Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0J3K4

Protein Details
Accession R0J3K4    Localization Confidence High Confidence Score 25.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-22SSMRNAVQRRNHKERAQPLERHydrophilic
28-48LEKRKDYKLRAADHREKKAKLBasic
206-227QEQARREARKFRKDRERALERTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
14-54KERAQPLEREKWGLLEKRKDYKLRAADHREKKAKLKILSEK
210-237RREARKFRKDRERALERTASKLQGIKRR
268-276KFKIRERKR
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1, cyto 1, vacu 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007144  SSU_processome_Utp11  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF03998  Utp11  
Amino Acid Sequences MSSMRNAVQRRNHKERAQPLEREKWGLLEKRKDYKLRAADHREKKAKLKILSEKARDRNPDEFSFKMMSSHVDKQGRKVADRGNKALSLDVVKLLKTQDAGYIRTMLQVTRKEREELERKLVMEEQGEVRALKDGERAKQGKHRVFVDNEDEQDEFDPDTWFGRGEQMPRRAEPPTFGDLQDELLQDEEAPTQQSNTLSKKQMEAQEQARREARKFRKDRERALERTASKLQGIKRRERELMLAEEELELQRAKMNNTVGGVNKHGVKFKIRERKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.81
3 0.82
4 0.79
5 0.78
6 0.77
7 0.78
8 0.73
9 0.68
10 0.58
11 0.54
12 0.53
13 0.52
14 0.53
15 0.53
16 0.58
17 0.62
18 0.69
19 0.7
20 0.67
21 0.69
22 0.69
23 0.67
24 0.7
25 0.71
26 0.74
27 0.77
28 0.83
29 0.81
30 0.76
31 0.76
32 0.74
33 0.73
34 0.67
35 0.67
36 0.67
37 0.69
38 0.74
39 0.74
40 0.75
41 0.73
42 0.75
43 0.71
44 0.66
45 0.62
46 0.59
47 0.57
48 0.53
49 0.46
50 0.43
51 0.4
52 0.35
53 0.29
54 0.24
55 0.21
56 0.22
57 0.27
58 0.31
59 0.36
60 0.36
61 0.4
62 0.47
63 0.46
64 0.42
65 0.42
66 0.42
67 0.43
68 0.48
69 0.47
70 0.43
71 0.41
72 0.4
73 0.36
74 0.29
75 0.22
76 0.17
77 0.16
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.12
83 0.11
84 0.11
85 0.13
86 0.15
87 0.17
88 0.17
89 0.18
90 0.17
91 0.18
92 0.18
93 0.14
94 0.17
95 0.22
96 0.25
97 0.27
98 0.29
99 0.29
100 0.3
101 0.37
102 0.4
103 0.37
104 0.4
105 0.37
106 0.36
107 0.35
108 0.35
109 0.28
110 0.2
111 0.17
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.12
121 0.14
122 0.16
123 0.23
124 0.24
125 0.24
126 0.31
127 0.39
128 0.37
129 0.39
130 0.4
131 0.37
132 0.37
133 0.39
134 0.37
135 0.31
136 0.28
137 0.25
138 0.22
139 0.18
140 0.17
141 0.14
142 0.09
143 0.08
144 0.08
145 0.06
146 0.07
147 0.07
148 0.07
149 0.07
150 0.11
151 0.12
152 0.16
153 0.23
154 0.29
155 0.31
156 0.32
157 0.34
158 0.32
159 0.31
160 0.29
161 0.26
162 0.22
163 0.22
164 0.21
165 0.2
166 0.19
167 0.2
168 0.2
169 0.15
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.06
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.09
181 0.11
182 0.15
183 0.2
184 0.26
185 0.29
186 0.3
187 0.32
188 0.36
189 0.4
190 0.41
191 0.41
192 0.43
193 0.47
194 0.48
195 0.5
196 0.5
197 0.46
198 0.44
199 0.49
200 0.51
201 0.53
202 0.59
203 0.65
204 0.71
205 0.76
206 0.83
207 0.83
208 0.82
209 0.76
210 0.75
211 0.73
212 0.63
213 0.62
214 0.56
215 0.47
216 0.41
217 0.41
218 0.41
219 0.41
220 0.46
221 0.49
222 0.54
223 0.59
224 0.6
225 0.58
226 0.56
227 0.53
228 0.51
229 0.44
230 0.36
231 0.31
232 0.27
233 0.26
234 0.21
235 0.17
236 0.12
237 0.09
238 0.13
239 0.14
240 0.16
241 0.2
242 0.22
243 0.23
244 0.24
245 0.28
246 0.28
247 0.29
248 0.31
249 0.29
250 0.32
251 0.32
252 0.35
253 0.34
254 0.38
255 0.42
256 0.49