Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

R0IXE2

Protein Details
Accession R0IXE2    Localization Confidence High Confidence Score 16.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
304-323LTAGGRKKKRKGAKTSTSGYHydrophilic
407-432FLGSHHTQGKRRVKRGKQQTGIEQLDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
308-317GRKKKRKGAK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MVFAETSAPNKREESEPAGSSRASQYSAATGRSKIKSRRELESEYGNKVRSNEGEAANYGIFYDDTEYDYMQHMRDLGTGGGDAYFVEAKPEKKGKQKMDLADMLRDASLNDSRSQADMSVSSNISSVSDLFGEDMAPSEFVRKQTYQDQQNIPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDDEEDIFNELAQDGYEVDQREWSASADSAHDERDPMDRFLDDEDPGWETDDTIKASSPKPKSTADPLSLPAPDEAPAPADAADMAYLKEFKKFKDDVKAAKPTTTKPSGPADTQSFITGASALTAGGRKKKRKGAKTSTSGYSMTSSALHRTEGLTLLDQRFDKIEEEYANDDDSTFDFPDDASLASGISKISGLTGISQSSTTTSSNSHAPPLLRSDFDSIMDDFLGSHHTQGKRRVKRGKQQTGIEQLDEVRRGLGAPRVKPKDHFSVLRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.39
4 0.4
5 0.4
6 0.37
7 0.36
8 0.34
9 0.28
10 0.24
11 0.22
12 0.21
13 0.25
14 0.28
15 0.3
16 0.28
17 0.3
18 0.36
19 0.42
20 0.49
21 0.51
22 0.58
23 0.64
24 0.66
25 0.71
26 0.7
27 0.7
28 0.66
29 0.68
30 0.62
31 0.59
32 0.58
33 0.51
34 0.46
35 0.41
36 0.41
37 0.32
38 0.33
39 0.32
40 0.3
41 0.31
42 0.29
43 0.31
44 0.26
45 0.24
46 0.18
47 0.13
48 0.11
49 0.09
50 0.11
51 0.09
52 0.11
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.15
57 0.17
58 0.14
59 0.14
60 0.13
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.11
65 0.1
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.06
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.1
75 0.14
76 0.15
77 0.22
78 0.3
79 0.34
80 0.43
81 0.52
82 0.56
83 0.62
84 0.69
85 0.66
86 0.66
87 0.67
88 0.59
89 0.53
90 0.46
91 0.36
92 0.29
93 0.24
94 0.17
95 0.14
96 0.16
97 0.15
98 0.15
99 0.16
100 0.17
101 0.18
102 0.18
103 0.15
104 0.13
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.11
114 0.09
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.09
127 0.11
128 0.13
129 0.18
130 0.17
131 0.21
132 0.28
133 0.36
134 0.4
135 0.46
136 0.48
137 0.47
138 0.5
139 0.47
140 0.39
141 0.32
142 0.26
143 0.19
144 0.15
145 0.12
146 0.08
147 0.07
148 0.08
149 0.07
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.1
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.13
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.05
180 0.05
181 0.03
182 0.05
183 0.07
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.08
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.13
202 0.14
203 0.14
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.16
209 0.11
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.09
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.13
224 0.2
225 0.23
226 0.24
227 0.27
228 0.28
229 0.3
230 0.35
231 0.39
232 0.33
233 0.32
234 0.31
235 0.29
236 0.27
237 0.25
238 0.18
239 0.13
240 0.11
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.13
257 0.14
258 0.14
259 0.21
260 0.23
261 0.27
262 0.36
263 0.4
264 0.42
265 0.48
266 0.56
267 0.49
268 0.51
269 0.5
270 0.43
271 0.45
272 0.43
273 0.36
274 0.32
275 0.37
276 0.36
277 0.35
278 0.36
279 0.32
280 0.29
281 0.28
282 0.25
283 0.19
284 0.16
285 0.15
286 0.1
287 0.07
288 0.06
289 0.05
290 0.04
291 0.05
292 0.08
293 0.1
294 0.18
295 0.26
296 0.32
297 0.4
298 0.49
299 0.58
300 0.65
301 0.74
302 0.77
303 0.79
304 0.8
305 0.78
306 0.72
307 0.66
308 0.56
309 0.47
310 0.37
311 0.28
312 0.21
313 0.17
314 0.15
315 0.15
316 0.15
317 0.15
318 0.13
319 0.14
320 0.14
321 0.14
322 0.14
323 0.13
324 0.17
325 0.17
326 0.2
327 0.2
328 0.19
329 0.18
330 0.18
331 0.17
332 0.15
333 0.17
334 0.15
335 0.18
336 0.2
337 0.2
338 0.19
339 0.18
340 0.16
341 0.14
342 0.14
343 0.14
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.11
349 0.1
350 0.1
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.05
361 0.06
362 0.06
363 0.08
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.14
371 0.12
372 0.12
373 0.13
374 0.15
375 0.21
376 0.22
377 0.23
378 0.24
379 0.25
380 0.26
381 0.31
382 0.32
383 0.27
384 0.29
385 0.3
386 0.28
387 0.28
388 0.29
389 0.22
390 0.2
391 0.19
392 0.16
393 0.11
394 0.11
395 0.13
396 0.11
397 0.13
398 0.19
399 0.24
400 0.3
401 0.41
402 0.51
403 0.57
404 0.67
405 0.75
406 0.78
407 0.84
408 0.9
409 0.9
410 0.88
411 0.86
412 0.85
413 0.84
414 0.77
415 0.67
416 0.57
417 0.5
418 0.47
419 0.4
420 0.32
421 0.22
422 0.19
423 0.18
424 0.2
425 0.23
426 0.26
427 0.32
428 0.42
429 0.49
430 0.52
431 0.57
432 0.6
433 0.63
434 0.63