Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5AB84

Protein Details
Accession Q5AB84    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MAKASKVDKKLSKKKEEKPAKKVEEESSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-22KVDKKLSKKKEEKPAKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005635  C:nuclear envelope  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0008139  F:nuclear localization sequence binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0043047  F:single-stranded telomeric DNA binding  
GO:0048255  P:mRNA stabilization  
GO:0000381  P:regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome  
GO:0044011  P:single-species biofilm formation on inanimate substrate  
KEGG cal:CAALFM_C100160CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKASKVDKKLSKKKEEKPAKKVEEESSSEESSSDDSSSEESSSDDDSSDDSSSSSSDEGSDSDSSDEEEVEKKESSSDESDDEDKKEESSSGSDEEEKKEEKSSSSDSEDSSSSDSSSSESDSDSDSDSDSDSEEEPSKKRKAEESKEEESAPVKKSKPAASTEEPATLFVGRLSWNIDDAWLKREFEHIGGVIGARVIMERATGKSRGYGYVDFESKSAAEKALEEMQGKEIDGRPINLDMSTGKPHASKSNNDRAKQYGDSQSPPSDTLFIGNLSFNANRDNLFNVFGEYGNVISCRVPTHPDTQQPKGFGYVQFSSVDEAKAALEAMNGEYIEGRPCRLDFSTPRDNTNNNNNNNRRGGFGGGFGGRERSATPRSGNSTPRPNKSTEFKGTKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.89
3 0.91
4 0.91
5 0.91
6 0.91
7 0.88
8 0.85
9 0.81
10 0.76
11 0.73
12 0.67
13 0.63
14 0.58
15 0.51
16 0.44
17 0.38
18 0.32
19 0.26
20 0.22
21 0.16
22 0.11
23 0.1
24 0.12
25 0.14
26 0.13
27 0.11
28 0.11
29 0.12
30 0.14
31 0.13
32 0.12
33 0.11
34 0.11
35 0.13
36 0.14
37 0.12
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.1
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.09
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.1
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.16
60 0.14
61 0.16
62 0.17
63 0.2
64 0.2
65 0.21
66 0.2
67 0.22
68 0.26
69 0.27
70 0.27
71 0.25
72 0.22
73 0.21
74 0.2
75 0.17
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.16
80 0.17
81 0.21
82 0.22
83 0.25
84 0.27
85 0.26
86 0.25
87 0.27
88 0.26
89 0.23
90 0.26
91 0.28
92 0.28
93 0.31
94 0.31
95 0.29
96 0.29
97 0.28
98 0.24
99 0.22
100 0.18
101 0.13
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.1
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.08
121 0.1
122 0.13
123 0.15
124 0.17
125 0.23
126 0.27
127 0.28
128 0.3
129 0.37
130 0.44
131 0.51
132 0.59
133 0.61
134 0.61
135 0.61
136 0.59
137 0.51
138 0.43
139 0.37
140 0.3
141 0.27
142 0.23
143 0.25
144 0.29
145 0.33
146 0.34
147 0.35
148 0.39
149 0.38
150 0.4
151 0.39
152 0.37
153 0.32
154 0.29
155 0.25
156 0.18
157 0.14
158 0.1
159 0.09
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.08
164 0.08
165 0.08
166 0.09
167 0.11
168 0.11
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.14
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.14
177 0.11
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.06
191 0.08
192 0.1
193 0.1
194 0.12
195 0.14
196 0.15
197 0.17
198 0.16
199 0.17
200 0.2
201 0.21
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.13
206 0.14
207 0.11
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.13
213 0.14
214 0.13
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.14
220 0.12
221 0.14
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.13
228 0.12
229 0.09
230 0.11
231 0.13
232 0.13
233 0.13
234 0.13
235 0.15
236 0.21
237 0.24
238 0.29
239 0.34
240 0.45
241 0.5
242 0.51
243 0.52
244 0.48
245 0.49
246 0.44
247 0.41
248 0.38
249 0.35
250 0.36
251 0.37
252 0.36
253 0.32
254 0.31
255 0.26
256 0.2
257 0.16
258 0.15
259 0.13
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.13
271 0.15
272 0.13
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.13
278 0.13
279 0.1
280 0.1
281 0.08
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.08
286 0.09
287 0.1
288 0.14
289 0.16
290 0.22
291 0.27
292 0.36
293 0.42
294 0.48
295 0.51
296 0.49
297 0.46
298 0.44
299 0.41
300 0.34
301 0.33
302 0.28
303 0.25
304 0.24
305 0.24
306 0.22
307 0.2
308 0.19
309 0.13
310 0.12
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.09
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.14
327 0.14
328 0.18
329 0.19
330 0.26
331 0.27
332 0.35
333 0.45
334 0.45
335 0.5
336 0.51
337 0.52
338 0.51
339 0.57
340 0.58
341 0.55
342 0.64
343 0.64
344 0.66
345 0.7
346 0.64
347 0.55
348 0.48
349 0.45
350 0.35
351 0.31
352 0.29
353 0.24
354 0.24
355 0.22
356 0.22
357 0.18
358 0.18
359 0.17
360 0.19
361 0.22
362 0.25
363 0.29
364 0.33
365 0.4
366 0.45
367 0.52
368 0.54
369 0.61
370 0.66
371 0.71
372 0.68
373 0.65
374 0.66
375 0.66
376 0.67
377 0.66
378 0.67
379 0.64
380 0.71