Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IFV5

Protein Details
Accession R0IFV5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-146GSDSERGRLRRKRSREDFEDDAEADKQPEKKIERHTRKRSRDMTKDVDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
105-110RLRRKR
128-135KIERHTRK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011993  PH-like_dom_sf  
IPR000156  Ran_bind_dom  
IPR045255  RanBP1-like  
Gene Ontology GO:0046907  P:intracellular transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00638  Ran_BP1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50196  RANBD1  
Amino Acid Sequences MTDVSEKQQPPVAAPAADDAAAAVTPASENTDAAPAAPASPARSDKSSDSEGKNVREKLKDTQIDAQAPSYPASGSDQALNNAPNGSAKPGDHQSVSGSDSERGRLRRKRSREDFEDDAEADKQPEKKIERHTRKRSRDMTKDVDADMSAKPSGNPITSIKESDADEHMASPSKTPTTTTDKASGSGTSPKHKRTRDEAEKDAEDTADGAEAATANGQPDTKRLRDQDGSKPSSDTVESKAKIPRGSGFANTSAASPFTAMAAKSQGPKSSDKPESLPQTSDDKFKASGFGGFAASSTSPFGFASSGSSSPFGGASGGKLTSFAGKTAAPTLGGSGGGFGALAGSGTSGFGGSSFGGGFGGLGTTKTLGSFAAPGGNLEIKGLKEKEKPFGAAADGNSSDEEDDDDEDPEKATEKEERQSSQPLLSQQPPETGEEGEQTLWTGRAKLYNMAGEGSNRGWKERGVGTFKFNITVDEPKKARFVLRAEGTHRLLLNAAVTRKMVFGGDAQGEKPKDGRLLFNSPNGDGELEMHLLRMKAENAKLLWQEVTKVQEEQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.26
3 0.22
4 0.22
5 0.19
6 0.12
7 0.1
8 0.09
9 0.08
10 0.05
11 0.04
12 0.05
13 0.05
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.1
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.15
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.18
28 0.22
29 0.24
30 0.26
31 0.29
32 0.31
33 0.36
34 0.4
35 0.42
36 0.42
37 0.47
38 0.51
39 0.54
40 0.58
41 0.58
42 0.58
43 0.56
44 0.56
45 0.56
46 0.6
47 0.58
48 0.55
49 0.57
50 0.57
51 0.55
52 0.53
53 0.46
54 0.39
55 0.35
56 0.32
57 0.24
58 0.17
59 0.14
60 0.18
61 0.18
62 0.16
63 0.19
64 0.2
65 0.21
66 0.24
67 0.24
68 0.21
69 0.19
70 0.18
71 0.15
72 0.14
73 0.16
74 0.15
75 0.15
76 0.2
77 0.23
78 0.26
79 0.25
80 0.24
81 0.23
82 0.23
83 0.24
84 0.21
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.23
89 0.27
90 0.3
91 0.38
92 0.44
93 0.52
94 0.59
95 0.68
96 0.75
97 0.79
98 0.84
99 0.82
100 0.81
101 0.76
102 0.69
103 0.63
104 0.52
105 0.44
106 0.35
107 0.28
108 0.22
109 0.21
110 0.2
111 0.19
112 0.26
113 0.28
114 0.33
115 0.44
116 0.54
117 0.62
118 0.7
119 0.79
120 0.83
121 0.88
122 0.92
123 0.9
124 0.89
125 0.87
126 0.85
127 0.81
128 0.76
129 0.69
130 0.59
131 0.5
132 0.4
133 0.32
134 0.24
135 0.19
136 0.13
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.15
141 0.13
142 0.16
143 0.16
144 0.21
145 0.23
146 0.24
147 0.22
148 0.23
149 0.23
150 0.22
151 0.22
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.16
156 0.16
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.19
164 0.25
165 0.28
166 0.3
167 0.34
168 0.33
169 0.34
170 0.33
171 0.29
172 0.22
173 0.26
174 0.25
175 0.28
176 0.32
177 0.39
178 0.46
179 0.5
180 0.53
181 0.55
182 0.64
183 0.66
184 0.68
185 0.65
186 0.63
187 0.59
188 0.55
189 0.46
190 0.35
191 0.24
192 0.17
193 0.12
194 0.06
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.1
207 0.15
208 0.17
209 0.21
210 0.23
211 0.28
212 0.33
213 0.38
214 0.44
215 0.48
216 0.49
217 0.45
218 0.44
219 0.38
220 0.34
221 0.31
222 0.22
223 0.18
224 0.22
225 0.22
226 0.25
227 0.28
228 0.29
229 0.29
230 0.29
231 0.26
232 0.24
233 0.25
234 0.23
235 0.22
236 0.2
237 0.2
238 0.2
239 0.17
240 0.13
241 0.12
242 0.1
243 0.08
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.08
250 0.09
251 0.13
252 0.14
253 0.16
254 0.18
255 0.21
256 0.24
257 0.3
258 0.31
259 0.29
260 0.31
261 0.34
262 0.37
263 0.36
264 0.33
265 0.27
266 0.3
267 0.3
268 0.3
269 0.25
270 0.2
271 0.2
272 0.19
273 0.18
274 0.13
275 0.14
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.08
283 0.06
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.07
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.07
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.12
315 0.12
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.08
320 0.07
321 0.07
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.03
327 0.02
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.04
348 0.03
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.06
358 0.06
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.09
366 0.11
367 0.09
368 0.14
369 0.15
370 0.19
371 0.25
372 0.28
373 0.34
374 0.35
375 0.36
376 0.32
377 0.32
378 0.3
379 0.25
380 0.23
381 0.2
382 0.18
383 0.17
384 0.16
385 0.15
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.07
390 0.08
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.11
398 0.09
399 0.1
400 0.16
401 0.19
402 0.25
403 0.3
404 0.32
405 0.33
406 0.39
407 0.39
408 0.35
409 0.35
410 0.33
411 0.34
412 0.36
413 0.37
414 0.32
415 0.34
416 0.33
417 0.32
418 0.29
419 0.24
420 0.21
421 0.18
422 0.18
423 0.14
424 0.13
425 0.11
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.11
430 0.11
431 0.15
432 0.17
433 0.2
434 0.22
435 0.23
436 0.23
437 0.23
438 0.23
439 0.19
440 0.2
441 0.18
442 0.2
443 0.18
444 0.19
445 0.19
446 0.19
447 0.22
448 0.26
449 0.31
450 0.33
451 0.35
452 0.38
453 0.42
454 0.42
455 0.4
456 0.35
457 0.3
458 0.27
459 0.35
460 0.33
461 0.36
462 0.37
463 0.36
464 0.39
465 0.38
466 0.37
467 0.34
468 0.36
469 0.36
470 0.42
471 0.45
472 0.46
473 0.52
474 0.51
475 0.48
476 0.44
477 0.34
478 0.28
479 0.24
480 0.23
481 0.21
482 0.2
483 0.18
484 0.19
485 0.19
486 0.19
487 0.19
488 0.15
489 0.11
490 0.12
491 0.15
492 0.18
493 0.19
494 0.19
495 0.26
496 0.26
497 0.26
498 0.26
499 0.24
500 0.27
501 0.27
502 0.33
503 0.33
504 0.41
505 0.44
506 0.49
507 0.48
508 0.43
509 0.42
510 0.37
511 0.31
512 0.22
513 0.2
514 0.16
515 0.15
516 0.14
517 0.13
518 0.14
519 0.14
520 0.15
521 0.16
522 0.17
523 0.22
524 0.24
525 0.29
526 0.29
527 0.35
528 0.36
529 0.35
530 0.35
531 0.29
532 0.29
533 0.28
534 0.32
535 0.28