Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0J556

Protein Details
Accession R0J556    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-302EAAWPWLKRKTTRRGAPKSRAEGTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-295RKTTRRGAPK
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 9.5, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036397  RNaseH_sf  
IPR038717  Tc1-like_DDE_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF13358  DDE_3  
Amino Acid Sequences MAPNTDISTRSFIVALKSPFGGKSTREIAEMTGISPRTIDSIYGRACQRGFEPNARLIKILPQYLEDAPRAGRPRKQEEIHDATLKNTSVVLNHRRGGYRVWRRPDEVFTKSVIRERWKGYSEFMFWGCFTYDYKGPCHVWRPETAQEKRDAALQIEELDKALEPLMREAWELTTGIKRLGLRNKPGRVPQWRWVKETGKLARESSRGGIDWWRYQTQVLIPKLIPFAKECQKERPRVFVQEDKAPSHTHHAQRTIYRNAEVEQLPWPGNSPDLNAIEAAWPWLKRKTTRRGAPKSRAEGTKVWQQYWDELPQHQIQAWIERIPFHIQEIIKLEGGNEYKEGRRDRST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.28
3 0.25
4 0.25
5 0.26
6 0.25
7 0.26
8 0.25
9 0.2
10 0.25
11 0.28
12 0.28
13 0.28
14 0.28
15 0.27
16 0.29
17 0.27
18 0.21
19 0.21
20 0.2
21 0.19
22 0.18
23 0.17
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.13
28 0.19
29 0.22
30 0.27
31 0.28
32 0.3
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.31
37 0.34
38 0.36
39 0.39
40 0.42
41 0.47
42 0.47
43 0.44
44 0.36
45 0.38
46 0.36
47 0.34
48 0.28
49 0.24
50 0.27
51 0.29
52 0.31
53 0.24
54 0.21
55 0.2
56 0.25
57 0.29
58 0.3
59 0.32
60 0.37
61 0.45
62 0.52
63 0.54
64 0.55
65 0.58
66 0.61
67 0.61
68 0.58
69 0.51
70 0.43
71 0.43
72 0.37
73 0.28
74 0.2
75 0.16
76 0.14
77 0.21
78 0.27
79 0.28
80 0.31
81 0.33
82 0.34
83 0.35
84 0.38
85 0.41
86 0.45
87 0.48
88 0.53
89 0.54
90 0.56
91 0.58
92 0.59
93 0.55
94 0.47
95 0.41
96 0.35
97 0.35
98 0.33
99 0.35
100 0.32
101 0.31
102 0.33
103 0.35
104 0.39
105 0.38
106 0.38
107 0.36
108 0.35
109 0.32
110 0.29
111 0.27
112 0.22
113 0.19
114 0.19
115 0.16
116 0.13
117 0.12
118 0.13
119 0.15
120 0.15
121 0.17
122 0.2
123 0.21
124 0.23
125 0.28
126 0.29
127 0.29
128 0.31
129 0.35
130 0.38
131 0.45
132 0.46
133 0.43
134 0.42
135 0.41
136 0.38
137 0.36
138 0.29
139 0.21
140 0.18
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.09
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.23
168 0.27
169 0.33
170 0.41
171 0.44
172 0.46
173 0.5
174 0.52
175 0.52
176 0.53
177 0.54
178 0.57
179 0.56
180 0.56
181 0.58
182 0.53
183 0.49
184 0.53
185 0.5
186 0.43
187 0.42
188 0.41
189 0.38
190 0.37
191 0.34
192 0.26
193 0.23
194 0.19
195 0.18
196 0.2
197 0.19
198 0.22
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.22
203 0.22
204 0.22
205 0.27
206 0.25
207 0.24
208 0.23
209 0.24
210 0.27
211 0.26
212 0.22
213 0.16
214 0.21
215 0.26
216 0.33
217 0.34
218 0.42
219 0.49
220 0.57
221 0.58
222 0.61
223 0.57
224 0.57
225 0.6
226 0.57
227 0.53
228 0.52
229 0.52
230 0.46
231 0.43
232 0.38
233 0.33
234 0.33
235 0.37
236 0.35
237 0.38
238 0.41
239 0.43
240 0.48
241 0.54
242 0.53
243 0.48
244 0.44
245 0.4
246 0.35
247 0.37
248 0.31
249 0.25
250 0.21
251 0.21
252 0.2
253 0.19
254 0.2
255 0.14
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.17
260 0.17
261 0.18
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.15
266 0.15
267 0.12
268 0.12
269 0.14
270 0.2
271 0.25
272 0.33
273 0.42
274 0.51
275 0.59
276 0.67
277 0.76
278 0.81
279 0.86
280 0.88
281 0.88
282 0.85
283 0.82
284 0.76
285 0.7
286 0.63
287 0.58
288 0.57
289 0.51
290 0.44
291 0.41
292 0.38
293 0.38
294 0.39
295 0.41
296 0.34
297 0.32
298 0.36
299 0.35
300 0.35
301 0.31
302 0.3
303 0.25
304 0.28
305 0.3
306 0.28
307 0.25
308 0.25
309 0.28
310 0.29
311 0.28
312 0.24
313 0.28
314 0.24
315 0.28
316 0.31
317 0.31
318 0.27
319 0.26
320 0.24
321 0.24
322 0.26
323 0.23
324 0.21
325 0.21
326 0.25
327 0.32
328 0.37