Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D7W1

Protein Details
Accession B0D7W1    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-114AQMEKERQERQRRLFKQQGKMTHydrophilic
464-484GGTIFCRRKQWSTKNFPRDHFHydrophilic
583-602ACWQRPPRKYTTKDEPWMQEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
IPR003903  UIM_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_319104  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09122  PLDc_Tdp1_1  
cd09123  PLDc_Tdp1_2  
Amino Acid Sequences MADDDLASAIALSLQESNLNTRAPIMVESGEEDDQELQFQADLKRALEASKSELSREARSQSNSESSTNLSRVTADVGGSTSSNAFTFLADRAQMEKERQERQRRLFKQQGKMTAHREEDNNDSDVEEPCAKRPRLTASHSINSSGRNSRASPSSTSGTDSIFWNGEFRQTATRHADPRKDNMATFRLTEVLGQKKDIAFAILSSYSLDWMWIYQFFDPATPVIMVAQPDQTGRAIIKNVLPHWIKTTPYLRGGHGCQHMKFMLLFYRNGRLRVVVSTANLIEYDWRDMENSVWLQDVPLRSSPIPHDPKATNDFPSIIQRVLNSLNVKPHPNLALKSIEDLRCRWDWSKVKVHLVPSIAGKHEGWPAVIKTGHPRLMMAVREMAMRTGKGKAKELILECQGSSLGIYTTQWMNEFHWSARGESAEDWLDEPKKRREKLPYPPIKIFFPSKRTVQESALGEKGGGTIFCRRKQWSTKNFPRDHFYDSKSKGGPVLMHSKMIIATHQETTRKTLQAAESSSEEDDDIEVVDPPLGWSYLGSHNFTPSAWGNLSGSSFNPVLNIANYELGIVFPVKDAAEADKVACWQRPPRKYTTKDEPWMQEESVYHQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.11
4 0.15
5 0.17
6 0.18
7 0.17
8 0.17
9 0.19
10 0.17
11 0.17
12 0.16
13 0.14
14 0.14
15 0.16
16 0.18
17 0.17
18 0.16
19 0.16
20 0.15
21 0.14
22 0.15
23 0.12
24 0.09
25 0.1
26 0.13
27 0.14
28 0.17
29 0.19
30 0.18
31 0.2
32 0.21
33 0.21
34 0.22
35 0.22
36 0.23
37 0.28
38 0.28
39 0.27
40 0.33
41 0.36
42 0.37
43 0.4
44 0.39
45 0.38
46 0.41
47 0.43
48 0.41
49 0.44
50 0.42
51 0.38
52 0.36
53 0.33
54 0.35
55 0.33
56 0.29
57 0.22
58 0.2
59 0.2
60 0.21
61 0.18
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.12
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.18
81 0.21
82 0.22
83 0.29
84 0.33
85 0.42
86 0.5
87 0.58
88 0.64
89 0.7
90 0.78
91 0.76
92 0.8
93 0.81
94 0.81
95 0.8
96 0.78
97 0.79
98 0.75
99 0.76
100 0.72
101 0.69
102 0.63
103 0.56
104 0.52
105 0.45
106 0.43
107 0.39
108 0.34
109 0.27
110 0.24
111 0.22
112 0.2
113 0.21
114 0.2
115 0.18
116 0.22
117 0.31
118 0.31
119 0.32
120 0.35
121 0.4
122 0.42
123 0.48
124 0.51
125 0.5
126 0.56
127 0.55
128 0.55
129 0.47
130 0.43
131 0.41
132 0.37
133 0.31
134 0.28
135 0.29
136 0.29
137 0.32
138 0.32
139 0.31
140 0.31
141 0.31
142 0.29
143 0.3
144 0.27
145 0.24
146 0.22
147 0.2
148 0.17
149 0.15
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.2
157 0.2
158 0.26
159 0.31
160 0.36
161 0.4
162 0.45
163 0.52
164 0.48
165 0.53
166 0.55
167 0.5
168 0.46
169 0.43
170 0.41
171 0.35
172 0.33
173 0.27
174 0.21
175 0.19
176 0.2
177 0.2
178 0.24
179 0.23
180 0.23
181 0.24
182 0.23
183 0.24
184 0.21
185 0.17
186 0.1
187 0.09
188 0.11
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.13
225 0.15
226 0.15
227 0.22
228 0.22
229 0.21
230 0.24
231 0.25
232 0.23
233 0.26
234 0.29
235 0.25
236 0.3
237 0.31
238 0.28
239 0.29
240 0.3
241 0.31
242 0.34
243 0.34
244 0.29
245 0.3
246 0.29
247 0.26
248 0.24
249 0.19
250 0.17
251 0.16
252 0.17
253 0.16
254 0.24
255 0.24
256 0.25
257 0.24
258 0.2
259 0.2
260 0.19
261 0.2
262 0.13
263 0.12
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.09
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.08
276 0.09
277 0.1
278 0.1
279 0.08
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.12
288 0.11
289 0.13
290 0.15
291 0.22
292 0.26
293 0.25
294 0.28
295 0.27
296 0.31
297 0.36
298 0.35
299 0.28
300 0.24
301 0.24
302 0.21
303 0.24
304 0.21
305 0.16
306 0.15
307 0.13
308 0.14
309 0.14
310 0.16
311 0.14
312 0.14
313 0.19
314 0.21
315 0.23
316 0.21
317 0.22
318 0.23
319 0.23
320 0.23
321 0.2
322 0.22
323 0.2
324 0.22
325 0.25
326 0.24
327 0.23
328 0.22
329 0.24
330 0.22
331 0.25
332 0.23
333 0.27
334 0.3
335 0.35
336 0.44
337 0.44
338 0.48
339 0.48
340 0.49
341 0.44
342 0.39
343 0.34
344 0.27
345 0.25
346 0.2
347 0.18
348 0.17
349 0.15
350 0.16
351 0.15
352 0.13
353 0.13
354 0.13
355 0.14
356 0.15
357 0.13
358 0.17
359 0.22
360 0.25
361 0.23
362 0.23
363 0.22
364 0.26
365 0.26
366 0.21
367 0.17
368 0.14
369 0.15
370 0.15
371 0.14
372 0.11
373 0.1
374 0.11
375 0.15
376 0.19
377 0.2
378 0.23
379 0.24
380 0.25
381 0.3
382 0.31
383 0.29
384 0.28
385 0.27
386 0.23
387 0.21
388 0.19
389 0.14
390 0.12
391 0.08
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.07
396 0.07
397 0.08
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.15
402 0.17
403 0.15
404 0.2
405 0.2
406 0.2
407 0.2
408 0.2
409 0.17
410 0.16
411 0.18
412 0.14
413 0.13
414 0.13
415 0.15
416 0.18
417 0.2
418 0.25
419 0.32
420 0.4
421 0.42
422 0.48
423 0.55
424 0.61
425 0.68
426 0.74
427 0.75
428 0.73
429 0.77
430 0.73
431 0.65
432 0.6
433 0.56
434 0.51
435 0.47
436 0.44
437 0.43
438 0.45
439 0.48
440 0.47
441 0.42
442 0.42
443 0.39
444 0.39
445 0.36
446 0.3
447 0.25
448 0.21
449 0.2
450 0.13
451 0.1
452 0.08
453 0.16
454 0.23
455 0.27
456 0.32
457 0.35
458 0.43
459 0.53
460 0.62
461 0.64
462 0.69
463 0.75
464 0.81
465 0.84
466 0.8
467 0.76
468 0.68
469 0.65
470 0.6
471 0.54
472 0.53
473 0.5
474 0.53
475 0.48
476 0.45
477 0.39
478 0.35
479 0.33
480 0.28
481 0.34
482 0.28
483 0.28
484 0.27
485 0.26
486 0.24
487 0.22
488 0.19
489 0.15
490 0.17
491 0.2
492 0.24
493 0.27
494 0.27
495 0.33
496 0.37
497 0.34
498 0.32
499 0.33
500 0.34
501 0.36
502 0.37
503 0.34
504 0.3
505 0.31
506 0.3
507 0.25
508 0.21
509 0.15
510 0.12
511 0.1
512 0.09
513 0.07
514 0.07
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.07
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.07
523 0.11
524 0.18
525 0.22
526 0.24
527 0.24
528 0.26
529 0.26
530 0.26
531 0.27
532 0.2
533 0.22
534 0.2
535 0.21
536 0.19
537 0.2
538 0.22
539 0.18
540 0.17
541 0.17
542 0.16
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.14
547 0.14
548 0.16
549 0.13
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.13
554 0.11
555 0.11
556 0.09
557 0.08
558 0.07
559 0.09
560 0.08
561 0.09
562 0.1
563 0.13
564 0.15
565 0.16
566 0.16
567 0.17
568 0.2
569 0.23
570 0.25
571 0.27
572 0.34
573 0.43
574 0.51
575 0.56
576 0.63
577 0.7
578 0.74
579 0.78
580 0.79
581 0.8
582 0.79
583 0.81
584 0.78
585 0.71
586 0.68
587 0.59
588 0.51
589 0.41