FuNGI

Q5A7S5

Protein Details

Accession

Q5A7S5

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-31	DGNISGPKKKKFTTKCRPFSFYKNRHI	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR004871 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_C IPR018846 Cleavage/polyA-sp_fac_asu_N IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0005686 C:U2 snRNP GO:0030620 F:U2 snRNA binding GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	cal:CAALFM_C300660WA -
Pfam	View protein in Pfam PF03178 CPSF_A PF10433 MMS1_N

Amino Acid Sequences

MMMRDGNISGPKKKKFTTKCRPFSFYKNRHIIMLINDESVYLYNLTLKPPSYYISSIVGQFYKQDNSTKNAQQLVLVSSTTLQLFEINEEAGKLELQSSQNLLGIINSIEKICLSEVDGVVITSDSGNLSILQYDNKTKKFISKIQEPMTKNGWGRNYVGENLAIDPENRCILVAAMEKNKLFYKIESNSSGSKELSSPLEAHSKQVLCLKIVALNTDHNNPLFGALELTPEKKCIINYYELDQGLNHVVKKKPNSSNSDPLPNDVNYLIPLPGHIGGMVVCGTNWCFYDKLDGPRIYLPLPRRNGQTQDSIIVNHVTHVLKKKKFFILLQNALGDLFKLTVDYDFDKEIIKNISITYFDTIPPALSLNIFKNGFLFANVLNNDKLLYQFEKLGDDLTEGELVINSSDYESLNSVRESVTSFKLKGLDNLALIDVLETLSPITDSKIIDSKLVTLSSHSYVKSITHGVPTTTLVESPLPITPTDIFTTKLSLESANDEYLVISSSLSSKTLVLSIGEVVEDVEDSEFVLDQPTIAVQQVGIASVVQIYSNGIKHVRTVNGNKKTTDWFPPAGITITHATTNNQQVLIALSNLSVVYFEIDATDDQLIEYQDRLEIATTITAMAIQENISEKSPFAIIGCSDETIQVVSLQEHNCLEIKSLQALSANSSSLKMLKSSGKETHVHIGMENGVYARIKIDTINGNLSNSRVKYIGSKPVSLSVIKFSNEIEGILAISSAPWISYLYRDSFKITPLLEIDITNGSSFISEDIGGEGIVGIKDNNLIIFSVGKEDSVFDPSQDLTIATTKLRYTPRKMITNGNRLFISESEYNVQGPFKCNINGDVKENVDEDYYEAFGYEWKQNSWASCIQVVDSKSNQVIQSLQLDGNESIVSMSAVSFNKTSTPSVPASHLVVGVCTNQTILPNSYDKSYLYTFKIGKKHLQLVHKTELDHIPQVLENFQDKLLVASGNHIRLYDIGQKQLLKKSTTIIDFSTNINKIIPQTNRIIICDSHKSSIVFAKFDESQNQFVPFADDVMKRQITSIMNLDIDTLIGGDKFGNIFVTRIDEDISKQADDDWTILKTQDGILNSCPYKLQNLIEFHIGDIITSFNLGCLNLAGTESVIYTGLQGTIGLLIPLVSKSEVELLFNLQLYMQQSQNNLVGKDHLKLRSYYNPIKNVIDGDLLERFLEFDISLKIEISRKLNKSVNDIEKKLIDLRNRSAF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.69
3	0.76
4	0.78
5	0.81
6	0.84
7	0.86
8	0.87
9	0.82
10	0.82
11	0.82
12	0.81
13	0.8
14	0.79
15	0.71
16	0.67
17	0.63
18	0.55
19	0.5
20	0.49
21	0.4
22	0.31
23	0.3
24	0.28
25	0.27
26	0.24
27	0.19
28	0.11
29	0.09
30	0.14
31	0.16
32	0.18
33	0.2
34	0.21
35	0.22
36	0.23
37	0.25
38	0.24
39	0.25
40	0.25
41	0.27
42	0.28
43	0.27
44	0.29
45	0.27
46	0.23
47	0.24
48	0.25
49	0.26
50	0.26
51	0.31
52	0.32
53	0.36
54	0.43
55	0.45
56	0.47
57	0.47
58	0.44
59	0.4
60	0.38
61	0.36
62	0.3
63	0.24
64	0.19
65	0.15
66	0.16
67	0.14
68	0.12
69	0.09
70	0.09
71	0.1
72	0.11
73	0.12
74	0.11
75	0.11
76	0.11
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.08
81	0.08
82	0.12
83	0.14
84	0.15
85	0.17
86	0.18
87	0.19
88	0.19
89	0.18
90	0.13
91	0.13
92	0.12
93	0.12
94	0.11
95	0.1
96	0.1
97	0.1
98	0.11
99	0.1
100	0.1
101	0.1
102	0.14
103	0.14
104	0.16
105	0.16
106	0.14
107	0.14
108	0.13
109	0.11
110	0.07
111	0.07
112	0.06
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.07
117	0.08
118	0.09
119	0.12
120	0.15
121	0.23
122	0.3
123	0.32
124	0.35
125	0.35
126	0.42
127	0.47
128	0.52
129	0.51
130	0.54
131	0.61
132	0.66
133	0.73
134	0.68
135	0.65
136	0.62
137	0.59
138	0.52
139	0.48
140	0.44
141	0.38
142	0.38
143	0.38
144	0.38
145	0.33
146	0.33
147	0.28
148	0.24
149	0.22
150	0.22
151	0.17
152	0.14
153	0.14
154	0.14
155	0.15
156	0.13
157	0.13
158	0.11
159	0.11
160	0.15
161	0.18
162	0.21
163	0.24
164	0.28
165	0.28
166	0.3
167	0.32
168	0.3
169	0.27
170	0.24
171	0.29
172	0.3
173	0.36
174	0.37
175	0.39
176	0.39
177	0.41
178	0.4
179	0.32
180	0.28
181	0.24
182	0.22
183	0.21
184	0.2
185	0.18
186	0.18
187	0.27
188	0.25
189	0.27
190	0.31
191	0.29
192	0.3
193	0.34
194	0.33
195	0.25
196	0.26
197	0.24
198	0.21
199	0.21
200	0.21
201	0.17
202	0.21
203	0.22
204	0.25
205	0.26
206	0.22
207	0.22
208	0.2
209	0.2
210	0.15
211	0.13
212	0.11
213	0.09
214	0.13
215	0.14
216	0.17
217	0.16
218	0.16
219	0.17
220	0.17
221	0.17
222	0.19
223	0.21
224	0.26
225	0.28
226	0.3
227	0.35
228	0.33
229	0.33
230	0.27
231	0.25
232	0.23
233	0.23
234	0.21
235	0.21
236	0.24
237	0.3
238	0.37
239	0.45
240	0.49
241	0.55
242	0.62
243	0.64
244	0.7
245	0.68
246	0.71
247	0.63
248	0.56
249	0.52
250	0.43
251	0.37
252	0.28
253	0.24
254	0.15
255	0.16
256	0.13
257	0.09
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.09
262	0.08
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.06
268	0.05
269	0.06
270	0.07
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.18
277	0.22
278	0.28
279	0.35
280	0.35
281	0.35
282	0.38
283	0.39
284	0.33
285	0.33
286	0.33
287	0.34
288	0.38
289	0.39
290	0.42
291	0.45
292	0.49
293	0.47
294	0.47
295	0.4
296	0.38
297	0.35
298	0.31
299	0.27
300	0.24
301	0.2
302	0.14
303	0.16
304	0.14
305	0.17
306	0.25
307	0.33
308	0.36
309	0.4
310	0.46
311	0.47
312	0.51
313	0.52
314	0.53
315	0.54
316	0.55
317	0.53
318	0.47
319	0.42
320	0.37
321	0.33
322	0.23
323	0.12
324	0.07
325	0.05
326	0.05
327	0.05
328	0.06
329	0.08
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.12
334	0.13
335	0.13
336	0.15
337	0.15
338	0.14
339	0.13
340	0.13
341	0.14
342	0.13
343	0.14
344	0.13
345	0.12
346	0.12
347	0.13
348	0.12
349	0.11
350	0.1
351	0.1
352	0.08
353	0.08
354	0.1
355	0.11
356	0.17
357	0.17
358	0.16
359	0.16
360	0.17
361	0.16
362	0.14
363	0.14
364	0.08
365	0.14
366	0.15
367	0.16
368	0.15
369	0.15
370	0.14
371	0.13
372	0.14
373	0.11
374	0.12
375	0.11
376	0.14
377	0.14
378	0.15
379	0.15
380	0.15
381	0.12
382	0.11
383	0.11
384	0.09
385	0.08
386	0.07
387	0.07
388	0.06
389	0.06
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.07
398	0.08
399	0.1
400	0.1
401	0.1
402	0.09
403	0.1
404	0.11
405	0.13
406	0.16
407	0.17
408	0.18
409	0.19
410	0.23
411	0.22
412	0.23
413	0.23
414	0.21
415	0.18
416	0.18
417	0.16
418	0.13
419	0.12
420	0.1
421	0.06
422	0.05
423	0.04
424	0.03
425	0.03
426	0.03
427	0.04
428	0.04
429	0.05
430	0.07
431	0.07
432	0.09
433	0.13
434	0.14
435	0.15
436	0.15
437	0.16
438	0.15
439	0.16
440	0.14
441	0.11
442	0.13
443	0.15
444	0.17
445	0.15
446	0.14
447	0.14
448	0.14
449	0.15
450	0.16
451	0.14
452	0.15
453	0.16
454	0.16
455	0.16
456	0.17
457	0.16
458	0.14
459	0.13
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.08
467	0.1
468	0.1
469	0.12
470	0.13
471	0.13
472	0.13
473	0.13
474	0.14
475	0.13
476	0.13
477	0.11
478	0.1
479	0.1
480	0.12
481	0.13
482	0.12
483	0.11
484	0.11
485	0.1
486	0.1
487	0.1
488	0.06
489	0.04
490	0.04
491	0.06
492	0.06
493	0.07
494	0.07
495	0.06
496	0.07
497	0.08
498	0.08
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.05
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.03
509	0.03
510	0.03
511	0.03
512	0.03
513	0.03
514	0.03
515	0.04
516	0.04
517	0.04
518	0.04
519	0.04
520	0.04
521	0.04
522	0.04
523	0.03
524	0.05
525	0.05
526	0.05
527	0.05
528	0.04
529	0.04
530	0.04
531	0.04
532	0.03
533	0.03
534	0.04
535	0.05
536	0.06
537	0.07
538	0.08
539	0.08
540	0.1
541	0.13
542	0.15
543	0.19
544	0.26
545	0.35
546	0.43
547	0.45
548	0.44
549	0.43
550	0.44
551	0.41
552	0.39
553	0.33
554	0.25
555	0.23
556	0.23
557	0.22
558	0.2
559	0.17
560	0.13
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.11
566	0.13
567	0.17
568	0.15
569	0.14
570	0.13
571	0.12
572	0.13
573	0.12
574	0.09
575	0.06
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.04
581	0.03
582	0.04
583	0.04
584	0.04
585	0.04
586	0.04
587	0.04
588	0.05
589	0.06
590	0.05
591	0.05
592	0.06
593	0.06
594	0.06
595	0.06
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.04
601	0.05
602	0.04
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.04
607	0.04
608	0.04
609	0.03
610	0.04
611	0.03
612	0.04
613	0.06
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.05
624	0.08
625	0.08
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.08
630	0.07
631	0.07
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.09
636	0.09
637	0.1
638	0.1
639	0.11
640	0.11
641	0.11
642	0.11
643	0.09
644	0.09
645	0.1
646	0.1
647	0.1
648	0.11
649	0.11
650	0.12
651	0.11
652	0.11
653	0.1
654	0.1
655	0.1
656	0.1
657	0.1
658	0.08
659	0.1
660	0.13
661	0.16
662	0.2
663	0.23
664	0.25
665	0.27
666	0.28
667	0.31
668	0.29
669	0.26
670	0.22
671	0.19
672	0.16
673	0.15
674	0.13
675	0.07
676	0.06
677	0.06
678	0.06
679	0.06
680	0.05
681	0.05
682	0.05
683	0.08
684	0.11
685	0.12
686	0.16
687	0.16
688	0.16
689	0.16
690	0.17
691	0.18
692	0.15
693	0.15
694	0.12
695	0.12
696	0.17
697	0.2
698	0.28
699	0.27
700	0.28
701	0.27
702	0.31
703	0.32
704	0.27
705	0.24
706	0.18
707	0.18
708	0.17
709	0.17
710	0.14
711	0.14
712	0.14
713	0.13
714	0.09
715	0.07
716	0.06
717	0.06
718	0.05
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.03
725	0.04
726	0.04
727	0.06
728	0.09
729	0.12
730	0.13
731	0.14
732	0.17
733	0.17
734	0.18
735	0.2
736	0.18
737	0.16
738	0.16
739	0.17
740	0.14
741	0.13
742	0.13
743	0.11
744	0.11
745	0.09
746	0.08
747	0.07
748	0.06
749	0.06
750	0.05
751	0.05
752	0.05
753	0.05
754	0.05
755	0.05
756	0.05
757	0.05
758	0.04
759	0.04
760	0.04
761	0.04
762	0.03
763	0.03
764	0.04
765	0.04
766	0.04
767	0.04
768	0.04
769	0.05
770	0.05
771	0.06
772	0.08
773	0.08
774	0.08
775	0.08
776	0.09
777	0.1
778	0.13
779	0.13
780	0.1
781	0.12
782	0.12
783	0.12
784	0.11
785	0.1
786	0.07
787	0.09
788	0.1
789	0.09
790	0.1
791	0.1
792	0.16
793	0.24
794	0.28
795	0.33
796	0.41
797	0.48
798	0.54
799	0.56
800	0.61
801	0.62
802	0.67
803	0.62
804	0.56
805	0.49
806	0.42
807	0.41
808	0.31
809	0.28
810	0.18
811	0.17
812	0.17
813	0.17
814	0.17
815	0.16
816	0.18
817	0.13
818	0.15
819	0.15
820	0.16
821	0.17
822	0.18
823	0.21
824	0.26
825	0.27
826	0.27
827	0.29
828	0.27
829	0.27
830	0.26
831	0.22
832	0.16
833	0.14
834	0.12
835	0.1
836	0.1
837	0.08
838	0.08
839	0.07
840	0.08
841	0.11
842	0.14
843	0.14
844	0.14
845	0.16
846	0.18
847	0.19
848	0.22
849	0.23
850	0.2
851	0.21
852	0.21
853	0.19
854	0.22
855	0.23
856	0.22
857	0.2
858	0.2
859	0.19
860	0.21
861	0.21
862	0.17
863	0.17
864	0.15
865	0.16
866	0.16
867	0.16
868	0.13
869	0.15
870	0.14
871	0.14
872	0.12
873	0.09
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.04
878	0.05
879	0.08
880	0.09
881	0.1
882	0.1
883	0.11
884	0.13
885	0.15
886	0.17
887	0.14
888	0.19
889	0.19
890	0.21
891	0.23
892	0.22
893	0.22
894	0.21
895	0.21
896	0.16
897	0.14
898	0.13
899	0.12
900	0.11
901	0.09
902	0.08
903	0.08
904	0.09
905	0.12
906	0.13
907	0.14
908	0.17
909	0.18
910	0.19
911	0.19
912	0.18
913	0.19
914	0.2
915	0.21
916	0.22
917	0.27
918	0.3
919	0.35
920	0.41
921	0.41
922	0.45
923	0.47
924	0.53
925	0.52
926	0.57
927	0.58
928	0.58
929	0.62
930	0.57
931	0.52
932	0.47
933	0.45
934	0.4
935	0.34
936	0.28
937	0.22
938	0.21
939	0.21
940	0.18
941	0.16
942	0.15
943	0.14
944	0.14
945	0.13
946	0.12
947	0.12
948	0.12
949	0.11
950	0.09
951	0.13
952	0.17
953	0.19
954	0.19
955	0.18
956	0.18
957	0.17
958	0.22
959	0.25
960	0.24
961	0.24
962	0.27
963	0.3
964	0.34
965	0.41
966	0.41
967	0.34
968	0.33
969	0.34
970	0.37
971	0.36
972	0.34
973	0.29
974	0.28
975	0.27
976	0.29
977	0.32
978	0.27
979	0.25
980	0.24
981	0.23
982	0.22
983	0.28
984	0.28
985	0.25
986	0.29
987	0.34
988	0.35
989	0.35
990	0.35
991	0.29
992	0.31
993	0.35
994	0.34
995	0.31
996	0.32
997	0.31
998	0.31
999	0.36
1000	0.33
1001	0.26
1002	0.23
1003	0.25
1004	0.25
1005	0.27
1006	0.32
1007	0.28
1008	0.3
1009	0.31
1010	0.32
1011	0.28
1012	0.25
1013	0.27
1014	0.2
1015	0.19
1016	0.2
1017	0.19
1018	0.19
1019	0.26
1020	0.27
1021	0.23
1022	0.24
1023	0.27
1024	0.24
1025	0.26
1026	0.28
1027	0.23
1028	0.23
1029	0.23
1030	0.23
1031	0.17
1032	0.15
1033	0.12
1034	0.08
1035	0.06
1036	0.05
1037	0.05
1038	0.05
1039	0.06
1040	0.06
1041	0.06
1042	0.08
1043	0.08
1044	0.09
1045	0.09
1046	0.14
1047	0.14
1048	0.14
1049	0.15
1050	0.15
1051	0.16
1052	0.22
1053	0.23
1054	0.18
1055	0.18
1056	0.19
1057	0.19
1058	0.19
1059	0.19
1060	0.15
1061	0.14
1062	0.15
1063	0.15
1064	0.14
1065	0.13
1066	0.14
1067	0.16
1068	0.16
1069	0.17
1070	0.19
1071	0.26
1072	0.26
1073	0.26
1074	0.26
1075	0.23
1076	0.25
1077	0.26
1078	0.27
1079	0.27
1080	0.31
1081	0.33
1082	0.36
1083	0.35
1084	0.31
1085	0.3
1086	0.25
1087	0.18
1088	0.14
1089	0.12
1090	0.08
1091	0.09
1092	0.08
1093	0.06
1094	0.07
1095	0.07
1096	0.07
1097	0.07
1098	0.07
1099	0.07
1100	0.08
1101	0.08
1102	0.07
1103	0.07
1104	0.07
1105	0.07
1106	0.07
1107	0.06
1108	0.07
1109	0.07
1110	0.07
1111	0.07
1112	0.07
1113	0.06
1114	0.07
1115	0.07
1116	0.06
1117	0.06
1118	0.06
1119	0.06
1120	0.07
1121	0.08
1122	0.07
1123	0.07
1124	0.09
1125	0.15
1126	0.15
1127	0.16
1128	0.16
1129	0.18
1130	0.2
1131	0.2
1132	0.19
1133	0.13
1134	0.15
1135	0.17
1136	0.18
1137	0.18
1138	0.18
1139	0.2
1140	0.23
1141	0.28
1142	0.29
1143	0.27
1144	0.25
1145	0.29
1146	0.28
1147	0.32
1148	0.35
1149	0.35
1150	0.35
1151	0.36
1152	0.41
1153	0.45
1154	0.52
1155	0.57
1156	0.59
1157	0.6
1158	0.61
1159	0.62
1160	0.57
1161	0.5
1162	0.42
1163	0.35
1164	0.27
1165	0.24
1166	0.22
1167	0.2
1168	0.18
1169	0.16
1170	0.14
1171	0.12
1172	0.12
1173	0.09
1174	0.09
1175	0.11
1176	0.13
1177	0.13
1178	0.13
1179	0.16
1180	0.19
1181	0.24
1182	0.29
1183	0.36
1184	0.38
1185	0.46
1186	0.51
1187	0.52
1188	0.56
1189	0.61
1190	0.65
1191	0.64
1192	0.63
1193	0.59
1194	0.55
1195	0.55
1196	0.54
1197	0.5
1198	0.47
1199	0.45

Q5A7S5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer