Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0JYJ4

Protein Details
Accession R0JYJ4    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MARGRGSARKKQSAKDKELAKKSVHydrophilic
363-399EEKELEKRWTQRNKEKEERRRIQRENIERKKKEKAAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-23GRGSARKKQSAKDKELAKKS
297-325RREKEKLKAGDATSHARARGSKPRVEKRA
369-399KRWTQRNKEKEERRRIQRENIERKKKEKAAK
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR045112  PPAN-like  
Gene Ontology GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MARGRGSARKKQSAKDKELAKKSVAGPKSMVIRIGAQEVGKSVSDLVNDVRHCLEPDTAIRLKERRANKLKDYLVMCGPLGVSHLLLFSRSESGNTNLRLARTPRGPTLHFRVENYSLCKDIIKAMKRPRSGASDYLVAPLLVMNNFLTSDSERERLGEKAPPKHLEKLVTDMFQGLFPPIQPHTTPLHSIKRVLLLNREAPSGETGSINISLRHYAITTKQVGIPKAIRRLYAAEKLVGSREKKKSALPNLGKLEDVADYMLDPSAAGYTSVSDTEQDTDAEVEVTAPVRQKVLSRREKEKLKAGDATSHARARGSKPRVEKRAVKLIELGPRMQLRLTKVEEDVCGGKVLWHEFITKTKAEEKELEKRWTQRNKEKEERRRIQRENIERKKKEKAAKAETAEEGEEGEEDEEMEDFDDYDMDDDVWQDAADAGEGEDDEDEDEEMDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.78
3 0.78
4 0.78
5 0.81
6 0.77
7 0.68
8 0.64
9 0.62
10 0.63
11 0.55
12 0.48
13 0.41
14 0.41
15 0.46
16 0.4
17 0.36
18 0.28
19 0.29
20 0.27
21 0.28
22 0.26
23 0.19
24 0.18
25 0.18
26 0.19
27 0.15
28 0.14
29 0.13
30 0.12
31 0.13
32 0.14
33 0.15
34 0.19
35 0.19
36 0.21
37 0.22
38 0.21
39 0.22
40 0.23
41 0.21
42 0.19
43 0.21
44 0.26
45 0.27
46 0.27
47 0.31
48 0.32
49 0.36
50 0.4
51 0.45
52 0.49
53 0.56
54 0.62
55 0.64
56 0.7
57 0.68
58 0.67
59 0.62
60 0.55
61 0.47
62 0.41
63 0.34
64 0.25
65 0.22
66 0.15
67 0.14
68 0.11
69 0.09
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.08
76 0.11
77 0.11
78 0.12
79 0.14
80 0.18
81 0.24
82 0.25
83 0.28
84 0.27
85 0.28
86 0.32
87 0.32
88 0.35
89 0.34
90 0.37
91 0.38
92 0.41
93 0.43
94 0.44
95 0.49
96 0.52
97 0.48
98 0.45
99 0.46
100 0.45
101 0.47
102 0.45
103 0.39
104 0.31
105 0.29
106 0.28
107 0.23
108 0.24
109 0.28
110 0.29
111 0.35
112 0.43
113 0.51
114 0.52
115 0.55
116 0.52
117 0.51
118 0.5
119 0.45
120 0.38
121 0.34
122 0.32
123 0.31
124 0.27
125 0.2
126 0.16
127 0.12
128 0.11
129 0.07
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.06
134 0.07
135 0.08
136 0.08
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.16
143 0.16
144 0.18
145 0.2
146 0.23
147 0.29
148 0.35
149 0.39
150 0.41
151 0.45
152 0.46
153 0.45
154 0.4
155 0.39
156 0.36
157 0.31
158 0.28
159 0.23
160 0.21
161 0.16
162 0.15
163 0.1
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.13
171 0.16
172 0.17
173 0.21
174 0.24
175 0.31
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.31
180 0.32
181 0.3
182 0.29
183 0.24
184 0.28
185 0.27
186 0.27
187 0.21
188 0.2
189 0.2
190 0.16
191 0.13
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.08
204 0.09
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.17
209 0.2
210 0.2
211 0.21
212 0.24
213 0.24
214 0.3
215 0.3
216 0.27
217 0.26
218 0.29
219 0.3
220 0.31
221 0.28
222 0.22
223 0.21
224 0.21
225 0.22
226 0.23
227 0.22
228 0.25
229 0.29
230 0.31
231 0.32
232 0.37
233 0.43
234 0.46
235 0.54
236 0.49
237 0.52
238 0.52
239 0.51
240 0.46
241 0.38
242 0.31
243 0.21
244 0.17
245 0.09
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.04
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.07
263 0.08
264 0.09
265 0.08
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.14
280 0.22
281 0.32
282 0.4
283 0.45
284 0.52
285 0.6
286 0.67
287 0.67
288 0.67
289 0.62
290 0.57
291 0.56
292 0.5
293 0.47
294 0.43
295 0.44
296 0.39
297 0.35
298 0.32
299 0.27
300 0.29
301 0.29
302 0.35
303 0.36
304 0.38
305 0.46
306 0.55
307 0.61
308 0.65
309 0.68
310 0.64
311 0.69
312 0.64
313 0.56
314 0.51
315 0.49
316 0.49
317 0.43
318 0.37
319 0.31
320 0.3
321 0.3
322 0.26
323 0.25
324 0.21
325 0.25
326 0.28
327 0.26
328 0.26
329 0.28
330 0.27
331 0.27
332 0.25
333 0.19
334 0.16
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.16
340 0.15
341 0.16
342 0.17
343 0.22
344 0.25
345 0.23
346 0.24
347 0.29
348 0.31
349 0.33
350 0.38
351 0.4
352 0.46
353 0.52
354 0.54
355 0.52
356 0.57
357 0.63
358 0.67
359 0.7
360 0.7
361 0.73
362 0.77
363 0.83
364 0.87
365 0.88
366 0.89
367 0.89
368 0.9
369 0.9
370 0.87
371 0.86
372 0.86
373 0.86
374 0.86
375 0.87
376 0.87
377 0.83
378 0.82
379 0.82
380 0.8
381 0.79
382 0.77
383 0.76
384 0.75
385 0.78
386 0.77
387 0.71
388 0.65
389 0.58
390 0.48
391 0.38
392 0.29
393 0.2
394 0.15
395 0.11
396 0.09
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.07
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.08
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.07
424 0.07
425 0.06
426 0.06
427 0.07
428 0.07
429 0.07