Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0KAD7

Protein Details
Accession R0KAD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
156-177QDPKARVQKRSKYKKAIPKQTAHydrophilic
273-293QYWPMKAIKQRTKQPEQYLKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
164-169KRSKYK
Subcellular Location(s) cyto 9.5, pero 9, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003196  TFIIF_beta  
IPR040450  TFIIF_beta_HTH  
IPR040504  TFIIF_beta_N  
IPR011039  TFIIF_interaction  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005674  C:transcription factor TFIIF complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF02270  TFIIF_beta  
PF17683  TFIIF_beta_N  
CDD cd07980  TFIIF_beta  
Amino Acid Sequences MNGIKADPDVKMDPDASTPGGGFMDDEFYEDTGEMIMNKDGPEKDIWLTRIPPWLYDAVAKWDNLADGNDTDQIQIGEIYGFATTSGIDKTKPMRVFLNDRWRAKSELPSAFQLDPAPATDTLLGNTYVFTEKDLPGFRGQGYGRGAQQGSFGGVQDPKARVQKRSKYKKAIPKQTALIGHATRQYNANPLETKEYKDFSAARIKQAIQGLHMTTIITKDTEVSDVNNSITLNNRFKNFIRPMTKGKSQQNKAARMARSDLIDFLHTLFDEYQYWPMKAIKQRTKQPEQYLKEVLGDIALLVKSGPFASNWKRQAVFENQRDTSKQAEAAAPEGPGDGDSEGEDEMEDVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.2
4 0.18
5 0.16
6 0.14
7 0.14
8 0.12
9 0.11
10 0.09
11 0.11
12 0.1
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.12
18 0.11
19 0.08
20 0.09
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.09
25 0.1
26 0.15
27 0.15
28 0.17
29 0.18
30 0.19
31 0.21
32 0.25
33 0.27
34 0.26
35 0.29
36 0.29
37 0.36
38 0.34
39 0.31
40 0.29
41 0.28
42 0.25
43 0.26
44 0.24
45 0.23
46 0.25
47 0.24
48 0.21
49 0.2
50 0.2
51 0.18
52 0.17
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.14
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.1
62 0.09
63 0.08
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.05
73 0.07
74 0.08
75 0.08
76 0.11
77 0.15
78 0.23
79 0.24
80 0.25
81 0.28
82 0.33
83 0.4
84 0.46
85 0.54
86 0.54
87 0.56
88 0.58
89 0.56
90 0.54
91 0.49
92 0.48
93 0.45
94 0.43
95 0.42
96 0.41
97 0.42
98 0.38
99 0.36
100 0.28
101 0.21
102 0.15
103 0.14
104 0.13
105 0.1
106 0.1
107 0.11
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.15
121 0.16
122 0.17
123 0.17
124 0.18
125 0.17
126 0.19
127 0.19
128 0.2
129 0.21
130 0.21
131 0.2
132 0.22
133 0.22
134 0.17
135 0.18
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.09
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.12
144 0.13
145 0.15
146 0.22
147 0.24
148 0.3
149 0.39
150 0.47
151 0.54
152 0.64
153 0.69
154 0.71
155 0.78
156 0.81
157 0.82
158 0.84
159 0.77
160 0.7
161 0.63
162 0.59
163 0.52
164 0.42
165 0.36
166 0.26
167 0.23
168 0.24
169 0.22
170 0.18
171 0.19
172 0.18
173 0.19
174 0.2
175 0.21
176 0.17
177 0.18
178 0.24
179 0.24
180 0.26
181 0.23
182 0.23
183 0.21
184 0.23
185 0.22
186 0.18
187 0.28
188 0.26
189 0.26
190 0.28
191 0.28
192 0.29
193 0.32
194 0.29
195 0.2
196 0.21
197 0.19
198 0.17
199 0.16
200 0.12
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.06
206 0.06
207 0.07
208 0.08
209 0.08
210 0.09
211 0.1
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.15
218 0.2
219 0.23
220 0.24
221 0.26
222 0.28
223 0.29
224 0.38
225 0.38
226 0.41
227 0.42
228 0.44
229 0.5
230 0.54
231 0.59
232 0.58
233 0.62
234 0.64
235 0.62
236 0.66
237 0.67
238 0.67
239 0.67
240 0.66
241 0.59
242 0.51
243 0.51
244 0.45
245 0.38
246 0.32
247 0.27
248 0.2
249 0.19
250 0.16
251 0.13
252 0.12
253 0.1
254 0.11
255 0.1
256 0.1
257 0.11
258 0.12
259 0.18
260 0.19
261 0.2
262 0.2
263 0.22
264 0.28
265 0.33
266 0.42
267 0.46
268 0.52
269 0.62
270 0.69
271 0.77
272 0.78
273 0.81
274 0.81
275 0.77
276 0.75
277 0.69
278 0.6
279 0.52
280 0.44
281 0.33
282 0.23
283 0.17
284 0.11
285 0.1
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.15
295 0.22
296 0.32
297 0.36
298 0.41
299 0.42
300 0.43
301 0.48
302 0.52
303 0.55
304 0.53
305 0.58
306 0.55
307 0.57
308 0.58
309 0.53
310 0.47
311 0.39
312 0.34
313 0.28
314 0.29
315 0.27
316 0.27
317 0.25
318 0.21
319 0.18
320 0.16
321 0.13
322 0.1
323 0.1
324 0.08
325 0.07
326 0.08
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.08