0.15
1060 0.16