Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0JN84

Protein Details
Accession R0JN84    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-45AFSIARQRPSGKKPNKPPGQKWARCFAKHydrophilic
430-453AAAANRAKRGRKRKSATLESKAPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-46QRPSGKKPNKPPGQKWARCFAKR
433-444ANRAKRGRKRKS
Subcellular Location(s) mito 24.5, cyto_mito 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004875  DDE_SF_endonuclease_dom  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03184  DDE_1  
Amino Acid Sequences MKSKLGHPVRIKFLPSIAFSIARQRPSGKKPNKPPGQKWARCFAKRHPEIKARTVKPIDWNLHEKYTYEKMEHWFKVIQEVLQDPAVVPENVYNMDETGVMLSMQNCVKVLVGKDDPRDYRGAGVKRTMVTAIECISADGRVLLPLIIWPALTHRSNWTTYPTPGWHYAHSENGYDNSKISLEWLMRVFDTQTRETANGKPRVLICDGFGSHETVEVLEFCLANNIILCRLPSHTSHKLQPCDVAVFAALKAAYRDQVDRLGRGGVDTIGKEHFTSLYSPARARAFTKRNITSAWAATGLFPFNPERVLRGIPKPAAHPAVQTTATPTTPVTPVNVEDVRSLFDRIKPRAETLDESSKHELLRDTHMMAKATRIAIAERSFLQDHNRFLSKINGEVKARRSTKLLVLGTAQVMKYEQLVEAQARRAATAAAAANRAKRGRKRKSATLESKAPDATAETAQASRVSGPWRAPVARMVAGDCQVILVEKSYRCLIDSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.42
3 0.38
4 0.32
5 0.3
6 0.28
7 0.36
8 0.37
9 0.35
10 0.35
11 0.38
12 0.44
13 0.52
14 0.62
15 0.62
16 0.67
17 0.75
18 0.84
19 0.88
20 0.9
21 0.87
22 0.88
23 0.89
24 0.86
25 0.8
26 0.8
27 0.8
28 0.76
29 0.74
30 0.73
31 0.73
32 0.74
33 0.74
34 0.73
35 0.72
36 0.72
37 0.77
38 0.77
39 0.68
40 0.69
41 0.68
42 0.62
43 0.62
44 0.64
45 0.6
46 0.56
47 0.59
48 0.53
49 0.54
50 0.5
51 0.42
52 0.39
53 0.41
54 0.38
55 0.34
56 0.34
57 0.35
58 0.44
59 0.44
60 0.42
61 0.37
62 0.34
63 0.4
64 0.37
65 0.31
66 0.25
67 0.25
68 0.23
69 0.21
70 0.21
71 0.13
72 0.14
73 0.16
74 0.13
75 0.12
76 0.11
77 0.13
78 0.14
79 0.14
80 0.12
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.1
94 0.1
95 0.11
96 0.13
97 0.14
98 0.17
99 0.21
100 0.25
101 0.29
102 0.35
103 0.36
104 0.36
105 0.36
106 0.31
107 0.31
108 0.34
109 0.35
110 0.32
111 0.33
112 0.34
113 0.33
114 0.33
115 0.28
116 0.22
117 0.18
118 0.17
119 0.15
120 0.12
121 0.12
122 0.11
123 0.11
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.05
137 0.08
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.18
142 0.21
143 0.23
144 0.24
145 0.28
146 0.26
147 0.27
148 0.3
149 0.27
150 0.28
151 0.32
152 0.32
153 0.28
154 0.3
155 0.3
156 0.31
157 0.31
158 0.28
159 0.23
160 0.24
161 0.25
162 0.2
163 0.19
164 0.14
165 0.13
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.1
170 0.12
171 0.13
172 0.13
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.17
178 0.15
179 0.16
180 0.16
181 0.18
182 0.2
183 0.25
184 0.31
185 0.33
186 0.32
187 0.34
188 0.33
189 0.35
190 0.35
191 0.29
192 0.21
193 0.18
194 0.18
195 0.17
196 0.17
197 0.15
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.08
202 0.08
203 0.06
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.08
218 0.1
219 0.12
220 0.2
221 0.26
222 0.28
223 0.35
224 0.4
225 0.41
226 0.4
227 0.39
228 0.32
229 0.27
230 0.23
231 0.17
232 0.11
233 0.09
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.05
238 0.05
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.17
248 0.16
249 0.15
250 0.14
251 0.13
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.09
263 0.11
264 0.15
265 0.16
266 0.16
267 0.19
268 0.2
269 0.2
270 0.22
271 0.27
272 0.29
273 0.34
274 0.42
275 0.41
276 0.41
277 0.41
278 0.41
279 0.35
280 0.3
281 0.24
282 0.17
283 0.15
284 0.14
285 0.14
286 0.11
287 0.08
288 0.09
289 0.09
290 0.08
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.13
295 0.16
296 0.18
297 0.21
298 0.26
299 0.26
300 0.28
301 0.28
302 0.3
303 0.3
304 0.26
305 0.24
306 0.21
307 0.22
308 0.22
309 0.2
310 0.19
311 0.18
312 0.17
313 0.17
314 0.15
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.12
319 0.11
320 0.12
321 0.17
322 0.18
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.17
327 0.17
328 0.18
329 0.14
330 0.19
331 0.25
332 0.27
333 0.33
334 0.32
335 0.33
336 0.36
337 0.37
338 0.36
339 0.35
340 0.41
341 0.37
342 0.4
343 0.41
344 0.38
345 0.35
346 0.33
347 0.3
348 0.22
349 0.28
350 0.26
351 0.24
352 0.27
353 0.3
354 0.29
355 0.27
356 0.26
357 0.23
358 0.21
359 0.21
360 0.17
361 0.16
362 0.19
363 0.2
364 0.2
365 0.17
366 0.21
367 0.2
368 0.2
369 0.27
370 0.27
371 0.28
372 0.31
373 0.33
374 0.3
375 0.3
376 0.37
377 0.31
378 0.33
379 0.36
380 0.36
381 0.37
382 0.42
383 0.46
384 0.48
385 0.48
386 0.43
387 0.42
388 0.39
389 0.42
390 0.46
391 0.41
392 0.33
393 0.33
394 0.33
395 0.31
396 0.3
397 0.24
398 0.15
399 0.15
400 0.13
401 0.13
402 0.12
403 0.1
404 0.09
405 0.12
406 0.14
407 0.17
408 0.19
409 0.21
410 0.2
411 0.2
412 0.19
413 0.17
414 0.13
415 0.15
416 0.15
417 0.15
418 0.19
419 0.21
420 0.24
421 0.29
422 0.34
423 0.38
424 0.45
425 0.54
426 0.61
427 0.7
428 0.75
429 0.79
430 0.85
431 0.88
432 0.88
433 0.86
434 0.83
435 0.75
436 0.71
437 0.6
438 0.5
439 0.39
440 0.31
441 0.26
442 0.18
443 0.18
444 0.16
445 0.16
446 0.17
447 0.17
448 0.15
449 0.13
450 0.15
451 0.17
452 0.19
453 0.21
454 0.26
455 0.31
456 0.32
457 0.32
458 0.33
459 0.35
460 0.35
461 0.34
462 0.3
463 0.28
464 0.28
465 0.27
466 0.22
467 0.17
468 0.13
469 0.14
470 0.12
471 0.11
472 0.15
473 0.16
474 0.19
475 0.22
476 0.23