Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0I6E1

Protein Details
Accession R0I6E1    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-51ADDSKGKKRKSAPETAPKAKKPRKSDDVAASEPKPTRKSARKQAADFMGHydrophilic
422-441AEPPKGKKGKKGAKAQAETKBasic
481-506VAEPVADKKNKKDKKRKSDVALETAAHydrophilic
511-554TVSEVAPKSKKPKKEKETKPEPIVEEVEEKKAAAKPKKAKKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-44KGKKRKSAPETAPKAKKPRKSDDVAASEPKPTRKSARK
104-109KKQAKK
425-438PKGKKGKKGAKAQA
455-465AQAKKGKKAAK
488-497KKNKKDKKRK
517-554PKSKKPKKEKETKPEPIVEEVEEKKAAAKPKKAKKSKA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 11.333, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAADDSKGKKRKSAPETAPKAKKPRKSDDVAASEPKPTRKSARKQAADFMGIDEEEAAPAVAAEPVKPKKDKQSKAAAASAAATKVAEPVAEAVEAAEVQEKPKKQAKKAKAVVAEETTVTETPKETTNKAKKTKAAADAPAIVEETAIVTKAKKTKGAKKQEAPEPEVEATETAVVSDDDDDVAEDDQTAALLAGFSDDDSEDAEEDENFNEDEKIPKLSAKQRKALKQAQDAPKADQPGVIYVGRVPRGFFEPQMKKYFSQFGKVNNLRLSRNKKTGASKHYAFVEFQSQEVADIVARTMNNYLLFGHILKVHLIPNDQVHPDLFKGANQRFKVDPRNKKAGLEMERGAERSQWEKRVENENKRRQSKAKQLKEAFDYEFEAPVLKTVDSVPQHTTIKKLQPAESKKLLVDAPAAEVADAEPPKGKKGKKGAKAQAETKPVEAVEATKVASPAQAKKGKKAAKANADEPNGVTEEAPVVAEPVADKKNKKDKKRKSDVALETAAVTEETVSEVAPKSKKPKKEKETKPEPIVEEVEEKKAAAKPKKAKKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.76
3 0.84
4 0.87
5 0.87
6 0.85
7 0.87
8 0.85
9 0.84
10 0.82
11 0.82
12 0.81
13 0.79
14 0.8
15 0.78
16 0.78
17 0.75
18 0.72
19 0.62
20 0.59
21 0.56
22 0.54
23 0.47
24 0.44
25 0.48
26 0.53
27 0.62
28 0.67
29 0.73
30 0.76
31 0.77
32 0.8
33 0.76
34 0.69
35 0.59
36 0.5
37 0.41
38 0.31
39 0.27
40 0.19
41 0.13
42 0.1
43 0.1
44 0.07
45 0.05
46 0.05
47 0.05
48 0.06
49 0.06
50 0.08
51 0.16
52 0.22
53 0.28
54 0.32
55 0.36
56 0.45
57 0.56
58 0.63
59 0.62
60 0.68
61 0.7
62 0.72
63 0.72
64 0.62
65 0.51
66 0.46
67 0.39
68 0.28
69 0.2
70 0.15
71 0.1
72 0.11
73 0.1
74 0.08
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.09
85 0.08
86 0.11
87 0.16
88 0.18
89 0.24
90 0.31
91 0.39
92 0.45
93 0.55
94 0.63
95 0.68
96 0.75
97 0.76
98 0.76
99 0.71
100 0.66
101 0.58
102 0.5
103 0.39
104 0.32
105 0.26
106 0.2
107 0.17
108 0.13
109 0.11
110 0.11
111 0.18
112 0.19
113 0.2
114 0.31
115 0.4
116 0.49
117 0.56
118 0.61
119 0.6
120 0.65
121 0.7
122 0.67
123 0.64
124 0.57
125 0.53
126 0.49
127 0.44
128 0.37
129 0.29
130 0.21
131 0.15
132 0.11
133 0.09
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.11
139 0.17
140 0.19
141 0.26
142 0.34
143 0.43
144 0.53
145 0.64
146 0.69
147 0.71
148 0.78
149 0.78
150 0.76
151 0.7
152 0.62
153 0.55
154 0.45
155 0.38
156 0.3
157 0.22
158 0.16
159 0.12
160 0.1
161 0.06
162 0.06
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.03
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.05
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.11
205 0.12
206 0.18
207 0.26
208 0.36
209 0.39
210 0.45
211 0.5
212 0.57
213 0.64
214 0.66
215 0.63
216 0.63
217 0.66
218 0.68
219 0.68
220 0.63
221 0.57
222 0.53
223 0.47
224 0.39
225 0.31
226 0.22
227 0.16
228 0.17
229 0.14
230 0.11
231 0.11
232 0.14
233 0.15
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.16
238 0.16
239 0.17
240 0.24
241 0.28
242 0.32
243 0.37
244 0.38
245 0.35
246 0.36
247 0.43
248 0.34
249 0.34
250 0.32
251 0.32
252 0.4
253 0.41
254 0.42
255 0.39
256 0.4
257 0.37
258 0.42
259 0.46
260 0.41
261 0.45
262 0.44
263 0.44
264 0.5
265 0.54
266 0.53
267 0.51
268 0.47
269 0.43
270 0.43
271 0.4
272 0.32
273 0.26
274 0.25
275 0.19
276 0.17
277 0.15
278 0.12
279 0.12
280 0.11
281 0.1
282 0.05
283 0.04
284 0.04
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.15
307 0.14
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.13
313 0.11
314 0.11
315 0.18
316 0.21
317 0.28
318 0.28
319 0.31
320 0.3
321 0.35
322 0.44
323 0.46
324 0.53
325 0.53
326 0.62
327 0.6
328 0.58
329 0.57
330 0.55
331 0.51
332 0.45
333 0.39
334 0.33
335 0.32
336 0.33
337 0.29
338 0.22
339 0.18
340 0.19
341 0.22
342 0.25
343 0.28
344 0.3
345 0.34
346 0.43
347 0.51
348 0.56
349 0.63
350 0.67
351 0.73
352 0.74
353 0.75
354 0.72
355 0.72
356 0.72
357 0.72
358 0.72
359 0.72
360 0.73
361 0.72
362 0.69
363 0.64
364 0.54
365 0.44
366 0.38
367 0.28
368 0.24
369 0.2
370 0.16
371 0.12
372 0.12
373 0.12
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.15
378 0.16
379 0.18
380 0.19
381 0.23
382 0.25
383 0.25
384 0.29
385 0.28
386 0.34
387 0.36
388 0.38
389 0.39
390 0.47
391 0.53
392 0.57
393 0.56
394 0.51
395 0.46
396 0.45
397 0.39
398 0.3
399 0.26
400 0.19
401 0.15
402 0.15
403 0.14
404 0.11
405 0.11
406 0.1
407 0.13
408 0.12
409 0.1
410 0.14
411 0.15
412 0.2
413 0.27
414 0.29
415 0.32
416 0.43
417 0.53
418 0.57
419 0.68
420 0.72
421 0.76
422 0.8
423 0.79
424 0.76
425 0.73
426 0.65
427 0.55
428 0.47
429 0.37
430 0.31
431 0.24
432 0.18
433 0.13
434 0.13
435 0.13
436 0.12
437 0.13
438 0.12
439 0.15
440 0.17
441 0.21
442 0.29
443 0.36
444 0.37
445 0.44
446 0.53
447 0.57
448 0.61
449 0.65
450 0.65
451 0.68
452 0.73
453 0.72
454 0.71
455 0.67
456 0.6
457 0.5
458 0.43
459 0.34
460 0.28
461 0.22
462 0.14
463 0.11
464 0.11
465 0.1
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.12
472 0.17
473 0.22
474 0.24
475 0.33
476 0.45
477 0.54
478 0.64
479 0.7
480 0.76
481 0.83
482 0.91
483 0.91
484 0.89
485 0.91
486 0.87
487 0.83
488 0.74
489 0.63
490 0.52
491 0.42
492 0.34
493 0.23
494 0.16
495 0.09
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.06
500 0.08
501 0.1
502 0.17
503 0.2
504 0.26
505 0.35
506 0.43
507 0.53
508 0.62
509 0.71
510 0.76
511 0.83
512 0.89
513 0.9
514 0.93
515 0.93
516 0.9
517 0.86
518 0.79
519 0.73
520 0.64
521 0.56
522 0.52
523 0.44
524 0.4
525 0.33
526 0.3
527 0.28
528 0.3
529 0.37
530 0.39
531 0.47
532 0.53
533 0.64
534 0.75